Heatmap: Cluster_221 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_970V3.1	-0.39	0.87	0.29	-1.9	-0.45	1.11	1.55	1.8	0.47	0.17	-4.54	-5.1	-0.97	-1.87	-0.12	-1.18	0.24	-0.39	1.0	0.78	0.85	0.29	1.2	-1.97	-0.07	-0.98	-2.24	0.85	-0.83	-0.09	0.09	-0.92	-0.4	0.53	-0.56	0.48	-0.04	-0.15	-0.92	-1.09	-2.91	-2.66	-1.04	-0.96	-0.84	-0.01	0.18	-0.05
Pp3c11_19180V3.1	-1.51	-1.3	-0.6	-2.42	-0.24	-0.09	0.52	0.6	-1.52	0.44	-0.36	-0.4	0.08	0.52	0.28	-0.42	-0.28	-0.52	0.41	0.67	0.6	0.26	0.76	-2.01	0.36	-1.23	-0.1	-0.52	-0.32	-0.29	-0.24	-0.37	0.26	0.19	0.57	0.23	-0.28	-0.0	0.11	0.28	0.53	0.43	0.62	0.09	0.11	-0.05	-0.09	-0.3
Pp3c11_23530V3.1	-0.91	0.26	-0.4	-0.13	-0.41	0.68	1.3	0.77	-0.35	0.25	-0.98	-0.77	-0.12	-1.02	-0.28	-0.73	0.06	0.41	0.93	1.08	0.58	0.11	-0.84	-0.84	0.57	-0.14	0.92	0.27	-0.88	-0.17	0.06	0.14	0.01	0.03	-1.49	-0.73	0.26	0.53	-1.31	-0.19	-0.69	-0.94	-0.38	-0.5	-0.53	0.53	-1.02	-0.18
Pp3c11_24600V3.1	-0.07	0.37	0.59	-1.13	0.21	-0.45	-0.63	-0.57	-0.54	-0.02	-2.12	-2.01	0.01	-0.1	0.12	-0.6	1.23	0.56	0.66	0.85	0.56	0.38	1.25	-0.35	0.36	0.53	0.02	-0.76	-0.54	-0.3	-0.67	-1.35	-0.15	-0.3	-1.31	-0.92	0.06	0.33	-0.66	0.05	-0.06	0.06	0.31	0.02	0.19	0.36	-0.82	-0.18
Pp3c11_25340V3.1	-1.81	-2.01	-0.89	-2.99	-1.81	0.74	0.96	1.17	-1.68	0.7	-1.68	-1.48	-0.3	-1.09	0.34	-1.77	-0.75	-1.21	-0.1	0.02	0.28	-0.07	0.6	-1.32	0.08	-1.52	0.15	0.32	-0.3	0.16	0.74	0.51	0.58	0.17	-1.31	0.15	0.74	0.55	-0.73	0.38	0.28	-0.37	0.62	0.44	-0.07	0.56	0.63	0.38
Pp3c12_14690V3.1	-1.26	-0.24	0.15	-1.09	-0.2	0.34	1.12	0.89	-0.92	0.66	-2.64	-2.6	0.06	-1.2	-0.06	-1.63	0.06	-0.19	-0.11	0.04	0.36	0.52	-2.28	-0.67	0.47	-0.58	-0.46	0.31	0.09	-0.01	0.76	-0.16	0.39	0.3	-0.51	0.4	0.66	0.57	-0.56	0.05	-0.33	-0.5	0.24	-0.01	0.05	0.57	0.37	-0.2
Pp3c12_15830V3.1	-0.72	-1.26	-0.48	-1.23	0.4	0.66	1.08	1.0	-0.76	0.67	-2.46	-2.62	0.25	-0.86	0.26	-2.05	-0.2	-0.78	-0.06	-0.04	0.36	0.29	-2.41	0.02	0.1	-0.23	-0.79	0.2	-0.58	-0.02	0.53	-0.33	0.46	0.28	-0.23	0.14	0.32	0.6	-0.34	0.14	0.12	0.05	0.35	0.18	-0.26	0.58	0.37	0.14
Pp3c12_9961V3.1	-4.65	-1.72	-1.99	-2.66	-3.02	-1.64	-2.18	-1.57	-4.3	1.24	-8.02	-5.07	-0.89	-1.98	0.59	-2.4	0.66	-1.56	2.13	2.15	1.23	0.11	-1.94	-4.06	-1.13	-2.42	-1.26	-0.08	-2.09	0.46	0.98	-1.61	0.16	-0.15	-2.69	1.19	1.07	0.44	-1.18	0.11	0.44	1.04	0.34	-0.24	-0.71	0.5	0.5	1.33
