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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)
Gene | Immature female cone | Immature male cones | Cambium and expanding xylem | Cambium | Expanding xylem | Expanding and mature xylem | Maturing xylem | Wood | Bark | Bark, healthy | S1 xylem tracheids | S1 whole sections | S2 ray cells | S2 xylem tracheids | S2 whole sections | Dead late wood | Phloem and cambium | Dear early and late wood | Bark, root and butt rot | Vegetative shoots - needles | Vegetative shoots - stem | Vegetative shoots | Girdled twig - stem | Dried twig - needles | Girdled twig - needles | Needles | Needles - dawn | Needles - later afternoon | Needles - midday | Needles - night | Light, 1 hour | Light, 3 hours | Light, 5 hours | Light, 7 hours | Light, 9 hours | Light, 13 hours | Light, 15 hours | Darkness, 1 hour | Darkness, 3 hours | Darkness, 5 hours | Darkness, 7 hours | Darkness, 11 hours | Vegetative buds | Female buds | Male buds | Buds | Pineapple galls | Somatic germinants - abnormal type | Somatic germinants - normal type | Cell culture - H20 - 5 days | Cell culture - KI added - 5 days | Cell culture - KI added - 20 days | Cell culture - KI removed - 4 days | Cell culture - KI removed - 12 days | Cell culture - solid medium | Somatic embryogenic cell line |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.78 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.07 | - | - | - | - | 1.55 | - | - | - | 3.59 | - | - | 2.19 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.8 | - | - | 2.28 | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.15 | 4.19 | - | - | 4.32 | - | |
- | - | - | 2.34 | - | - | - | - | - | 1.13 | - | 2.99 | 2.96 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.74 | - | - | - | - | 3.64 | 2.78 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | -2.2 | -0.0 | - | 1.21 | - | 1.46 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.72 | - | - | - | - | 1.73 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.2 | 2.64 | 2.07 | 2.57 | 0.86 | 3.51 | - | |
2.83 | - | - | - | - | - | - | - | -0.46 | 2.51 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.63 | - | - | - | - | - | 2.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.65 | -0.84 | 3.33 | - | 1.95 | 1.75 | 2.72 | - | 1.39 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | -1.5 | 1.87 | - | -0.2 | 1.73 | - | 0.43 | - | - | - | 1.71 | - | - | - | - | - | - | -2.97 | - | - | - | - | -0.61 | - | - | - | 0.4 | 2.72 | - | - | - | - | 0.52 | 0.93 | 0.95 | 0.73 | 1.16 | - | - | -3.21 | -0.66 | 2.88 | 2.88 | - | - | - | 3.27 | -2.01 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.81 | - | 4.81 | - | - | - | |
- | 4.52 | - | - | - | - | - | - | - | 1.49 | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | -1.51 | - | - | - | - | - | - | 1.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.9 | -2.6 | - | 2.86 | 3.68 | -0.74 | - | 1.79 | 1.25 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.49 | - | - | - | - | 3.9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.01 | - | 4.12 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.24 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.84 | - | 3.85 | - | 4.14 | 2.3 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.94 | - | - | - | - | - | - | - | 2.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.04 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.89 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.7 | - | - | 4.36 | - | 2.49 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.37 | 4.28 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.38 | - | - | 4.15 | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.55 | - | - | - | 3.0 | 4.34 | - | 3.39 | - | 2.42 | 0.49 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.27 | - | - | - | - | - | - | 2.54 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.95 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | 3.79 | - | - | - | - | - | 2.65 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.19 | - | 4.14 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.57 | - | - | - | - | - | - | 1.53 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.43 | - | - | - | 4.68 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.39 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.51 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.27 | - | - | - | - | - | - | 2.54 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.95 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.39 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.51 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.81 | - | 3.9 | 3.71 | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.75 | - | - | - | 4.5 | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.28 | - | - | 3.14 | 3.02 | - | - | - | 2.36 | - | - | - | - | - | - | 1.41 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.28 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.58 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.44 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.77 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | -1.2 | 1.0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.66 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.74 | 4.16 | 1.94 | 3.78 | 1.65 | 3.0 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.14 | 1.37 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.35 | - | - | - | - | 0.65 | - | 0.84 | - | 2.12 | - | - | - | 2.52 | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.71 | - | 2.43 | 2.37 | 3.21 | 1.74 | 2.26 | 2.54 | 0.36 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.65 | - | 2.67 | - | - | - | - | - | - | 3.02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.68 | 4.17 | - | - | - | 3.81 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.57 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | -2.43 | - | - | - | - | - | 0.81 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.14 | 0.42 | 1.12 | - | - | -1.24 | -1.46 | 3.3 | 3.27 | 3.29 | 3.48 | -1.36 | 2.65 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.79 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.3 | 3.88 | 4.57 | - | - | 2.76 | 0.23 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | 1.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.87 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.69 | - | 5.16 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.35 | - | - | - | - | 2.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.07 | - | 4.64 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.61 | - | - | 2.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.68 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.26 | - | - | - | - | - | - | 2.02 | 3.27 | 2.41 | 3.41 | 3.34 | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.26 | 3.39 | 3.41 | 3.17 | 4.03 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.93 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.35 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.19 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.68 | - | - | - | 3.89 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.91 | - | - | - | - | - | - | 0.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.11 | - | 2.54 | 2.71 | - | - | - |
Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.