Heatmap: Cluster_293 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
5.67 5.11 9.73 2.33 25.56 21.63 19.86 17.48 10.57 10.38 10.38 11.85 8.84 3.74 9.54 7.36 4.62 4.18 13.87 17.25 16.35 12.49 5.14 1.32 15.96 4.93 21.0 8.63 10.19 8.58 10.76 16.03 7.81 6.4 6.63 9.38 9.85 9.11 3.67 6.68 8.71 6.12 8.21 10.56 6.24 8.45 8.84 12.26
7.94 8.11 12.51 15.97 38.09 78.8 71.66 65.49 13.24 20.18 13.42 14.11 10.36 5.39 21.56 6.49 6.1 8.54 17.54 22.66 21.14 16.69 12.53 40.53 31.1 7.64 41.29 21.74 15.6 15.91 22.73 23.71 17.06 12.81 12.55 19.42 20.67 14.44 6.08 10.17 8.47 5.9 13.62 14.55 8.96 14.29 17.16 16.11
6.12 7.86 13.07 6.7 33.66 66.6 60.99 61.93 9.61 21.28 11.72 10.08 14.88 6.2 21.48 8.19 4.7 9.06 14.71 18.05 20.02 21.63 8.1 29.82 28.48 7.18 29.77 14.19 10.25 10.52 20.18 19.9 16.21 11.39 6.82 14.09 19.18 12.95 6.43 10.21 8.82 6.26 14.03 11.43 10.16 12.32 12.26 12.64
8.11 8.93 20.15 5.4 37.28 35.84 23.89 24.08 11.7 12.2 17.25 17.27 8.67 4.19 12.13 8.1 10.87 6.97 18.74 20.34 18.08 15.1 12.37 6.98 18.77 8.84 17.95 15.49 10.56 9.87 13.01 13.28 10.64 11.28 11.72 12.87 13.11 11.73 5.58 6.81 6.28 5.48 8.94 9.33 6.44 11.27 12.12 12.22
58.2 50.82 56.09 16.02 236.16 98.56 86.0 83.23 47.01 52.82 50.74 52.11 56.82 34.32 42.61 60.42 59.96 52.09 55.73 77.94 69.29 75.21 21.02 37.47 84.07 94.27 51.9 50.12 34.34 40.45 52.29 45.1 43.97 44.43 46.67 33.62 52.74 49.79 29.5 40.25 33.63 32.13 42.79 40.73 35.11 50.96 49.97 39.69
5.23 4.71 6.38 5.13 26.64 52.58 46.55 38.44 6.87 13.3 5.16 5.74 15.84 11.34 14.32 5.31 6.3 4.96 10.9 14.14 16.17 13.74 7.79 5.79 21.43 9.66 27.06 10.95 14.03 7.79 13.39 8.18 10.71 8.75 7.62 11.15 13.06 7.03 7.0 6.36 10.16 7.73 10.17 5.98 7.0 7.53 7.06 12.11
29.22 18.96 32.83 19.74 105.39 24.36 21.99 40.56 32.59 25.82 24.36 24.04 28.46 20.82 22.94 26.07 34.72 29.33 25.01 31.04 35.32 34.19 11.99 18.01 43.59 30.71 34.18 16.13 10.67 16.17 19.17 19.62 18.03 19.06 38.94 17.6 18.16 26.77 14.45 18.67 19.99 21.61 20.68 16.1 14.64 28.73 16.48 16.81
5.74 4.37 12.43 4.59 23.62 33.33 29.97 26.62 4.29 10.88 20.54 18.19 6.79 1.7 8.78 4.29 6.87 6.68 9.15 11.33 12.55 10.14 6.46 3.98 16.24 5.76 21.12 9.94 20.89 8.07 10.49 18.24 9.78 9.5 5.38 10.08 12.99 6.64 4.56 5.87 4.45 3.69 7.3 10.0 5.52 6.8 9.71 11.35
6.94 6.7 12.45 7.92 43.76 41.01 33.2 32.53 7.46 13.8 18.32 17.61 6.99 3.14 15.62 5.46 6.22 7.1 14.71 18.28 19.65 18.89 5.9 21.5 21.69 8.0 21.23 7.62 7.68 7.95 10.91 12.05 8.9 5.92 5.26 9.28 11.34 8.69 2.69 5.67 7.02 5.05 8.94 8.98 4.29 8.04 8.84 9.5