Pp3c14_15250V3.1	-0.84	-0.04	0.17	-1.5	1.07	-0.98	-1.14	-0.67	-0.4	0.28	-1.22	-1.09	-0.19	-1.2	0.37	-0.11	0.82	0.42	0.87	0.86	1.26	1.44	0.39	0.47	0.09	-0.96	-0.57	-0.44	-0.57	-0.07	-0.28	-0.98	-0.09	-0.01	-0.85	-0.93	-0.59	0.35	-1.47	0.2	-0.45	-0.79	0.36	0.26	0.19	0.34	-0.4	-0.0
Pp3c14_15890V3.1	0.42	-0.59	-0.7	-2.88	-0.33	0.16	0.8	0.65	-0.0	0.62	-1.31	-1.22	0.26	-0.03	-0.34	-0.71	-0.98	-0.82	0.37	0.31	0.14	-0.33	-1.54	-2.16	-0.27	-0.88	0.38	0.16	-0.16	0.26	0.78	0.41	0.61	0.46	-1.31	-0.16	0.53	1.0	-0.35	0.19	-0.06	-0.61	0.27	-0.03	-0.12	0.92	0.18	-0.35
Pp3c14_20870V3.1	-0.5	-0.79	-0.14	-1.07	0.52	0.86	0.87	0.76	-0.82	0.28	-1.85	-2.06	-0.67	-1.24	0.12	-0.94	-0.48	-0.56	-0.0	0.6	0.28	-0.1	-0.55	-1.35	-0.2	-1.39	-0.65	0.33	-0.73	0.39	0.42	0.66	0.68	0.27	-1.35	0.04	0.46	0.25	-0.33	0.46	-0.33	-0.63	0.59	0.67	0.46	0.3	0.6	-0.2
Pp3c15_12420V3.1	-0.51	-0.88	-0.17	-0.94	-1.59	0.35	0.87	0.77	-0.92	0.25	-1.34	-1.38	-0.59	-2.02	-0.16	-0.51	-0.1	-0.56	0.52	1.04	1.02	0.6	0.22	0.16	0.45	-1.56	-0.19	0.39	-0.33	0.18	0.53	0.09	0.29	0.21	-3.19	0.11	0.29	0.29	-0.54	-0.02	-0.61	-0.92	0.37	0.4	0.01	0.22	0.44	-0.12
Pp3c15_23780V3.1	0.1	-0.47	-0.45	-2.51	1.04	-0.32	-0.29	-0.11	-0.08	-0.26	-4.39	-3.99	-1.11	-0.78	-0.11	0.0	0.98	-0.25	0.87	1.32	2.12	1.21	1.18	-1.96	0.13	-1.31	-1.82	0.07	-1.05	0.05	-0.4	-1.88	0.13	-0.01	-0.79	-0.71	-0.39	-0.08	-0.67	0.0	-0.37	-0.46	0.46	0.05	0.06	-0.12	-0.32	-0.23
Pp3c16_8370V3.1	-1.4	-2.41	-1.27	-3.76	-0.54	0.88	1.05	1.26	-0.71	0.27	-0.62	-0.44	-0.14	-0.6	0.11	-1.06	-1.37	-1.44	0.04	0.23	0.08	-0.15	0.43	-2.35	-0.05	-1.17	0.29	0.91	0.21	0.21	0.79	-0.17	0.69	0.38	-0.75	0.16	0.63	0.57	-0.66	0.02	-0.7	-0.89	0.2	0.24	0.28	0.49	0.35	0.03
Pp3c17_16690V3.1	-0.94	-0.46	0.22	-1.85	0.2	0.38	0.97	0.94	-0.74	0.02	-1.72	-1.8	-0.95	-2.1	-0.14	-1.17	0.23	-0.25	0.71	0.6	0.84	0.68	-1.37	0.99	-0.08	-0.8	-0.82	0.64	0.3	0.14	0.29	-0.06	0.17	0.52	-0.59	0.11	0.16	0.02	-0.29	-0.15	-1.3	-1.13	-0.05	0.35	-0.21	-0.03	0.73	-0.29
Pp3c17_18640V3.1	-1.29	-1.22	-0.74	-3.91	-0.68	0.94	1.63	1.62	-0.65	0.26	-1.04	-1.17	-0.51	-1.51	0.26	-2.2	-0.88	-1.99	0.61	0.68	0.68	0.18	1.04	-2.84	-0.16	-2.28	-0.16	0.06	-0.67	-0.08	0.1	0.18	0.45	-0.08	-1.31	-0.24	0.18	0.14	-0.72	0.49	-0.17	-0.61	0.81	0.17	0.26	0.15	0.29	0.14
