Heatmap: Cluster_226 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.52 1.23 0.87 0.18 0.01 0.96 0.39 0.15 3.61 0.65 0.0 0.05 0.08 0.07 0.4 0.0 1.21 1.17 2.14 0.42 0.28 0.17 0.16 23.02 0.19 0.57 0.0 3.36 3.15 0.84 0.75 0.28 0.32 1.72 0.2 1.45 0.48 0.58 0.24 0.75 0.0 0.02 0.22 0.59 0.2 0.54 0.72 0.21
33.28 40.25 54.15 49.73 21.58 39.82 39.34 42.7 27.89 10.89 1.1 2.27 5.92 6.15 8.07 23.01 31.95 34.68 25.0 26.94 31.92 30.11 6.09 173.7 22.63 8.2 9.21 23.51 8.57 20.0 14.0 6.45 15.26 20.56 12.47 15.11 8.71 29.67 10.82 14.23 7.21 7.95 14.34 15.16 11.2 29.47 16.87 10.57
3.99 3.77 5.64 0.57 15.26 10.95 7.21 8.42 1.11 1.5 0.0 0.01 0.84 0.29 1.54 0.28 9.52 2.4 14.46 10.85 5.3 3.01 12.97 115.88 4.06 0.8 0.16 0.79 0.3 0.87 0.82 0.2 0.69 0.8 0.17 0.18 1.01 1.16 0.63 1.95 0.12 0.57 3.81 2.0 1.3 0.98 1.62 0.27
0.0 8.96 10.47 0.0 1.68 1.69 0.82 2.28 0.01 0.44 0.09 0.06 0.05 0.0 0.02 0.0 0.49 65.66 1.16 0.42 0.41 16.69 0.27 442.12 45.42 0.68 1.66 0.03 0.25 0.31 0.04 0.01 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.03 0.11 0.23 0.02
13.34 20.03 16.3 4.55 39.36 31.62 31.84 33.39 12.11 18.22 0.51 0.25 12.46 3.35 13.36 20.75 22.12 14.89 32.88 36.91 29.25 25.55 5.04 209.73 22.63 3.4 4.84 6.39 2.02 5.53 4.27 1.97 6.01 8.86 4.05 3.8 4.03 9.55 2.25 6.1 1.56 1.79 8.32 5.06 3.43 8.78 4.22 2.22
3.07 6.92 6.37 5.99 0.8 2.74 1.9 1.09 2.73 0.27 0.06 0.07 0.07 0.24 0.2 0.05 0.27 13.71 0.0 0.21 0.3 0.78 0.0 61.07 4.46 0.44 0.07 0.07 0.36 0.07 1.28 0.07 0.14 0.31 0.0 0.11 0.03 0.42 0.0 1.03 0.35 0.23 0.86 0.24 0.07 0.31 0.72 0.51
0.13 3.22 2.55 1.54 1.46 1.09 1.14 1.29 0.29 0.12 0.01 0.02 0.08 0.07 0.1 1.25 0.17 43.08 0.02 0.14 0.09 0.44 0.13 589.37 33.98 0.19 0.02 0.81 0.3 0.18 0.24 0.06 0.17 0.29 0.12 0.33 0.29 0.14 0.15 0.1 0.07 0.07 0.06 0.12 0.03 0.1 0.16 0.2
0.0 20.73 53.24 0.56 0.92 1.52 6.85 1.36 1.34 0.16 0.05 0.0 0.47 0.18 0.16 2.69 8.56 14.98 6.24 6.51 3.05 1.77 0.72 394.59 11.31 0.4 1.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.04 0.04 0.0 0.06 0.0
14.98 9.53 20.51 6.82 1.3 1.46 4.2 2.53 2.81 0.02 0.0 0.0 0.17 0.0 0.14 0.0 3.74 81.07 5.93 3.24 2.77 28.75 1.52 731.48 39.4 0.26 0.04 0.07 0.03 0.05 0.03 0.05 0.0 0.07 0.02 0.03 0.09 0.12 0.04 0.05 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.16 0.06 0.03
2.32 0.0 2.12 7.33 5.35 8.12 14.97 12.11 7.19 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 23.05 0.0 0.03 0.92 12.39 0.0 151.36 22.29 0.25 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
7.1 3.38 11.22 2.39 12.97 15.88 17.6 15.0 9.32 5.27 5.06 4.87 2.56 1.82 3.34 3.75 9.85 10.43 8.99 10.12 8.57 10.77 0.91 58.21 21.8 8.04 10.22 8.42 4.74 1.66 3.13 0.89 3.01 1.67 0.94 1.49 5.78 8.71 1.56 1.28 5.15 3.7 4.17 1.27 1.15 8.81 1.06 4.29
