Heatmap: Cluster_295 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Immature female cone
Immature male cones
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Wood
Bark
Bark, healthy
S1 xylem tracheids
S1 whole sections
S2 ray cells
S2 xylem tracheids
S2 whole sections
Dead late wood
Phloem and cambium
Dear early and late wood
Bark, root and butt rot
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Light, 1 hour
Light, 3 hours
Light, 5 hours
Light, 7 hours
Light, 9 hours
Light, 13 hours
Light, 15 hours
Darkness, 1 hour
Darkness, 3 hours
Darkness, 5 hours
Darkness, 7 hours
Darkness, 11 hours
Vegetative buds
Female buds
Male buds
Buds
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
Somatic embryogenic cell line
0.42 0.54 -1.82 -1.03 -2.04 -3.52 -1.96 0.59 -0.6 -0.19 0.37 -0.01 0.63 0.55 0.01 -2.05 - -1.38 -0.36 -0.1 0.4 0.53 -0.18 0.36 0.16 0.03 -0.0 0.13 0.12 0.14 0.5 0.16 0.3 0.39 0.23 0.31 0.31 0.24 0.29 0.29 0.52 0.05 -0.16 -0.13 -0.25 0.57 -0.25 -0.72 -0.7 -0.12 0.57 0.48 -0.14 -0.34 0.62 -0.36
-0.63 -0.43 -5.33 -3.92 -5.06 -3.99 - 0.44 0.04 -0.3 0.22 0.53 0.9 -0.22 0.16 -6.46 - -6.0 -0.38 -0.16 0.2 -0.97 -0.02 -0.5 -0.06 -0.26 -0.11 -0.68 -0.33 -0.19 0.93 0.61 0.87 0.89 0.68 0.94 0.66 1.07 1.07 0.83 1.16 0.47 0.75 0.4 0.67 -0.19 -0.81 -0.49 -0.49 -0.54 -0.08 -0.06 -0.68 -0.77 0.04 -0.7
0.38 -0.31 -4.7 -2.03 -5.49 -7.09 - 0.12 -0.69 1.1 -0.58 -0.46 0.75 -1.67 -0.46 -5.02 - -2.66 0.64 -0.18 -0.14 -0.31 0.15 -0.43 0.06 0.45 -0.03 0.14 -0.39 -0.43 0.94 0.68 0.95 0.76 0.68 0.69 0.79 0.92 0.98 0.45 1.06 0.44 -0.54 -0.8 0.76 0.13 -0.48 -0.46 -0.19 -0.73 -0.11 -0.15 -0.43 -0.47 -0.54 0.77
0.05 -0.69 -1.92 -1.66 -2.51 -2.32 - 0.52 -0.38 0.3 0.52 -0.22 0.47 -0.08 -0.52 -1.91 - -1.23 0.15 -0.18 0.12 -0.67 -0.48 -0.39 0.02 -0.08 -0.04 -0.11 0.13 0.16 0.59 0.24 0.54 0.38 0.59 0.43 0.33 0.54 0.6 0.28 0.64 0.06 1.05 0.73 0.31 -0.42 -0.39 -0.16 -0.16 0.21 0.08 0.3 0.25 0.11 0.28 0.22
0.18 0.75 -1.7 -1.96 -2.11 -2.7 -2.57 0.18 -0.26 -0.32 0.6 -0.68 0.12 -1.13 -0.91 -0.99 - -2.09 -0.22 -0.25 0.31 0.02 -0.11 0.48 0.46 -0.02 0.42 0.29 0.49 0.39 0.72 0.18 0.23 0.42 0.38 0.69 0.07 0.51 0.32 0.23 0.63 -0.21 0.57 0.02 0.54 0.07 0.39 -0.09 0.13 -0.55 -0.05 0.23 -0.34 -0.32 0.15 0.04
