Heatmap: Cluster_190 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 2.12 -0.37 1.28 -1.46 - - - -1.27 -1.33 - 1.29 2.0 -1.58 - 2.45 -1.38 3.66 0.65 1.57 1.09 - - -0.96 0.89 -2.49 - - -0.88 -0.97 - - - - -2.23 -1.94 - - - -0.21 -2.05 0.67 - - -1.21 - -2.68
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.58 - - - - - - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.57 - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - - - - - -0.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.45 - -0.38 - - - - - 0.85 0.56 - - -0.84 - 2.77 3.41 - - - - - 0.97 1.01 3.13 - - 0.66 -0.43 -0.02 - - - - - - - - - - - 1.14 - - - 1.2 -
- - 2.38 - - - - - 2.77 - - - - - - - 4.68 - - - - - - 1.22 - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.55 2.76 0.36 - - 2.16 - -1.32 - - - - - - 2.5 0.75 - - - - - 2.19 0.69 2.14 - - - -2.32 -1.0 - - - - 1.31 - -0.26 - 0.25 - - - - - - - -1.95
- 0.13 3.59 1.7 - - - - 0.75 - - - - - -3.14 2.81 3.72 0.28 - - - - - - - 3.04 - - - -3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.56 3.23 1.33 -1.82 - - - 1.75 - - - - - - - 3.68 0.18 0.6 2.14 - - - -0.71 - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.75
- - 4.87 3.3 - - - - - - - - - - - - - 2.87 - - - - - - - - - - - 0.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.96 2.78 2.04 -0.21 - - - - - - - - - -1.64 1.5 4.77 - - - - - - - - 1.79 - - - -1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.28 2.46 -0.8 2.89 2.17 0.57 - - - - - - - -3.66 - 1.41 2.58 - 2.08 - - - - 0.6 3.02 - - - -2.25 0.63 - - -0.88 - - - - - -0.75 - - -0.65 - - - - -
- - 2.39 0.82 - 1.37 - - - - - - - - - - 0.98 - 3.81 1.6 4.08 -0.09 - - 0.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.96 3.14 1.41 - - - - - - - - - - - - 1.49 - 3.27 - - - - 1.18 2.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.23 - - - - - - - - - - - - 4.27 - - - - - - - 4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.82 1.49 3.16 - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - 3.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.72 0.32 - - - 2.6 - 0.18 - - - - -1.07 2.37 3.12 3.39 - - - - - 1.23 - 0.66 - - - - - - - - - - - - - 1.89 - - - - - - - -1.04
4.13 - 1.43 -1.29 1.34 - - - - - - - - - -5.4 2.88 1.53 0.04 - 3.58 - - - - -2.91 - - - - -3.55 - -1.42 - - - - - - - - -0.89 - - - - - -1.2 -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.56 - - - - - - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.12 2.8 2.39 -0.67 - - - - 0.61 - - - - - - -1.98 1.44 -2.01 2.0 4.04 -1.92 0.54 - -1.53 - 1.79 - - - -5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.96 - - - - - - - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.83 - 2.33 4.4 - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.66 - 3.16 - - - - - - - - - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.58 3.77 0.96 - - - - 1.34 - - - - - -4.13 - 3.54 0.7 - 2.03 - - - 1.88 - 2.38 - - - -3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.97
- -0.8 3.54 1.36 - - - - 2.39 - - - - - -5.28 0.53 3.39 0.02 3.04 - - -1.08 - -1.09 - 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.06 - 3.22 1.71 -1.14 - - - - - - - - - - 0.75 3.8 0.56 - 1.79 - - - - -1.62 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.66 - 3.47 1.13 - - - - - - - - - - - 3.52 1.87 -6.43 1.9 3.03 - - - 1.14 - 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.0 1.81 - - - - - - - - - - - 1.23 2.82 - - 4.55 - - - - - 1.84 - - - -2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.44 3.46 - - - - - - - - - - - - 3.33 1.45 - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.32 2.0 - - - - - - - - - - - - 4.79 - - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.84 2.69 - - - - - - - - - - -3.78 - 3.38 - - 1.41 - 0.97 - - - 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.66 4.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.44 - - - - - - - - - - - - - 2.5 4.77 - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.53 - 1.51 -0.16 - - - - 1.39 - - - - - - -0.48 1.21 -2.43 -0.14 4.63 - -2.28 - - - -0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.6 2.14 - - - - 1.27 - - - - - -2.69 - 3.85 1.8 - - - - - - - 3.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.44 -0.72 1.32 0.8 - - - - 0.39 - - - - - - 1.26 -0.97 - 3.24 3.65 -0.38 1.75 - -2.36 - 0.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.48 3.64 1.44 - - - - 2.92 - - - - - -6.09 2.07 2.92 -3.17 1.7 0.82 - 0.12 - 0.09 - 2.37 - - -1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.38 - 3.38 0.15 - - - - 0.02 - - - - - - - 2.24 -1.59 2.52 3.71 -0.36 1.56 - - - 0.97 - - - -4.23 - - - - - -1.81 -1.32 - - - - - - - - - - -