25.73 44.71 56.48 57.68 74.79 30.47 34.28 31.63 34.07 29.15 14.43 12.77 24.76 20.12 21.9 28.63 65.64 40.82 59.8 47.72 57.5 59.77 16.2 334.28 39.96 11.52 16.98 34.79 27.26 35.34 33.49 23.39 45.11 43.9 20.87 14.32 37.35 54.14 26.56 62.85 40.07 40.31 58.7 46.52 48.81 54.67 37.74 26.11
0.06 0.54 1.53 0.53 0.28 0.67 0.22 0.38 2.47 0.51 0.0 0.0 0.3 0.26 0.31 3.11 0.58 3.67 0.33 1.12 1.03 0.99 1.51 23.63 1.04 0.53 0.05 0.17 0.62 0.33 0.46 0.03 0.38 0.59 0.04 0.53 0.46 0.54 0.16 0.16 0.08 0.22 0.19 0.16 0.19 0.8 0.17 0.23
3.81 4.44 12.37 3.01 16.02 15.97 6.75 23.15 2.02 0.46 0.01 0.05 0.68 0.26 0.71 0.73 7.06 36.54 2.31 5.37 11.2 30.5 2.24 202.36 49.83 16.33 3.5 8.71 5.15 1.43 0.18 0.25 1.09 2.11 0.33 0.2 0.55 1.17 2.14 0.2 0.16 0.17 0.27 0.13 1.33 1.09 1.36 1.34
0.09 1.23 0.52 0.01 0.71 0.16 0.05 0.14 0.35 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.29 1.53 38.51 1.55 0.43 0.53 0.85 0.43 961.45 53.14 0.32 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.07 0.43 0.91 0.75 0.04 0.47 0.05 0.2 0.19 0.02 0.08 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 1.12 2.77 0.14 0.25 0.15 0.31 0.68 25.62 3.02 0.74 0.44 0.04 1.91 0.21 0.01 0.09 0.04 0.11 0.0 0.02 0.0 0.02 0.05 0.04 0.03 0.02 0.04 0.04 0.0 0.09 0.03 0.06
0.0 19.51 28.93 0.9 1.05 3.64 7.01 4.37 4.63 1.04 0.08 0.0 1.17 0.97 0.94 0.0 5.54 24.46 10.67 3.56 1.66 6.25 1.12 92.06 7.37 6.02 2.34 3.67 2.66 2.0 1.72 1.11 2.42 2.63 1.33 1.86 3.15 6.02 2.37 2.47 1.93 3.53 2.06 2.31 2.4 6.33 2.86 3.61
0.0 3.7 8.49 0.16 0.21 0.84 0.37 1.6 1.06 0.6 0.28 0.02 0.51 0.47 0.54 1.02 2.33 10.94 2.51 1.69 0.46 1.86 0.96 37.01 4.88 3.1 3.72 2.99 1.31 1.49 1.75 0.67 1.24 2.19 0.87 1.12 2.13 2.46 0.78 1.32 1.38 1.71 1.52 1.39 0.78 2.1 1.77 2.41
0.0 0.0 0.47 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.38 0.09 0.55 0.2 0.04 0.08 0.0 0.21 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.91 0.45 0.3 0.14 0.11 0.18 0.31 0.11 0.03 0.0 0.05 0.03 0.0 0.03 0.62 0.0 0.04 0.36 0.19 0.24 0.18 0.05 0.62 0.0 0.47
0.5 0.62 3.57 0.62 2.8 3.31 4.88 3.95 2.69 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.37 0.86 2.2 1.93 1.3 0.86 0.1 0.78 198.79 13.72 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.99 0.0 0.03 4.27 0.07 0.87 0.72 0.57 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.98 0.38 0.74 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 47.6 0.9 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.31 5.56 6.18 1.52 13.18 5.87 8.93 4.69 3.73 5.89 2.32 2.75 6.1 7.49 6.12 9.46 14.11 16.78 17.08 15.03 11.58 11.66 24.12 125.81 23.65 12.69 31.78 12.25 5.59 10.75 7.66 4.51 10.83 11.5 8.67 11.13 10.24 9.83 12.22 12.96 10.57 12.25 12.11 8.18 11.0 10.53 7.61 10.33
