Heatmap: Cluster_279 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.73 -2.16 -0.91 -0.39 0.23 0.96 0.99 0.94 -1.87 0.33 0.78 0.85 0.39 -0.22 0.49 -1.85 -0.62 -0.52 -0.68 -0.59 -1.2 -0.89 -2.27 -2.3 0.3 0.41 0.53 0.45 0.0 0.12 0.54 0.48 -0.24 -0.16 -0.06 0.3 0.53 0.36 -0.87 -0.3 -0.01 -0.13 -0.27 -0.32 -0.68 0.37 0.03 0.19
-0.86 -0.79 -0.22 -0.19 0.8 -0.21 0.12 0.17 -0.68 0.54 0.69 0.68 -0.13 -0.82 0.32 -1.41 -0.62 -0.88 -0.56 -0.29 -0.51 -0.57 -1.69 -2.29 0.32 -0.03 0.32 0.53 -0.25 0.12 0.58 0.92 0.18 0.27 -0.76 0.7 0.36 0.28 -0.28 -0.34 -0.87 -1.12 -0.57 0.55 -0.35 0.21 1.24 -0.03
-0.07 -0.82 -0.18 -2.06 0.27 0.27 0.21 0.13 -1.17 0.64 1.42 1.41 0.7 0.08 -0.13 -0.9 -0.96 -1.29 -0.36 -0.27 -0.41 -0.31 -3.16 -2.36 0.39 -0.17 0.41 0.24 -0.08 -0.02 0.41 0.73 0.23 0.0 0.57 0.02 0.45 0.45 -1.09 -0.31 -0.6 -0.85 -0.41 -0.59 -0.52 0.36 -0.12 -0.02
-1.8 -2.23 -2.08 -4.0 -0.38 0.71 0.27 0.47 -1.58 0.46 1.6 1.38 0.25 -0.11 0.69 -1.95 -2.51 -2.1 -1.68 -0.72 -0.38 -0.31 -4.73 -2.84 0.51 -1.03 1.35 0.22 0.09 -0.04 0.53 1.31 0.39 0.04 -0.33 0.15 0.92 -0.23 -0.46 -0.07 0.14 -0.27 -0.04 0.03 -0.13 -0.31 0.04 -0.15
-1.56 -2.44 -1.02 -1.74 0.42 0.61 0.36 0.17 -0.83 0.61 0.51 0.41 -0.05 -1.7 0.43 -1.59 -0.94 -1.18 -1.01 -0.72 -1.01 -0.84 -3.55 -0.32 0.57 -0.44 0.46 1.0 0.88 0.35 0.85 1.18 0.46 0.23 0.46 0.75 0.77 -0.18 -0.89 -0.42 -1.01 -1.36 -0.46 0.35 -0.54 -0.2 0.92 0.0
0.19 -1.14 -1.3 -2.42 0.04 -0.08 0.38 0.24 -0.4 0.35 0.96 1.09 -0.3 -1.04 0.39 -0.81 -1.65 -1.11 -0.93 -0.53 -0.25 -0.49 -1.97 -1.73 0.41 -0.52 0.71 0.45 0.65 0.11 0.62 0.81 0.44 0.21 0.17 0.33 0.52 0.13 -0.44 -0.11 -0.28 -0.73 0.04 0.04 -0.14 0.06 0.39 0.25
-1.65 -1.45 -1.2 -0.64 0.53 0.7 0.94 0.6 -0.65 0.25 0.57 0.55 0.5 0.2 0.11 -1.62 -0.74 -1.65 -0.18 -0.02 -0.1 -0.4 0.05 -0.34 0.4 -0.56 0.83 0.13 -0.13 -0.01 0.2 0.03 0.11 -0.07 -0.51 0.18 0.08 -0.29 -0.55 0.11 0.3 -0.17 0.3 0.11 -0.28 -0.28 0.02 0.2
