Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_16540V3.1	-1.0	-0.23	0.12	-1.06	1.14	-0.08	-0.37	-0.2	-1.44	0.02	-1.19	-1.39	-0.2	0.08	-0.67	-0.46	0.26	0.81	0.04	0.34	0.56	0.34	-1.39	1.09	1.34	-0.3	0.22	-0.76	-0.91	-0.55	-0.25	-0.7	0.16	-0.09	-1.41	-0.52	-0.43	-0.13	-0.17	0.37	0.77	0.92	0.57	-0.13	0.18	-0.07	-0.3	-0.56
Pp3c10_4240V3.1	-2.55	-1.96	-2.76	-3.09	-1.06	0.05	0.03	0.13	-1.65	0.78	-2.0	-2.35	1.36	0.49	0.86	-3.68	-1.44	0.62	-1.85	-0.06	1.15	1.5	-3.52	0.81	1.82	-0.14	-0.0	-3.83	-3.77	-0.03	-0.04	-1.17	0.12	-0.62	-2.39	-0.92	0.29	1.06	-1.03	0.87	-0.29	0.06	0.69	0.26	0.22	0.98	-0.0	-1.22
Pp3c11_19190V3.1	0.13	0.07	-0.37	-1.09	0.94	0.55	0.01	0.4	0.13	1.13	-0.78	-0.91	0.81	0.61	0.8	-0.36	-0.11	0.71	-0.73	-0.32	0.06	0.53	-2.63	-0.41	0.41	0.42	-0.13	-1.1	-1.22	-0.71	-0.32	0.81	0.13	-0.46	-1.52	-1.0	0.05	0.48	-0.82	-0.13	-0.64	-0.7	-0.1	-0.22	0.27	0.47	-0.3	-0.58
Pp3c11_6670V3.1	-0.77	0.05	0.0	-2.27	0.69	-0.27	-1.06	-0.77	-2.44	0.28	-3.16	-3.31	0.01	-0.21	-0.13	-0.97	0.26	0.43	0.32	0.48	0.75	0.85	-1.79	-0.06	1.04	-0.01	0.9	0.29	-0.46	-0.33	0.23	0.28	0.3	0.44	-1.41	0.04	0.45	0.36	0.1	0.18	-0.52	-0.52	0.03	0.25	0.16	0.39	0.33	-0.59
Pp3c12_10070V3.1	-0.34	-0.41	-0.32	-2.32	0.12	-0.26	0.18	0.54	-2.32	0.68	-4.53	-4.32	0.26	-0.64	0.54	-2.36	0.39	1.08	0.35	0.72	1.02	1.39	-0.44	-0.03	1.31	-0.47	0.42	-0.46	-1.74	-0.63	0.15	-2.75	-0.42	-0.5	-0.75	-1.05	-0.24	0.9	-1.56	0.51	-0.29	0.02	0.8	-0.09	-1.03	0.92	-0.28	-0.66
Pp3c12_24880V3.1	-1.44	-1.88	0.81	-1.76	0.0	0.46	0.27	0.31	-0.33	0.19	-2.5	-2.29	-0.09	-0.19	-0.05	0.74	0.77	0.44	0.96	0.87	1.0	0.77	0.57	-1.25	-0.12	0.39	-0.23	-0.43	-1.22	-0.14	-0.25	-0.38	-0.32	-0.21	-1.81	-0.75	-0.05	0.71	-0.47	-0.09	-0.32	-0.06	0.04	-0.19	-0.47	0.71	-0.24	-0.26
Pp3c12_660V3.1	-3.66	-0.57	-0.57	-1.4	0.96	-0.74	-1.85	-1.93	-1.71	-0.33	-3.17	-3.24	-0.66	0.21	-0.54	0.11	-0.19	1.17	-0.73	0.2	0.36	0.38	-1.14	1.91	0.66	-0.37	-0.31	-0.39	-0.93	0.22	-0.64	-0.53	0.41	0.24	-0.9	-1.23	0.03	0.37	0.27	0.97	0.17	0.39	0.72	0.37	1.08	0.3	-0.44	0.29
Pp3c12_7740V3.1	-0.03	0.33	0.5	-0.52	1.06	0.29	0.07	-0.09	-0.87	0.32	0.04	-0.08	0.05	-0.36	-0.35	0.2	0.58	0.13	0.31	0.76	0.38	0.24	-0.86	-1.04	0.71	0.48	0.2	-0.51	-0.55	-0.35	-0.11	0.4	-0.24	-0.46	0.3	-0.18	-0.08	0.24	-1.26	-0.65	-0.33	-0.36	-0.59	-0.45	-0.69	0.28	-0.36	-0.44