9.48 5.63 8.35 2.32 39.73 15.32 14.15 12.88 7.09 9.4 7.86 7.57 5.61 1.44 9.57 5.48 9.6 7.96 8.91 10.61 8.99 7.6 4.29 5.37 12.13 9.51 12.85 8.59 4.77 6.98 8.66 9.99 7.13 6.83 9.98 9.17 8.75 8.66 3.05 5.0 3.48 2.46 5.23 6.59 3.65 8.38 6.87 8.59
37.03 35.14 39.2 13.22 75.04 58.9 60.11 55.46 61.8 43.33 58.36 56.25 43.49 18.61 40.02 21.39 20.71 22.92 35.66 38.81 35.91 54.35 18.28 32.34 81.74 42.67 91.02 28.97 39.39 28.94 37.38 29.61 28.2 27.24 63.09 30.83 34.56 29.78 15.9 25.4 16.37 15.61 30.91 22.84 21.23 28.8 26.39 26.26
5.8 3.79 15.14 12.58 42.48 17.77 24.8 29.51 15.46 8.06 22.45 24.2 5.71 5.02 7.2 6.23 9.98 7.53 15.4 17.5 10.16 7.78 6.59 9.64 12.87 7.02 9.38 7.59 2.56 7.54 7.84 5.76 7.73 6.44 2.21 5.14 6.94 10.8 3.86 7.86 6.2 6.97 8.53 7.22 6.01 11.39 6.41 5.9
27.97 33.24 40.8 9.83 58.73 85.13 83.5 85.96 39.83 36.29 69.38 68.26 30.38 11.79 33.69 37.75 38.6 32.58 39.56 35.65 30.36 31.1 13.05 14.96 50.73 51.69 52.99 37.92 29.33 29.12 48.02 42.2 30.26 25.91 38.52 40.29 38.47 30.02 13.04 18.71 14.39 9.6 19.69 17.79 16.18 30.61 22.31 38.05
89.01 93.61 159.98 63.2 426.88 228.79 244.15 248.94 96.11 96.63 90.51 102.89 98.62 63.93 84.05 79.75 105.74 73.79 150.11 149.89 103.28 83.83 119.6 33.31 106.16 75.73 90.29 98.49 88.93 81.79 101.89 84.72 74.93 65.43 60.32 73.55 81.47 95.53 49.69 73.84 67.99 71.12 81.71 59.44 61.22 87.04 73.59 96.5
5.86 8.75 13.82 7.59 26.83 15.02 20.41 20.74 5.98 6.22 9.4 8.43 6.52 2.77 5.62 2.32 10.96 5.29 14.97 14.91 13.28 10.03 9.91 8.88 8.54 3.07 11.14 7.2 4.81 5.48 6.97 7.12 7.52 6.84 2.21 5.63 8.36 6.72 4.37 6.27 4.02 3.46 6.97 11.1 6.38 7.34 7.11 7.62
3.44 3.3 10.39 1.75 12.34 25.81 23.47 22.74 5.66 9.16 8.2 8.84 7.04 4.5 8.75 5.22 4.59 7.27 11.01 13.77 13.61 13.84 4.11 11.96 17.85 6.03 21.73 6.34 5.56 5.83 9.42 8.35 7.11 5.72 5.58 6.87 10.71 7.15 3.75 5.83 5.8 4.88 7.16 6.55 3.91 6.98 6.1 6.61
14.69 16.69 15.6 18.2 89.19 95.34 63.58 64.95 19.97 29.87 26.71 26.9 24.72 11.91 32.62 21.47 15.24 11.22 31.22 36.46 35.29 28.84 41.68 17.36 46.0 15.28 52.56 25.8 22.41 19.83 26.35 23.07 22.22 18.37 26.58 24.15 28.06 24.33 10.37 18.44 17.61 13.01 23.46 20.36 16.4 23.43 19.1 21.6
8.62 12.35 11.75 1.92 21.43 28.13 24.92 26.42 17.57 13.75 20.22 20.01 8.47 3.11 15.65 8.05 7.3 6.84 12.91 15.74 14.07 12.61 19.54 6.07 21.96 14.57 26.09 11.77 13.33 9.2 12.2 13.72 8.57 6.23 12.04 9.94 11.93 9.07 2.65 4.2 3.56 2.62 6.17 6.44 3.47 9.16 8.66 11.55