-1.74 -1.43 -0.85 -2.69 0.15 -0.21 -0.15 0.04 -1.03 0.36 1.56 1.47 0.31 -0.04 0.38 -2.46 -2.06 -1.66 -0.55 -0.39 -0.39 -0.07 -3.86 -1.09 0.56 -1.36 0.56 0.22 0.28 -0.04 0.33 0.62 0.37 0.18 0.34 0.72 0.71 0.07 -0.46 0.02 -0.05 -0.41 0.18 0.17 0.04 -0.07 0.1 -0.02
-0.71 -0.07 0.23 -2.17 0.38 0.48 0.83 0.47 -0.07 0.16 0.35 0.27 0.3 0.05 0.38 -0.54 -0.43 -0.27 -0.67 -0.27 -0.63 -0.47 -2.2 -1.43 0.43 0.36 0.72 0.41 0.29 -0.06 0.29 0.08 0.01 0.29 0.08 -0.01 0.71 -0.24 -0.61 -0.25 -0.45 -0.39 -0.37 -0.11 -0.05 -0.22 -0.12 0.17
-2.78 -1.06 -1.87 -1.19 -0.72 -0.88 -0.73 -0.01 -1.72 0.95 0.91 1.3 1.36 1.05 0.53 -2.14 -0.96 -1.33 -0.82 -1.52 -2.06 -1.99 -2.61 -2.61 -0.66 -1.01 0.19 0.76 -0.41 -0.06 1.1 0.97 0.11 -1.31 -1.96 0.11 0.54 1.11 -0.93 0.31 0.8 0.16 0.25 0.06 -0.46 1.08 0.61 -0.05
-0.52 -1.73 -0.82 -1.92 0.63 0.04 -0.16 0.04 -0.96 0.55 1.27 1.07 0.22 -0.56 0.36 -1.81 -1.77 -1.4 -0.72 -0.41 -0.31 -0.52 -2.21 -2.15 0.5 -0.94 0.43 0.15 0.49 -0.01 0.52 0.89 0.52 0.18 0.28 0.38 0.61 0.17 -0.57 -0.04 0.04 -0.23 0.15 0.09 -0.06 0.12 0.32 -0.06
-1.84 -1.3 -0.7 -1.98 1.06 -0.53 -1.64 -1.16 -0.55 0.37 1.6 1.69 -0.07 -1.02 0.08 -1.12 -0.19 -0.49 -0.12 0.19 0.42 0.26 -3.29 -0.59 0.27 -0.07 0.18 -0.01 0.08 0.01 0.22 0.81 0.07 0.04 -0.18 -0.55 0.42 0.45 -1.11 -0.33 -0.33 -0.56 0.08 0.2 -0.24 0.53 0.13 -0.3
-0.98 -0.78 -0.04 -2.33 0.29 0.6 0.27 0.16 0.13 0.44 1.56 1.58 -0.72 -2.98 0.34 -1.68 -0.38 -0.14 -0.36 0.07 -0.15 -0.17 -0.6 0.23 0.63 -0.25 0.76 0.6 0.04 -0.04 0.66 0.89 -0.18 -0.06 -0.7 0.67 0.28 -0.18 -1.5 -1.13 -2.68 -2.91 -1.01 -0.7 -1.68 -0.19 0.3 0.07
-0.4 -0.6 -4.07 -2.46 -1.16 -0.93 -2.11 -1.38 1.52 0.32 3.19 3.19 -0.51 0.64 0.88 -0.14 -2.91 -3.07 -2.92 -2.01 -2.36 -1.6 -5.36 -4.3 -1.02 0.95 -0.56 -2.12 0.07 -0.23 -1.88 0.76 -1.05 -0.92 0.5 -1.7 -1.48 -1.05 -0.91 -1.1 -1.41 -1.24 -1.4 -0.23 -1.15 -1.05 -0.81 -0.25
-0.41 -0.97 -0.47 -3.31 0.8 0.04 -0.25 -0.41 0.27 0.57 0.84 0.79 0.07 -1.08 0.5 -1.12 -0.32 -0.87 0.03 0.32 0.27 -0.03 -2.85 -2.39 0.25 -0.59 0.34 0.1 0.4 -0.08 0.43 1.05 0.28 -0.05 0.2 -0.27 0.6 0.25 -1.05 -0.0 -0.41 -0.97 0.04 0.15 -0.08 0.27 0.15 -0.1
