Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.08 4.77 -0.7 - - - - - - - - - - -4.46 1.26 2.05 - - - - - - - - 3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 3.47 - -0.15 - - - - - - - - - -2.92 - - 0.97 - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.78 3.08 -2.06 -1.55 - - - - - 2.68 3.53 - - - -2.74 0.39 -1.45 - - - - - - -1.29 0.15 1.36 - - -5.63 - 0.16 - - - - -3.33 - - - - - - - - - - -3.14
- 5.04 2.97 2.16 - - - - - - - - - - - - 1.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.67 4.32 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.25 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.22 2.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.38 -0.29 0.37 1.25 -0.21 2.14 - - 0.57 -1.21 - - -2.63 0.67 1.23 -0.97 - 1.0 - - 1.87 -1.47 - 1.51 - - -2.47 -2.3 - - - -2.28 -2.23 - - -2.05 - - - - - - - -1.57 -0.7 -
- 3.51 4.05 - 0.1 3.07 - - - - - - - - - - 2.34 1.24 - 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.86 1.8 -2.28 0.06 1.64 0.26 -0.72 - -2.95 0.83 1.52 -0.76 - -1.76 -0.83 0.31 0.59 0.45 1.55 1.87 1.21 0.85 -1.1 0.38 -1.0 0.63 -2.9 -3.55 -2.09 -1.31 -1.27 -1.84 -1.11 -2.31 -2.93 -1.03 -0.15 -2.46 -3.23 - -2.96 -2.71 -1.89 -2.19 -0.71 -1.93 -0.78
- - 2.91 - 2.29 - - - 5.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.65 3.23 4.62 -1.22 - - - - - - - - - -0.75 -4.64 -0.09 2.12 1.88 -2.47 - -0.55 - - - -0.68 0.82 - - - -3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.37 3.29 - -0.02 0.71 0.3 2.9 - -1.51 - - -0.14 -0.46 -3.1 2.84 - 0.7 - - - - - 0.75 - -0.72 - - 0.37 -1.91 -1.52 - - - - - - - - -1.14 - - - - - -0.07 - -
- 3.12 3.81 1.71 0.96 2.39 0.82 0.59 - -2.85 - - - - -4.7 - 0.79 0.99 - -1.84 -1.06 -0.89 -0.95 1.24 0.13 0.51 -2.26 - - -6.16 - - - - - - - -2.99 - - - - -1.72 - - - -2.5 -3.45
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.97 3.79 3.7 -0.06 -2.3 - - - - - - - - - -4.29 2.8 0.8 0.39 - - - - - - -1.59 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.58 4.3 - -1.75 - - - - - - - - - - -0.06 - -0.36 - -0.52 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.89 2.31 3.62 -1.0 -1.74 - 0.92 -0.59 2.92 -6.61 - -6.31 - - -2.07 2.66 1.58 - -0.37 0.27 -2.05 -1.27 0.59 - -5.31 -4.83 -7.17 -2.92 -6.42 -2.65 -4.82 -2.91 -4.55 -4.9 2.07 -2.93 -3.97 -2.94 -4.54 -4.78 -6.47 - -6.64 -6.9 -6.96 -3.53 - -2.16
- 1.78 3.9 -1.09 -1.2 - - - 3.89 - - - - - -3.54 - 2.7 -0.52 - - - - - -0.95 - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.72 2.96 - 2.5 0.46 1.25 0.17 -0.93 -1.28 -1.29 - - - -0.78 - 0.91 - 1.24 1.31 1.15 1.13 - - -1.09 -0.28 - - - -3.89 -2.3 - - - - - - -0.2 - - - - -0.02 - - - - -
0.84 3.49 3.21 -0.14 -1.19 -0.45 -0.93 -2.43 - -3.26 -2.66 - -2.11 - -2.97 - 1.45 2.0 2.42 -1.38 0.19 0.49 - 0.16 0.1 1.78 -0.78 - - -2.32 - - - - - - - - - - -2.29 - - - - -1.79 - -1.42