0.1 0.08 -3.34 -3.98 -3.93 -3.62 -4.94 0.56 -0.39 -1.67 -0.61 -0.34 0.54 -0.12 -0.5 -2.33 - -3.53 -0.79 0.23 0.34 -0.04 0.17 -0.4 0.92 -0.25 0.46 0.53 0.86 0.62 0.88 0.94 1.0 0.94 0.92 0.74 0.88 0.91 0.87 0.87 0.55 0.5 0.08 0.0 -0.11 0.01 -0.56 -1.25 -1.13 -1.03 -0.5 -0.36 -1.28 -1.13 -0.13 -0.83
-1.19 1.32 - - -1.93 - - -0.52 0.26 -0.31 - -0.92 -4.88 - -2.32 - - - 0.15 -0.71 -0.09 -0.26 -0.28 -0.4 -0.01 0.97 0.36 0.49 0.12 0.51 0.59 -0.07 0.31 0.01 0.25 0.33 -0.91 0.5 0.1 0.01 0.27 -0.17 0.76 0.64 0.64 0.41 -0.54 -0.36 0.03 0.92 0.54 1.15 1.07 1.01 1.26 1.11
-0.1 0.13 -1.92 -1.06 -1.06 -1.49 -1.87 0.19 0.17 0.54 -0.07 -0.57 0.12 -2.31 -0.47 -0.72 - -0.52 0.32 -0.23 0.29 -0.23 0.47 -0.61 0.2 -0.32 0.11 -0.27 -0.3 -0.42 0.67 0.77 0.67 0.94 0.63 0.52 0.37 0.79 0.66 0.55 0.74 0.06 0.61 0.33 0.64 0.05 -0.96 -0.64 -0.42 -0.76 -0.09 -0.31 -0.7 -0.93 -0.3 0.74
-0.03 -0.7 -5.07 -2.95 -4.59 -6.71 - 0.39 0.38 0.05 -0.32 -0.19 0.59 -0.15 0.05 -4.53 - -5.16 -0.23 -0.34 0.24 0.2 -0.05 -0.65 0.1 0.31 0.07 -0.46 -0.32 -0.34 0.51 0.29 0.53 0.66 0.59 0.61 0.61 0.65 0.62 0.51 0.73 0.27 1.07 0.66 1.01 0.14 0.42 -0.45 -0.35 -0.24 0.04 0.16 -0.19 -0.37 0.28 -0.02
0.01 -0.21 -2.02 -1.23 -1.74 -1.87 -3.35 0.49 0.38 -1.01 -0.2 -0.34 0.24 -0.28 -0.62 -2.31 - -1.51 -0.75 -0.5 -0.21 -0.76 0.14 -0.55 0.0 0.09 -0.22 -0.24 -0.25 -0.4 1.01 0.83 0.9 0.86 0.57 0.6 0.6 1.09 1.01 0.85 1.13 0.14 0.48 0.03 -0.12 -0.06 0.36 -0.34 -0.16 -0.21 -0.08 0.09 -0.24 -0.24 0.07 -0.5
0.52 -0.2 -1.97 -1.0 -2.23 -2.57 -2.89 0.41 -0.18 0.5 0.38 -0.13 0.53 -0.27 -0.44 -2.78 - -2.2 0.83 0.05 0.54 0.58 0.62 -0.38 0.48 -0.33 0.24 0.33 0.06 0.17 0.31 0.2 0.29 0.29 0.21 0.33 0.32 0.29 0.3 0.24 0.45 0.04 0.3 0.16 0.41 0.5 0.14 -0.54 -0.47 -0.29 0.07 0.1 -0.2 -0.54 0.11 -0.67
0.18 -0.38 -3.87 -2.15 -3.8 -4.89 -4.42 0.18 0.11 0.07 -0.5 0.18 0.8 -0.86 0.09 -3.29 - -2.46 -0.31 -0.01 0.11 -0.5 0.35 -0.12 0.24 0.01 0.3 -0.12 -0.2 -0.01 0.37 0.22 0.51 0.72 0.49 0.43 0.44 0.7 0.56 0.44 0.68 0.06 0.1 0.03 0.22 0.09 -0.25 -0.16 -0.12 0.55 0.61 0.39 0.37 0.37 0.44 -0.01
