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Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-1.45 -0.07 0.37 -1.91 0.87 -0.79 -0.78 -0.68 -0.6 0.22 -2.12 -1.95 -0.26 -0.14 -0.28 -0.6 0.68 -0.68 0.41 0.29 0.58 0.55 -0.92 -2.12 -0.56 -0.85 -1.36 0.8 0.5 0.15 0.36 -0.34 0.3 0.6 0.28 0.67 0.15 0.22 0.23 0.35 -0.23 -0.28 0.39 0.55 0.22 0.24 0.57 -0.07
-0.36 -0.54 -0.36 -2.13 0.83 -0.95 -0.94 -0.99 -1.22 -0.16 -2.53 -2.31 -0.57 -1.56 -0.19 -0.1 0.81 -0.31 -0.07 -0.03 -0.48 -0.89 -2.05 -2.73 -1.22 -0.74 -1.3 1.56 0.26 0.8 0.48 0.55 0.78 0.76 0.97 0.79 1.07 0.66 0.18 -0.17 -1.26 -1.42 -0.31 0.77 0.08 0.61 0.82 -0.07
0.07 -0.9 -0.97 -1.85 1.38 -0.58 -0.8 -1.03 -0.95 -0.0 0.18 0.06 0.12 -0.02 -0.09 0.24 -0.64 -1.13 -0.22 0.01 0.05 -0.16 -2.01 -1.66 -0.29 -1.7 -0.04 0.68 0.5 0.02 0.11 0.4 0.41 0.54 0.15 0.93 0.36 -0.18 0.54 0.27 -0.33 -0.6 0.29 0.54 0.31 -0.15 0.43 0.21
-0.81 -0.11 -0.02 -1.84 0.47 -0.32 -0.57 -0.24 -0.21 0.3 -0.82 -0.8 -0.15 -0.91 -0.28 0.19 0.68 0.21 0.51 0.78 0.68 0.53 -1.72 -0.44 -0.44 -0.71 -1.14 0.33 0.48 0.1 0.63 -0.08 0.36 0.34 -0.64 0.19 0.6 0.21 -0.31 -0.1 -0.56 -0.53 0.14 0.16 0.02 0.2 0.62 -0.22
-1.6 -0.8 -0.62 -4.69 0.48 -0.46 -0.53 -0.61 -2.56 0.1 -0.56 -0.77 -0.34 -0.63 -0.07 -1.28 0.18 -0.83 0.22 0.39 -0.03 -0.14 0.11 -2.75 -0.05 -0.54 0.5 1.11 0.13 0.42 0.08 0.6 0.59 0.76 -0.14 0.58 0.47 0.18 0.14 0.32 -0.17 -0.5 0.27 0.57 0.4 0.21 0.61 0.45
-0.03 -0.91 0.75 -3.15 -0.69 0.04 -0.22 -0.51 0.1 -0.07 -2.35 -2.04 -0.91 -1.51 -0.11 -0.69 0.57 -0.8 0.57 0.66 0.67 0.38 0.68 -2.21 -0.82 -1.04 -1.03 0.94 0.28 0.42 0.22 0.02 0.26 0.89 0.18 0.29 -0.03 0.21 0.19 0.32 -1.48 -1.33 0.19 0.81 -0.11 0.22 0.9 0.06
-1.15 -1.0 -1.53 -3.62 0.83 -0.88 -0.7 -0.81 -1.21 -0.72 -1.13 -0.97 -0.91 -0.1 -0.27 -1.78 -0.65 -1.72 -0.01 -0.0 0.15 -0.37 0.81 -2.78 -1.28 -2.47 -1.19 1.44 1.26 0.6 -0.09 -0.05 0.43 0.87 0.58 0.63 0.38 -0.31 0.94 0.61 -0.2 -0.52 0.54 0.63 0.68 -0.3 0.82 0.79
-1.76 -0.95 -0.21 -2.42 1.65 -0.58 -0.53 -0.78 -0.8 -0.08 -0.58 -0.62 -0.53 -1.36 -0.32 -1.3 0.59 -1.16 0.88 0.84 1.02 0.5 -0.66 -2.0 -0.24 -1.58 -0.18 0.67 0.01 0.23 -0.02 0.31 0.54 0.46 -0.49 0.59 0.07 0.14 -0.27 0.17 -0.46 -0.75 0.35 0.35 0.26 0.11 0.46 0.34
