Heatmap: Cluster_234 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.64 -1.12 0.24 -2.48 0.97 -0.01 0.08 0.3 -1.21 0.32 -1.47 -1.85 -0.79 -0.47 -1.09 -0.95 0.22 -2.03 0.51 0.43 0.27 0.52 -2.25 -2.86 -0.7 -2.35 -1.71 -1.94 -0.14 0.57 -0.65 -1.95 0.27 0.87 0.99 -2.0 -0.59 0.99 0.33 1.19 0.86 1.16 0.95 0.39 0.2 1.02 -0.2 0.08
- -3.12 -2.7 -5.48 -5.74 -2.69 -4.07 -2.67 -1.99 0.54 -0.53 -1.2 0.63 0.21 0.09 -4.15 -2.68 -2.09 -1.81 -1.62 -3.23 -2.47 - -0.99 2.29 -1.32 -1.56 0.15 0.89 0.72 0.68 0.36 0.81 0.71 0.34 0.11 1.95 1.45 -0.3 -0.13 0.35 -0.29 -0.5 -0.12 0.24 1.38 -0.47 1.79
-0.75 0.01 -0.21 -1.79 0.61 -0.31 -0.4 -0.88 -0.77 0.11 -0.71 -0.99 -0.29 -2.36 0.35 -0.9 0.02 -0.41 0.01 0.01 0.18 0.01 -2.66 0.73 0.1 -0.24 0.07 0.85 -0.58 0.28 0.22 0.16 0.23 0.78 0.86 0.8 0.41 -0.24 -0.25 -0.44 -0.48 -0.86 -0.23 0.43 -0.41 -0.09 0.98 1.02
-1.62 -0.74 -0.04 -0.43 0.81 -0.34 -0.48 -0.71 -1.85 0.4 -0.49 -0.66 -0.05 -1.62 0.39 -0.81 0.12 -0.33 -0.05 0.06 0.39 0.51 -2.32 0.29 0.13 -0.32 -0.72 0.71 0.56 0.28 0.56 0.1 0.47 0.73 -0.04 0.75 0.49 0.08 0.07 -0.34 -0.86 -0.82 -0.6 0.28 0.09 0.02 0.66 0.36
- - -3.55 -2.78 -2.97 -1.61 -2.1 -2.86 -0.69 0.98 -1.18 -2.41 1.15 0.14 1.44 - -1.19 -2.4 -0.23 -1.94 -1.59 -1.6 - -6.48 -3.31 -4.51 -6.88 -0.06 1.39 1.35 0.76 -1.53 0.72 2.82 -0.02 -0.23 1.39 0.55 -0.34 0.05 0.9 0.33 0.5 -0.69 0.14 0.48 -1.9 1.37
-1.35 -2.76 -4.47 -8.23 -2.74 -2.34 -2.26 -1.92 -2.2 1.37 -3.29 -3.26 1.28 0.22 0.87 -3.82 -3.22 -4.32 -3.51 -3.95 -3.49 -3.92 -4.13 -9.78 -2.49 -4.5 -2.74 1.33 0.44 0.76 1.11 -0.56 0.92 0.98 0.52 1.5 1.08 1.2 0.41 -0.38 0.3 0.46 0.11 0.75 0.66 1.34 0.91 1.48
-0.44 -1.77 1.21 -2.35 -2.65 2.38 2.46 2.5 -1.34 -1.38 - -28.94 0.46 -1.48 -0.72 -2.61 -0.23 1.81 0.36 -1.34 0.38 1.18 -3.88 1.68 -6.3 0.63 -2.72 -0.47 -2.71 -0.87 -2.61 -9.85 -2.62 -2.74 -0.8 -0.08 -1.69 -0.98 -1.07 -3.17 -1.41 -0.97 -1.88 -2.37 -1.23 -1.84 -1.88 1.54
-0.74 -0.13 0.16 -0.77 -0.13 0.38 0.34 0.39 0.29 0.13 0.12 -0.14 -0.04 -1.0 0.1 -0.68 -0.1 -0.05 -0.01 0.33 -0.02 -0.04 -1.67 -1.69 0.64 0.95 0.32 0.48 0.53 -0.14 0.47 -0.06 -0.13 -0.13 -0.1 -0.37 0.63 0.24 -0.79 -0.46 0.08 -0.18 -0.41 -0.3 -0.67 0.21 -0.18 0.29