- - 5.23 - - - - - - - - - - - - - 2.49 1.25 - - - - - - - 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.58 3.61 -1.15 - - - - 4.57 - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - 1.81 - - - -4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.69 3.06 - - 2.24 1.03 - 1.71 - 1.88 1.91 - - - 2.12 -0.18 - - - - - - 0.4 - -0.17 - - - -0.37 - - - - - - - - - - - - - -0.47 - - - -1.57
- - 3.63 -0.13 - - - - 3.97 -0.57 - - -1.04 - - 0.8 1.92 - - - - - - - - -0.49 - - - -1.43 -0.25 -1.68 -0.99 -1.73 - -0.93 -1.46 -1.51 - 0.98 - 0.37 0.84 - -0.94 - 1.14 -2.15
- 4.9 3.7 0.36 - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.78 4.09 - - - - - - - - - - - - - 0.47 -0.22 - - - - - - - 0.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.51 2.42 2.45 -0.71 -1.61 1.29 1.74 1.29 2.28 -0.67 -2.86 -3.07 -1.98 -2.09 -0.96 0.12 0.81 0.11 0.67 0.18 -0.38 -1.4 -0.91 -1.02 -0.86 -1.19 -1.04 -0.13 -0.83 -0.92 -1.49 0.06 -1.93 -2.17 -2.37 -1.45 -1.54 -0.19 -2.44 -1.93 -1.37 -1.1 -1.27 -0.45 -1.75 -0.39 -0.24 -0.72
- 2.54 3.41 2.12 - - - - - - - - - - - - 2.76 1.66 - - - - - - - 2.14 - - 0.07 -0.52 0.26 - -0.74 -0.1 - - 0.39 - - 0.63 0.63 0.45 0.55 - - - - 0.27
- 5.25 2.61 - -0.78 - - - - - - - - - - - 0.48 -1.77 - - - - - -1.2 - 0.23 - - - -5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.12 2.43 - - - - - - - - - - -1.42 - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.89 - - - - - - - - - - - - - 0.71 3.08 - -0.33 - - - 1.21 1.41 -0.58 - - - -3.65 - - - - - - - - - - 0.47 - - - - - - -1.91
- 3.53 2.68 0.36 -0.59 0.55 0.66 2.0 -0.51 -0.91 -3.48 -3.78 -1.41 -2.57 -1.19 0.48 1.17 -0.15 -2.25 -0.32 -0.36 -1.93 -0.82 -0.63 -2.27 -0.67 -5.37 -1.27 0.08 -0.42 -1.07 -3.16 -1.59 -0.77 -1.78 -1.91 -2.42 -0.25 -2.04 0.19 -0.89 -1.4 -0.88 -2.64 -4.34 -0.67 -1.82 -0.52
- 3.13 3.25 - -2.33 -0.48 -2.09 -1.98 4.51 -3.41 - - - - - 0.95 -0.29 - - - - - -1.32 - -0.56 0.48 - - -2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.04 3.75 -1.13 -2.77 -0.51 -1.16 - 0.6 -1.81 -0.14 -0.08 -0.75 -0.45 -2.25 1.5 0.89 1.58 1.04 0.22 0.19 -0.53 -0.84 3.16 -0.13 0.32 -1.1 - - -5.14 - -2.48 - - - - -3.11 -3.19 - - -2.88 -3.03 -1.61 -2.76 - -0.96 - -
- 4.19 2.59 - -0.78 - - - 2.68 - - - - - - - 3.56 - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.09 2.75 - -0.98 - - - - - - - - - - - 0.47 - - - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.7 -0.39 - - - - 4.37 - - - - - -3.07 - 1.19 -0.05 - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.88 -0.05 3.82 1.96 -2.86 1.05 -0.62 - 3.0 - -0.21 - - - -5.88 0.8 2.81 2.45 - - - - - - - 1.34 - - - -1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.14 2.19 - 0.06 - - - -1.17 - - - - - - 0.18 0.08 -2.12 - - - - - -0.35 - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.93 1.82 2.65 -3.0 -1.66 0.3 -0.19 -0.78 1.67 -0.39 -1.49 -1.53 0.44 0.35 -0.24 -1.23 0.99 -0.59 -0.46 0.02 -1.97 -4.44 0.66 -2.5 -0.09 0.27 -0.6 -0.15 -0.12 0.16 -1.11 0.01 -0.43 -0.38 -0.31 -0.44 -0.27 0.52 -3.75 0.11 -0.71 -0.97 -0.94 -0.31 -0.87 0.65 -0.85 -0.45
