Heatmap: Cluster_260 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00212220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.220)	0.01	1.0	0.0	0.02	0.15	0.0	0.2	0.0	0.2	0.2	0.52	0.55	0.29	0.27	0.19	0.07	0.98	0.32	0.19	0.14	0.21	0.14
AMTR_s00001p00258770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.361)	0.0	0.0	0.0	0.17	0.12	0.0	0.01	0.09	0.04	0.05	0.5	0.79	0.12	0.16	0.1	0.43	1.0	0.33	0.35	0.41	0.65	0.11
AMTR_s00001p00263560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.394)	0.0	0.0	0.03	0.43	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.98	1.0	0.4	0.23	0.44	0.27	0.56	0.69	0.62	0.83	0.47	0.49
AMTR_s00002p00139370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.102)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.16	0.0	0.17	0.0	0.21	0.14	0.47	0.67	0.22	0.38	0.42	0.5	1.0	0.57	0.58	0.41	0.99	0.27
AMTR_s00002p00193850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.175)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.21	0.0	0.06	0.02	0.17	0.13	0.83	0.94	0.14	0.13	0.09	0.15	1.0	0.15	0.15	0.12	0.2	0.14
AMTR_s00004p00261460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.256)	0.26	0.08	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.52	0.33	0.13	0.15	0.25	1.0	0.45	0.39	0.37	0.43	0.49
AMTR_s00006p00267510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.303)	0.02	0.12	0.0	0.19	0.15	0.0	0.04	0.0	0.1	0.07	0.58	0.6	0.34	0.31	0.38	0.33	1.0	0.49	0.43	0.42	0.99	0.34
AMTR_s00010p00081100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.44)	0.0	0.0	0.42	0.04	0.05	0.0	0.16	0.0	0.14	0.16	0.69	0.78	0.15	0.11	0.08	0.16	1.0	0.21	0.2	0.15	0.47	0.1
AMTR_s00010p00258470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.414)	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.39	0.28	0.19	0.18	0.17	0.24	0.59	0.29	0.27	0.27	1.0	0.17
AMTR_s00016p00157950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.114)	0.0	0.64	0.0	0.0	0.15	0.0	0.03	0.0	0.05	0.04	0.44	0.35	0.36	0.17	0.28	0.32	1.0	0.29	0.24	0.48	0.19	0.34
AMTR_s00016p00233120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.232)	0.05	0.1	0.3	0.3	0.25	0.0	0.04	0.01	0.09	0.08	0.86	1.0	0.6	0.61	0.79	0.73	0.92	0.69	0.5	0.5	0.43	0.51
AMTR_s00016p00244090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.269)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.52	0.22	0.14	0.14	0.42	0.97	0.56	0.41	0.5	0.33	0.4
AMTR_s00017p00130610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.53)	0.26	0.07	0.0	0.29	0.17	0.0	0.17	0.01	0.28	0.22	0.95	0.97	0.51	0.47	0.83	0.7	1.0	0.67	0.57	0.77	0.65	0.49
AMTR_s00017p00225350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.175)	0.51	0.64	0.22	0.09	0.21	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.76	0.55	0.43	0.15	0.14	0.25	1.0	0.41	0.36	0.2	0.15	0.33
AMTR_s00020p00207770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.85)	0.0	0.11	0.0	0.07	0.03	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.53	0.42	0.45	0.19	0.21	0.26	1.0	0.29	0.3	0.36	0.48	0.44
AMTR_s00022p00145800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.140)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.15	0.0	0.04	0.02	0.18	0.11	0.47	0.64	0.16	0.26	0.39	0.33	0.79	0.67	0.48	0.23	1.0	0.33
AMTR_s00025p00107100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.91)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.01	0.0	0.09	0.03	0.56	1.0	0.34	0.25	0.5	0.76	0.98	0.65	0.51	0.44	0.61	0.32
AMTR_s00027p00225770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.99)	0.26	0.46	0.24	0.17	0.06	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.83	0.72	0.34	0.23	0.13	0.24	1.0	0.29	0.26	0.05	0.11	0.48
AMTR_s00029p00102340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.99)	0.02	0.75	0.0	0.12	0.23	0.0	0.04	0.03	0.07	0.06	0.68	0.68	0.27	0.23	0.22	0.25	1.0	0.46	0.37	0.4	0.67	0.28
AMTR_s00030p00239430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.208)	0.08	0.89	0.0	0.03	0.23	0.0	0.06	0.0	0.08	0.08	0.96	0.97	0.38	0.36	0.39	0.47	0.95	0.95	0.72	0.48	1.0	0.29