Pp3c17_2240V3.1	-0.69	-0.71	0.09	-2.02	1.25	-0.49	-0.46	-0.5	-1.38	0.59	-2.72	-2.83	0.06	-0.97	0.01	-2.07	-0.24	0.5	0.44	0.73	0.98	1.47	-1.44	0.91	0.15	-2.94	-2.97	0.07	-0.61	0.05	0.51	-0.66	0.5	0.38	-0.53	0.19	0.26	0.42	-0.21	0.47	-0.9	-0.71	0.5	0.19	0.28	0.4	0.3	-0.49
Pp3c17_23220V3.1	-0.52	-0.14	-0.04	-0.87	-0.94	0.74	0.93	0.92	-0.51	0.36	-1.15	-1.48	-0.38	-1.54	-0.09	0.62	0.34	0.13	0.97	0.86	0.78	0.49	-1.48	-1.58	0.23	-1.11	-0.66	0.16	0.29	0.03	0.21	-0.39	0.06	0.27	-0.15	0.11	-0.05	0.57	-0.86	-0.21	-1.09	-1.4	-0.06	0.09	-0.22	0.57	-0.01	-0.53
Pp3c17_2340V3.1	-1.22	-0.86	-0.28	-2.37	-0.1	0.62	1.08	1.14	-0.4	0.51	-1.45	-1.29	-0.78	-2.19	-0.17	-0.81	-0.15	-1.0	0.32	0.59	0.87	0.55	0.02	-0.85	0.34	-1.94	-0.52	0.26	-0.37	0.07	0.41	0.13	0.68	0.26	-1.15	0.04	0.31	0.37	-0.91	0.19	-0.52	-1.1	0.71	0.43	0.12	0.46	0.46	-0.23
Pp3c18_12020V3.1	-0.08	-0.36	0.26	-2.31	0.0	0.54	1.0	1.17	-0.21	0.33	-3.19	-3.21	-0.63	-1.4	-0.32	-1.57	-0.15	-0.34	-0.19	0.28	-0.07	-0.61	-0.94	-2.56	-0.27	-1.28	-0.54	0.91	-0.49	0.26	0.54	-0.17	0.53	0.56	-1.43	-0.08	0.78	1.2	-0.57	0.17	-0.29	-0.44	0.11	0.25	0.02	1.14	0.49	0.06
Pp3c19_11010V3.1	-0.73	0.37	0.82	-3.15	1.04	1.65	1.06	1.3	0.32	0.73	-3.41	-3.34	-0.83	-2.08	0.23	-0.1	0.29	-1.22	0.75	1.0	0.7	-0.17	-0.67	-3.4	-1.12	-2.64	-3.81	1.05	-0.2	-0.01	0.49	0.59	0.2	-0.1	-1.61	-0.55	0.57	0.15	-1.13	-0.36	-3.13	-2.89	-0.34	-0.26	-0.13	0.03	0.06	-0.76
Pp3c19_15990V3.1	-0.33	0.3	0.56	-1.1	-0.68	0.34	0.9	1.18	0.35	0.06	-1.29	-1.2	-0.66	-1.3	-0.36	-0.28	0.33	-0.39	0.68	0.4	0.27	0.12	0.19	-1.52	0.06	-1.07	-0.37	0.4	0.2	0.04	0.33	0.43	0.21	0.29	-0.6	-0.19	0.16	0.16	-0.69	-0.29	-0.71	-0.8	-0.07	0.12	-0.04	0.25	0.47	-0.41
Pp3c19_20890V3.1	-0.45	0.1	0.09	-1.7	-1.87	0.59	1.31	1.29	0.21	0.42	-0.96	-0.97	-0.01	-0.92	0.01	-1.07	-0.64	0.11	-0.9	-0.53	-0.44	0.33	-2.75	-0.34	0.7	-0.22	0.09	0.38	0.1	0.11	0.71	-0.01	0.19	0.44	0.44	0.37	0.31	-0.05	-0.5	-0.4	-0.16	-0.44	-0.25	-0.2	-0.76	-0.1	0.41	0.12
Pp3c19_4024V3.1	-0.45	-2.94	-2.7	-2.69	-0.99	1.91	2.36	2.2	-3.05	0.35	-3.52	-4.27	-0.42	-1.17	0.07	-2.15	-1.39	-1.86	-0.15	0.95	1.34	0.52	-1.16	-2.8	1.13	-2.0	0.71	-0.12	-0.94	-0.6	0.32	-1.24	-0.32	-0.52	-0.97	-0.08	-0.03	0.49	-1.25	-0.17	-0.72	-0.73	0.13	-0.6	-0.98	0.46	-0.54	-0.42
Pp3c19_4870V3.1	-0.95	-0.87	-0.43	-1.83	1.63	-0.22	-0.73	-0.68	-0.35	0.26	-4.42	-4.55	-0.69	-0.99	0.0	-1.3	-0.27	-0.58	-0.02	0.02	0.41	0.47	-1.11	1.69	-0.37	-2.45	-1.86	0.44	0.26	0.39	0.59	-1.63	0.72	0.46	-0.01	-0.5	-0.01	0.77	-0.52	0.61	-0.01	0.07	0.72	0.35	0.35	0.83	-0.14	-0.43