-0.52 -0.57 -3.52 -3.19 -3.42 -5.05 -3.74 0.88 0.04 0.06 -0.15 -0.01 1.1 -0.41 -0.17 -2.88 - -2.98 0.13 -0.84 0.83 -0.59 0.59 -0.22 -0.81 0.1 -1.14 -1.11 -0.89 -1.03 0.95 0.52 0.92 0.75 0.63 0.87 0.71 0.99 0.8 0.82 1.23 0.3 0.81 0.3 0.46 -0.29 -0.5 0.16 0.25 -0.67 -0.36 -0.08 -0.76 -0.79 0.01 -0.84
-0.13 -0.79 -3.64 -3.42 -7.13 -6.86 - -0.14 0.65 0.45 -2.4 -0.4 0.61 -1.8 -0.2 -5.96 - -2.74 0.53 -0.08 0.08 -0.6 -0.05 -1.6 0.28 0.42 -0.45 -0.37 -0.24 -0.5 0.64 0.44 0.56 0.94 0.58 0.63 0.62 0.93 0.85 0.76 0.76 0.15 1.34 1.03 1.58 -0.32 -0.24 -0.11 0.09 -0.9 -0.48 -0.37 -0.68 -1.23 -0.33 0.58
-0.32 -0.62 -3.92 -3.54 -3.93 -4.9 -5.85 -0.26 -0.09 -0.11 0.62 -0.56 0.58 -0.11 -0.92 -4.1 - -3.12 0.04 0.23 0.04 -0.16 0.29 -0.19 0.44 0.1 0.14 0.26 0.32 0.34 1.02 0.16 0.77 0.6 0.53 0.92 0.37 0.83 0.6 0.5 1.26 -0.0 0.56 0.35 0.35 -0.12 -0.39 0.24 0.2 -0.69 -0.27 -0.02 -0.6 -0.66 0.21 -0.37
-1.02 -1.93 -1.57 -2.73 -2.24 -2.49 -4.29 0.25 -0.27 -0.06 -1.32 -0.38 0.16 -0.21 -0.49 -2.19 - -3.31 -0.25 -0.96 0.23 -1.87 -0.71 -0.4 -1.12 -0.52 -1.36 -0.7 -0.17 -0.28 1.2 1.05 1.31 1.21 1.18 1.14 0.9 1.31 1.06 1.24 0.99 0.66 1.29 0.83 0.05 -0.35 -1.16 -1.03 -1.0 -1.34 -0.47 0.21 -0.96 -0.86 0.6 -0.3
0.05 -0.41 -1.74 -1.48 -1.2 -2.0 -2.0 0.17 -0.22 -1.15 0.07 -0.3 0.89 0.35 -0.35 -1.79 - -1.74 -0.47 0.16 -0.03 0.52 -0.29 0.01 0.05 0.26 -0.51 0.01 0.07 0.09 0.89 0.83 0.82 0.82 0.75 0.81 0.72 0.81 0.87 0.59 0.43 0.48 0.45 0.33 0.26 0.05 0.08 -0.6 -0.55 -0.76 -0.67 -0.46 -0.86 -0.82 -0.61 -0.66
-0.24 -0.26 -2.55 -2.08 -2.33 -4.24 -2.76 0.05 0.15 0.04 0.57 0.56 1.0 -0.18 0.25 -3.95 - -2.39 -0.2 -0.76 -0.05 -0.28 0.16 -0.61 -0.36 0.05 -0.71 -0.84 -0.99 -0.68 0.63 0.44 0.74 0.89 0.61 0.66 0.57 0.91 0.8 0.72 0.81 0.31 0.13 -0.07 1.03 0.19 0.04 -0.41 -0.26 0.08 0.12 -0.05 -0.0 -0.17 0.21 -0.6
-0.54 -1.66 -3.75 -2.3 -4.3 -4.98 - -0.62 0.15 0.5 0.34 0.66 1.36 -0.33 0.31 -4.14 - -3.89 0.37 -1.15 -0.22 -1.84 -0.32 -0.62 -1.07 -0.1 -0.8 -1.04 -0.94 -1.21 0.89 0.97 1.01 1.24 0.86 0.6 0.93 1.22 0.98 0.98 0.94 0.47 0.17 0.14 -0.75 -0.58 -0.66 -0.54 -0.36 0.04 0.09 0.33 -0.09 -0.11 0.43 0.0