-0.3 -0.07 -0.24 -1.85 -0.03 0.87 0.66 0.58 -0.22 -0.12 -1.07 -1.09 -0.1 -0.33 -0.11 -1.12 -0.28 -0.18 0.89 0.79 0.07 -0.06 0.54 -1.43 0.66 -0.01 0.76 1.01 -0.04 0.04 -0.1 0.28 -0.39 -0.43 0.55 -0.15 0.32 0.16 -1.08 -0.42 -0.52 -0.88 -0.52 -0.66 -0.69 0.11 -0.55 0.52
- -1.91 -0.16 -1.16 0.61 2.71 2.86 0.6 - -2.05 -3.08 -2.78 -2.71 -2.45 -1.67 -3.16 -0.35 -1.23 -0.6 -0.63 -0.2 -1.82 -0.97 -0.99 1.7 -3.41 0.65 -0.21 -0.15 -0.07 -0.71 0.38 -0.34 -0.66 -0.42 -0.83 -0.06 -0.98 -1.32 -0.96 0.46 0.29 -0.53 -0.55 -0.57 -0.84 -0.66 1.64
-0.91 -1.72 -0.06 -2.96 -0.31 -0.11 0.36 0.33 -1.24 -0.04 -0.51 -0.49 -0.0 -1.03 0.51 -0.22 -0.96 -1.12 -0.07 -0.5 0.53 0.36 -2.31 -2.6 0.22 -0.4 -0.53 -0.29 1.01 0.46 0.83 -0.58 0.5 0.4 0.59 0.32 0.82 0.16 -1.34 0.18 0.87 0.7 0.08 -0.43 -0.22 0.22 -0.09 1.09
-2.51 -1.44 -2.83 -4.53 0.23 -0.31 0.08 0.12 -1.61 -0.07 -3.28 -3.52 0.68 -0.28 -0.17 -7.88 -0.22 -2.81 -0.37 1.08 1.24 -0.56 -1.63 -4.21 -0.8 -0.47 -1.14 -0.91 -0.49 0.63 0.33 0.12 0.53 -0.33 -0.98 -0.56 0.52 -0.04 0.24 1.46 1.22 0.91 0.68 1.48 0.64 0.34 0.9 0.16
- - 1.2 -5.42 -2.82 -0.79 -3.58 -1.75 - -1.56 -2.44 - -0.6 -1.85 -1.27 - 0.8 0.25 1.29 0.39 -0.58 -1.9 -3.55 -4.58 -2.24 -2.55 -2.47 0.46 1.53 0.57 1.52 0.12 0.52 1.96 -0.86 0.92 1.55 -0.16 0.6 0.51 -0.35 -0.57 -0.61 0.37 1.03 -0.33 -0.43 1.66
-8.82 - -2.43 -2.8 -2.52 -0.02 -0.6 -1.87 -3.02 0.81 0.84 0.39 0.35 -0.07 -0.34 0.73 -1.52 -0.76 -0.23 0.43 0.11 -0.57 - -1.63 0.69 -0.79 1.0 0.76 -1.58 0.31 1.02 2.29 0.44 0.11 -0.34 0.57 0.99 -0.02 -0.77 -0.4 -0.51 -0.95 -0.45 -0.87 -0.71 0.22 0.95 0.16
-0.86 -1.42 -0.31 -4.18 0.35 0.72 0.79 0.48 -0.65 0.55 -3.95 -4.43 -0.68 -2.67 0.56 -2.33 -0.59 -0.8 -0.37 0.11 -0.03 -0.23 -1.48 -2.2 0.14 0.4 0.36 0.28 -0.12 0.79 -0.32 -1.89 0.63 0.93 -1.05 -0.59 1.06 0.17 -0.18 -0.2 0.26 -0.27 0.16 0.51 0.36 0.12 1.2 1.36
-1.8 -2.15 -2.98 -1.18 -4.77 -0.95 -4.72 -1.75 -0.9 0.4 -2.86 -4.43 0.17 -0.99 0.78 -3.2 -1.56 -3.04 -1.82 -1.44 -1.78 -1.08 -0.33 -1.88 -1.86 -0.23 -1.85 -0.15 1.79 1.91 0.65 -1.26 0.46 1.45 1.96 0.5 0.23 0.46 -0.08 1.62 0.2 0.7 0.47 0.78 -0.42 0.52 -0.42 0.39
0.63 1.15 -1.74 0.24 -1.75 -1.12 -1.37 -0.39 0.46 0.2 -2.79 -3.23 -0.48 -0.83 0.49 -0.61 -1.44 -1.99 -3.64 -1.99 -2.3 -0.88 0.38 -0.81 -0.56 1.05 -0.26 -1.9 1.71 1.79 0.49 -1.83 -0.08 1.19 1.57 -0.07 -0.49 -0.01 -0.56 1.19 -0.34 -0.07 0.27 -0.09 -1.08 0.27 -1.35 0.16