Pp3c1_2170V3.1	-0.52	-0.88	-1.64	-1.26	0.62	-0.78	-0.7	-0.7	-0.87	-0.2	-2.57	-2.78	-0.55	-1.16	0.19	-1.05	-0.01	-0.38	0.66	1.4	1.33	0.67	1.0	-0.87	0.43	-1.65	-0.88	0.24	0.41	0.28	0.51	-1.61	0.42	0.39	0.28	-0.17	0.27	0.08	-0.27	0.34	-0.4	-0.6	0.53	0.36	0.31	0.11	0.25	0.13
Pp3c1_2210V3.1	-1.22	-1.41	-2.7	-2.5	-0.98	-1.07	0.36	0.16	-1.38	0.32	-4.27	-4.07	-0.46	-1.5	0.73	-1.95	-0.71	-1.5	0.38	1.45	1.84	1.06	-0.77	-0.44	0.48	-3.29	-1.79	0.48	-0.24	0.37	0.6	-2.04	0.54	0.35	0.07	-0.12	0.19	0.41	-0.55	0.74	-0.06	-0.4	0.91	0.52	0.41	0.38	0.54	0.07
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Pp3c5_7330V3.1	-2.96	-1.1	-0.05	-0.43	0.74	0.56	0.99	0.75	-4.63	0.29	-3.5	-3.37	-0.44	-1.63	0.35	-2.45	-0.32	-0.99	-0.06	0.44	0.29	0.55	-0.92	-0.35	0.29	-1.23	0.27	0.55	-1.13	0.15	0.42	0.01	0.4	0.31	-2.35	0.17	0.6	0.43	-0.56	0.24	0.61	0.11	0.44	0.54	-0.04	0.49	0.4	0.44
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Pp3c6_7400V3.1	-1.74	-0.02	0.5	-3.95	0.17	-1.09	-0.85	-0.92	-1.18	0.07	-6.97	-7.78	-0.58	-2.07	0.44	-2.56	1.32	0.01	1.28	1.23	1.03	1.04	1.97	-0.05	-1.69	-2.32	-4.64	0.06	-1.19	-0.08	0.45	-3.57	0.36	0.26	-0.43	-1.23	0.04	0.31	-0.53	0.27	-1.21	-0.74	1.04	0.61	0.48	0.3	-0.12	-0.03
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Pp3c7_3170V3.1	-0.34	-0.14	0.7	-3.38	-1.42	0.72	1.15	1.26	-0.35	0.44	-1.73	-2.21	-0.06	-1.84	-0.38	-1.31	0.21	-0.83	1.55	1.14	1.1	0.6	-2.19	-2.31	-0.0	-2.14	-0.8	0.15	-0.47	0.18	0.49	0.19	0.42	0.37	-1.82	0.6	0.42	0.1	-0.88	-0.45	-1.56	-1.85	-0.1	-0.01	-0.05	0.04	0.35	-0.47
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Pp3c8_4500V3.1	-0.86	-1.23	-1.62	-2.15	1.21	0.45	0.08	-0.16	0.39	-0.19	-1.97	-2.15	-0.21	-0.5	-0.79	-1.46	0.15	0.28	1.22	0.83	-0.19	0.04	0.05	0.35	0.51	-1.33	0.18	0.52	-0.39	0.27	-0.39	-1.49	-0.37	-0.14	-0.21	-0.79	0.05	0.23	-0.75	0.06	0.66	0.51	0.7	0.66	-0.97	0.22	-0.06	0.79
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Pp3c9_21750V3.1	-0.05	-1.09	-0.5	-1.87	-0.64	1.41	1.73	1.51	-0.25	0.45	-1.19	-1.02	-0.3	-1.05	0.31	-1.22	-1.57	-0.9	0.55	0.85	0.72	0.34	-0.2	-2.5	0.67	-1.67	0.02	-0.12	-0.86	-0.35	0.36	-0.35	0.15	-0.37	-0.75	-0.19	0.28	0.23	-0.96	-0.15	-0.43	-0.7	0.46	-0.04	-0.3	0.21	0.08	-0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.