-0.14 -0.51 -2.9 -1.48 -1.97 -1.75 -1.63 -0.27 0.33 0.9 0.27 -0.52 0.56 -0.5 -1.13 -1.1 - -0.98 0.55 0.07 0.29 -0.28 0.32 -0.52 -0.01 -0.24 0.7 0.15 -0.38 0.12 0.46 0.38 0.42 0.62 0.42 0.5 0.64 0.28 0.5 0.28 0.45 0.16 0.56 0.52 1.42 0.13 0.1 -0.26 -0.1 -1.04 -0.48 -0.35 -1.18 -1.24 -0.11 0.18
-0.83 -0.12 -1.0 -1.07 -0.44 -0.75 -1.45 -0.21 0.37 0.3 0.04 0.43 0.65 0.03 0.1 -1.24 - -0.94 0.31 -0.64 -0.12 -0.54 -0.44 0.01 -0.51 0.04 -0.5 -0.76 -0.65 -0.74 0.73 0.63 0.58 0.65 0.41 0.62 0.6 0.87 0.78 0.7 1.0 0.26 -0.08 -0.48 -0.39 -0.19 -0.07 -0.29 -0.16 0.07 0.11 0.09 0.06 0.04 0.18 -0.83
-0.17 -0.27 -3.9 -2.78 -4.41 -3.95 - -0.29 -0.02 0.45 -0.23 -1.02 0.17 -0.95 -0.61 - - - 0.56 0.17 -0.32 0.0 0.02 0.07 -0.26 0.53 0.42 0.29 0.09 0.68 0.49 0.5 0.74 0.55 0.55 0.49 0.64 0.53 0.62 0.74 0.44 0.15 0.65 0.36 0.35 0.06 0.06 0.09 -0.04 -0.21 0.3 0.27 -0.24 -0.37 0.18 0.47
0.04 -1.07 -3.18 -2.49 -2.2 -3.19 -1.82 0.05 0.07 -1.23 -0.05 -0.29 0.8 0.93 -0.94 -3.24 - -4.69 -1.71 -0.37 0.04 0.41 -0.87 0.56 0.49 0.4 -0.2 0.04 0.56 0.38 0.76 0.44 0.76 0.29 0.78 0.72 0.63 0.57 0.94 0.86 0.45 0.55 0.58 0.64 0.75 0.01 0.16 -0.51 -0.51 -0.95 -0.59 0.04 -0.45 -0.35 -0.45 -1.02
0.59 -0.22 -2.25 -0.87 -1.68 -1.0 -2.18 0.27 -0.23 0.82 -0.6 -0.26 0.77 -0.58 -0.4 -0.58 - 0.61 0.28 -0.61 0.32 -0.44 -0.01 -0.5 -0.16 0.25 0.02 0.11 -0.41 -0.23 0.66 0.34 0.61 0.59 0.36 0.57 0.63 0.51 0.5 0.39 0.92 0.21 0.32 -0.07 0.93 0.22 -0.24 -0.36 -0.25 -0.88 -0.76 -0.64 -0.93 -1.03 -0.95 0.54
0.03 -0.23 -4.27 -2.7 -3.21 -3.26 -3.71 -0.33 0.32 -0.02 0.44 -0.73 0.49 -0.28 -0.26 -3.32 - -1.46 -0.1 -1.12 -0.29 -0.21 -0.39 -0.08 -0.69 0.38 -0.7 -0.81 -0.37 -0.65 0.66 0.64 0.61 0.75 0.66 0.53 0.7 0.86 0.67 0.94 0.76 0.35 0.93 0.75 0.6 0.25 -0.29 -0.31 -0.2 -0.28 0.24 0.41 -0.26 -0.17 0.29 0.56
0.56 0.7 -1.7 -0.76 -0.83 -2.29 -2.22 0.63 -0.23 0.17 0.14 -0.29 0.6 -0.49 -0.31 -1.02 - -1.62 0.05 0.1 0.6 0.78 0.9 -0.35 0.57 -0.17 -0.14 0.08 -0.16 -0.11 0.05 0.06 0.26 0.35 0.18 -0.01 0.24 0.33 0.07 0.19 0.25 -0.31 0.05 -0.11 0.37 0.81 0.25 -0.34 -0.18 -0.35 -0.01 -0.03 -0.36 -0.49 -0.1 0.3
