Heatmap: Cluster_188 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c11_14020V3.1	0.36	4.64	1.38	1.88	-0.65	-	0.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_22180V3.1	-	4.93	2.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	-	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_8753V3.1	-	4.57	0.98	1.24	1.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_16530V3.1	-	4.8	0.68	2.05	-	-	-	-	-0.98	-	-	-	-	-	-	3.18	1.54	-0.34	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_5033V3.1	-	5.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	3.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_5620V3.1	-	4.74	-	0.36	0.46	-	-	-	-	-1.32	-	-	-	-	-4.5	-	2.67	2.52	-	-	-	-	-	1.27	-0.28	1.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_8880V3.1	-	5.44	-	-1.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.27	0.23	-1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_17670V3.1	-	3.83	2.99	-0.81	-	-0.83	-1.48	-0.29	-	-2.01	-2.57	-	-3.02	-2.42	-3.67	-	1.82	-2.28	3.6	0.85	-	-0.85	-0.67	-	0.01	-0.53	-2.98	-	-	-2.17	-	-2.73	-	-2.93	-	-	-	-2.16	-	-2.19	-	-	-2.28	-0.92	-	-1.45	-	-4.32
Pp3c15_2260V3.1	-	5.1	1.52	-	-	-	-	-	-	-1.6	-	-	-3.13	-	-7.04	1.99	1.72	-	-	-	-	-	-	-2.24	-	-0.35	-	-	-0.76	-3.45	-	-	-3.68	-1.4	-	-2.83	-0.94	-	-	-	-	-	-2.32	-	-	-	-	-4.41
Pp3c15_9490V3.1	-	4.53	-	1.57	-	-	-	-	0.58	-	-	-	-	-	-	2.68	2.75	-1.02	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_9510V3.1	-	4.51	2.67	-0.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.74	3.41	-0.23	-	-	-	-	-	-0.53	-	1.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_16160V3.1	-	4.71	0.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.84	2.88	0.54	-	-	-	-	-	-	-	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_19670V3.1	-	4.72	-	-	-	-	-	-	1.77	-	-	-	-	-	-2.51	2.47	3.42	-	-	-	-	-	-	-	-	0.88	-	-	-	-3.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_6425V3.1	-	4.24	2.45	0.09	-1.73	-	-	-	-	-0.87	-	-	-1.07	-0.62	-1.8	-	3.16	-1.34	-	-	-	-	-	-	-	1.49	-	-	-	-1.13	-	-0.79	-	-	-	-	-	0.34	-	-0.86	-	-0.43	0.51	1.03	-1.0	-0.76	-	-
Pp3c17_28V3.1	-	4.93	0.04	0.0	-4.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-7.72	2.97	1.85	-1.97	-	-	-	-	-	-	-	1.93	-	-	-	-6.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_36V3.1	-	4.93	0.04	0.0	-4.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-7.72	2.97	1.85	-1.97	-	-	-	-	-	-	-	1.93	-	-	-	-6.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_14670V3.1	-	4.09	2.46	-	0.05	2.84	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-3.89	-	2.3	0.32	-	-	-	-	-	-	-	3.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.61
Pp3c19_13390V3.1	-	4.08	3.18	-0.53	0.14	0.69	-0.08	-	1.27	-	-	-	-	-	-5.27	3.09	2.33	-0.55	-	-	-	-	-	-	-	-0.12	-	-	-	-3.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_21420V3.1	-	4.92	-	-	-0.24	-	-	-	-	-1.09	-	-	-	-	-	-	3.08	0.76	-	-	-	-	-	0.33	-	1.84	-	-	-0.67	-	-	-0.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_9339V3.1	-	5.06	2.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.11	1.78	-	-	-	-	-	-	-0.48	-	2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_10900V3.1	-	5.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_11480V3.1	-	4.62	-	-0.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.54	2.97	-	-	-	-	-	-	-	0.71	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_1720V3.1	-	5.28	3.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_19630V3.1	-	4.78	-	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.44	-	2.61	-0.78	-	-	-	-	-	-0.42	-	2.84	-	-	-	-3.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_19970V3.1	-	5.36	0.67	-	-	-	0.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.75	-	-	-	-	-	-	-	-	1.27	-	-	-	-4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_23190V3.1	-	5.33	2.05	-1.67	-1.96	-	-1.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.21	-0.54	-	-	-1.78	-	-	-	-2.67	-	0.12	-	-	-	-6.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_14070V3.1	-	5.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_16759V3.1	0.59	4.71	-	0.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.31	3.61	-	-	-	-	-	-	-0.15	-	2.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_3770V3.1	-	5.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.0	1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	0.71	-	-	-	-1.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_5860V3.1	-	4.82	0.81	-0.05	-0.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.0	3.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_12620V3.1	-	5.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_5160V3.1	-	4.62	1.41	-	-3.39	-0.43	1.01	-0.84	-	-2.77	-2.3	-1.01	-	-	-2.83	-	1.6	-2.88	-	-	-	-	-	-2.04	-2.01	1.33	-	0.09	-1.0	-1.54	-1.98	-	-0.21	-0.82	-1.22	-0.04	-	-0.72	-0.63	-2.4	-	-	-	0.99	-	-1.31	0.05	-2.05
Pp3c22_7080V3.1	-	4.41	3.02	1.8	-0.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.72	2.07	2.29	1.69	-	-	-0.96	-2.22	-	-	-	-1.3	-	-	-1.58	-3.83	-	-	-	-2.58	-	-	-	-2.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.32