-0.76 -0.63 -0.74 -1.52 1.69 0.67 -0.23 0.15 -0.46 -0.97 -0.5 -0.75 -1.64 -1.98 -1.54 -1.03 0.03 -3.84 1.35 0.76 0.07 -0.26 0.59 -5.24 -1.88 -2.67 -2.97 0.75 0.8 0.13 0.64 0.59 1.03 0.48 -0.93 0.49 0.37 0.42 -0.56 0.49 -0.68 -1.18 0.38 0.0 0.65 0.43 -0.16 -0.1
-3.47 -2.13 -1.11 -4.25 0.91 -0.35 -0.5 -0.35 -2.61 -0.68 -1.72 -1.71 -0.65 -0.71 -0.34 -1.53 -0.09 -2.55 0.4 0.12 -0.03 -0.59 1.32 0.25 -0.95 -2.29 -0.37 0.71 -1.37 0.62 -0.68 0.6 0.76 0.63 -0.23 1.11 -0.22 0.11 0.3 0.73 0.49 0.05 0.68 0.48 1.33 0.22 0.37 0.77
-1.32 -1.22 0.59 -2.49 0.85 -0.39 -0.38 -0.64 -2.8 0.39 -2.93 -3.1 0.03 -1.02 0.34 -2.34 -1.26 -0.82 0.17 -0.3 -0.45 0.14 -2.71 1.15 -0.23 -1.61 -1.5 1.2 0.81 0.42 0.91 0.48 0.79 0.8 0.01 1.17 1.08 0.29 0.09 -0.2 -1.9 -1.95 -0.13 -0.09 -0.32 0.29 0.86 0.36
-0.7 0.68 0.03 -0.9 0.01 0.35 0.09 0.01 -0.36 0.1 -3.14 -3.73 -0.38 -1.1 -0.06 -0.39 -0.12 -0.57 -0.22 0.04 0.27 0.21 -1.72 -2.58 -0.4 -0.79 -1.43 1.08 0.77 0.46 0.62 -0.18 0.32 0.91 0.32 -0.36 0.77 -0.04 0.33 0.2 -0.99 -0.74 0.28 0.66 0.45 -0.15 1.0 -0.23
-1.17 -0.97 0.2 -3.22 0.76 0.18 0.03 -0.19 -1.39 -0.21 -0.61 -0.66 -0.55 -1.61 -0.33 -1.3 1.04 -0.18 0.66 0.13 0.1 0.53 0.03 -1.35 0.65 -0.99 0.58 1.05 0.26 0.07 0.03 0.42 0.22 0.87 0.27 0.75 0.1 -0.31 -0.08 -0.36 -1.07 -1.33 -0.28 -0.01 -0.04 -0.23 0.46 0.21
-1.4 -1.07 -1.09 -1.31 1.28 -0.52 -0.61 -0.45 -1.54 -0.28 0.1 0.32 -0.99 -1.24 -0.49 -0.12 -0.47 -0.44 -0.66 0.07 0.25 -0.05 0.41 0.83 0.22 -1.24 0.12 0.54 -0.34 0.44 0.12 0.6 0.5 0.44 -0.77 0.43 -0.0 -0.27 -0.02 0.32 -0.55 -0.27 0.39 0.74 0.2 -0.33 1.08 0.17
-2.24 -1.29 0.16 -2.79 0.13 0.16 -0.24 -0.35 -1.48 0.06 0.05 0.17 -0.2 -0.67 -0.18 -1.2 0.83 -0.26 1.05 0.57 0.48 0.31 0.49 -1.58 -0.16 -0.77 0.38 0.52 -0.78 0.15 -0.41 0.55 0.29 0.38 -1.57 0.2 -0.17 0.25 -0.25 0.23 -0.22 -0.38 0.2 0.33 0.34 0.2 0.42 0.43
-0.54 0.11 -0.34 -1.42 -0.32 -0.05 -0.29 -0.29 -0.63 0.0 -4.31 -4.21 -0.55 -0.73 -0.09 -0.62 -0.13 -0.2 -0.51 0.17 0.59 0.21 -0.46 -0.94 -0.51 -0.91 -1.03 1.13 0.97 0.53 0.44 -0.37 0.33 0.87 -0.05 0.48 0.56 0.26 0.61 0.23 -1.23 -0.92 0.38 0.8 0.4 0.28 0.78 0.02