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-0.68 0.02 -3.16 -1.19 -1.64 -2.31 - -0.26 0.49 0.48 - -2.67 -0.29 - -1.24 -4.48 - -1.54 0.8 0.47 0.08 -0.0 -0.47 0.67 -0.17 1.09 0.99 0.11 -0.25 0.43 0.04 -0.85 0.44 -0.3 0.01 -1.23 -0.99 -0.2 0.17 0.34 0.13 -0.73 0.93 1.05 0.95 0.44 0.0 0.03 0.17 0.05 0.93 0.68 0.61 0.36 0.93 0.84
0.63 0.81 -2.32 -1.95 -1.87 -2.93 -3.39 0.71 0.01 -0.52 -0.18 0.41 0.7 0.04 0.42 -2.77 - -2.27 -0.47 -0.71 0.31 0.22 -0.03 -0.32 -0.18 0.12 -0.43 -0.65 -0.83 -0.57 0.48 0.58 0.59 0.7 0.38 0.41 0.48 0.71 0.57 0.46 0.67 0.18 -0.06 -0.42 -0.15 0.43 -0.22 -0.28 -0.11 0.03 0.34 0.41 0.02 -0.07 0.5 -0.11
-0.17 -0.54 -2.87 -2.31 -2.66 -2.01 -2.08 -0.01 -0.28 0.2 -1.23 -0.48 0.74 -0.58 -0.48 -1.57 -1.8 -1.61 0.19 -0.06 0.22 0.12 0.26 -0.79 -0.01 0.09 -0.15 -0.22 -0.19 -0.12 0.72 0.75 0.76 0.93 0.84 0.61 0.72 0.82 0.78 0.61 0.63 0.28 0.14 0.02 0.63 -0.14 -0.43 -0.33 -0.07 -0.39 0.04 0.25 -0.4 -0.5 0.32 0.23
-0.37 -0.45 -2.92 -2.12 -2.96 -2.14 -3.27 -0.18 -0.07 -0.1 -0.18 -1.0 -0.33 -0.67 -0.91 -2.82 - -1.47 -0.08 -0.3 0.02 -0.6 -0.25 -0.78 -0.65 0.23 -0.58 -0.84 -0.97 -0.72 0.82 0.72 0.92 1.05 0.88 0.93 0.98 1.34 1.08 0.94 1.04 0.5 0.17 -0.53 -0.48 -0.33 0.24 -0.08 0.05 0.13 0.56 0.63 0.1 0.06 0.44 -0.26
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-0.35 0.1 - -3.66 -4.04 - - -0.57 -0.02 0.86 0.03 0.16 0.96 -1.61 -0.16 -5.24 - -2.4 0.84 -0.64 0.07 -0.6 -0.53 -0.96 -0.21 0.16 -1.35 -0.49 -0.37 -0.2 0.84 0.55 0.83 0.94 0.77 0.96 0.9 1.03 0.54 0.87 0.98 0.33 -0.29 0.0 -0.86 -0.82 -0.03 -0.45 -0.31 0.09 0.46 0.53 0.01 -0.0 0.47 0.23
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-0.02 -0.41 -5.54 -3.73 -4.58 -6.45 - 0.09 0.38 0.37 -0.15 -0.13 0.95 -2.15 -0.11 - - -7.6 0.39 -0.38 -0.09 0.18 -0.32 -0.32 0.08 0.61 0.05 -0.04 0.0 0.05 0.18 0.02 0.38 0.45 0.22 0.35 0.21 0.64 0.26 0.29 0.47 0.04 0.94 0.44 0.6 0.17 0.08 -0.11 -0.05 0.45 0.36 0.51 0.38 0.46 0.65 0.26
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-0.52 -0.83 -1.66 -1.57 -0.94 -1.34 -1.69 -0.05 0.07 0.87 0.31 0.19 0.81 -0.15 0.08 -2.5 - -1.32 0.97 -0.73 -0.23 -0.89 -0.28 -1.04 -0.91 0.36 -0.56 -0.53 -0.87 -0.68 0.77 0.27 0.81 0.57 0.5 0.74 0.49 0.89 0.69 0.51 1.33 0.1 0.08 -0.45 1.13 -0.32 -0.77 -0.88 -0.53 -0.44 0.05 0.1 -0.38 -0.62 -0.13 0.87