7.94 6.59 9.7 4.54 31.41 29.43 27.18 25.74 4.59 10.16 7.09 6.71 10.54 5.66 11.06 5.98 8.56 6.02 15.09 13.11 14.08 11.67 5.57 4.48 13.36 6.13 11.74 10.53 8.15 7.93 9.54 9.03 10.19 8.79 9.18 9.9 9.57 8.21 5.68 9.04 7.43 6.48 11.03 9.73 8.48 8.42 8.79 9.56
16.94 12.22 24.89 11.79 57.61 28.46 26.29 32.66 17.85 24.04 27.76 26.69 24.42 13.48 22.41 14.64 22.25 14.89 32.08 29.1 25.74 25.86 15.0 7.94 26.01 13.25 22.27 26.37 19.35 22.16 25.12 26.07 23.55 24.35 34.29 25.96 23.47 24.75 15.84 17.29 13.61 13.64 20.48 18.73 18.64 24.63 23.13 20.59
14.16 10.28 23.3 7.84 40.9 28.34 23.13 22.72 18.67 7.52 12.83 10.32 7.3 2.63 6.58 13.8 8.1 11.48 15.55 16.68 17.03 18.31 4.98 19.58 19.25 5.15 11.82 4.88 5.73 7.83 6.0 11.39 6.23 8.01 5.29 2.85 8.15 6.54 3.51 5.96 5.85 6.23 7.01 6.62 4.64 6.82 5.52 10.75
10.9 15.45 15.36 5.73 54.06 15.67 24.59 20.89 12.62 12.32 4.76 5.28 8.97 4.7 12.4 14.22 13.59 12.49 14.87 16.64 18.51 13.07 6.39 6.94 16.1 9.42 16.06 17.06 6.06 12.66 14.15 12.86 14.2 12.19 11.59 15.75 16.57 13.93 6.36 9.24 6.46 4.67 11.37 12.52 9.97 13.43 13.04 13.71
9.95 7.97 16.11 5.4 30.71 69.69 60.51 64.04 10.19 16.75 18.8 15.56 10.14 5.46 16.15 5.84 8.25 6.49 17.33 27.77 27.59 22.49 5.65 8.75 26.15 9.97 32.0 16.81 12.42 14.07 17.54 22.0 16.19 12.53 4.46 10.55 16.03 9.05 7.55 14.15 9.54 8.52 17.21 14.31 12.69 8.84 15.74 12.21
4.32 5.36 8.43 4.71 19.14 25.36 24.98 26.16 7.23 10.37 19.75 18.55 6.77 2.49 8.81 4.41 3.94 4.2 6.46 9.77 10.77 8.95 1.81 4.35 14.54 6.1 23.29 10.37 8.48 7.71 10.14 12.87 8.29 7.79 7.76 10.11 11.4 7.15 3.29 5.08 3.62 2.61 6.2 6.96 4.15 6.31 8.27 7.97
12.22 13.4 23.61 4.01 64.3 51.99 52.36 55.45 15.94 19.65 36.01 31.19 11.81 5.88 19.6 11.73 11.73 10.88 29.17 29.71 30.71 25.42 16.77 8.48 29.83 9.59 37.96 24.04 26.46 16.22 19.35 28.17 21.14 18.15 11.16 23.7 24.39 13.61 10.4 14.87 14.04 10.94 18.28 20.59 12.34 13.33 20.69 18.36
9.17 6.91 19.86 10.45 29.75 48.25 36.11 39.59 24.15 22.61 29.25 26.66 19.43 8.89 16.61 12.96 15.93 15.47 17.82 22.6 17.21 15.61 2.05 5.75 35.15 21.68 30.96 9.38 13.94 9.34 13.42 18.86 10.43 8.92 12.03 9.04 13.48 12.08 4.44 8.16 9.88 8.6 9.83 7.37 5.88 11.73 8.94 10.84
6.02 13.28 23.46 16.59 57.13 39.1 43.23 49.2 10.13 13.31 13.08 13.72 12.78 8.22 13.33 8.93 11.87 12.52 22.82 21.51 18.27 23.88 13.28 15.92 20.91 9.49 30.3 12.33 4.29 10.2 8.6 12.3 8.48 9.01 4.73 9.81 9.77 10.45 4.88 7.94 7.06 5.85 10.1 9.13 7.32 10.41 10.32 11.59
8.38 6.35 21.86 2.17 30.09 18.28 12.61 13.6 5.88 9.4 8.65 8.5 5.66 1.93 8.5 4.2 9.14 10.2 17.02 16.8 14.75 15.98 3.67 5.87 14.05 3.8 9.32 8.23 5.26 6.31 9.16 6.81 7.17 6.53 8.11 9.5 7.43 7.71 3.27 5.27 3.71 2.32 6.42 7.64 3.62 7.67 9.13 7.4
