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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)
Gene | Immature female cone | Immature male cones | Cambium and expanding xylem | Cambium | Expanding xylem | Expanding and mature xylem | Maturing xylem | Wood | Bark | Bark, healthy | S1 xylem tracheids | S1 whole sections | S2 ray cells | S2 xylem tracheids | S2 whole sections | Dead late wood | Phloem and cambium | Dear early and late wood | Bark, root and butt rot | Vegetative shoots - needles | Vegetative shoots - stem | Vegetative shoots | Girdled twig - stem | Dried twig - needles | Girdled twig - needles | Needles | Needles - dawn | Needles - later afternoon | Needles - midday | Needles - night | Light, 1 hour | Light, 3 hours | Light, 5 hours | Light, 7 hours | Light, 9 hours | Light, 13 hours | Light, 15 hours | Darkness, 1 hour | Darkness, 3 hours | Darkness, 5 hours | Darkness, 7 hours | Darkness, 11 hours | Vegetative buds | Female buds | Male buds | Buds | Pineapple galls | Somatic germinants - abnormal type | Somatic germinants - normal type | Cell culture - H20 - 5 days | Cell culture - KI added - 5 days | Cell culture - KI added - 20 days | Cell culture - KI removed - 4 days | Cell culture - KI removed - 12 days | Cell culture - solid medium | Somatic embryogenic cell line |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.34 | - | - | 3.95 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.1 | 4.45 | - | - | 4.03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.26 | - | - | 5.03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.52 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.29 | - | - | - | - | - | 1.88 | 1.04 | - | - | - | 1.17 | -0.56 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.03 | 4.1 | 3.34 | 3.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.46 | - | 2.76 | 4.53 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | 3.34 | - | - | - | - | - | - | 4.16 | - | - | 4.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.92 | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.77 | - | - | 4.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | 2.69 | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.74 | - | - | 4.32 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.21 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.96 | - | - | 3.54 | - | - | - | - | - | 4.1 | - | - | - | - | -0.59 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.46 | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.0 | - | - | 4.58 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.55 | 4.81 | - | - | 3.42 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.46 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.21 | - | - | 4.79 | - | - | - | 3.3 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.83 | - | - | 4.42 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.76 | - | - | 4.37 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.05 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.52 | - | - | 4.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.25 | - | - | - | - | - | 3.17 | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.91 | - | - | 4.84 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.63 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | 3.24 | - | - | 3.19 | - | - | - | - | - | - | 3.6 | - | 3.52 | 3.79 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.08 | - | - | 5.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.81 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.77 | - | 4.52 | 3.59 | - | 4.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | 4.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.97 | - | - | 4.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | 3.32 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.52 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.97 | - | - | 4.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.82 | - | - | 4.43 | - | - | - | 2.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | 4.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | 4.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.97 | - | - | 4.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | 4.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | 4.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.41 | - | - | 2.97 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.84 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.02 | - | 1.72 | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | 4.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.68 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.55 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.4 | - | - | 3.98 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.25 | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | -0.29 | 2.64 | - | 4.38 | - | - | 2.98 | - | - | - | 3.05 | - | - | - | - | - | - | 1.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.29 | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.0 | 5.32 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.31 | - | - | 3.65 | - | - | - | 2.73 | - | - | - | - | - | - | -0.27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.95 | - | - | 3.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.33 | - | - | 3.98 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.47 | - | - | 5.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.53 | - | - | 4.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.98 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.04 | - | 3.75 | - | - | 3.36 | - | - | - | 2.29 | - | - | - | - | - | - | 0.96 | - | - | - | 4.41 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.99 | - | - | 4.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | 0.66 | - | - | 3.2 | - | - | 4.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.87 | - | - | - | - | 2.74 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.01 | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.7 | 3.95 | - | 3.25 | 3.55 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | 4.01 | - | - | - | - | 1.99 | - | 3.85 | - | - | 4.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.68 | 4.99 | - | - | 3.52 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | 4.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.47 | - | - | 4.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.76 | - | - | 3.41 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.82 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.08 | |
4.77 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.04 | - | - | 3.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | 0.58 | - | - | 5.17 | - | - | 3.75 | - | - | - | 2.32 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.97 | - | - | 4.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.