-1.14 -2.08 -1.19 -3.02 -0.87 0.2 0.87 1.11 -0.73 0.54 1.34 1.5 0.01 -0.72 0.54 -1.31 -2.02 -1.01 -1.4 -0.68 -0.75 -0.55 -3.01 -2.03 0.68 -0.95 0.94 0.11 -0.22 0.12 0.73 1.4 0.4 0.01 0.58 0.08 0.66 -0.03 -1.06 -0.35 -0.24 -0.81 -0.18 -0.42 -0.37 -0.03 0.05 -0.14
-0.31 -1.19 -0.41 -2.29 0.77 -0.19 -0.4 -0.37 -1.17 0.36 1.21 1.18 0.09 -0.47 0.3 -0.92 -0.66 -0.7 -0.37 0.16 0.13 0.15 -3.31 -0.81 0.63 0.0 0.49 0.15 0.08 -0.05 0.17 0.92 0.07 0.0 0.24 -0.09 0.39 -0.15 -0.66 -0.12 -0.11 -0.24 -0.1 0.18 -0.32 -0.12 0.31 -0.04
-0.74 -1.0 -0.86 -3.11 0.86 1.06 0.81 0.51 -0.51 -0.1 0.96 0.83 -1.44 -3.55 0.11 -1.79 -0.55 -0.87 0.52 0.57 0.55 0.23 -0.25 -1.13 0.54 -0.61 0.51 0.6 0.69 0.06 0.98 0.85 0.18 -0.02 -2.71 0.51 0.4 -0.6 -1.22 -0.92 -1.48 -1.87 -0.65 -0.27 -0.87 -0.62 0.39 0.23
-1.83 -0.45 -0.2 -1.91 0.47 -0.2 -0.31 0.19 -0.57 0.55 1.55 1.48 0.05 -1.22 0.23 -1.62 -1.12 -0.01 -0.88 -0.39 -0.12 0.67 -1.69 -1.54 1.45 0.1 0.44 -0.03 0.29 -0.24 0.11 0.92 0.02 -0.11 -0.07 0.12 0.03 -0.29 -0.84 -0.53 -1.01 -0.97 -0.17 -0.13 -0.42 -0.3 0.39 0.0
-2.56 -1.62 -2.88 -3.96 -1.65 -2.28 -3.37 -3.78 -2.5 -0.21 2.87 2.96 0.0 -0.53 1.09 -1.88 -2.4 -1.93 -1.3 -0.9 -0.81 -0.55 -2.24 -1.9 0.18 -0.86 1.53 -0.4 0.3 -0.16 -0.17 1.92 -0.82 -0.58 -0.81 1.12 -0.67 -3.11 -0.35 -0.86 -1.9 -1.83 -1.37 -0.3 -0.96 -3.11 0.11 0.67
-0.75 -0.88 -0.2 -2.12 1.14 0.04 0.08 -0.02 -0.36 0.22 0.58 0.53 0.09 -0.6 0.16 0.16 0.0 -0.49 0.09 0.51 0.4 0.27 -1.25 -1.69 0.23 -0.7 -0.12 0.24 0.07 -0.01 0.18 0.77 0.15 -0.1 -0.17 -0.29 0.33 0.36 -1.09 0.13 -0.1 -0.53 0.15 0.05 -0.12 0.39 -0.33 -0.44
-3.59 -2.36 -4.16 -9.2 -4.62 -5.58 -5.35 -4.59 -3.21 1.14 1.78 1.99 -0.01 -1.63 0.92 -3.86 -2.34 -1.73 -1.88 -1.81 -1.91 -2.5 -4.07 -2.64 -1.69 -2.41 -0.87 -0.12 -0.51 1.07 0.92 1.53 0.93 1.18 -0.99 0.18 0.98 1.33 -0.49 0.28 -0.14 -0.64 -0.09 0.75 0.67 1.24 0.8 0.24