32.29 28.64 52.5 11.69 95.67 47.61 53.14 46.84 26.46 23.48 35.34 35.9 17.41 4.58 24.13 16.67 25.82 24.84 38.05 35.79 39.58 34.27 12.17 35.34 36.0 26.3 30.16 27.99 21.21 22.24 28.4 24.67 18.79 16.67 26.63 20.1 27.53 23.03 9.23 11.05 7.79 6.8 13.1 13.57 9.53 22.78 18.07 23.1
1.65 3.17 5.19 4.74 12.72 32.93 26.44 28.06 2.79 8.58 1.99 1.25 4.42 1.95 8.71 1.81 2.83 3.32 6.02 6.27 6.97 7.05 4.99 8.37 8.82 4.55 13.29 5.5 3.47 5.3 7.58 7.94 6.7 4.77 2.31 6.07 7.91 4.52 2.59 3.97 4.29 2.88 5.13 5.3 3.77 4.59 4.9 6.03
8.26 15.45 14.13 6.73 52.44 52.4 64.04 60.37 18.8 27.8 34.55 29.17 22.85 11.13 27.98 9.81 25.19 29.87 16.56 24.29 25.6 25.1 10.39 13.95 42.98 33.49 35.56 19.79 18.43 23.84 26.89 28.32 24.32 19.54 10.24 20.52 28.41 19.9 14.77 22.29 19.92 19.16 26.22 23.14 20.16 20.07 25.46 24.13
17.76 18.52 30.97 8.32 108.16 57.4 42.04 45.72 25.16 28.06 23.55 20.45 18.87 2.96 30.08 15.62 31.23 16.0 48.23 41.74 41.13 36.63 17.22 17.41 33.24 18.04 29.86 32.36 22.28 26.48 32.48 31.61 23.95 22.61 22.95 26.66 33.24 23.4 10.3 10.84 8.18 5.15 18.11 23.13 12.32 24.21 31.3 37.74
13.73 16.83 21.83 5.94 44.9 46.84 41.92 39.25 16.37 21.95 29.55 29.59 21.48 9.81 20.09 12.05 24.71 17.97 20.66 22.54 23.47 20.89 20.64 14.28 27.96 26.16 33.53 16.25 13.64 15.35 21.26 20.9 18.79 14.84 16.77 18.19 21.61 15.07 9.75 14.28 16.46 14.1 17.26 14.53 12.58 13.74 17.36 18.67
15.84 8.7 16.75 10.15 35.68 29.09 29.55 24.24 8.74 15.03 10.22 8.97 14.14 8.34 14.52 6.72 10.22 7.53 22.98 21.68 23.92 17.49 9.29 6.34 21.79 10.15 22.5 14.84 12.19 11.92 13.9 14.69 14.35 12.02 12.49 14.26 16.29 12.31 8.13 11.66 11.68 9.56 14.5 12.85 11.56 11.62 11.12 13.91
12.02 24.5 39.0 12.9 44.29 40.69 34.26 36.27 20.8 18.61 20.75 20.83 8.89 1.96 14.92 24.42 20.7 15.75 23.97 25.61 28.2 26.04 8.26 6.3 21.33 17.92 15.58 15.64 13.72 14.54 22.44 21.09 15.06 14.44 12.37 16.56 17.27 14.02 5.68 6.0 5.71 4.17 9.36 11.74 7.91 13.48 19.81 17.7
3.21 5.73 9.51 2.24 13.67 22.56 25.67 25.13 4.0 9.51 22.25 20.4 10.23 5.01 10.89 6.38 3.74 4.69 7.11 10.01 8.9 7.38 3.18 2.92 11.66 6.74 18.9 7.8 8.02 7.03 8.47 19.23 6.8 5.64 9.09 7.05 10.73 6.52 3.15 5.66 6.47 5.22 5.69 5.27 4.52 6.09 4.48 8.36
6.76 3.19 7.78 4.49 24.42 9.99 7.5 9.1 8.23 8.85 6.22 5.96 5.87 2.8 8.37 3.12 9.73 6.02 10.6 11.23 9.88 8.82 9.78 5.53 9.59 7.95 11.73 7.45 6.64 6.46 8.02 8.63 7.94 7.39 3.36 7.33 8.09 9.03 4.26 5.28 3.11 3.72 5.91 6.31 5.84 8.73 8.24 7.66
