1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00147850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.130)
 0.12 0.05 0.09 0.07 0.06 0.03 0.05 0.04 0.07 0.09 0.14 0.14 0.1 0.2 0.18 0.73 0.04 1.0 0.54 0.66 0.68 0.01
AMTR_s00001p00175920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.167)
 0.08 0.05 0.04 0.15 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.25 0.36 0.25 0.2 0.17 0.2 0.19 1.0 0.72 0.77 0.45 0.08
AMTR_s00001p00191890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.191)
 0.01 0.0 0.0 0.09 0.04 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.25 0.18 0.08 0.09 0.04 0.2 0.24 1.0 0.73 0.54 0.79 0.02
AMTR_s00002p00266120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.505)
 0.03 0.04 0.02 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.13 0.11 0.12 0.21 0.03 0.1 0.89 1.0 0.7 0.45 0.01
AMTR_s00002p00267770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.529)
 0.16 0.06 0.24 0.32 0.14 0.08 0.02 0.05 0.01 0.01 0.27 0.28 0.21 0.14 0.15 0.18 0.47 0.58 0.65 1.0 0.28 0.23
AMTR_s00002p00271180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.613)
 0.0 0.04 0.12 0.02 0.03 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.13 0.18 0.1 0.16 0.15 0.29 0.21 1.0 0.46 0.33 0.38 0.12
AMTR_s00003p00251710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.300)
 0.11 0.11 0.0 0.0 0.06 0.14 0.19 0.0 0.1 0.07 0.19 0.2 0.09 0.24 0.51 0.15 0.24 1.0 0.67 0.93 0.44 0.03
AMTR_s00004p00044800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.27)
 0.03 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.24 0.41 0.06 0.04 0.03 0.28 1.0 0.95 0.51 0.54 0.02
AMTR_s00005p00239290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.125)
 0.07 0.03 0.03 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.34 0.12 0.1 0.22 0.26 0.33 1.0 0.93 0.86 0.68 0.14
AMTR_s00006p00250270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.149)
 0.28 0.19 0.0 0.11 0.24 0.0 0.01 0.1 0.01 0.01 0.31 0.37 0.33 0.19 0.28 0.34 0.36 1.0 0.71 0.76 0.51 0.13
AMTR_s00007p00182110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.145)
 0.04 0.12 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.22 0.25 0.32 0.35 0.39 0.64 0.18 0.87 1.0 0.95 0.61 0.08
AMTR_s00007p00193800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.164)
 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.13 0.06 0.04 0.17 0.0 0.18 0.84 1.0 0.97 0.35 0.0
AMTR_s00009p00163120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.90)
 0.13 0.13 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.22 0.27 0.24 0.12 0.17 0.55 0.3 0.71 0.84 1.0 0.31 0.1
AMTR_s00010p00265990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.518)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.53 0.54 0.47 0.01
AMTR_s00011p00241810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.138)
 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.09 0.03 0.08 0.08 0.15 0.07 0.05 0.02 0.05 0.01 0.39 0.82 0.83 1.0 0.28 0.05
AMTR_s00012p00254690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.280)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.11 0.17 0.1 0.08 0.05 0.28 0.89 1.0 0.99 0.7 0.02
AMTR_s00012p00257120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.301)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.25 0.22 0.12 0.07 0.03 0.03 0.33 1.0 0.91 0.59 0.58 0.02
AMTR_s00016p00108610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.69)
 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.19 0.07 0.08 0.03 0.13 0.38 1.0 0.77 0.94 0.61 0.01
AMTR_s00018p00243310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.150)
 0.0 0.0 0.13 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.3 0.23 0.16 0.28 0.23 0.54 0.91 0.87 1.0 0.47 0.11
AMTR_s00018p00255680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.171)
 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.02 0.0 0.0 0.02 0.33 1.0 0.44 0.37 0.56 0.0
AMTR_s00019p00244740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.373)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.21 0.12 0.03 0.03 0.05 0.69 0.58 0.66 1.0 0.55 0.0
AMTR_s00021p00158020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.111)
 0.09 0.05 0.0 0.18 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.23 0.37 0.14 0.19 0.08 0.69 0.66 0.91 1.0 0.46 0.15
AMTR_s00022p00205270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.242)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.16 0.06 0.09 0.46 0.4 0.68 0.82 1.0 0.3 0.03
AMTR_s00022p00242510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.352)
 0.09 0.0 0.15 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.17 0.3 0.15 0.14 0.14 0.4 0.14 1.0 0.65 0.55 0.39 0.04
AMTR_s00024p00238310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.270)
 0.26 0.18 0.01 0.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.22 0.33 0.17 0.31 0.23 0.45 0.52 0.62 1.0 0.31 0.07
AMTR_s00025p00041760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.20)
 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.06 0.09 0.03 0.02 0.01 0.05 0.53 1.0 0.81 0.62 0.69 0.03
AMTR_s00025p00042290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.21)
 0.09 0.01 0.0 0.0 0.08 0.04 0.05 0.0 0.04 0.04 0.12 0.14 0.12 0.05 0.03 0.07 0.54 1.0 0.94 0.59 0.5 0.07
AMTR_s00025p00112220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.100)
 0.26 0.22 0.11 0.19 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.34 0.28 0.24 0.22 0.39 0.32 0.86 1.0 0.89 0.51 0.3
AMTR_s00025p00126870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.118)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.15 0.18 0.12 0.13 0.04 0.08 0.3 1.0 0.71 0.65 0.62 0.01
AMTR_s00029p00134700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.153)
 0.0 0.0 0.17 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.17 0.1 0.09 0.02 0.04 0.02 0.33 1.0 0.56 0.64 0.82 0.02
AMTR_s00037p00234060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.152)
 0.25 0.15 0.14 0.14 0.07 0.0 0.11 0.04 0.12 0.11 0.16 0.24 0.15 0.16 0.14 0.15 0.34 0.7 0.69 1.0 0.15 0.16
