Heatmap: Cluster_284 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c11_11990V3.1	-1.1	-0.51	0.16	-3.57	0.54	0.89	0.89	0.81	-0.99	0.97	0.25	0.25	0.14	-0.68	0.36	-1.07	0.13	-0.44	0.19	0.61	0.47	0.23	-0.79	-1.34	0.4	-0.58	-0.13	-0.39	-0.13	-0.08	-0.19	-0.08	0.05	-0.02	-0.69	-1.11	-0.05	0.78	-0.91	-0.23	-0.18	-0.24	0.03	-0.1	-0.28	0.76	-0.46	-0.12
Pp3c11_23620V3.1	-1.99	0.46	1.19	-3.81	0.69	-21.65	-1.4	-4.45	-0.99	0.65	-2.69	-2.75	-0.11	-0.71	0.85	-0.62	0.06	0.35	0.84	1.11	0.32	1.32	-21.64	-1.84	-0.23	-0.94	-0.93	0.72	-0.76	0.36	0.13	0.02	0.27	0.07	-1.55	-0.01	-0.0	0.52	-0.26	0.29	-0.55	-0.45	0.19	0.68	0.37	0.59	0.65	0.29
Pp3c11_3060V3.1	-0.42	0.52	0.95	-2.32	-0.47	0.23	0.6	0.45	-0.62	0.64	-0.86	-0.94	-0.09	-1.84	0.42	-0.87	0.61	-0.25	0.05	0.19	0.04	-0.21	-2.36	-1.86	0.27	0.24	-0.29	0.83	-0.09	0.2	0.34	0.35	0.2	0.58	-0.75	0.83	0.54	0.17	-0.34	-0.69	-1.87	-2.18	-0.43	0.11	-0.27	0.22	0.69	0.14
Pp3c12_13690V3.1	-0.03	-0.61	0.45	-1.58	0.43	0.09	0.42	0.62	0.05	0.26	-0.06	-0.1	0.14	-1.14	0.06	-1.26	0.06	-0.25	1.04	0.86	0.76	0.74	-0.83	-1.91	-0.02	-0.25	0.04	-0.17	-0.3	-0.06	-0.12	0.03	-0.02	0.13	-0.61	-0.5	-0.16	0.2	-0.91	-0.12	-0.45	-0.52	-0.09	0.3	-0.25	0.16	0.16	0.28
Pp3c12_23520V3.1	0.11	-0.56	0.95	-2.57	0.3	-0.08	0.13	0.53	-1.96	0.83	-2.56	-2.71	0.12	-0.52	0.49	-1.38	-0.21	-0.85	-0.05	0.89	1.19	0.6	-3.15	-0.97	0.43	-0.32	0.01	0.23	-0.43	0.02	0.39	-0.27	0.26	0.08	-0.93	-0.24	0.7	0.28	-0.97	0.2	-0.16	-0.23	0.42	0.27	-0.12	0.19	0.46	-0.34
Pp3c13_1370V3.1	0.08	-0.25	-0.03	-2.63	0.12	0.22	0.9	0.87	-0.77	0.58	-1.3	-1.24	0.09	-0.32	0.02	-0.66	-0.05	-0.8	0.75	0.73	0.43	0.54	-2.43	-1.84	-0.08	-0.44	-0.72	0.15	-0.45	0.07	0.38	-0.15	0.08	0.02	-0.02	-0.17	0.35	0.93	-0.71	-0.08	-0.12	-0.16	-0.16	-0.02	-0.44	0.88	0.22	-0.08
Pp3c13_16720V3.1	0.12	0.2	0.9	-0.75	0.49	0.62	0.5	0.43	-0.51	0.33	-1.98	-2.09	-0.01	-0.79	0.39	-1.42	0.44	-0.22	-0.85	0.14	0.36	0.28	-1.95	-0.4	0.2	-0.37	-0.06	0.55	-0.67	0.04	0.47	0.33	0.2	0.4	-0.82	0.7	0.46	0.23	-0.46	-0.26	-1.14	-1.34	-0.65	0.21	-0.22	0.34	0.47	-0.06
Pp3c13_8000V3.1	-1.31	-0.01	-0.13	-2.49	-2.0	-0.39	0.16	0.23	-2.16	0.39	-0.13	-0.1	0.25	-0.34	0.01	-0.29	-0.31	-0.12	-0.22	0.22	0.38	0.14	0.29	-1.49	-0.15	-0.68	-0.01	-0.07	-0.06	0.14	0.19	0.29	0.49	0.39	-0.61	0.41	0.2	0.42	-0.09	0.55	0.34	0.46	0.35	0.34	-0.05	0.4	0.38	0.03