-0.36 -0.56 0.07 -2.82 1.43 -0.06 -0.41 -0.66 0.02 0.19 -0.88 -0.89 -0.12 -0.47 -0.38 -0.54 0.2 -0.85 0.4 0.42 0.5 0.39 -0.58 0.24 -0.06 -1.34 -0.21 0.23 0.36 0.15 -0.02 0.21 0.29 0.31 -0.02 0.15 0.05 -0.0 -0.45 0.25 -0.29 -0.27 0.37 0.23 0.12 0.01 0.31 0.22
-2.03 -1.16 -0.08 -5.19 1.33 -0.27 -0.45 -0.22 -1.71 0.07 0.69 0.58 -1.21 -3.06 0.06 -2.12 0.19 -0.81 0.53 0.42 -0.09 -0.13 -0.23 -2.68 -0.67 -1.29 -0.55 1.34 -1.24 0.7 -0.06 0.89 0.49 0.93 -2.88 1.09 -0.12 -0.27 -0.39 0.07 -2.0 -1.92 -0.05 1.01 -0.08 -0.17 1.55 0.3
-0.63 -0.34 0.45 -1.3 -0.37 0.23 0.25 0.09 -0.12 -0.13 -2.69 -2.97 -0.96 -1.62 -0.56 -0.83 0.94 -0.74 0.95 0.92 0.47 0.0 0.02 -2.63 -1.02 -1.76 -1.3 1.21 -0.58 0.47 0.24 0.28 0.68 0.76 -1.04 0.41 0.43 0.34 -0.18 0.21 -1.24 -1.24 0.09 0.85 0.22 0.19 0.87 -0.12
-1.1 -0.38 -0.24 -3.07 1.81 -0.41 -0.55 -0.83 -0.58 -0.42 -1.2 -1.19 -0.39 -0.33 -0.5 -1.51 0.55 -1.59 1.01 1.02 0.84 0.12 1.42 -2.48 -0.51 -1.63 -0.02 0.67 -0.63 0.08 -0.16 0.25 0.31 0.29 -1.11 -0.28 0.04 -0.39 -0.27 0.56 -0.14 -0.38 0.65 0.33 0.33 -0.46 0.3 -0.22
-0.01 -0.26 -0.04 -1.74 -0.64 -1.27 -1.55 -1.98 -0.44 -0.1 -1.89 -1.77 -0.43 -0.19 -0.11 -0.56 0.43 0.17 0.15 -0.08 -0.13 -0.06 -0.62 0.55 -0.02 -0.63 -0.35 0.99 0.58 0.42 0.13 0.31 0.43 0.6 0.08 0.48 0.5 0.29 0.36 0.08 -0.66 -0.79 0.08 0.56 0.69 0.29 0.73 0.24
-1.61 -0.49 -0.11 -2.21 -0.28 -1.64 -1.6 -1.82 -1.92 0.24 -2.6 -2.85 0.18 -0.4 -0.27 -1.7 0.27 -1.31 0.26 0.18 0.05 -0.22 0.33 -3.01 -0.2 -1.33 -0.41 0.77 0.12 0.23 0.52 0.27 0.77 0.91 -0.94 0.98 0.65 0.77 0.85 0.44 -0.35 -0.38 0.48 0.61 0.65 0.79 1.01 0.21
-0.94 -0.28 0.04 -2.98 0.46 0.29 0.09 0.17 -1.91 0.32 -0.83 -0.82 -0.31 -1.39 -0.12 -0.55 0.64 -0.05 0.69 0.6 0.44 0.45 0.17 -1.64 0.37 -0.53 0.37 0.52 -0.42 0.08 0.42 0.51 0.35 0.46 -1.24 0.46 0.31 0.22 -0.47 -0.09 -0.73 -0.9 -0.08 0.05 -0.17 0.21 0.52 0.09
-1.28 -0.04 0.37 -2.41 0.17 -0.17 -0.26 -0.19 -0.61 0.26 -2.08 -2.33 -0.32 -0.76 0.12 -0.16 0.62 -0.45 -0.3 0.24 0.28 0.22 -0.66 -2.37 -0.12 -0.42 -0.75 0.94 0.16 0.44 0.5 0.12 0.5 0.64 -0.21 0.43 0.47 0.32 0.13 0.08 -0.62 -0.64 0.1 0.48 0.3 0.28 0.88 0.17
