Heatmap: Cluster_174 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00128110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.102)
0.09 0.14 0.01 0.0 0.25 0.01 0.47 0.14 0.38 0.25 0.03 0.11 0.21 0.99 1.0 0.14 0.01 0.13 0.05 0.13 0.12 0.03
AMTR_s00001p00210810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.217)
0.52 0.18 0.13 0.29 0.26 0.24 0.52 0.18 0.55 0.54 0.44 0.44 0.89 1.0 0.95 0.42 0.46 0.27 0.34 0.27 0.13 0.32
AMTR_s00002p00149570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.115)
0.45 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.75 0.68 0.1 0.13 0.25 0.48 0.11 0.0 0.27 0.04 0.05 0.18 0.1 0.16
AMTR_s00002p00263850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.484)
0.21 0.12 0.17 0.09 0.21 0.4 0.63 0.22 0.95 0.84 0.31 0.3 0.49 1.0 0.59 0.18 0.19 0.32 0.33 0.39 0.29 0.31
AMTR_s00002p00271790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.638)
0.24 0.24 0.07 0.05 0.52 0.39 1.0 0.12 0.57 0.7 0.34 0.24 0.4 0.45 0.61 0.19 0.39 0.13 0.13 0.26 0.1 0.27
AMTR_s00002p00271860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.643)
0.54 0.15 0.41 0.03 0.4 0.01 0.86 0.12 1.0 0.9 0.36 0.3 0.28 0.5 0.54 0.2 0.36 0.23 0.26 0.33 0.1 0.33
AMTR_s00003p00036090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.18)
0.42 0.0 0.33 0.26 0.15 0.0 1.0 0.0 0.7 0.79 0.25 0.29 0.23 0.26 0.15 0.16 0.09 0.1 0.17 0.07 0.14 0.11
AMTR_s00003p00223750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.217)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.6 0.5 0.0 0.0 0.01 0.36 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
AMTR_s00003p00269890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.421)
0.0 0.0 0.66 0.08 0.5 0.15 0.94 0.15 0.87 1.0 0.59 0.65 0.28 0.36 0.36 0.22 0.21 0.12 0.09 0.02 0.04 0.24
AMTR_s00005p00257860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.183)
0.0 0.06 0.0 0.1 0.25 0.14 0.46 0.04 0.4 0.45 0.22 0.21 0.66 1.0 0.86 0.22 0.23 0.21 0.19 0.21 0.09 0.21
AMTR_s00007p00110480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.65)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 1.0 0.0 0.44 0.4 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.17
AMTR_s00009p00107000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.51)
0.02 0.19 0.0 0.08 0.44 0.26 1.0 0.15 0.82 0.75 0.21 0.35 0.4 0.7 0.66 0.13 0.19 0.18 0.18 0.17 0.08 0.32
AMTR_s00010p00060450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.33)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.47 0.46 0.22 0.1 0.08 0.11 0.07 0.07 0.38 1.0 0.57 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11
AMTR_s00010p00136880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.97)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.59 0.45 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00010p00179060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.146)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.8 0.0 0.52 0.76 0.25 0.0 0.54 1.0 0.48 0.0 0.2 0.25 0.13 0.2 0.0 0.08
AMTR_s00010p00179070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.147)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.51 0.0 0.23 0.73 0.32 0.57 0.34 0.71 0.62 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.0 0.09
AMTR_s00010p00179080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.148)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.77 0.0 0.49 0.61 0.12 0.0 0.4 1.0 0.57 0.09 0.19 0.12 0.34 0.21 0.11 0.12
AMTR_s00010p00257080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.396)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.68 0.0 0.6 1.0 0.0 0.0 0.18 0.06 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.09
AMTR_s00011p00209170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.80)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.35 0.64 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00012p00263950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.351)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.73 0.0 0.25 0.23 0.08 0.25 0.19 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.22
AMTR_s00016p00254920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.331)
0.18 0.42 0.21 0.0 0.2 0.4 1.0 0.06 0.64 0.75 0.06 0.08 0.26 0.57 0.34 0.01 0.09 0.04 0.03 0.04 0.01 0.09
AMTR_s00016p00256700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.344)
0.0 0.79 0.0 0.0 0.52 0.0 1.0 0.0 0.58 0.96 0.06 0.02 0.03 0.17 0.25 0.12 0.12 0.0 0.01 0.04 0.06 0.03
AMTR_s00017p00218470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.162)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 1.0 0.81 0.0 0.0 0.01 0.56 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
AMTR_s00019p00150410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.138)