-0.42 -2.16 -2.62 -3.64 -1.87 -0.78 -1.69 -1.41 -0.03 0.74 0.4 0.21 0.07 -0.65 0.96 -2.67 -2.0 -2.37 -2.61 -2.17 -2.55 -1.99 -4.41 -3.81 -0.37 -0.03 -0.58 1.25 0.26 0.63 1.28 0.75 0.79 0.43 0.19 1.39 1.43 0.39 0.15 0.06 -0.24 -0.77 -0.1 0.28 -0.17 0.53 1.15 1.09
-1.23 -1.12 -1.3 -6.63 -0.53 -1.15 -0.65 -0.96 -0.78 0.08 -4.18 -5.39 -0.16 -1.44 0.28 -4.66 0.17 -1.93 1.7 1.21 0.52 -0.03 -3.5 -4.51 -3.15 -1.32 -4.09 -2.04 -1.62 1.06 -0.48 -2.73 1.1 2.02 -0.43 -1.63 0.83 0.94 0.28 0.64 1.0 0.66 0.58 -0.19 0.86 0.98 -1.17 1.41
-5.05 -2.84 -2.85 -4.98 -3.02 -3.53 -2.39 -3.14 -3.1 0.84 -3.73 -4.06 2.38 2.07 0.47 -4.32 -3.64 -3.41 -3.58 -3.08 -3.24 -2.66 -0.56 -5.1 -2.8 -3.86 -4.18 -2.91 0.7 1.71 -1.62 -4.82 -0.31 0.31 -1.66 -3.82 -1.84 -0.26 1.46 0.76 0.86 2.37 2.08 -3.69 -0.57 -0.25 -3.59 2.68
-0.84 -0.82 -0.11 -3.08 0.03 -0.66 0.22 0.41 -1.31 0.05 0.39 0.46 0.25 0.42 -0.07 -1.25 0.26 -0.19 0.55 0.29 -0.07 -0.17 -0.94 -1.13 0.03 0.11 0.15 0.4 -0.2 0.0 -0.04 0.08 0.04 0.02 0.33 -0.02 0.28 0.41 0.0 0.23 0.32 0.07 0.13 -0.11 -0.15 0.4 -0.09 0.25
-0.31 -0.31 0.19 -2.48 0.07 0.82 1.47 1.5 -0.55 0.23 0.03 -0.14 -1.31 -3.62 -0.05 -1.78 0.11 -0.88 0.74 0.71 0.68 0.11 -0.39 -0.79 0.13 -1.32 -0.14 0.07 -0.58 0.09 0.25 0.22 0.14 -0.0 -0.13 0.2 0.23 0.01 -1.2 -0.57 -1.5 -1.95 -0.07 0.22 -1.0 -0.01 0.61 0.55
-0.34 -0.77 -2.18 -2.79 -0.87 0.23 0.2 -0.24 -0.23 0.06 -0.18 0.04 -0.06 -0.92 0.27 -1.58 -1.41 -0.48 -2.13 -2.01 -1.12 -0.66 -3.89 -1.11 0.81 -0.9 -1.13 0.7 1.36 0.8 0.84 -0.49 0.66 0.56 1.41 1.33 0.46 -0.87 0.24 -0.38 -0.05 -0.19 -0.36 0.14 0.22 -1.02 0.23 1.44
-1.57 -5.6 -1.95 -2.4 -3.04 -1.1 -2.48 0.33 -1.16 0.6 -3.6 -3.74 0.14 0.79 0.41 -6.65 -1.2 -4.95 -5.11 -5.03 -5.93 -1.73 -6.34 -6.25 -1.88 -0.57 -1.96 -2.29 1.6 1.46 0.73 -3.66 0.54 2.38 -1.12 -1.03 0.37 -1.01 -1.33 0.85 1.72 1.89 0.83 0.79 -0.1 -0.82 -1.37 2.34
-2.88 -1.47 -2.63 -3.36 -2.26 0.75 1.82 1.19 -0.78 1.01 -3.4 -2.63 0.2 0.39 0.49 -0.35 -1.6 -3.61 -4.03 -3.57 -2.96 -1.74 -3.17 -4.94 -1.63 -0.88 -2.13 -0.82 1.57 1.37 0.79 -2.33 0.83 1.41 0.1 0.4 0.91 -0.01 -0.25 0.45 -0.55 0.5 0.37 1.02 0.58 -0.37 -0.96 0.74
