Heatmap: Cluster_254 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-1.22 1.79 1.5 3.82 -3.04 - - - 4.18 - - - - - -5.34 0.41 1.48 -1.33 - - - - - -2.29 - 2.06 - - - -5.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.61 - - - - - - - - - - - - 4.12 2.72 -2.04 - - - - - 0.82 - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.06 3.13 3.23 -0.51 - - - - 3.33 - - - - - - 2.54 1.45 -1.76 - - - - - 1.99 - 2.16 -1.45 - - -2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.5
- - 1.74 2.83 - - - - 4.01 - - - - - - 3.04 2.78 - - - - - - - - 2.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.45 -1.98 2.36 2.52 - - - - 4.3 - - - - - - 3.38 1.44 - - - - - - - - 0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.05 - 3.02 0.11 - - - - 2.41 - - - - - -2.14 3.15 2.69 - - - - - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.88 - - - 4.58 - - - - - - 3.48 1.95 - - - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.9 -1.23 0.67 3.13 0.28 0.76 0.41 0.03 2.39 -0.4 0.73 1.2 -2.55 -2.25 -0.64 -1.33 1.18 0.06 -1.77 -0.1 -2.63 -0.41 -0.22 0.55 -0.76 1.04 0.36 -1.61 -0.67 -1.18 -2.41 -2.47 -3.8 -2.39 -2.45 -2.17 - 0.45 -1.03 -1.33 -1.93 -0.94 -1.27 -1.68 -1.35 -0.19 -0.93 -0.4
- - - - 3.12 - - - 3.98 - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - 3.21 - - - - - - 2.43 - - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - -
0.52 2.41 0.89 0.59 -1.3 - 0.22 -0.06 3.79 -1.67 -1.04 -0.66 -1.65 -3.24 -2.96 1.15 0.56 1.92 -3.0 -3.23 -1.53 -2.42 -1.97 -2.05 2.11 0.79 -3.72 -1.66 -3.64 -1.7 -1.38 -3.57 -1.0 -2.64 -1.32 -1.43 -2.18 -2.27 -1.0 -2.72 -2.67 -3.35 -3.54 -3.8 -2.48 -2.49 -2.24 -5.29
- - 0.28 - - - - - 4.14 - - - - - - 2.1 4.1 0.8 - - - - - - - 2.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.3 - - -2.59 0.26 -1.16 -1.14 2.57 - - - - - -3.68 3.02 -0.2 2.78 - - - - - 1.5 2.13 1.46 -1.78 - -1.92 -1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.63
- 1.67 0.93 0.62 -0.04 - - - 3.8 -4.41 - - - - -6.34 2.72 1.42 -1.33 - -0.14 -2.9 -1.63 - - -1.87 1.22 - 1.72 -1.66 -0.92 - -1.78 -3.03 -1.43 - - - 1.58 - - - - - - -1.18 1.82 - -0.1
-1.83 -3.23 -1.35 3.63 -4.51 2.24 2.46 1.72 2.82 -3.85 -4.54 -2.04 - -2.71 -2.52 1.61 1.17 1.15 - -1.81 -4.2 -4.02 - 1.29 -1.7 -0.2 -2.91 -4.0 -4.95 -3.73 -3.76 -2.63 -6.4 - -3.24 -4.55 - -1.23 -3.86 -2.31 -4.03 -3.28 -4.54 - - -1.79 -3.05 -6.1
- - 2.9 2.85 - - - - 4.33 - - - - - - - 2.42 - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.0 - - - 4.39 - - - - - - 0.69 3.14 0.09 - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.44 - - - - 4.3 - - - - - - 3.89 1.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.77 1.84 1.86 0.16 0.99 0.64 -0.83 3.99 -3.36 - - -2.26 -3.77 -2.97 - 0.51 3.39 - -1.5 -1.72 -1.92 - -0.13 0.09 -0.59 -3.88 -1.42 - -2.97 -2.25 - -3.84 -3.19 -4.27 -2.14 -3.79 -2.96 -2.39 - - -3.89 - - -4.3 -3.07 - -3.02