Pp3c23_350V3.1	0.85	4.67	0.29	-1.93	0.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.58	3.13	2.12	0.48	-	-0.59	-	-	-	-	-	0.97	-	-	-	-3.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_5760V3.1	-	4.97	-	0.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.36	2.95	1.9	-	-	-	-	-	-	0.9	-	0.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_8520V3.1	-	4.02	3.54	2.3	-	-	-	-	-	-4.29	-	-	-	-3.17	-2.98	2.54	2.25	-0.27	-	-	-	-	-	-1.3	-3.84	0.9	-0.87	-	-3.88	-4.6	-	-	-	-	-	-	-	-1.67	-	-	-	-	-	-3.74	-	-3.48	-	-
Pp3c24_8970V3.1	-	5.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.66	-	-	-	-	1.46	-	-	-	-	-	-	1.11	-	2.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_15180V3.1	0.28	4.72	0.62	-0.91	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	2.07	2.81	-2.8	-	-	-	-	-	-2.1	-	2.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_10590V3.1	-	4.97	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-4.26	2.78	2.11	-	-	-	-	-	-	-	-	2.08	-	-	-	-3.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_6580V3.1	-	4.04	0.4	-2.5	-	-1.36	-1.71	-0.76	0.36	0.6	-	-	1.25	-1.68	-1.31	2.11	0.9	-2.33	-	-3.37	-	-2.41	-	-	-	-0.51	-	-	-3.98	-0.73	-2.7	-	0.41	-0.7	-	-1.32	-1.32	1.6	-1.57	1.35	-1.12	-0.27	-0.24	-2.63	0.21	1.09	-1.95	-1.95
Pp3c2_29200V3.1	-	4.95	1.21	-	-3.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.33	3.46	1.03	-	-	-	-	-	-	-2.29	-	0.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_11520V3.1	-	4.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.52	-	3.33	1.63	-	-	-	-	-	-	-	2.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_11530V3.1	-2.61	4.59	-2.12	1.71	-0.2	-	-0.54	-1.33	0.13	0.41	-	-	-0.99	-2.51	-1.92	-	1.99	-0.53	-	-	-	-	-	-	-2.58	2.99	-	-	-	-1.33	-0.72	-	-	-	-	-	-	-1.6	-	-1.55	-	-	-2.79	-	-	-	-2.59	-2.66
Pp3c3_20670V3.1	-	5.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_2590V3.1	-	5.01	-	-	-	0.35	-	-	-	-	0.73	1.85	-	-	-4.69	-	-0.4	1.01	-	-	-	-	-	0.71	-	2.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.03
Pp3c3_38200V3.1	-1.0	4.37	-0.53	0.8	1.18	-0.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.11	2.72	2.57	-1.58	-	-	-	-	-	-	-	2.94	-0.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_4916V3.1	1.5	4.2	1.54	1.79	-3.14	-	-3.87	-	-0.46	-	-	-	-	-	-4.36	2.37	2.91	-0.5	-3.87	-	-	-	-	-2.5	-	2.55	-	-	-	-5.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_9140V3.1	1.96	4.37	2.72	0.04	-2.79	-1.05	-	0.15	-	-	-	-	-	-	-3.22	-1.17	2.06	-0.97	-	-0.38	-0.36	-	-	-	-	2.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_1420V3.1	-	5.12	0.32	0.68	-2.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.9	0.82	1.32	-	-	-	-	-	-	-	-	2.55	-	-	-	-3.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_26800V3.1	-	5.32	-	-	-	-	-	-	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_29230V3.1	-	4.34	3.18	-	1.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.43	1.72	3.02	0.36	-	-	-	-	-	-2.85	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_4540V3.1	-	5.11	2.29	0.78	-	0.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.41	-	-	1.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.06	-	-
Pp3c6_19310V3.1	-	4.48	2.44	0.67	1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.59	3.0	1.78	-	-	-	-	-	-	-	-	2.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_23440V3.1	0.08	3.98	1.74	1.57	-3.41	-	-4.47	-	2.3	-	-	-	-	-	-4.66	2.92	2.74	-0.68	-	-	-	-	-	-1.04	-	2.14	-	-	-	-5.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.42
Pp3c6_5220V3.1	-	4.53	2.81	-1.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.47	-	2.61	1.6	-	-	-	-	-	-0.74	-	2.92	-	-	-	-4.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_6580V3.1	-	4.49	-	-1.62	-1.78	-	2.02	1.88	-	-	-	0.04	-	-	-	2.5	1.33	1.71	-	-	-	-	0.74	-0.68	-	1.29	-	-	-	-3.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_800V3.1	-	4.85	0.71	0.32	-0.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.75	3.64	0.59	-	-	-	-	-	-	-	-	0.73	-	-	-	-5.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_8180V3.1	-	4.83	-1.07	1.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.48	2.64	2.58	0.12	-	-	-	-	-	-	-	1.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_3840V3.1	-	5.29	-0.05	-1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.08	0.4	-2.15	-	-	-	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_9510V3.1	1.41	4.48	0.44	0.65	-0.79	-	-	-	0.95	-	-	-	-	-	-	2.19	2.68	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_14770V3.1	-	5.11	1.36	-	-	-	-	-	0.84	-	-	-	-	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_16450V3.1	1.63	4.63	2.18	-	1.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.35	0.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_2160V3.1	-	4.61	-	-0.11	-	-	-	0.34	-	-0.67	-	-0.81	-	-	-2.7	1.48	-0.48	-2.06	-	-	-	-	-	-	-1.86	3.97	-1.75	-	-	-3.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_21419V3.1	-	5.13	0.49	-	-2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	0.26	0.43	-	-	-	-	-	1.26	-	-0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_22180V3.1	-	5.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s466_20V3.1	-	5.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.66	-0.98	-	-	-	-	-	-	-	1.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s50_40V3.1	-	5.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.96	1.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s876_30V3.1	-	4.82	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.22	0.62	-1.92	-	-	-	-	-	-1.81	-	3.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.