1.81 0.08 0.42 1.66 0.66 1.39 1.96 1.87 2.17 0.9 0.23 0.41 0.13 0.08 0.33 6.04 1.92 2.68 0.6 0.53 0.45 0.36 0.11 21.33 0.84 0.8 0.12 0.26 0.71 1.07 0.35 0.1 0.29 0.5 0.22 0.08 0.24 0.82 0.11 0.38 0.22 0.27 0.54 0.29 0.15 0.79 0.25 0.55
3.31 11.34 28.2 1.37 2.58 11.47 22.21 17.4 5.56 4.74 2.11 2.21 4.43 3.26 4.94 7.1 3.29 19.74 11.0 5.28 4.7 10.42 1.28 107.19 15.53 9.21 3.51 4.66 1.56 3.07 3.31 4.01 1.67 1.77 2.81 1.81 2.81 5.22 0.99 1.96 2.09 1.32 1.74 2.41 0.97 3.97 4.16 5.02
37.22 32.46 35.62 7.57 60.26 68.33 69.77 63.13 54.32 48.63 25.06 21.71 41.33 26.25 36.95 24.25 57.67 24.1 69.24 68.58 69.42 56.14 64.15 203.24 47.4 21.75 21.96 39.37 27.89 28.33 40.25 21.72 39.36 42.18 39.85 32.32 35.66 55.93 24.29 33.7 25.26 22.92 40.15 31.99 28.64 55.73 34.03 24.14
1.99 9.03 20.56 2.0 2.9 10.11 5.23 5.05 2.79 8.56 2.96 2.57 15.78 21.26 8.95 3.1 26.29 39.37 24.42 15.63 12.79 10.61 22.57 376.46 17.87 18.29 18.3 12.39 8.81 19.42 7.9 8.39 9.9 11.2 3.88 11.83 8.22 20.9 15.59 23.55 16.54 14.35 18.23 14.09 10.98 22.72 12.63 17.45
0.0 0.45 0.18 1.17 0.0 0.1 0.07 0.0 0.0 1.52 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.18 7.11 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 152.73 6.1 0.28 0.18 0.03 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.01
8.84 9.29 6.08 4.73 1.15 3.01 4.38 4.97 7.66 0.96 0.25 0.58 0.29 0.11 0.72 9.66 4.34 3.37 3.31 0.58 0.8 0.87 0.19 46.99 3.91 4.57 0.22 0.52 0.14 0.29 0.48 0.27 0.25 0.24 0.02 0.21 0.37 0.34 0.18 0.24 0.25 0.36 0.19 0.02 0.03 0.49 0.15 0.39
0.0 0.64 0.35 0.47 2.82 12.64 3.12 7.66 1.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.34 1.46 3.72 1.26 1.17 0.0 0.0 0.0 33.03 8.75 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.97 9.1 2.33 3.66 3.1 4.28 1.77 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.13 0.33 44.65 0.97 0.48 0.7 16.25 0.15 307.77 19.94 0.31 1.71 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
5.3 1.72 2.06 0.54 4.53 2.54 1.8 0.54 0.0 1.53 1.02 0.61 1.13 0.51 0.59 4.85 31.85 4.16 149.01 130.34 31.34 5.08 37.36 633.81 16.71 0.68 4.6 0.0 0.27 1.04 1.46 0.52 0.86 0.21 0.0 0.26 0.21 2.56 2.04 1.29 0.0 0.09 8.75 1.36 2.62 3.41 1.49 0.11