- - 2.85 - - - - - 3.86 - - - - - - 0.98 4.2 1.01 - - - - - - - 1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.13 - - - - - 4.53 - - - - - -2.16 - - - - - - - - - - 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.98 0.45 - - - - - 4.19 - - - - - - 2.28 3.62 - - - - - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.05 - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.74 - 1.97 - -0.89 - 2.58 0.26 - - - - -0.23 -1.39 1.22 3.21 -0.86 -0.85 - 2.27 - 0.05 3.17 -0.51 -2.38 - - -6.05 -1.59 - -2.8 - - - - -0.26 - -2.21 - - 1.03 -0.11 - -0.36 -0.33 -
-0.48 1.19 -0.11 3.38 -0.2 1.58 1.6 1.78 1.07 -0.61 -1.27 -0.6 -0.67 -0.97 -1.16 0.76 -0.24 0.46 -3.49 -1.03 -1.91 -2.09 -3.12 -1.13 -0.63 0.49 -0.74 -0.5 -0.85 -0.88 -0.76 -1.06 -1.08 -1.16 -1.58 -1.66 -0.77 -0.95 -2.03 -1.71 -1.07 -0.59 -1.5 -1.76 -1.32 -1.09 -1.41 -0.9
- - 4.07 - 0.51 - - - 4.37 - - - - - - - - 1.49 - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.52 2.21 0.19 -0.68 -0.72 -0.51 0.56 0.81 2.77 -0.62 -4.57 -2.34 -0.64 -2.24 -1.39 3.27 0.81 -1.84 -2.87 -4.29 -3.37 -3.47 - -3.13 -2.21 1.97 -3.31 -1.03 -3.29 -0.81 0.27 -0.24 -1.44 -2.01 - -2.4 -0.59 -0.41 -2.1 -1.62 -1.88 -1.76 -1.68 -3.14 -2.99 -0.11 -1.59 -1.08
- - - 0.26 - - 2.95 0.76 4.48 - - - - - - - 3.15 -0.08 - - - - - - - 2.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.05 - - - - - 5.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.91 0.98 4.15 -0.84 1.32 1.98 0.88 2.87 -2.43 - - -3.82 - -5.48 - 0.41 0.45 -2.25 -0.22 -0.85 -1.27 - - -1.43 -0.22 -3.78 -0.81 0.32 -1.38 -1.74 - -4.41 -0.78 -0.41 -2.52 -2.46 -3.32 - - -2.45 -3.18 -3.08 - - -2.52 -3.31 -1.79
- - 2.17 - - - - 1.1 4.4 - - - - - - 2.45 - 2.15 - - 2.07 - - - - 1.91 - - - - - - - - - - - - - - 1.24 - - - - - - -
- 1.0 4.31 - - - - - 4.29 - - - - - -5.86 - 1.19 -1.71 - - - - - - - 2.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.92 2.43 1.54 -0.92 - - - 4.02 - - - - - -5.57 3.46 2.48 - - - - - - - - 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.99 - - - - 4.27 - - - - - - - 4.21 2.32 - - - - - - - 1.33 - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.14 1.25 - - - - 3.89 - - - - 1.69 0.63 - 3.03 - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.45 -4.69 -1.63 4.53 2.91 1.66 1.11 0.04 3.04 -5.56 - - - - -6.88 -1.32 -2.25 -2.17 - - - -3.82 -3.92 - - -3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.69 1.52 -0.63 - - -0.75 - 4.72 - - - - - -5.89 3.45 1.77 -0.87 - - - - - -1.75 - 0.76 - - - -4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.4 -5.47
- - 0.24 2.37 -2.14 -0.19 0.04 - 4.0 - - - - - - -0.46 3.62 -0.16 - - - - - - 2.72 1.16 -0.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.64 - - 1.7 - - - 4.87 - - - - - -3.61 3.09 0.38 - - - - - - - - 1.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.95 -1.33 -2.51 -0.89 -1.74 - -1.97 - 0.5 2.94 - -2.08 -0.23 -0.93 - 0.62 3.1 2.65 1.47 - -1.87 -3.46 - - -4.51 - - - - -2.11 - - - -2.3 - - - -2.17 - -
