Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G52970 (DD11)
3.7 3.56 - -5.43 -5.52 -5.9 - - - - - - - -1.61 1.53 -5.0 -3.02 -5.75 -3.9 1.75 -1.45 -5.86 - -2.63 - -2.27 - -5.31 -5.87 - 3.96 -6.62 - - -6.19 - -5.6 -8.97 - - - - - - -5.33 - - -
4.11 3.41 - - - - - - - - - - - -0.79 - - -3.89 - - 1.6 - - - -2.76 - -5.96 - - - - 4.02 - - - -7.77 - - - - - - - - - - - - -
3.32 3.55 - - - - - - - - - - - -0.86 -1.46 - - - -5.13 1.83 - - -1.69 -2.1 - -4.63 - - - - 4.4 - - - -8.41 - - -8.92 - - - - - - - - - -
2.98 3.8 - - - - - - - - - - - -1.12 - -5.52 - - -6.11 2.05 - - -3.52 -2.95 - -5.01 - - - - 4.41 -5.93 - - -8.46 - - - - - - - - - - - - -
3.96 3.73 - - - - - - - - - - - -2.44 -2.09 -7.4 - - -5.09 2.2 -5.61 -6.44 - -2.18 - -5.18 - - -0.75 -5.91 3.73 -8.18 - - -8.29 - - -9.75 -10.27 - - - - - - - - -
AT2G20660 (RALFL14)
3.54 3.73 - -1.4 - - - - - - - - - - 1.91 - - - - 2.47 - - - -4.67 - -3.57 -0.61 - -1.79 - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.56 3.77 - - - - -5.24 -5.82 0.7 - -1.47 - - -1.82 0.44 -6.3 - -5.73 -4.1 2.46 -4.51 - - -4.11 - -5.35 - - - - 3.72 - -7.68 - -7.58 - - -9.04 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.69 3.83 - - - - - - - - - - -4.59 -1.18 0.76 - - - -6.07 2.03 - - - -3.25 - -6.0 - - - - 3.85 - - - -7.06 - - -9.02 - - - - - - -5.38 - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.58 3.21 - - - - - - - - - -5.78 -4.09 -3.67 0.52 - - -6.29 -4.8 2.38 -6.33 - - -1.32 - -2.68 - - -1.24 - 2.81 -8.17 -6.47 -6.51 -7.08 -5.96 - - -9.37 - - -4.98 - - - - - -
5.44 1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G00190 (PME38)
4.66 2.71 - -3.2 - - -1.66 - - - - - - -2.23 -0.57 - - -4.68 -5.83 1.66 -4.58 - -4.25 -4.22 -3.63 -5.32 0.01 -0.94 -0.83 - 2.08 - - - - - -4.11 -6.23 -4.23 - - - - - - 2.29 - -
5.11 2.47 - - - - - - -0.96 -4.94 -3.47 - -3.12 -5.14 -0.03 - - - - 1.2 - - - -4.77 - -5.52 - - - - 1.93 - - - -6.28 - - -7.44 - - - - - - - - - -
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G18770 (MYB98)
3.83 3.35 -1.83 - - - - - -2.0 - - - 0.73 -0.73 2.38 - - -0.33 -3.43 2.24 - - - -4.78 - -5.29 - -3.09 -4.55 - 2.79 -3.3 -3.48 -1.97 -3.1 -2.2 -3.1 -0.9 -5.24 - - -1.21 -1.54 - -0.8 - - -4.35
3.73 3.7 - - - -3.75 - - - - - - - -2.0 - - -3.47 -3.73 - 2.03 - - - -1.0 -3.68 -2.77 - - -1.57 -5.07 4.0 - -4.23 - - - - -6.59 - - - - - - - - - -
3.55 3.81 - - -6.36 - - - -6.13 - - - - -2.14 -1.69 -5.61 - - -5.37 2.08 -4.53 -6.71 - -2.57 -2.73 -5.33 -5.89 - -1.37 -4.46 4.03 -8.45 -6.03 - -8.04 - - -6.23 -7.22 - - -4.76 - - -4.08 - - -
2.93 3.63 - - - - -4.27 - - - - - - -1.58 1.81 -6.32 -5.51 - -6.92 2.22 -3.55 - - 1.82 - -0.23 -5.44 -3.61 -0.49 - 3.82 -7.31 - - -9.36 - - - -8.61 - - - - - - - - -
AT5G12380 (ANNAT8)
3.76 2.16 -0.97 -1.39 -0.41 -2.07 -1.04 -0.9 -1.07 -1.25 -0.28 - -1.48 0.16 0.54 -1.58 -2.99 -4.28 -1.65 1.17 -1.74 -1.61 -1.79 -2.01 -1.46 -1.37 0.54 -0.23 -0.85 -0.43 1.26 -2.51 -1.84 -1.78 -1.44 -1.74 0.26 -0.74 1.19 -0.82 1.46 -0.56 -1.48 -0.72 -2.3 -1.31 -5.38 -1.59
5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.29 3.47 - - - - - - - - - - - -1.76 -2.03 - - - -5.12 2.08 1.26 - - -3.92 - -6.19 - - -3.73 - 4.31 -6.53 -7.16 - -8.78 - - - - - - - - - - - - -