0.66 0.3 0.4 0.05 0.22 0.23 0.99 0.24 1.0 0.89 0.14 0.18 0.19 0.47 0.55 0.05 0.55 0.09 0.07 0.06 0.02 0.19
AMTR_s00019p00246010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.384)
0.04 0.02 0.13 0.01 0.73 0.18 0.8 0.49 1.0 0.8 0.25 0.28 0.26 0.45 0.46 0.24 0.11 0.2 0.16 0.17 0.05 0.15
AMTR_s00021p00210180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.183)
0.1 0.01 0.01 0.0 0.12 1.0 0.6 0.52 0.61 0.59 0.04 0.07 0.41 0.8 0.45 0.69 0.07 0.12 0.14 0.13 0.06 0.11
AMTR_s00023p00106320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.52)
0.31 0.06 0.34 0.14 0.44 0.05 0.84 0.0 0.69 0.71 0.27 0.29 0.42 0.64 0.75 0.79 0.16 0.52 0.61 0.4 1.0 0.5
AMTR_s00025p00088540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.71)
0.32 0.15 0.1 0.09 0.63 0.45 1.0 0.66 0.67 0.79 0.21 0.26 0.33 0.44 0.2 0.23 0.11 0.19 0.22 0.21 0.08 0.23
AMTR_s00025p00242850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.375)
0.49 0.22 0.12 0.03 0.02 0.39 0.44 0.09 0.36 0.39 0.07 0.13 0.33 1.0 0.24 0.05 0.08 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02
AMTR_s00027p00193830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.63)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.47 0.02 1.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00027p00211720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.75)
0.15 0.29 0.21 0.25 0.72 0.04 0.68 0.07 0.48 0.4 0.1 0.17 0.36 0.94 1.0 0.09 0.09 0.07 0.07 0.16 0.09 0.27
AMTR_s00028p00208360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.99)
0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.4 0.0 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04
AMTR_s00032p00203450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.193)
0.47 0.3 0.31 0.13 0.47 0.04 0.7 0.05 1.0 0.78 0.22 0.27 0.15 0.42 0.5 0.06 0.18 0.23 0.26 0.31 0.29 0.32
AMTR_s00034p00179220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.57)
0.02 0.37 0.0 0.03 0.23 0.35 0.71 0.13 0.79 0.87 0.27 0.23 0.38 0.4 1.0 0.31 0.18 0.15 0.15 0.39 0.22 0.35
AMTR_s00038p00202780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.152)
0.39 0.07 0.16 0.04 0.13 0.27 0.79 0.09 0.72 0.75 0.31 0.23 0.34 1.0 0.63 0.37 0.13 0.22 0.29 0.33 0.19 0.25
AMTR_s00044p00070150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.41)
0.0 0.23 0.0 0.0 0.01 0.0 0.34 0.01 1.0 0.79 0.04 0.02 0.3 0.77 0.08 0.01 0.03 0.03 0.01 0.06 0.0 0.24
AMTR_s00045p00216650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.303)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.46 0.0 0.64 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00046p00058640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00046.15)
0.39 0.44 0.46 0.07 0.36 0.34 1.0 0.11 0.74 0.86 0.31 0.35 0.39 0.56 0.52 0.47 0.23 0.26 0.37 0.71 0.35 0.4
AMTR_s00047p00177970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.101)
0.55 0.15 0.17 0.33 0.33 0.21 1.0 0.22 0.55 0.67 0.26 0.2 0.25 0.36 0.29 0.34 0.18 0.18 0.21 0.21 0.14 0.26
AMTR_s00047p00215210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.159)
0.15 0.01 0.14 0.2 0.06 0.15 0.79 0.32 1.0 0.93 0.2 0.27 0.24 0.37 0.25 0.64 0.21 0.26 0.18 0.27 0.08 0.26
AMTR_s00048p00028800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.5)
0.17 0.17 0.16 0.01 0.03 0.28 1.0 0.02 0.64 0.81 0.12 0.26 0.29 0.66 0.17 0.64 0.16 0.17 0.13 0.28 0.16 0.42
AMTR_s00048p00057000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.20)
0.01 0.01 0.77 0.06 0.44 0.38 0.68 0.03 1.0 0.83 0.26 0.47 0.23 0.5 0.59 0.17 0.41 0.03 0.04 0.02 0.02 0.07
AMTR_s00050p00195040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.60)
0.17 0.21 0.2 0.18 0.22 0.15 1.0 0.09 0.89 0.99 0.25 0.31 0.31 0.43 0.85 0.34 0.22 0.17 0.23 0.47 0.12 0.33
AMTR_s00051p00052460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.19)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.69 0.66 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00051p00052510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.20)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.66 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00057p00210380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.259)
0.18 0.4 0.37 0.19 0.42 0.35 0.93 0.22 0.82 1.0 0.36 0.36 0.38 0.49 0.39 0.39 0.16 0.38 0.45 0.57 0.51 0.33
AMTR_s00059p00041200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.24)
0.27 0.15 0.17 0.13 0.2 0.16 1.0 0.15 0.76 0.67 0.2 0.22 0.29 0.55 0.41 0.14 0.18 0.17 0.22 0.3 0.11 0.22
AMTR_s00059p00197160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.218)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.08 0.41 0.07 1.0 0.62 0.0 0.01 0.04 0.25 0.23 0.08 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01