AMTR_s00037p00138240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.59)	0.29	1.0	0.0	0.04	0.06	0.01	0.13	0.0	0.12	0.12	0.42	0.54	0.28	0.22	0.14	0.48	0.68	0.4	0.46	0.48	0.37	0.25
AMTR_s00038p00136890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.82)	0.17	0.15	0.14	0.52	0.1	0.08	0.04	0.03	0.12	0.1	1.0	0.83	0.46	0.45	0.74	0.6	0.96	0.65	0.51	0.76	0.62	0.54
AMTR_s00043p00149000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00043.28)	0.28	0.16	0.15	0.4	0.09	0.0	0.08	0.02	0.22	0.13	1.0	0.86	0.34	0.39	0.3	0.33	0.92	0.73	0.67	0.59	0.79	0.35
AMTR_s00046p00160890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00046.85)	0.0	0.48	0.0	0.02	0.29	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.72	1.0	0.5	0.38	0.31	0.44	0.71	0.84	0.77	0.58	0.7	0.25
AMTR_s00048p00053570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.18)	0.0	0.51	0.35	0.1	0.26	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.49	0.45	0.22	0.12	0.16	0.38	1.0	0.28	0.3	0.23	0.36	0.27
AMTR_s00048p00175550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.130)	0.0	0.0	0.43	0.26	0.26	0.0	0.08	0.02	0.15	0.1	0.81	0.8	0.5	0.39	0.46	0.3	1.0	0.71	0.66	0.44	0.8	0.3
AMTR_s00049p00186050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.186)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.9	0.23	0.06	0.21	0.27	1.0	0.26	0.22	0.55	0.63	0.21
AMTR_s00055p00191850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.124)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06	0.12	0.08	0.0	0.13	0.09	0.72	0.82	0.11	0.22	0.07	0.15	1.0	0.42	0.33	0.15	0.31	0.2
AMTR_s00055p00192010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.125)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.16	0.06	0.18	0.15	0.85	0.62	0.25	0.35	0.09	0.13	1.0	0.3	0.42	0.22	0.12	0.23
AMTR_s00056p00045910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.28)	0.42	0.82	0.39	0.57	0.53	0.05	0.21	0.06	0.24	0.22	0.78	1.0	0.62	0.61	0.82	0.75	0.85	0.74	0.63	0.87	0.42	0.56
AMTR_s00056p00059990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.40)	0.0	1.0	0.4	0.12	0.2	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.68	0.62	0.31	0.11	0.27	0.42	0.98	0.41	0.39	0.27	0.37	0.36
AMTR_s00056p00216230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.211)	0.0	0.29	0.24	0.02	0.08	0.0	0.08	0.03	0.05	0.05	0.56	0.39	0.24	0.06	0.08	0.17	1.0	0.15	0.16	0.11	0.1	0.27
AMTR_s00056p00217370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.212)	0.05	0.61	0.06	0.0	0.07	0.0	0.04	0.0	0.06	0.04	0.67	0.49	0.13	0.04	0.07	0.29	1.0	0.23	0.16	0.11	0.18	0.27
AMTR_s00058p00026290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.6)	0.58	1.0	0.13	0.08	0.37	0.0	0.04	0.0	0.04	0.05	0.7	0.84	0.47	0.18	0.24	0.28	0.75	0.46	0.46	0.22	0.3	0.32
AMTR_s00058p00127730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.92)	0.14	0.3	0.28	0.0	0.2	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.9	0.64	0.26	0.08	0.04	0.33	1.0	0.43	0.4	0.05	0.21	0.18
AMTR_s00060p00141700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.84)	0.04	0.41	0.0	0.18	0.2	0.0	0.06	0.0	0.08	0.07	0.88	0.84	0.71	0.4	0.21	0.2	1.0	0.26	0.42	0.31	0.3	0.5
AMTR_s00062p00152740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.140)	0.24	0.9	0.41	0.13	0.52	0.01	0.1	0.0	0.15	0.12	0.82	0.87	0.47	0.42	0.44	0.44	1.0	0.54	0.41	0.35	0.54	0.4
AMTR_s00062p00192260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.201)	0.15	0.0	0.16	0.03	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.61	0.49	0.32	0.08	0.07	0.17	1.0	0.43	0.29	0.22	0.23	0.31
AMTR_s00062p00213230	0.0	0.01	0.0	0.11	0.15	0.0	0.09	0.0	0.15	0.11	0.72	0.56	0.28	0.17	0.24	0.27	0.81	0.63	0.62	0.31	1.0	0.21
AMTR_s00067p00176230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.180)	0.13	0.51	0.18	0.07	0.45	0.02	0.06	0.0	0.07	0.07	1.0	0.8	0.29	0.27	0.41	0.68	0.61	0.98	0.87	0.61	0.93	0.28