Pp3c14_7230V3.1	0.5	-0.18	0.71	-1.41	-0.37	0.32	0.39	0.11	-0.46	0.58	-1.07	-0.94	-0.04	-1.16	0.23	-1.69	0.46	0.1	-0.09	0.22	0.24	0.35	-1.77	-0.3	0.12	-0.06	-0.37	0.44	-0.55	0.18	0.45	0.27	0.31	0.42	-1.7	0.25	0.43	0.62	-0.58	-0.33	-0.51	-0.38	-0.23	0.18	-0.41	0.59	0.41	0.03
Pp3c15_2410V3.1	-	-0.81	-0.09	-1.37	-0.09	-0.24	-1.39	-1.34	-0.94	0.59	-2.6	-2.53	0.46	0.15	0.56	-	0.42	0.03	0.79	0.53	0.42	0.44	-0.89	-1.48	-0.11	0.01	-0.16	1.01	-0.15	0.09	-0.04	0.05	0.41	0.36	-0.8	1.2	0.67	0.34	0.13	0.01	-0.36	-0.0	-0.05	0.46	0.38	0.36	0.25	-0.03
Pp3c15_5620V3.1	-1.24	-0.06	0.79	-1.48	0.09	0.19	-0.13	0.14	0.2	0.63	-0.86	-0.79	0.02	-1.17	0.27	-1.8	-0.15	-0.07	-0.36	0.07	-0.22	-0.15	-1.65	-1.18	0.4	-0.51	0.2	0.65	0.45	0.1	0.6	0.69	0.46	0.71	0.18	0.52	0.36	0.29	-0.63	-0.25	-0.73	-1.07	-0.48	-0.06	-0.44	0.45	0.4	0.36
Pp3c15_6250V3.1	-0.97	-0.13	0.49	-0.95	0.67	0.32	0.35	0.15	-1.28	0.37	-2.55	-2.45	0.11	-0.12	-0.14	-0.45	0.18	-0.81	0.33	0.39	0.3	0.41	-2.52	-2.38	-0.25	-1.77	-0.5	0.05	-0.19	0.14	0.43	-0.13	0.48	0.47	-1.34	0.3	0.26	0.38	-0.1	0.31	0.45	0.49	0.45	0.15	0.35	0.43	-0.11	0.63
Pp3c16_5590V3.1	0.1	-1.93	-2.38	-3.27	0.89	-0.25	-0.15	0.2	-0.7	0.44	-1.89	-2.01	0.17	0.48	0.41	0.34	-0.09	-1.16	-0.51	-0.22	0.88	1.25	-2.81	-2.15	0.27	-0.98	0.22	-0.36	0.94	-0.07	-0.22	-0.74	0.11	0.51	-1.91	-0.64	0.19	-0.23	0.21	0.36	0.94	0.72	0.52	0.42	0.44	-0.28	-0.55	0.56
Pp3c17_18330V3.1	0.24	-0.11	0.52	-2.36	-0.03	0.8	1.15	1.07	0.14	0.29	-0.88	-0.97	-0.18	-0.87	-0.09	-0.16	0.65	0.03	0.44	0.57	0.65	0.66	-2.08	-1.59	0.4	-0.23	-0.73	-0.45	-0.34	-0.17	-0.09	-0.15	-0.19	-0.09	0.22	-0.75	-0.28	0.52	-0.96	-0.29	-0.15	-0.14	-0.08	-0.36	-0.74	0.6	-0.37	-0.31
Pp3c18_20590V3.1	-0.59	-0.6	-0.32	-2.23	0.58	-0.0	-0.08	-0.13	-0.37	0.79	-0.26	-0.43	0.46	-1.25	0.5	-0.21	-0.37	-0.05	0.69	0.45	0.74	0.99	-2.34	-1.66	1.11	-0.18	0.71	-0.27	-0.49	-0.2	0.07	-0.07	-0.17	-0.36	-1.23	-0.57	0.14	0.9	-1.53	-0.16	-0.37	-0.77	0.23	0.01	-0.57	0.93	-0.07	0.17
Pp3c18_21360V3.1	0.14	-0.5	0.56	-1.4	0.58	-0.0	0.68	0.63	-0.12	0.5	-0.96	-0.97	0.09	-1.18	0.06	-0.66	-0.29	-0.31	0.67	0.85	0.94	0.67	-1.99	-1.11	0.46	-0.5	0.04	-0.02	-0.03	-0.06	0.22	-0.16	0.09	-0.07	-1.27	-0.39	0.41	0.52	-1.04	-0.22	-0.58	-0.54	-0.05	0.05	-0.19	0.48	0.15	-0.36