8.2 9.0 24.05 20.01 34.04 81.42 62.37 62.95 10.33 15.32 34.05 31.19 10.63 7.36 15.98 8.29 9.2 9.57 16.06 20.95 21.7 17.73 3.2 4.1 21.62 8.81 38.4 15.07 9.24 15.3 15.34 24.6 16.97 13.58 7.82 16.41 17.35 12.58 7.58 15.25 13.09 9.97 18.21 15.84 11.95 11.64 15.5 17.82
4.8 7.56 11.55 4.4 23.17 35.76 36.29 30.94 10.44 13.83 14.07 14.0 10.24 7.29 10.71 12.94 8.97 9.29 15.85 17.29 13.86 11.0 5.36 6.12 26.11 5.43 23.82 14.04 24.58 11.38 16.39 23.08 13.16 11.31 17.71 18.17 15.07 11.81 7.17 9.95 12.11 7.68 8.95 8.66 9.66 10.67 10.24 18.8
11.77 12.65 14.66 2.26 42.52 40.91 43.52 37.79 15.17 23.95 31.1 33.05 24.24 11.64 22.6 4.13 10.47 11.64 23.74 26.09 20.36 16.36 11.02 7.25 31.27 18.01 30.87 19.95 12.33 15.44 19.53 21.26 14.12 12.46 10.33 15.34 18.43 19.47 6.55 13.84 13.75 10.54 16.73 13.34 9.69 19.15 15.42 19.95
6.25 17.66 21.76 29.19 71.21 32.98 42.06 36.16 15.25 23.09 31.99 32.97 21.91 12.56 17.03 11.36 18.84 14.99 34.61 34.99 29.49 29.65 32.03 13.67 35.54 18.41 28.81 18.31 12.6 16.25 20.28 20.6 14.85 16.86 13.54 12.39 18.4 20.69 8.86 14.64 11.0 13.97 18.24 18.37 13.16 21.89 22.59 14.63
18.35 31.34 47.85 14.06 95.16 64.29 53.62 77.65 15.6 24.29 20.75 18.25 6.79 0.68 20.41 14.66 32.12 18.95 19.84 32.74 39.13 39.22 1.98 16.09 19.97 11.44 17.49 5.94 5.33 11.13 13.84 25.5 7.06 8.13 1.79 7.76 9.65 19.85 1.5 5.51 6.53 3.76 9.67 12.12 2.72 18.9 13.02 16.2
16.04 23.94 29.02 19.21 80.63 50.98 45.12 40.96 18.7 20.81 33.44 35.72 16.43 6.86 19.56 15.91 19.06 14.49 30.42 37.36 28.74 20.39 22.44 4.96 32.54 20.18 45.92 21.12 13.6 17.98 23.25 23.49 15.54 13.39 19.42 20.44 20.42 20.24 6.82 11.52 9.42 6.68 13.5 13.77 8.76 19.75 15.57 19.36
2.72 2.52 5.68 15.86 26.6 40.19 42.5 42.64 4.65 10.65 10.26 10.4 10.99 6.55 10.82 4.84 5.24 5.3 8.51 11.21 9.77 8.57 5.27 8.24 19.87 8.02 27.09 10.38 8.76 8.88 11.21 11.98 9.94 8.72 10.05 11.48 11.19 6.48 5.2 8.78 9.15 8.07 10.52 9.39 7.95 5.92 9.51 9.81
6.76 7.83 18.39 5.05 50.12 34.74 34.43 33.3 6.2 15.13 20.53 18.2 11.46 6.18 15.31 6.21 7.54 7.29 27.28 28.83 27.28 26.0 8.96 8.72 24.82 6.68 28.85 14.88 11.28 10.9 13.3 19.03 14.98 13.34 4.81 15.2 16.05 11.77 8.36 12.93 11.31 10.64 15.32 13.64 11.42 10.75 15.15 11.57
21.7 18.83 19.17 11.28 71.9 56.43 52.76 50.79 22.3 25.57 25.1 28.84 24.63 25.48 31.54 10.63 13.5 19.52 26.07 31.54 28.95 29.85 21.4 22.47 45.64 19.68 38.83 21.89 21.13 15.99 22.8 16.28 21.53 18.54 28.62 20.9 22.51 22.53 12.44 18.97 30.46 23.76 25.3 19.53 19.46 21.76 19.17 22.17

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)