-0.9 -0.85 -1.23 -1.68 -0.79 -1.03 -1.13 -0.05 0.47 -0.14 -0.2 -0.76 0.73 -0.22 -1.07 0.35 - 0.17 -0.1 -0.59 -0.17 -1.89 -0.34 0.91 -0.62 -0.99 -0.62 -0.94 -0.61 -0.92 0.94 0.94 0.99 1.03 0.87 0.73 0.87 1.12 0.95 1.05 0.93 0.58 0.72 -0.05 -0.55 -0.6 -1.19 -0.47 -0.46 -0.54 -0.47 -0.38 -0.38 -0.27 -0.1 -1.87
-1.03 1.07 -5.01 -5.41 -5.89 -5.23 - -0.89 -0.48 -0.13 0.7 -1.0 -0.16 0.15 -1.21 -5.34 - -7.2 -0.25 0.49 -0.42 -0.63 -0.11 0.21 0.61 -0.11 0.96 0.32 0.71 0.36 0.95 -0.21 0.62 0.27 0.09 0.86 0.31 0.53 0.59 0.27 1.21 0.04 0.15 -0.21 0.98 -0.22 -0.79 0.37 0.46 -0.05 -0.05 0.32 -0.05 0.16 0.18 -0.62
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0.48 -0.02 -2.45 -1.95 -3.64 -8.46 - -0.13 -0.1 0.61 0.41 -0.12 0.49 -0.39 0.02 -2.22 - -2.92 0.39 -1.43 -0.53 -0.17 -0.58 -0.67 -0.57 -0.26 -1.7 -0.46 -0.87 -0.98 0.82 0.69 0.71 1.03 0.71 0.85 0.55 0.94 0.71 0.83 0.82 0.64 0.65 0.65 0.35 -0.01 -0.26 -0.18 -0.21 -0.1 0.18 0.28 -0.24 -0.36 0.15 0.23
0.81 0.8 -2.11 -1.72 -2.41 -3.99 -1.93 0.41 -0.26 0.25 -1.23 -0.36 0.83 0.71 -0.56 -0.28 - -4.0 -0.09 -0.04 0.53 0.93 0.44 0.17 0.15 0.38 0.03 -0.24 -0.4 -0.59 0.6 0.18 0.53 0.71 0.54 0.59 0.13 0.53 0.51 0.64 0.94 0.02 0.08 -0.05 0.46 0.7 -0.12 -0.54 -0.62 -0.98 -0.79 -0.47 -1.25 -1.16 -0.79 -0.33
-0.48 -2.32 -0.83 -2.59 -4.96 -2.96 - 1.77 -0.17 0.56 - -3.21 -1.6 0.01 -2.85 -2.43 - -2.71 0.53 -0.03 1.23 -3.55 -0.42 -1.43 -0.83 -0.69 -0.25 -0.5 -0.09 0.09 1.27 1.41 1.39 1.14 1.46 1.32 1.18 1.14 1.31 1.3 1.1 1.26 0.45 0.4 0.92 -2.34 -4.03 -1.2 -1.3 -4.17 -2.79 -3.73 -2.96 -2.58 -2.97 -1.73
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-1.05 0.26 -2.77 -2.89 -3.26 -3.83 -6.21 -0.38 -0.0 0.74 0.24 -0.65 0.66 -0.38 -0.78 -2.96 - -3.1 0.33 -1.16 0.08 -0.92 -0.27 -0.61 -0.52 -0.56 -0.78 -0.21 -0.63 -0.34 0.76 1.02 0.97 1.06 1.12 0.69 0.95 1.31 1.03 0.98 0.86 0.65 -1.2 -1.27 -2.08 0.17 -0.54 -1.12 -1.48 0.68 0.57 0.31 0.65 0.53 0.62 -1.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.