Pp3c12_8780V3.1	-1.0	-0.35	0.01	-0.54	-0.1	0.33	0.57	0.56	-0.14	0.39	-1.89	-1.86	0.12	-0.28	0.29	-1.28	0.31	0.36	0.3	0.72	0.84	0.75	-1.13	0.12	0.72	-0.05	0.06	-0.15	-0.49	-0.31	0.02	-0.35	0.07	-0.16	-0.24	-0.28	0.04	0.25	-0.65	-0.14	0.14	0.11	0.14	-0.22	-0.45	0.26	-0.03	-0.26
Pp3c13_14430V3.1	-1.07	0.05	0.62	-2.99	0.53	-0.39	-0.55	-0.2	-1.02	0.76	-0.75	-0.59	0.21	-1.14	0.43	-0.92	0.48	1.53	0.9	0.58	1.07	1.14	-0.24	-0.3	1.86	-0.09	0.33	-1.04	-1.73	-0.8	-0.35	-0.15	-0.4	-0.68	-2.28	-0.89	-0.29	0.15	-1.44	-0.34	-0.84	-1.14	0.3	-0.68	-0.67	0.14	-0.08	-0.19
Pp3c13_15340V3.1	-0.51	0.28	1.37	-0.31	1.35	1.39	1.47	1.09	-0.48	0.37	-4.02	-5.15	0.11	-1.77	0.44	2.02	0.87	1.67	-4.0	-0.18	0.42	0.45	-2.87	0.67	1.17	1.37	0.19	-3.79	-4.17	-2.38	-1.98	-3.23	-2.86	-3.94	-5.39	-3.55	-3.09	-0.53	-3.58	-1.29	0.46	-0.32	-0.58	-0.68	-2.75	-0.56	-1.67	-1.12
Pp3c13_3620V3.1	-0.38	0.12	-0.13	-1.61	0.8	0.32	-0.01	0.21	-0.11	0.29	-1.48	-1.34	0.05	-0.79	0.25	-1.26	0.54	0.04	0.73	0.9	0.44	0.35	-0.49	-1.6	0.04	0.38	0.07	0.31	-0.62	-0.06	0.02	-0.1	-0.08	0.13	-0.88	0.01	0.52	0.46	-0.6	-0.15	-0.48	-0.46	-0.07	0.24	-0.04	0.4	0.01	-0.08
Pp3c13_5080V3.1	-0.35	-0.27	-0.11	-4.22	0.74	1.1	0.84	0.53	0.35	0.39	-2.13	-2.04	0.35	-0.08	0.24	-0.78	0.32	-0.34	0.5	0.73	0.3	-0.15	-0.4	-2.4	0.38	0.08	0.21	0.58	-1.3	-0.14	0.29	0.3	-0.14	-0.09	-1.12	-0.14	0.4	0.53	-0.83	-0.25	-0.3	-0.73	-0.36	-0.45	-0.63	0.53	-0.1	0.01
Pp3c14_19320V3.1	-0.1	0.22	0.5	-1.5	-1.17	-0.85	0.15	0.07	0.41	0.37	-0.91	-0.65	0.45	-0.84	0.3	-0.36	0.31	-0.26	1.1	1.19	0.97	0.72	-1.25	-2.11	0.21	0.06	-0.25	-0.34	-0.55	0.22	-0.14	-0.01	-0.29	0.09	-0.12	-0.51	-0.08	0.52	-0.94	-0.28	-0.66	-0.36	-0.1	-0.14	-0.5	0.6	0.06	0.25
Pp3c14_22420V3.1	-	0.08	0.49	0.91	-0.38	0.68	-0.83	0.47	-2.42	1.55	-5.08	-5.79	0.64	-0.24	0.94	-2.11	-0.38	-0.27	0.07	-0.78	-0.73	-0.68	-	-2.36	0.02	-0.56	-0.71	0.8	-1.48	0.14	0.06	0.45	0.7	0.75	-1.15	0.42	0.91	0.81	-0.43	0.15	-0.18	-0.7	-0.21	-0.59	-0.28	1.02	-0.89	1.05
Pp3c14_5270V3.1	-0.72	-1.22	0.44	-1.88	0.79	0.92	0.79	0.65	-0.23	0.33	-1.64	-1.58	-0.11	-1.31	-0.21	-0.52	0.21	1.03	0.69	0.46	0.52	0.28	0.06	-1.86	1.14	-1.23	-0.29	0.35	-0.31	-0.22	0.3	0.39	0.03	-0.02	-0.9	0.12	0.34	0.24	-1.22	-0.29	-0.9	-0.95	-0.31	-0.21	-0.48	0.29	-0.02	-0.54