Pp3c19_11370V3.1	-1.72	-0.23	0.5	-1.41	-0.07	0.39	0.66	0.6	0.55	1.15	-2.99	-3.04	0.75	0.08	0.37	-1.94	0.24	-0.11	0.39	0.65	0.17	0.47	-0.7	-1.99	0.36	-0.36	-0.51	0.1	-1.02	0.02	0.55	0.06	0.08	-0.04	-0.67	0.09	0.48	0.89	-1.24	-0.06	-0.7	-0.7	-0.31	-0.43	-0.67	0.85	-0.11	-0.41
Pp3c19_5770V3.1	0.18	-1.15	-0.11	-4.35	-0.91	-0.6	-0.59	-0.37	-0.3	0.46	-0.97	-1.1	0.23	-0.24	-0.04	-0.13	0.53	0.23	0.54	0.66	0.76	0.54	-2.53	-1.35	0.4	0.38	0.06	-0.23	-0.29	0.02	0.38	0.21	0.2	0.17	-1.38	-0.38	0.21	0.7	-0.84	0.3	0.46	0.37	0.13	0.26	-0.26	0.63	0.13	0.2
Pp3c1_1240V3.1	-0.41	-0.21	0.11	-1.94	-1.31	0.8	0.76	0.79	-0.68	0.62	0.05	0.05	0.06	-1.18	0.38	-0.57	0.1	0.08	0.24	0.34	0.16	0.03	-0.93	-1.87	-0.07	-0.54	-0.14	0.41	-0.15	-0.19	0.36	0.95	0.2	0.17	-0.67	0.84	0.39	0.16	-0.84	-0.86	-1.87	-1.62	-0.66	0.56	-0.47	0.22	0.86	-0.39
Pp3c1_21160V3.1	-0.61	-0.44	-0.25	-1.94	0.96	-0.78	-1.05	-1.07	-1.11	0.5	-0.9	-0.85	0.17	-0.32	0.21	-0.53	-0.02	-0.76	0.27	0.3	0.49	0.16	-1.47	-1.36	0.6	-0.86	-0.29	0.3	0.91	0.04	0.1	-0.5	0.32	0.18	0.1	-0.28	0.34	0.38	-0.4	0.15	0.51	0.54	0.62	0.3	0.13	0.4	-0.08	0.53
Pp3c1_21290V3.1	-0.59	-1.46	0.01	-1.93	0.28	0.29	0.9	0.75	-0.29	0.74	-0.07	-0.29	0.25	-1.19	0.45	-0.76	0.04	0.64	0.07	0.37	0.17	0.77	-2.8	-0.44	0.78	0.11	-0.21	-0.07	0.02	-0.05	0.47	-0.2	-0.09	0.02	-0.81	-0.42	0.35	0.82	-1.27	-0.43	-0.64	-0.74	-0.29	-0.53	-0.78	0.8	-0.07	-0.19
Pp3c1_23810V3.1	-0.76	-0.14	-0.06	-2.32	0.31	0.32	0.75	0.79	-0.38	1.04	-3.25	-3.14	0.33	-1.15	0.53	-0.83	-0.44	0.0	-0.42	0.76	0.97	1.24	-1.07	-1.54	0.95	0.4	-0.21	0.37	-0.61	-0.08	0.27	-0.33	0.2	0.02	-0.86	-0.08	0.64	0.47	-1.05	-0.35	-1.31	-1.43	-0.0	-0.29	-0.42	0.45	-0.05	-0.33
Pp3c1_6350V3.1	-0.42	0.04	0.19	-0.09	0.25	0.52	0.11	0.43	-0.52	0.28	-0.94	-0.74	-0.15	-1.34	0.26	-0.46	0.38	0.2	0.24	0.35	0.41	0.29	-0.53	-0.31	0.26	-0.21	0.08	0.35	0.29	0.17	0.33	-0.07	0.09	0.05	-0.63	0.05	0.38	0.61	-1.14	-0.35	-0.8	-0.95	-0.28	-0.1	-0.27	0.51	0.09	-0.11
Pp3c1_8060V3.1	0.61	-0.12	0.34	-1.79	0.59	0.41	0.81	0.87	0.11	0.07	-1.68	-1.62	-0.2	-1.65	-0.11	1.07	0.53	0.41	0.57	0.58	0.3	0.47	-2.63	-0.77	0.22	0.1	-0.2	-0.13	-0.63	-0.15	0.05	-0.16	-0.29	-0.01	-1.01	-0.06	-0.08	0.3	-0.97	-0.17	-0.56	-0.34	-0.17	-0.08	-0.38	0.31	-0.07	-0.23