0.04 -0.36 -3.41 2.71 2.05 1.03 2.1 2.11 1.96 -0.3 -5.98 -6.14 -0.02 -0.01 -1.45 -5.27 -0.68 0.06 -0.36 -1.42 -0.74 -2.13 -3.44 1.59 -0.24 0.03 -2.05 -2.89 -2.25 -1.45 -2.24 -2.27 -2.8 -1.59 -2.23 -3.37 -2.7 0.4 -3.24 -0.87 -0.73 0.06 -0.88 -1.27 -3.08 0.37 -1.74 -1.12
- 0.5 1.68 0.71 - - - - 3.82 - - - - - -5.36 3.06 3.42 -0.35 - - - - - -1.1 - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.44 2.19 1.96 2.46 - 3.89 0.73 - - - - - - - 0.62 - - - - - 1.78 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.6 - - - 3.95 - - - - - - - 4.05 - - - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.68 2.74 - - - - - 4.44 - - - - - - - 3.2 - - - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.85 1.42 0.19 0.34 0.37 -0.83 0.27 -0.16 2.46 -1.22 -0.6 -2.24 -2.76 -4.36 -1.43 1.14 1.39 2.04 -2.79 -2.49 -1.57 -0.24 -3.03 0.57 2.31 1.13 -1.01 -0.86 0.22 -1.17 -0.64 0.53 -0.45 -0.19 -1.37 -1.48 -0.47 -1.31 -1.98 -3.47 -3.0 -2.88 -2.89 -2.51 -2.11 -1.79 -1.3 -0.91
- -0.11 - 2.52 -1.35 - - - 3.99 - - - - - -3.38 0.34 3.14 1.21 - - - - - -0.26 - 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.96 - - - - - 4.5 - - - - - - - 3.6 0.55 - - - - - - - 3.28 - - - -2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.92 - 3.57 0.67 - - - - - - - - - - - 2.93 2.46 - - 0.47 - - - - - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.08 -0.01 0.63 -1.91 0.63 2.01 2.1 2.2 -1.28 -3.34 - -3.71 -3.01 -2.51 -1.17 1.41 2.22 2.6 -0.08 -1.67 -1.06 - -0.02 -1.22 -0.08 - -2.98 -3.44 -0.68 -1.46 -2.88 -1.16 -1.24 -1.11 -4.19 -1.56 -0.47 -3.72 0.46 -1.89 -2.05 -0.64 0.15 -0.77 -0.48 -0.12 -3.92
- -2.7 0.67 3.15 - 0.88 -0.75 - 4.09 -4.03 -0.94 0.24 - -2.68 -2.34 3.21 -2.96 0.26 - -2.41 - -2.84 - - - 0.21 -3.24 -1.74 -0.46 -2.17 -1.92 - - -2.62 -1.41 -1.66 - -2.97 - - - - -1.7 -2.35 - -2.49 -2.77 -1.74
- - 0.79 3.5 - - 2.99 2.9 3.26 - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - 1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.24 0.08 0.88 -2.34 1.62 - 0.59 3.53 -2.52 - - - - -2.41 2.08 0.3 3.7 0.9 -1.1 - - - - 2.37 - - - - -4.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.09 -0.34 - - - - 3.66 - - - - - - - 4.22 - - - - - - 1.2 - 2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.34 1.94 - - - - 4.58 - - - - - - - 2.21 -1.01 - - - - - -0.18 - 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.57 2.24 -0.45 - - - 4.14 - - - - - - - 3.6 1.85 - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.84 - - - -1.82 1.01 4.11 -2.1 1.99 2.67 -1.48 0.14 -1.69 - 1.49 -2.15 - - - 0.67 - - -1.87 1.03 -0.99 -0.91 -0.03 -1.8 - - - -2.39 -1.36 - - -0.97 -0.49 - 0.14 -1.0 -2.16 - -0.81 -1.17 - -1.18