AMTR_s00063p00190060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.72)
0.2 0.23 0.2 0.01 0.23 0.44 0.47 0.12 0.53 0.44 0.15 0.21 0.44 1.0 0.62 0.44 0.08 0.2 0.26 0.28 0.2 0.04
AMTR_s00064p00093670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.34)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.85 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00065p00205110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.193)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 1.0 0.0 0.72 0.86 0.0 0.0 0.02 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05
AMTR_s00077p00115650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.104)
0.09 0.02 0.01 0.02 0.13 0.91 1.0 0.52 0.7 0.75 0.04 0.05 0.82 0.93 0.25 0.29 0.06 0.19 0.02 0.44 0.07 0.01
AMTR_s00077p00185660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.216)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.49 1.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
AMTR_s00078p00116560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.89)
0.0 0.66 0.0 0.0 0.23 0.02 1.0 0.3 0.92 0.95 0.39 0.55 0.12 0.34 0.72 0.11 0.27 0.26 0.15 0.12 0.29 0.1
AMTR_s00085p00036550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.12)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.59 0.0 0.94 0.09 0.94 1.0 0.03 0.0 0.14 0.97 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.2
AMTR_s00088p00158600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.128)
0.11 0.35 0.38 0.11 0.72 0.71 0.96 0.19 1.0 0.71 0.35 0.3 0.38 0.59 0.48 0.24 0.67 0.33 0.43 0.5 0.35 0.31
AMTR_s00092p00170060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.154)
0.12 0.05 0.03 0.02 0.41 1.0 0.94 0.16 0.31 0.45 0.0 0.01 0.08 0.91 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
AMTR_s00094p00127780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00094.15)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.17 0.41 0.22 0.01 0.12 0.12 0.06 0.05 0.13 0.8 1.0 0.01 0.09 0.01 0.03 0.31 0.01 0.15
AMTR_s00096p00013400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.63 0.33 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00106p00055220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.31)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.43 0.25 0.18 0.28 0.0 0.08 0.15 1.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00106p00117270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.87)
0.11 0.0 0.07 0.16 0.66 0.21 1.0 0.0 0.53 0.56 0.0 0.0 0.04 0.14 0.38 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.03
AMTR_s00134p00031500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00134.8)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.93 0.24 1.0 0.86 0.1 0.12 0.04 0.05 0.14 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
AMTR_s00136p00023930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00136.5)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.24 0.52 0.01 0.56 0.7 0.16 0.25 0.07 1.0 0.23 0.07 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02
AMTR_s00142p00045140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00142.22)
0.06 0.06 0.19 0.12 0.2 0.4 1.0 0.18 0.96 0.9 0.59 0.62 0.48 0.97 0.96 0.52 0.21 0.52 0.6 0.78 0.65 0.66
AMTR_s00156p00027150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.8)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.67 0.32 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00163p00062330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00163.25)
0.32 0.35 0.31 0.02 0.89 0.21 0.91 0.54 0.96 1.0 0.44 0.35 0.41 0.73 0.52 0.23 0.21 0.23 0.21 0.18 0.12 0.4
AMTR_s00164p00033820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.67 0.0 0.88 1.0 0.0 0.0 0.03 0.23 0.06 0.0 0.11 0.21 0.0 0.03 0.0 0.03
AMTR_s00193p00024950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00193.4)
0.07 0.15 0.13 0.0 0.4 0.45 1.0 0.16 0.62 0.91 0.29 0.43 0.34 0.99 0.96 0.23 0.12 0.2 0.48 0.37 0.06 0.21
AMTR_s00197p00022270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00197.4)
0.19 0.26 0.13 0.07 0.08 0.18 0.94 0.14 0.87 1.0 0.19 0.28 0.41 0.49 0.17 0.98 0.22 0.19 0.2 0.38 0.17 0.2
AMTR_s00198p00016850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00198.3)
0.3 0.21 0.5 0.33 0.11 0.1 0.94 0.16 0.76 1.0 0.14 0.19 0.3 0.64 0.34 0.28 0.12 0.12 0.16 0.35 0.09 0.32
AMTR_s00209p00025840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00209.6)
0.05 0.0 0.0 0.02 0.22 0.25 1.0 0.0 0.75 0.64 0.02 0.2 0.1 0.48 0.37 0.05 0.01 0.0 0.01 0.06 0.05 0.25
AMTR_s00244p00015280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00244.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.65 0.0 0.79 1.0 0.0 0.08 0.03 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)