0.22 -0.77 -0.65 -2.38 0.23 0.03 -0.71 -0.21 -0.47 0.75 1.21 1.05 0.78 0.14 0.06 -0.25 -0.32 -0.77 -0.63 0.04 0.22 0.21 -1.96 -2.26 0.2 -0.13 0.41 0.05 -0.27 0.11 0.55 0.46 0.24 -0.03 -0.33 -0.07 0.52 0.39 -0.99 -0.53 -0.4 -0.71 -0.23 0.08 -0.33 0.43 0.04 -0.09
-1.03 -0.35 -0.67 -0.97 -0.35 -0.17 -0.43 -0.59 -0.69 0.02 1.31 1.14 -0.2 -1.41 -0.73 -0.16 -0.44 -0.33 -0.63 -0.53 -0.35 0.03 -1.21 -2.22 0.36 -0.39 1.1 0.19 0.77 0.01 0.63 0.79 0.26 0.48 0.46 -0.33 0.39 0.03 -0.57 -0.01 -0.02 -0.25 0.1 0.02 -0.14 0.07 0.11 0.11
-0.5 -0.71 -1.05 -2.9 0.57 -0.42 -0.75 -0.4 -0.96 0.31 1.74 1.71 0.07 -0.6 0.12 0.03 -1.39 -0.6 -1.12 -0.41 -0.33 -0.81 -3.08 -0.7 0.19 -0.53 0.59 0.09 -0.26 -0.18 0.76 1.39 0.51 0.27 -1.03 0.58 0.49 -0.35 -0.23 -0.32 -1.2 -1.27 -0.33 0.56 0.04 -0.36 0.37 -0.25
-1.33 -0.64 -0.23 -1.6 -0.11 0.02 0.11 -0.03 -0.52 0.62 0.73 0.42 0.47 -1.04 0.29 -0.33 -0.45 -0.9 -0.37 -0.38 -0.19 -0.22 -2.51 -2.25 0.27 -0.37 0.61 0.2 0.17 0.16 0.66 1.08 0.6 0.32 0.54 1.03 0.64 0.07 -0.53 -0.38 -0.83 -1.47 -0.38 -0.15 -0.07 0.0 0.2 0.16
-1.44 -0.67 -0.23 -0.68 -0.63 -0.33 0.03 -0.13 -0.72 0.45 1.18 1.14 0.53 -0.08 -0.0 -1.2 -0.88 -1.24 -0.06 -0.2 -0.27 -0.25 -1.87 -0.52 0.16 -1.15 0.6 0.17 0.54 -0.01 0.18 0.44 0.17 0.21 0.3 0.32 0.15 0.29 -0.43 0.21 -0.13 -0.09 0.14 0.22 -0.14 0.32 0.07 -0.05
-1.42 -2.32 -1.2 -2.91 0.14 -0.32 0.02 -0.29 -1.15 0.5 1.34 1.13 0.4 -0.35 0.24 -1.14 -1.63 -1.32 -0.97 -0.49 -0.6 -0.73 -2.88 -0.48 0.59 -0.59 0.76 0.05 0.82 -0.01 0.42 0.79 0.27 0.15 1.25 0.89 0.41 0.21 -0.73 -0.18 -0.1 -0.29 -0.09 -0.24 -0.32 0.16 -0.31 0.28
-2.23 -1.69 -0.17 -2.7 0.14 0.03 0.21 0.14 -0.4 0.26 0.53 0.65 -0.0 -0.81 0.26 -0.33 -0.83 -0.94 -0.08 0.08 -0.06 -0.42 -2.09 -0.68 0.83 -0.15 1.19 0.88 0.29 -0.11 0.35 0.77 0.08 -0.07 -0.54 1.14 0.42 0.09 -0.65 -0.53 -0.54 -0.83 -0.24 -0.07 -0.52 0.16 0.31 0.27
-0.58 -1.62 -0.46 -2.15 0.35 0.44 0.68 0.78 -0.3 0.45 1.69 1.88 -0.04 -1.46 0.49 -0.38 -0.75 -0.53 -0.59 -0.12 -0.36 -0.24 -2.14 -0.47 0.61 0.0 -0.09 -0.13 -0.29 -0.16 0.29 0.97 -0.1 -0.24 -0.99 0.83 0.12 0.06 -1.28 -0.86 -1.28 -1.69 -0.87 -0.32 -0.84 -0.05 0.17 -0.14