- 0.83 -0.3 0.67 -2.04 - - 0.45 4.17 -1.93 0.96 0.83 -1.71 -3.01 -1.34 -1.07 0.49 1.44 - -1.14 0.04 0.89 - 0.46 0.85 0.37 -0.9 - -1.77 -0.5 -2.52 -1.78 -2.83 -1.2 -0.95 -3.09 - -1.58 -2.62 -0.58 - -2.13 -1.04 -0.65 -2.35 0.05 - -3.45
- 3.35 - 1.46 - - - 2.07 3.79 - - - - - -3.69 - - 3.73 - - - - - - - 1.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.71
- - 1.38 -1.51 - - - - 4.4 - - - - - -4.36 4.14 1.7 -0.93 - - - - - -1.1 - 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.39 3.03 - - - - - 4.66 - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - 2.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.31 -2.39 -2.13 -2.77 - -0.59 - 2.02 -2.41 - -1.13 -0.67 -1.52 -1.93 3.0 0.4 2.76 2.68 -0.03 -1.47 - -0.77 - 0.17 0.66 - - - -1.49 -1.28 - - -2.03 - - - -0.15 - 0.58 0.28 -1.64 -1.81 - 0.6 0.26 -1.61 -1.19
-0.0 1.06 3.5 2.16 -0.85 -1.14 -0.9 - 3.8 - - - - - - -1.4 -2.11 3.24 - - - - - - 0.22 1.21 - - - -3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.34 1.6 - - - - 1.83 - - - - - - 3.56 3.56 - - - - - - - - 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.93 - - - - - 4.89 - - -1.0 - - - 0.88 1.87 - - - - - - - - 0.17 -0.67 - - - -0.56 - - - - - - - - - - - 0.16 - - 0.16 - -
- - - - 0.86 - - 0.77 3.66 -1.66 - - - - - - 0.51 2.83 - 0.07 2.81 - 1.54 3.08 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.98 -0.47 - - - - 4.14 - - - - - -2.32 2.38 3.45 0.52 - -0.05 - - - - - 2.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.45 - - - - - 3.28 - - - - - - 3.93 2.62 - - 0.79 - - - 0.6 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.07 - - - - - 4.07 - - - - - - - 4.3 - - - - - - - - 1.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.07 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.94 3.03 1.24 2.65 2.17 1.01 2.14 -2.03 -2.05 -1.53 -2.65 -2.48 -1.76 - -0.22 0.85 -1.2 1.23 0.49 -0.27 0.99 0.83 1.23 -2.12 -0.8 -1.87 -2.22 -1.47 -2.52 -4.62 -3.76 -2.28 -4.67 - -3.76 -1.55 -3.78 -2.39 -3.95 -1.19 -3.18 -0.66 -3.23 -2.89 -2.38 -2.36
- - 3.61 - - - - - 4.09 - - - - - - 3.83 - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.98 - - - - - 4.6 - - - - - - - 1.71 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.0 4.65 2.04 -0.02 0.22 0.16 3.46 - - - -2.32 - - - -0.74 -1.99 - - - - - - - 0.01 -1.03 - - -4.08 - -2.03 -2.9 - -2.21 - - -1.0 - - - - -1.5 - - - - -
- 1.23 2.78 -2.74 -0.72 1.17 0.73 1.09 2.54 -2.31 -3.41 - -3.73 - -1.66 1.77 1.64 1.58 -1.15 0.27 -1.39 -1.28 - 0.03 2.86 0.38 1.58 - - -4.4 - - -5.28 - - - - -2.12 - -2.9 - - -2.91 -2.17 -2.84 - - -
- - 3.85 - - - - - - - - - - - - 5.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.3 0.17 -1.09 - - - 4.17 - - - - - - 1.61 3.52 - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.25 - - - - 3.56 - - - - - -3.86 - 3.46 -0.18 - - - - - 0.62 - 4.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.