Pp3c14_9050V3.1	-1.78	0.12	0.48	-2.13	0.47	0.82	0.14	0.2	-0.45	0.83	-3.43	-3.52	0.37	0.62	0.5	-0.37	0.3	0.12	0.34	0.51	0.8	1.07	-0.11	-0.94	0.34	-0.13	-0.02	-0.48	-1.09	-0.37	0.03	-0.37	0.18	-0.14	-2.3	-0.06	-0.15	-0.01	-0.0	0.09	-0.42	-0.34	0.23	0.09	0.05	-0.01	0.15	-0.77
Pp3c15_12450V3.1	-0.82	-0.53	0.09	-4.14	-0.83	0.02	0.18	0.05	0.45	-0.1	-1.39	-1.66	-0.32	-0.76	-0.52	-3.47	-0.39	0.78	0.68	0.19	-0.33	-0.57	-1.85	-1.85	1.56	-0.74	0.18	1.05	-0.1	0.12	0.67	0.52	0.35	0.63	-1.53	0.46	1.18	0.4	-0.23	-0.29	-0.48	-0.83	-0.48	0.14	-0.09	0.38	0.27	0.4
Pp3c15_14570V3.1	-0.94	-0.27	-0.39	-0.89	0.73	0.49	-0.56	-0.12	-1.01	0.26	-1.6	-1.64	0.07	-0.23	-0.42	-1.04	0.58	1.03	0.36	0.35	0.17	0.44	-2.23	0.39	1.13	-0.53	-0.12	-0.43	-0.41	-0.35	-0.18	-0.37	0.34	0.24	-0.39	0.2	-0.07	0.5	-0.56	0.33	0.35	0.22	0.37	0.12	-0.07	0.39	-0.15	-0.46
Pp3c15_4550V3.1	-0.22	-0.16	0.43	-1.74	1.26	-0.62	-0.49	-0.66	-0.6	0.1	-0.5	-0.55	0.19	-0.07	0.07	-0.14	0.4	0.77	0.22	0.39	0.41	0.31	0.69	-0.03	0.73	-0.04	0.3	-0.57	-0.51	-0.44	-0.34	-0.51	-0.08	-0.23	-0.54	-0.28	-0.32	0.27	-0.53	0.16	0.16	0.09	0.2	-0.09	-0.25	0.28	-0.4	-0.51
Pp3c15_6360V3.1	-0.03	0.33	0.33	-0.86	-0.45	0.44	0.62	0.56	-0.17	0.16	-2.73	-2.6	-0.07	-0.45	0.5	-0.61	0.48	1.71	0.18	0.8	0.84	0.76	-0.82	0.77	1.01	0.96	-0.54	-1.41	-0.49	-0.61	-0.67	-1.98	-0.54	-0.45	-1.65	-0.96	-0.45	-0.24	-0.57	-0.08	-0.0	0.18	0.08	-0.35	-0.46	-0.33	-0.68	-0.59
Pp3c16_11150V3.1	-1.4	-0.3	0.51	-2.29	0.9	-0.05	0.31	-0.25	-1.86	0.22	-1.24	-1.27	-0.01	-0.15	-0.23	-1.72	0.61	-1.21	1.23	0.71	0.81	0.11	0.8	-2.8	-0.23	-1.57	-0.48	0.12	-0.71	-0.18	-0.43	-0.53	0.5	0.48	-0.72	0.38	0.16	0.01	0.22	0.19	-0.29	0.12	0.49	0.27	0.7	-0.05	0.35	-0.24
Pp3c16_16010V3.1	0.39	0.39	-0.83	-1.2	-1.86	-0.6	0.81	0.11	0.4	0.99	-2.48	-1.76	0.69	-0.39	0.67	-0.14	0.29	0.9	1.71	1.78	1.43	1.17	-1.67	-0.52	-0.39	0.08	-0.49	-0.93	-2.06	-0.44	-0.25	0.06	-0.8	-1.22	-2.9	-0.92	-0.64	0.36	-1.56	-0.23	-1.76	-1.46	-0.1	-0.18	-1.12	0.18	0.03	-1.22
Pp3c16_17730V3.1	0.32	0.54	0.36	-1.77	0.48	0.42	0.75	0.41	0.3	1.43	0.9	1.07	0.97	-0.18	1.32	-1.54	0.35	-0.34	-0.23	0.07	0.95	1.18	-2.35	-1.51	-0.41	0.56	-1.64	-0.99	-2.25	-1.18	-0.71	-0.35	-0.09	-1.51	-1.66	-0.1	0.34	0.53	-1.99	-1.51	-3.23	-3.07	-0.68	-0.49	-0.34	0.5	-1.41	-0.8