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-0.55 -0.61 -1.01 -1.7 0.13 -0.3 -0.14 -0.49 -0.52 0.69 1.34 1.19 0.34 -0.92 0.39 -1.37 -0.68 -0.42 -0.74 -0.5 -0.26 0.05 -3.82 -1.23 0.9 0.89 0.94 -0.45 -0.44 -0.23 0.0 0.91 0.2 0.15 1.0 -0.66 0.39 0.39 -0.75 -0.36 -0.45 -0.91 -0.3 -0.47 -0.15 0.37 -0.15 0.03
-1.08 -1.17 -1.37 -2.34 0.71 0.17 0.15 -0.03 -0.52 0.62 1.37 1.39 0.05 -0.92 0.29 -1.29 -1.46 -1.71 -0.55 -0.34 -0.13 -0.16 -2.48 -1.79 -0.19 -1.27 0.3 0.14 0.16 0.04 0.34 0.96 0.12 0.0 -0.72 -0.22 0.17 0.14 -0.44 0.05 -0.34 -0.48 0.43 1.07 -0.22 0.09 1.11 0.05
-11.01 -3.94 -7.75 -8.31 -3.88 -2.73 -2.24 -2.36 -1.99 0.72 1.66 1.73 0.65 0.33 0.89 -2.42 -4.39 -5.27 -4.91 -6.06 -6.75 -4.77 -7.57 -6.5 -1.36 -0.84 1.04 0.75 0.27 0.59 1.21 0.76 0.72 0.33 1.14 1.06 0.94 0.47 -0.6 0.46 0.13 -0.25 0.31 0.46 0.04 0.51 0.71 0.38
-1.58 -1.65 -1.36 -2.11 0.7 0.08 0.24 0.07 -0.99 0.42 0.95 0.93 0.5 0.59 0.38 -1.6 -1.49 -1.66 -0.58 0.06 0.14 -0.03 -0.7 -0.36 0.53 -1.46 -0.06 0.04 -0.27 -0.04 0.51 -0.17 0.27 0.11 0.27 0.08 0.31 0.01 -0.22 0.27 0.11 0.07 0.35 0.32 0.16 -0.05 0.15 0.14
-2.7 -0.96 -0.26 -2.7 0.26 0.2 0.62 0.42 -1.06 0.71 0.65 0.56 -0.13 -1.44 0.4 -1.91 -0.87 -0.73 0.09 0.02 0.03 0.12 -0.83 -1.81 0.55 -0.84 0.3 0.26 0.16 0.05 0.48 0.66 0.37 0.23 -0.83 0.44 0.64 0.13 -0.66 -0.11 -0.45 -0.95 0.26 0.44 0.0 0.13 0.74 0.21
-1.62 -1.63 -0.78 -3.91 1.07 0.12 -0.46 -0.39 -1.55 0.31 1.28 1.24 0.23 -0.89 0.25 -1.56 -0.85 -1.29 0.08 0.22 0.31 0.06 -1.06 -0.61 0.53 -0.68 1.05 0.14 -0.34 -0.13 0.22 1.07 0.22 -0.11 -1.42 0.43 0.4 -0.41 -0.63 -0.06 -0.13 -0.37 0.15 0.48 -0.23 -0.47 0.47 -0.05
-2.2 -2.25 -1.45 -2.91 0.32 0.28 -0.31 -0.32 -0.75 0.57 1.42 1.44 0.23 -0.75 0.61 -3.49 -2.55 -1.77 -1.55 -0.91 -0.79 -0.3 -3.22 -3.27 0.23 -0.94 0.59 -0.14 -0.83 0.09 0.11 1.49 -0.16 -0.37 0.48 0.3 -0.04 0.53 -1.43 0.27 1.01 0.14 0.51 0.79 -0.6 0.82 0.43 0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.