Pp3c20_10070V3.1	-1.13	0.15	-0.36	-1.46	-1.46	-0.61	0.12	0.45	-0.05	0.31	-1.45	-1.08	0.29	-0.58	0.83	-0.34	-0.44	-0.07	1.38	1.0	0.97	0.81	-1.1	-1.73	1.32	-0.18	0.99	0.29	-1.95	-0.18	0.32	-0.22	-0.23	-0.27	-1.17	-0.22	0.39	0.52	-0.99	-0.52	-0.67	-0.9	-0.29	-0.18	-0.78	0.44	-0.18	0.13
Pp3c20_11340V3.1	-0.47	-0.71	-0.55	-0.52	1.31	1.46	1.14	1.11	-0.45	0.2	-0.75	-0.51	0.34	-0.49	0.35	-0.66	-0.19	-0.06	0.06	0.73	0.29	-0.0	-0.88	-0.94	-0.12	0.23	-0.3	0.02	-1.12	-0.23	0.35	-0.77	-0.19	-0.45	-3.45	-0.69	0.17	0.01	-1.05	0.05	0.27	0.04	0.31	-0.32	-0.44	-0.06	-0.33	-0.04
Pp3c21_15940V3.1	-1.91	0.01	-0.27	-2.07	-0.5	1.22	0.98	1.18	-0.06	1.04	-0.35	-0.19	0.47	-0.32	0.29	-0.65	-0.48	-0.17	0.58	0.93	0.62	0.61	-2.41	-1.99	0.63	0.52	0.2	0.28	-1.6	-0.22	0.39	0.39	-0.32	-0.3	-1.43	-0.58	0.42	0.72	-1.53	-1.14	-1.06	-1.11	-0.79	-0.91	-1.29	0.48	-0.55	0.03
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Pp3c6_1360V3.1	-0.05	-0.26	0.3	-1.69	0.67	-0.49	-0.3	-0.37	-0.74	0.72	-0.56	-0.72	0.29	0.21	0.1	-0.6	0.02	-0.02	0.14	0.41	0.4	0.76	-3.37	-1.52	0.32	-0.13	-0.35	-0.32	0.24	0.09	0.19	-0.02	0.25	0.27	-0.55	-0.76	0.09	0.57	-0.78	0.15	0.28	0.49	0.25	0.03	-0.18	0.55	0.17	-0.14
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Pp3c7_960V3.1	-0.73	-0.83	-0.72	-2.22	0.75	1.28	1.25	1.25	-0.51	0.41	-1.16	-1.11	0.39	-0.13	-0.15	-1.24	0.02	-0.19	-0.38	-0.02	-0.17	-0.52	-1.88	-1.14	0.4	-0.4	-0.18	0.33	0.13	0.06	0.56	-0.43	0.1	-0.18	-0.36	-0.76	0.38	0.23	-1.11	-0.25	0.9	0.69	0.31	-0.51	-0.37	0.25	-0.54	-0.1
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Pp3c8_13830V3.1	-1.51	-0.75	0.55	-1.26	-0.71	-0.23	-0.18	-0.96	-2.54	0.93	-1.21	-1.11	-0.21	-2.01	0.68	-2.29	-0.2	-0.09	0.19	0.36	0.08	0.16	-1.63	-2.64	0.47	0.18	0.92	0.86	-0.19	0.29	0.9	1.12	0.33	0.51	-0.69	0.31	0.65	0.56	-0.58	-0.12	-1.27	-1.71	0.01	0.42	-0.44	0.57	0.7	0.12
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Pp3c9_6350V3.1	0.2	-1.83	-0.16	-2.1	0.94	0.95	0.84	0.56	-1.39	0.76	-2.31	-2.63	-0.25	-1.54	0.59	-0.92	-0.35	-0.44	0.75	0.63	0.43	0.46	-2.59	-1.58	1.39	0.35	1.16	-0.08	-0.7	-0.16	0.77	-0.57	0.32	0.03	-0.93	0.42	0.37	0.34	-1.18	-0.66	-1.11	-1.09	-0.51	-0.51	-0.64	0.16	0.37	-0.76

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.