2.61 0.24 4.78 43.71 73.34 24.1 28.37 23.2 5.39 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.04 0.11 10.17 0.42 0.57 0.45 0.04 0.71 209.38 32.22 0.24 0.01 0.04 0.01 0.03 0.11 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.6 1.28 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.44 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 76.13 2.17 0.58 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 2.49 2.96 0.37 0.49 8.76 11.96 13.84 2.36 1.77 2.37 2.6 1.16 0.76 1.48 1.26 1.68 6.93 1.25 1.86 1.27 1.53 0.68 274.87 31.6 8.52 28.17 8.94 3.06 3.21 6.96 1.31 2.5 3.65 2.16 3.09 4.73 1.99 1.22 0.94 0.41 0.5 1.06 1.08 0.78 1.98 3.69 4.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 2.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.22 0.0 0.97 0.3 0.24 0.0 11.02 1.52 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.93 13.16 15.75 2.05 10.01 10.79 12.77 11.49 5.82 9.13 4.81 4.89 9.34 5.25 5.98 5.05 16.56 7.5 9.62 14.36 14.68 11.53 0.32 49.76 12.76 12.15 7.09 4.15 2.31 2.79 4.98 8.23 3.64 3.77 2.83 3.18 5.05 4.96 2.33 3.66 3.79 2.85 3.96 3.4 3.48 4.5 3.6 3.99
0.05 0.0 0.07 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.19 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.08 0.03 0.0 0.15 0.17 0.24 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.13 2.97 0.03 0.05 0.0 0.01 0.0 94.53 9.35 0.11 0.0 0.02 0.01 0.03 0.04 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.03 0.06
0.0 0.0 0.39 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.92 0.33 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.29 1.09 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.66 0.55 0.59 2.45 1.93 1.66 0.66 0.42 0.05 0.03 0.4 0.41 0.32 0.22 1.82 0.96 4.49 2.05 2.78 1.16 0.56 14.2 2.71 0.29 0.21 0.11 0.16 0.12 0.1 0.09 0.07 0.04 0.1 0.15 0.19 0.3 0.16 0.11 0.12 0.21 0.1 0.06 0.1 0.26 0.05 0.14
0.0 0.58 0.02 0.0 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.29 0.41 2.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 105.34 7.97 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.1 15.49 9.28 63.28 12.17 13.66 14.36 25.66 5.72 1.45 5.65 5.09 1.84 0.19 1.26 1.01 5.27 16.45 6.24 3.61 2.51 4.63 4.2 536.77 40.12 5.32 13.34 0.15 0.05 0.49 0.25 0.58 0.2 0.09 0.05 0.03 0.21 1.51 0.08 0.64 0.19 0.03 0.28 0.18 0.22 1.48 0.11 0.66
0.0 0.0 0.18 0.0 0.04 0.22 0.12 0.09 0.0 0.06 0.02 0.05 0.02 0.02 0.07 0.0 0.03 0.09 0.15 0.5 0.25 0.14 0.0 5.48 0.81 0.08 0.0 0.08 0.03 0.04 0.0 0.02 0.05 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.05 0.12 0.0 0.04 0.11 0.0 0.06 0.06 0.04 0.03
0.0 0.0 0.05 0.51 3.26 13.05 5.86 10.2 2.59 0.33 0.05 0.08 0.2 0.06 0.06 0.0 1.72 3.45 0.38 1.56 0.19 0.19 0.33 55.27 5.32 1.46 0.04 0.0 0.04 0.09 0.03 0.25 0.04 0.0 0.0 0.11 0.11 0.73 0.0 0.43 0.08 0.07 0.11 0.1 0.08 1.26 0.14 0.09
2.22 0.39 4.39 0.0 0.0 1.56 1.44 0.0 3.76 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 1.03 7.11 0.0 0.78 0.37 0.64 0.0 91.74 2.33 2.29 0.57 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)