0.2 0.19 0.73 -2.59 -1.08 -0.12 0.3 0.35 0.45 -0.81 -2.32 -2.16 -0.72 -0.79 -0.47 -1.16 1.16 -0.01 0.6 0.06 -0.03 -0.03 0.4 -1.8 -1.57 -1.1 -1.16 1.13 0.64 0.74 -0.47 -0.55 0.11 0.75 -0.32 0.09 0.05 0.08 0.48 0.44 -1.12 -0.91 0.2 0.41 0.61 0.05 0.25 0.17
-2.24 -0.32 0.53 -0.68 1.24 0.1 -0.31 -0.46 -1.25 -0.47 -2.92 -3.13 -0.88 -1.58 -0.42 -2.32 0.55 -1.41 0.38 0.52 0.34 -0.25 1.03 -2.57 -0.99 -1.63 -1.44 1.13 0.52 0.64 0.39 0.1 0.48 0.73 -0.34 0.84 0.49 0.02 0.13 0.18 -1.4 -1.32 0.07 0.87 0.4 0.01 0.87 -0.03
-0.56 -0.35 -0.33 -2.58 1.47 0.09 -0.1 -0.79 -0.58 -0.16 0.05 -0.08 -0.58 -1.51 -0.35 -0.51 0.11 -1.01 0.75 0.74 0.61 0.42 -0.32 -1.51 0.17 -1.14 -0.1 0.57 0.47 0.18 0.02 0.26 0.3 0.25 -0.41 0.08 0.15 0.05 -0.47 0.05 -0.68 -0.71 0.17 0.32 0.02 0.07 0.57 0.28
-0.28 -0.78 -0.54 -1.58 0.78 -0.44 -0.48 -0.35 -0.01 0.39 0.74 0.44 0.28 -0.72 -0.16 -0.94 -1.03 -1.42 -0.34 -0.23 -0.04 -0.48 -0.42 -1.8 0.5 -0.92 0.69 0.15 0.68 -0.05 0.46 0.14 0.32 0.15 0.67 0.13 0.55 0.23 -0.67 0.1 0.36 -0.11 0.28 0.12 -0.33 0.37 0.3 -0.12
-3.53 -2.11 -1.35 -2.77 1.23 -0.31 -0.64 -1.08 -2.29 0.04 -1.47 -1.5 -0.01 -0.01 0.11 -2.73 -0.81 -1.8 -0.54 -0.34 -0.5 -0.86 -0.89 -1.49 -0.28 -1.67 -0.0 1.22 0.18 0.34 0.24 0.7 0.82 0.89 0.14 1.43 0.57 0.07 0.94 0.29 -0.41 -0.83 0.15 0.83 0.96 0.13 0.72 0.65
-0.85 -0.25 0.24 -2.26 1.29 0.21 -0.17 -0.29 -0.6 -0.24 -0.3 -0.37 -0.53 -1.22 -0.03 -2.09 0.31 -0.75 0.72 0.51 0.55 0.28 0.22 -2.05 -0.25 -0.76 -0.05 0.68 -0.47 0.18 -0.12 0.43 0.2 0.65 -0.57 0.51 0.14 0.24 0.06 -0.07 -0.77 -1.17 -0.08 0.35 -0.01 0.27 0.56 0.43
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-0.51 -1.29 -0.33 -3.78 1.15 -0.87 -0.96 -0.83 -0.81 0.08 -0.41 -0.49 0.3 0.52 -0.03 -1.97 -0.32 -1.05 -0.06 0.06 0.21 0.05 -0.82 -0.26 -0.31 -0.52 -0.57 0.2 0.38 0.16 -0.15 -0.33 0.48 0.42 0.25 0.03 0.19 0.44 -0.02 0.69 0.55 0.55 0.88 0.29 0.36 0.43 0.13 0.13
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-0.93 -0.76 0.46 -2.18 0.99 -0.53 -0.3 -0.67 -0.08 -0.26 -1.04 -1.06 -0.99 -1.57 -0.21 -0.57 0.97 0.0 0.76 0.54 0.49 0.23 -0.27 -1.38 -0.35 -0.79 -0.3 0.93 0.29 0.41 -0.13 0.14 0.28 0.54 0.02 0.37 0.0 0.17 -0.23 0.15 -0.61 -0.94 0.14 0.23 0.1 0.23 0.38 0.51