- - 4.87 -0.54 -2.47 1.11 3.13 0.57 - - - - - - - - - -0.38 - -0.82 - - - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.26 - - - - - - - - - - - - - 2.75 1.0 - - - - - - - -0.2 - - - -3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.06 -0.24 - -0.89 -2.04 -0.58 - - - -4.18 -5.16 - -4.08 1.52 0.26 3.06 0.22 0.43 0.82 1.01 1.12 3.46 1.83 -1.03 -0.88 - - -4.18 - - - - - - - -4.85 - - -2.34 -2.21 -4.85 - - -3.1 -3.65 -6.47
- -0.04 2.08 2.46 -0.41 -1.38 - - -2.83 -2.15 - -3.64 -1.45 -1.57 -3.62 - -1.0 3.06 - -2.89 - -1.85 - 3.03 2.45 0.85 1.16 -0.16 -4.36 -4.2 -2.18 -3.34 -2.13 -0.57 -1.84 -1.08 -3.15 0.43 -1.1 -4.41 -3.26 -0.79 -1.65 -2.69 - 0.03 -2.53 -0.41
- - 3.8 1.99 -1.57 0.53 -0.67 -0.43 2.56 -0.4 - -3.05 - - -1.75 0.34 2.13 1.4 -1.63 0.44 -0.86 0.77 - -0.31 -0.23 1.52 -1.04 -0.63 -1.12 -2.7 -1.89 - - - - - - -1.79 - -2.99 - - -2.89 -2.27 - -1.89 - -4.58
- - 5.39 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.99 1.68 -3.37 - - - 4.64 - - - - - - - 1.68 -1.54 - - - - - - -2.08 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.11 - - - - - 4.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.55 3.66 3.59 - - 1.06 - - - - - - - - - 1.28 - - - - - - - - 2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.27 2.04 0.14 -0.31 1.79 1.44 1.08 -0.2 -0.93 - - -3.21 -0.18 -2.03 1.29 0.75 0.47 -0.64 -0.35 -1.45 -1.04 -1.35 2.13 -1.1 -0.29 -1.92 -2.66 -3.31 -1.61 -1.92 - -2.0 0.22 -3.1 -1.49 -1.01 -0.89 - -1.65 -2.38 - 0.02 -0.54 -0.81 -1.9 -2.69 -1.69
- 4.73 2.27 0.81 - - - - - - - - - - - 1.48 2.57 0.18 - - - - - - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.03 2.92 1.68 -0.02 -1.55 -1.85 -3.14 -2.98 2.22 0.1 -1.12 -1.09 -1.15 -1.32 -1.31 0.76 2.14 0.06 0.28 -0.24 0.06 -0.03 - -0.67 0.37 0.57 -1.77 -0.43 -1.37 -1.1 1.13 -1.63 -1.26 -3.27 -2.54 -1.75 -2.31 0.3 -1.3 -1.0 -0.61 -0.92 -1.0 -1.28 -3.0 -0.04 -0.58 -1.77
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.38 3.75 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.24 2.5 -2.91 -1.13 1.54 1.29 0.3 -1.81 -1.21 -1.4 -0.85 -1.17 -0.14 -1.56 - 0.64 -1.02 -1.18 -1.66 -2.8 -2.63 -1.63 -1.09 -0.07 0.1 1.16 -0.68 -1.24 0.01 -0.99 1.28 -1.33 0.13 -1.52 -1.41 -0.75 0.08 -0.26 -0.05 -0.05 -0.58 -0.8 0.28 -1.04 0.53 0.63 0.47
- - 4.8 - 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.28 4.24 -5.01 -1.05 -3.42 -1.67 -4.19 1.61 - - - - - - 3.93 -3.04 -3.94 - - - - - - - - - - - -5.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - -8.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.