AMTR_s00068p00200420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.171)	0.62	0.7	0.21	0.08	0.48	0.04	0.07	0.18	0.16	0.14	0.93	0.98	0.58	0.39	0.42	0.51	1.0	0.63	0.52	0.38	0.43	0.45
AMTR_s00071p00143840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.129)	0.46	1.0	0.0	0.09	0.12	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.45	0.49	0.2	0.09	0.18	0.3	0.7	0.39	0.38	0.2	0.25	0.23
AMTR_s00076p00183960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.73)	0.03	0.16	0.0	0.03	0.15	0.0	0.17	0.0	0.15	0.15	0.71	0.61	0.17	0.1	0.06	0.18	1.0	0.26	0.19	0.08	0.32	0.43
AMTR_s00077p00186260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.217)	0.05	0.02	0.06	0.0	0.07	0.0	0.02	0.01	0.03	0.03	0.68	0.59	0.16	0.02	0.02	0.25	1.0	0.22	0.22	0.07	0.08	0.19
AMTR_s00078p00115450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.88)	0.12	0.32	0.13	0.02	0.06	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.74	0.47	0.14	0.03	0.03	0.14	1.0	0.24	0.13	0.04	0.03	0.26
AMTR_s00078p00127310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.104)	0.02	0.05	0.1	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.43	0.31	0.0	0.02	0.0	1.0	0.25	0.22	0.03	0.04	0.32
AMTR_s00078p00186760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.191)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.28	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.37	1.0	0.25	0.03	0.13	0.0	0.81	0.35	0.2	0.47	0.31	0.55
AMTR_s00080p00083910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.28)	0.18	0.06	0.13	0.04	0.12	0.04	0.15	0.0	0.21	0.14	0.83	0.68	0.18	0.16	0.09	0.16	1.0	0.24	0.17	0.1	0.31	0.18
AMTR_s00085p00089520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.48)	0.18	0.37	0.13	0.18	0.17	0.04	0.07	0.06	0.12	0.09	0.95	0.76	0.31	0.26	0.3	0.48	0.96	0.71	0.6	0.46	1.0	0.29
AMTR_s00099p00054090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.37)	0.21	0.61	0.16	0.09	0.23	0.03	0.05	0.0	0.06	0.07	0.69	0.98	0.49	0.28	0.28	0.31	1.0	0.43	0.44	0.26	0.55	0.38
AMTR_s00099p00073140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.53)	0.25	0.63	0.38	0.09	0.1	0.0	0.03	0.01	0.06	0.05	1.0	0.75	0.19	0.09	0.12	0.27	0.86	0.59	0.37	0.2	0.26	0.24
AMTR_s00099p00111970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.95)	0.01	0.29	0.09	0.14	0.07	0.0	0.02	0.0	0.04	0.03	0.66	0.48	0.3	0.04	0.07	0.1	1.0	0.33	0.26	0.2	0.21	0.3
AMTR_s00106p00090850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.59)	0.3	0.47	0.0	0.03	0.24	0.0	0.03	0.04	0.07	0.06	0.61	0.71	0.33	0.33	0.55	0.34	1.0	0.51	0.33	0.63	0.86	0.39
AMTR_s00106p00100050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.71)	0.15	0.32	0.03	0.27	0.07	0.05	0.2	0.01	0.38	0.3	1.0	0.94	0.27	0.46	0.17	0.33	0.77	0.89	0.64	0.45	0.6	0.25
AMTR_s00108p00034740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00108.5)	0.0	0.76	0.66	0.09	0.17	0.03	0.1	0.0	0.04	0.06	0.49	0.58	0.3	0.17	0.13	0.88	1.0	0.89	0.94	0.89	0.55	0.57
AMTR_s00126p00080460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00126.37)	0.01	0.94	0.0	0.05	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.69	0.27	0.19	0.17	0.25	1.0	0.29	0.42	0.25	0.42	0.25
AMTR_s00127p00108450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.27)	0.0	0.52	0.07	0.43	0.1	0.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.64	0.61	0.59	0.36	0.26	0.37	1.0	0.53	0.4	0.38	0.76	0.47
AMTR_s00148p00074330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.49)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	1.0	0.14	0.08	0.26	0.3	0.7	0.38	0.34	0.26	0.54	0.22
AMTR_s00148p00090060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.61)	0.13	0.19	0.11	0.24	0.13	0.05	0.07	0.02	0.12	0.09	0.76	0.72	0.36	0.25	0.35	0.34	1.0	0.59	0.46	0.49	0.81	0.31
AMTR_s00159p00042980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00159.12)	0.0	0.69	0.09	0.14	0.16	0.0	0.04	0.0	0.06	0.05	0.62	0.55	0.35	0.12	0.1	0.37	1.0	0.23	0.19	0.13	0.28	0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)