AMTR_s00039p00131500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.86)
 0.04 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.14 0.07 0.08 0.12 0.02 0.06 0.86 1.0 0.9 0.16 0.01
AMTR_s00045p00069220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.56)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.03 0.01 0.06 0.0 0.01 1.0 0.5 0.59 0.11 0.0
AMTR_s00045p00175560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.209)
 0.1 0.08 0.04 0.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.25 0.21 0.25 0.2 0.23 0.13 1.0 0.71 0.63 0.35 0.03
AMTR_s00049p00052690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.26)
 0.03 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.18 0.08 0.01 0.05 0.01 0.67 1.0 0.52 0.96 0.5 0.01
AMTR_s00049p00073250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.46)
 0.21 0.04 0.06 0.17 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.28 0.22 0.22 0.32 0.35 0.16 0.58 1.0 0.68 0.42 0.07
AMTR_s00049p00227880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.275)
 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.26 0.17 0.14 0.14 0.38 0.49 0.77 0.71 1.0 0.52 0.09
AMTR_s00058p00182650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.174)
 0.03 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.01 0.0 0.01 0.0 0.29 1.0 0.48 0.39 0.55 0.0
AMTR_s00059p00176390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.181)
 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.09 0.06 0.16 0.08 0.19 0.93 0.99 1.0 0.51 0.0
AMTR_s00059p00176870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.183)
 0.15 0.16 0.29 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.04 0.04 0.15 0.06 0.17 0.24 0.02 0.09 0.29 1.0 0.44 0.64 0.04 0.02
AMTR_s00060p00116070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.55)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.43 1.0 0.54 0.58 0.41 0.01
AMTR_s00061p00059490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.34)
 0.04 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.1 0.03 0.05 0.02 0.19 1.0 0.87 0.95 0.26 0.0
AMTR_s00061p00164910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.164)
 0.01 0.1 0.0 0.0 0.17 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.42 0.4 0.27 0.12 0.14 0.13 0.2 1.0 0.85 0.22 0.29 0.12
AMTR_s00062p00189550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.192)
 0.08 0.02 0.03 0.06 0.05 0.07 0.03 0.01 0.03 0.03 0.19 0.19 0.11 0.1 0.06 0.35 0.46 1.0 0.63 0.67 0.56 0.08
AMTR_s00062p00201460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.212)
 0.06 0.05 0.0 0.06 0.03 0.0 0.21 0.04 0.12 0.16 0.29 0.31 0.2 0.12 0.08 0.39 0.53 1.0 0.93 0.88 0.57 0.15
AMTR_s00065p00210500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.208)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.05 0.02 0.01 0.01 0.12 0.52 1.0 0.62 0.6 0.85 0.01
AMTR_s00070p00129320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.69)
 0.11 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.2 0.13 0.04 0.01 0.14 0.81 0.7 1.0 0.3 0.0
AMTR_s00072p00084990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.37)
 0.03 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.19 0.13 0.11 0.07 0.09 0.25 1.0 0.79 0.66 0.55 0.02
AMTR_s00073p00061640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.16)
 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.05 0.02 0.03 0.01 0.09 0.42 0.87 1.0 0.24 0.0
AMTR_s00079p00061090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.19)
 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.05 0.04 0.05 0.01 0.27 1.0 0.74 1.0 0.53 0.0
AMTR_s00081p00063880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.20)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.02 0.0 0.04 0.0 0.48 1.0 0.6 0.66 0.66 0.2
AMTR_s00088p00153020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.122)
 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.04 0.01 0.05 0.01 0.27 1.0 0.77 0.78 0.36 0.0
AMTR_s00089p00043950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.12)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.35 1.0 0.54 0.8 0.23 0.0
AMTR_s00089p00073940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.34)
 0.23 0.05 0.0 0.1 0.14 0.0 0.14 0.0 0.17 0.16 0.27 0.16 0.19 0.14 0.1 0.21 0.82 1.0 0.74 0.63 0.92 0.1
AMTR_s00092p00018230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.86 0.43 0.5 0.01
AMTR_s00092p00167540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.149)
 0.05 0.12 0.0 0.03 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.25 0.22 0.14 0.18 0.3 0.13 0.5 0.93 0.92 1.0 0.39 0.05
AMTR_s00095p00166740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.146)
 0.2 0.06 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.23 0.31 0.08 0.09 0.3 0.34 0.84 1.0 0.94 0.37 0.08
AMTR_s00098p00154060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.43)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.04 0.01 0.01 0.08 0.33 0.88 1.0 0.6 0.78 0.01
AMTR_s00099p00163300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.164)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.14 0.17 0.02 0.01 0.06 0.01 0.47 1.0 0.97 0.96 0.47 0.01
AMTR_s00106p00037610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.18)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.08 0.21 0.25 0.03 0.06 1.0 0.51 0.75 0.42 0.01
AMTR_s00107p00150560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00107.45)
 0.04 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.23 0.22 0.11 0.09 0.13 0.22 0.17 0.89 1.0 0.56 0.38 0.03
AMTR_s00166p00060690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.36)
 0.15 0.18 0.02 0.01 0.09 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.28 0.35 0.3 0.19 0.41 0.59 0.5 0.68 0.8 1.0 0.29 0.16
AMTR_s04181p00006640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04181.1)
 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.15 0.05 0.03 0.0 0.0 1.0 0.38 0.51 0.0 0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)