- 2.68 2.46 2.6 - - - - - - - - - - -3.42 1.92 3.74 0.01 - - - - - - - 3.55 - - - -3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.55 - - - - - - - - - - - - - 4.61 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.91 2.51 1.08 -0.21 - - - - - - - - - - 2.09 3.17 - - 4.09 -0.48 0.89 - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.72 - 0.59 -2.62 -4.73 - - - 1.44 - - - - - - 3.11 1.08 -1.57 2.89 3.56 -0.38 2.35 - - - -0.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.77 1.05 1.77 - 2.71 3.34 1.03 2.23 0.67 - - - - - -2.42 2.49 2.24 - - - - - - - - 0.79 - - 0.36 -0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.57 - - 2.59 - - - - - - - - - - 3.78 - - - - - - - 1.46 1.85 - 2.11 - - - - - - - - 2.53 - - - - - - - - - - -
- - 4.21 - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - 2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.63 - - - - - - - - - - - - - 3.79 3.85 - 0.99 - - - 0.85 - 1.79 - - - -2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.37 2.86 - - - - - - - - - - - - 4.18 1.96 - 2.2 - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.0 - -0.79 - - - - - - - - - - 2.5 3.71 - - 3.83 - - - - - 2.66 - - - -3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.83 3.37 1.25 - - - -1.95 - - - - - - -3.21 2.99 3.83 - - 2.58 - - - 0.85 - 1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.83 3.37 1.25 - - - -1.95 - - - - - - -3.21 2.99 3.83 - - 2.58 - - - 0.85 - 1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.21 1.45 2.48 1.01 -3.09 - - - - - - - - - - 1.41 2.25 -2.87 2.13 3.81 - -1.61 - -0.52 - 2.52 - - - -6.26 - - -4.12 - - - -3.15 - - - - - - - - - - -
- 3.45 3.76 2.97 - - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.77 3.53 2.93 0.46 - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.17 - - - - - 0.49 - - - - 1.43 -0.45 - 4.13 - - 1.71 - 3.28 - - - 2.65 - - - -2.92 - - - - - - 0.19 - - - - - - - - - - -0.55
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - - - - 4.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.34 - - - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.75
- - 0.06 0.51 1.21 2.31 0.07 - - 0.05 - - 0.18 - -2.97 - 0.81 - 3.55 1.71 3.18 0.5 - - 1.06 -0.04 -2.02 - - - -1.46 - - - - - - -1.74 - - -1.24 -0.48 -0.47 0.26 -1.65 - -1.55 -
- - 4.31 - - - - - - - - - - - - - 4.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.91 2.76 - - - - - - - - - - -1.08 - 4.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.89 - - - - - - - - - - - - - 4.22 2.76 - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.77 1.2 2.25 0.24 1.96 - - -0.93 - - -0.76 - -0.84 - 2.78 - 3.41 2.19 2.28 -0.46 - -0.93 - 0.07 - - 0.18 -2.67 - - - - - - - - - -0.95 - -1.02 0.5 -0.05 - - - -
- - 3.35 - - - - - - - - - - - - - 1.36 4.12 - 3.91 - 1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.07 -0.2 -0.01 2.83 - - - - -0.04 -0.2 - - -1.65 - 2.55 2.7 - - - - - - -0.42 2.58 - - -0.46 -0.12 -1.05 -0.07 -0.91 - - 0.16 0.0 0.5 - - - - - 0.89 - - - -1.42
- - 3.37 2.66 -0.34 - - - - - - - - - - 1.79 2.81 1.27 - 3.3 - - - 1.11 - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.9 - 2.51 -1.68 1.16 - - - - - - - - - - 2.87 2.51 -0.15 -0.3 1.81 - 0.45 - -0.5 - 2.18 - - - -4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.62 1.85 - - - - - - - - - - - - 2.28 4.18 - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.28 2.81 0.14 -1.79 - - - 0.13 - - - - - - 0.8 0.7 -0.36 3.82 3.83 1.11 -4.59 - -2.7 - 1.49 - - - -6.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.43 0.48 - - - - - - - - - - - 2.3 3.94 -6.1 - 4.03 -0.35 - - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.87 2.63 - - - - 1.27 - - - - - - - 3.25 - - 3.01 - - - - -0.63 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.45 2.21 1.93 -0.68 -3.8 - - - 0.4 - - - - - -7.91 2.56 2.31 -1.31 1.35 3.06 2.08 0.63 - -1.82 - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.4 2.56 2.79 2.08 - - - - - - - - - - 2.85 3.85 - - - - - - - - 2.98 - - - -3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.74 - - - - - - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.23 - - - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.97
2.38 - 3.98 - - - - - - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - 3.48 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - 1.73 - - - - - -
- - 3.81 - - - - - - - - - - - - - 2.98 - - 3.59 - - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.13 - 1.43 -1.29 1.34 - - - - - - - - - -5.4 2.88 1.53 0.04 - 3.58 - - - - -2.91 - - - - -3.55 - -1.42 - - - - - - - - -0.89 - - - - - -1.2 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.