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-0.91 -0.2 -0.74 -2.95 1.16 -0.56 -0.69 -0.5 -0.79 0.05 -3.38 -3.32 0.14 -0.21 0.36 -1.33 -0.24 -1.11 0.46 0.53 0.58 0.5 -0.2 -2.38 -0.64 -2.11 -0.95 0.63 0.66 0.46 0.34 -0.72 0.23 0.61 0.57 0.35 0.59 0.5 0.26 0.36 -0.23 -0.54 0.27 0.49 0.23 0.54 0.52 0.28
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-0.94 -0.67 -0.08 -3.46 1.22 -0.6 -0.37 -0.49 -0.7 -0.34 -0.54 -0.4 -0.45 -0.14 -0.12 -0.72 0.65 -0.93 0.3 0.44 0.35 -0.08 0.16 -1.96 -0.49 -1.09 -0.45 0.73 -0.26 0.35 -0.17 0.4 0.3 0.59 0.05 0.26 -0.02 0.1 0.39 0.25 0.08 -0.21 0.29 0.2 0.37 0.09 0.34 0.78
- -0.07 -0.37 0.52 2.19 0.39 -0.78 -1.39 -2.42 -1.47 -7.46 - -2.42 -2.91 -1.37 -1.15 0.28 -2.69 0.98 1.43 1.63 0.63 -2.45 1.83 -1.63 -5.73 -2.75 0.72 -1.12 0.02 0.15 -4.62 0.29 0.41 -2.26 -1.43 0.25 0.77 -0.93 0.65 -0.43 -0.39 0.42 0.72 0.36 0.78 0.32 -2.01
-0.24 0.2 0.56 -2.03 0.58 -0.36 -0.54 -0.41 -0.36 -0.37 -1.53 -1.73 -0.65 -0.55 -0.38 -0.38 0.9 -0.59 0.36 0.49 0.61 0.02 0.28 -1.45 -0.95 -1.46 -1.91 1.09 0.93 0.24 0.28 0.09 0.41 0.75 0.18 0.58 0.56 -0.52 0.59 0.05 -1.41 -1.53 0.1 0.37 0.42 -0.5 0.43 -0.46
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-0.22 0.35 0.69 -2.62 0.26 0.11 0.12 -0.06 -0.1 -0.1 -1.25 -1.28 -0.44 -1.27 -0.3 -0.6 1.01 -0.69 0.51 0.59 0.48 -0.02 -1.2 -2.35 -0.69 -0.58 -0.39 0.81 0.88 0.31 0.24 -0.03 -0.02 0.57 0.4 0.19 0.23 0.2 -0.35 0.25 -0.66 -0.93 -0.02 0.19 -0.16 0.17 0.33 0.08
-0.15 0.03 0.46 -2.19 1.09 -0.39 -0.56 -0.14 -0.24 0.02 -2.95 -3.34 -0.59 -0.87 -0.12 -0.91 -0.27 -0.94 0.53 0.24 0.27 0.27 -0.74 -1.81 -0.67 -1.84 -1.24 1.01 0.48 0.42 0.07 -0.39 0.36 0.92 0.48 -0.08 0.31 0.37 0.46 0.32 -0.74 -0.6 0.51 0.62 0.4 0.45 0.67 -0.11
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-2.05 -0.6 -0.64 -1.41 1.47 -0.37 -1.02 -0.69 -0.97 0.17 -0.12 -0.15 -0.56 -0.71 -0.03 -1.88 -0.01 -1.13 0.09 0.13 0.22 -0.23 0.5 -1.73 -0.47 -1.1 -0.48 1.17 0.13 0.12 0.11 0.46 0.66 0.47 -0.69 1.21 0.38 -0.13 0.06 0.04 -0.59 -0.85 0.06 0.76 0.74 -0.07 0.56 0.12
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.