-4.76 0.53 2.33 0.28 -3.2 2.66 2.85 2.41 -0.69 -1.94 -0.37 -0.41 -1.41 -1.92 -0.67 -1.61 0.32 -0.07 -1.85 -3.18 -1.38 -1.94 -3.6 1.34 -2.29 0.95 -3.52 -0.17 -4.13 -0.23 -2.28 -1.06 -1.81 -1.13 -2.01 -1.45 -2.4 -1.59 -2.47 -1.8 -1.61 -3.08 -2.81 -3.08 -1.08 -1.56 -3.27 1.49
-2.9 -0.51 -0.88 -1.61 0.96 0.04 0.38 0.43 -2.34 0.52 -0.98 -1.02 0.14 -0.18 0.57 -1.53 -1.23 -0.94 -0.61 -0.81 0.39 0.57 -5.23 -1.01 0.74 -1.12 0.26 0.36 -0.54 0.38 0.35 0.77 0.26 0.82 -0.16 0.97 0.09 -0.2 -0.38 0.12 0.53 0.35 0.32 -0.58 -0.11 -0.21 -0.4 1.24
-0.92 -1.53 -0.36 -2.49 1.55 -0.4 -0.82 -0.94 -1.56 0.91 -2.11 -2.53 -0.48 -2.03 0.6 -2.01 0.14 -0.29 -0.24 0.17 0.42 0.44 -2.31 -1.21 0.48 -1.01 -1.08 1.03 0.4 0.2 0.8 -0.13 0.53 1.08 0.59 0.87 0.73 0.32 0.01 -0.52 -1.83 -1.58 -0.27 0.15 0.09 0.29 0.94 0.03
-0.35 -0.29 -0.32 0.27 -1.47 0.16 0.22 0.15 -0.82 -0.11 -1.58 -1.47 -0.0 -0.46 0.03 -0.79 -0.09 -0.71 -0.0 0.17 0.22 0.16 -0.56 -1.13 -0.42 -0.62 -0.49 0.41 0.63 0.65 0.16 -0.45 0.08 0.81 0.39 0.11 0.19 0.46 -0.13 0.1 0.43 0.36 0.3 -0.3 -0.14 0.53 -0.61 1.16
-4.19 -3.08 0.66 -3.42 -0.26 1.66 1.73 1.62 -1.99 -0.31 0.18 0.38 -0.31 -0.88 0.1 -1.04 -0.28 -1.42 -2.42 -1.09 -1.38 -1.41 0.22 -3.79 -2.29 -0.89 -0.14 1.18 0.68 0.23 -0.13 0.1 0.39 0.67 -1.74 0.94 0.95 -0.13 -0.74 0.39 0.15 -0.41 -0.31 -0.61 -0.55 -0.53 -1.14 0.86
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-1.79 -1.29 -0.44 -0.24 -0.39 -1.22 -0.87 -1.12 -1.28 -0.49 -0.49 -0.57 0.05 -0.07 0.15 -1.89 -0.15 -0.48 0.63 0.42 0.48 -0.17 -3.07 -1.54 -0.69 0.31 -1.48 -1.34 -1.14 0.22 0.22 0.37 0.59 0.23 0.19 -0.77 0.94 0.1 0.52 0.88 0.68 1.03 1.18 0.51 1.04 -0.07 0.73 0.02
-0.37 0.3 0.28 0.87 0.4 0.73 0.74 0.79 0.52 0.06 -1.03 -1.03 -0.57 -1.49 -0.31 -2.65 -0.14 -0.23 0.8 1.15 0.67 0.3 -0.48 -0.83 0.2 -0.67 0.33 0.23 -1.29 -0.11 -0.36 0.12 -0.07 0.0 -1.57 0.23 -0.34 0.35 -0.8 -0.18 -1.13 -0.69 -0.17 0.14 -0.46 0.27 0.04 -0.21
-4.76 0.53 2.33 0.28 -3.2 2.66 2.85 2.41 -0.69 -1.94 -0.37 -0.41 -1.41 -1.92 -0.67 -1.61 0.32 -0.07 -1.85 -3.18 -1.38 -1.94 -3.6 1.34 -2.29 0.95 -3.52 -0.17 -4.13 -0.23 -2.28 -1.06 -1.81 -1.13 -2.01 -1.45 -2.4 -1.59 -2.47 -1.8 -1.61 -3.08 -2.81 -3.08 -1.08 -1.56 -3.27 1.49

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.