5.02 3.21 - - - - - - -2.15 - -4.74 - - -4.63 -2.15 - - - -5.82 1.13 - - - -5.87 - -5.69 - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.48 3.67 - - - - - - - - - - - -2.21 - - - - - 1.65 - - - -1.96 - - - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.02 3.21 - - - - - - -2.15 - -4.74 - - -4.63 -2.15 - - - -5.82 1.13 - - - -5.87 - -5.69 - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.1 2.76 - - - - - -7.51 - - -8.06 - - -7.51 - -9.29 - - -7.21 0.92 - - - -5.67 - -8.39 - -7.93 - - 2.33 -10.05 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.23 2.48 - - - - - -6.38 - - -6.94 - - -6.61 -0.6 -8.17 - - -6.08 1.44 - - - -6.92 - -7.27 - -6.81 - - 0.45 -8.93 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.08 2.76 - - - - - -5.74 -2.37 - -6.29 - - -4.3 -0.43 -7.52 - - -3.81 1.27 - - - -8.98 - -6.62 - -6.16 - - 2.0 -8.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.26 2.46 - - - - - - -3.1 - -7.02 - - -5.42 -1.16 -8.25 - - -6.17 0.78 - - - -5.53 - -7.36 - -6.89 - - 0.83 -9.01 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.22 2.47 - - - - - - -3.01 - -6.93 - - -5.34 -1.07 -8.17 - - -4.46 -0.57 - - - -9.62 - -9.01 - -6.81 - - 1.96 -8.93 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.31 1.65 - - -3.65 - - - - - -6.65 - - -4.56 0.98 -7.88 - - - 1.05 - - - -8.57 - -8.73 - -6.53 - - -0.05 -8.64 - - - - - -7.88 - - - - - - - - - -
4.9 2.72 - - - - - -1.28 -0.87 - - - - -4.09 -0.33 -8.54 - - -3.83 1.67 - - - -10.0 - -7.65 - -7.18 - - 2.69 -9.3 - - - - - - - - - - - - - - - -
5.27 2.34 - - - - - - -0.58 - - - - - - - - - - 0.54 - - - -10.15 - - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.87 3.15 - - -3.85 - - -1.21 -2.16 - - - - -4.76 - -8.08 - - - 1.74 -1.64 - - -6.78 - -7.19 - -6.72 - - 2.44 -8.84 - - - - - -8.08 - - - - - - - - - -
3.94 3.94 - 1.18 - - - - - 0.44 0.52 - - -3.07 - - - - - 2.71 -1.4 - - -0.58 - -0.99 - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.07 3.05 - - - - - -3.08 -1.27 - -2.38 - - -2.65 0.13 - - - - 1.01 - - - -7.0 - - - - - - 1.05 - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.97 3.21 - - - - - - -0.79 - - - -3.79 - -1.39 - - - - 1.55 - - - -7.38 - - - - - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.2 2.54 - - - - - - - - - - - - 0.27 - - - - 0.72 -3.7 - - - - - - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.97 3.21 - - - - - - -0.79 - - - -3.79 - -1.39 - - - - 1.55 - - - -7.38 - - - - - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - -
5.2 2.54 - - - - - - - - - - - - 0.27 - - - - 0.72 -3.7 - - - - - - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.84 2.66 - -4.34 - -2.49 -2.37 0.42 3.34 -1.76 2.94 - - -5.01 -1.36 - - - 0.07 0.92 - - - -9.95 -4.84 -6.47 - - - - 2.05 - - - -6.85 - - -7.92 - - - - - - - - - -
4.36 3.59 - - - -3.31 - - - - - - - -1.8 0.04 -2.99 - - - 1.53 -1.32 -3.46 - -8.54 - -5.02 - - -3.28 - 3.18 - 0.08 -2.87 - - - -5.86 -6.88 - - - - - - - - -
5.08 2.46 - - -4.4 -4.32 -2.9 -2.32 -3.05 - -4.04 - - -3.61 -0.87 - - - -3.92 1.45 - - - -4.69 - -6.03 - - - - 2.17 - - - -7.62 - - - - - - - - - -3.85 - - -
3.9 3.65 -3.64 - -3.46 - -5.31 -6.87 -6.68 - - -6.2 -5.2 -1.32 -0.47 - -6.55 -6.81 -6.38 1.68 - - - -3.21 - -6.11 - -6.23 - -8.13 3.94 -5.41 -7.45 - -8.65 - - -9.02 - - - - - -2.09 -3.68 - - -4.28
5.09 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.29 - - - - - - - - - - 1.01 - - - -0.25 - - - - - - - - - - - - -
4.93 3.08 - - -4.88 - -3.88 - - - -5.51 - - -4.22 -0.11 - - -5.86 -5.96 1.72 - - - -5.25 - -7.49 -2.76 -3.94 -4.22 - 2.05 -7.59 - - -6.35 - -5.57 -6.6 -4.24 - - - - - - - - -6.41
4.56 3.31 0.51 -2.52 -0.37 -1.5 -1.89 -4.37 - - -10.9 - - -3.83 -0.64 - -4.19 - -2.08 2.32 -4.24 - -2.11 -1.53 - -4.66 -3.77 -2.7 -2.78 -5.89 1.75 -3.92 -6.18 -4.18 -2.87 - -23.33 -5.49 -6.6 - - -3.12 - - -1.45 - - -2.91
4.4 3.17 - -3.34 -5.77 - - -4.52 - -4.46 -6.4 0.6 1.12 -3.36 -1.33 - - - -5.92 1.74 - - - -4.22 - -6.83 - -5.83 -0.36 - 3.17 -8.0 -7.57 -8.54 -8.66 - -6.48 -10.41 -7.11 - - - -6.24 -3.05 -4.22 - - -4.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.