Pp3c16_25190V3.1	-1.69	-0.51	0.89	-1.44	0.16	-0.17	-0.2	0.08	-0.06	0.46	-0.76	-0.85	0.41	-0.42	0.21	-1.18	0.53	0.02	0.9	0.4	-0.19	-0.21	-0.94	-1.53	0.4	0.44	0.26	0.18	-0.2	0.14	0.44	0.3	0.24	0.27	-0.87	-0.04	0.58	0.37	-0.97	-0.34	-0.38	-0.43	-0.07	-0.2	-0.22	0.52	-0.16	0.43
Pp3c16_5230V3.1	-0.36	-0.73	-0.72	-2.33	0.8	0.76	1.03	0.8	0.12	0.37	-1.97	-2.19	0.15	-0.58	0.07	-1.08	-0.13	0.72	-0.06	0.48	-0.05	0.28	-1.52	0.34	1.54	0.02	0.35	0.29	-0.83	-0.08	0.38	0.03	-0.03	0.2	-0.57	-0.61	0.66	0.0	-0.97	-0.41	-0.81	-1.02	-0.3	-0.27	-0.34	-0.03	-0.23	-0.21
Pp3c16_9310V3.1	-0.59	-0.48	-0.0	-1.89	1.15	1.1	0.58	0.4	-2.52	0.46	-2.31	-3.03	-0.11	-0.46	0.09	-1.85	0.01	1.17	0.11	0.47	0.16	0.46	-2.51	1.17	1.11	0.26	-0.07	0.28	-0.95	-0.53	0.19	-0.14	0.02	0.25	-1.44	0.48	0.47	0.18	-0.83	-0.75	-0.83	-0.85	-0.89	-0.16	-0.43	0.15	-0.01	-0.23
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Pp3c7_4340V3.1	-2.05	-1.95	-1.46	-3.54	-0.29	-1.06	-0.33	-0.31	-0.52	0.95	-0.36	-0.62	0.94	0.84	0.59	-2.09	-0.55	0.23	-0.8	-0.12	-0.16	0.74	-2.97	-0.35	0.63	0.44	-0.11	-0.02	-0.15	-0.03	0.35	-0.4	0.03	0.29	-0.8	0.75	0.14	0.43	0.46	0.39	0.2	0.35	0.51	0.36	-0.36	0.46	0.56	-0.54
Pp3c8_11610V3.1	0.58	0.08	0.49	-0.99	-1.17	-0.23	-0.48	-0.79	-0.52	0.22	-1.26	-0.99	0.27	-1.09	0.21	-0.04	0.65	0.13	0.99	0.81	0.9	0.53	-0.16	-0.95	0.06	0.27	-0.24	0.17	0.05	0.28	0.03	0.06	-0.23	0.08	-1.06	-0.47	0.26	0.68	-1.12	-0.4	-0.89	-0.61	-0.11	0.07	-0.34	0.72	-0.24	0.16
Pp3c8_12660V3.1	-	-	-2.51	-3.88	-1.34	-0.78	-2.38	-0.17	0.3	2.56	0.29	0.58	0.92	1.63	1.6	-0.17	-0.46	2.36	-0.17	0.2	-2.64	-1.45	-3.86	-3.81	0.39	0.27	-0.5	-1.3	-2.23	-0.91	-0.62	-0.91	-1.74	-1.75	-1.72	-2.28	-1.21	1.58	-2.05	-2.23	-0.48	-0.02	-0.73	-1.07	-0.31	1.69	-2.03	-0.36
Pp3c9_26010V3.1	-1.07	-0.27	0.01	-3.3	0.62	-0.49	-0.48	-0.6	-1.64	-0.21	-1.92	-1.86	-0.21	-0.07	-0.34	0.07	0.33	-0.3	1.04	0.67	0.44	0.27	0.67	-1.73	0.21	-1.05	0.31	0.4	-0.15	-0.09	-0.01	-0.22	0.07	0.37	-0.9	-0.15	0.24	0.38	0.06	0.38	0.58	0.47	0.39	0.31	0.2	0.46	0.1	-0.16
Pp3c9_8570V3.1	-2.3	-1.87	0.55	-4.21	-0.82	0.94	0.59	0.51	0.35	0.37	-2.03	-1.97	-0.47	-1.45	0.18	-	0.59	1.8	1.13	0.91	1.14	1.7	-1.01	-0.12	0.87	-0.28	-1.11	0.1	-1.52	-0.82	-0.05	-0.4	-0.06	-0.36	-2.64	-0.96	0.57	0.39	-1.19	-0.22	-1.48	-1.44	-0.26	-0.03	-0.5	0.51	-0.36	-0.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.