1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00269360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.438)
 1.0 0.33 0.58 0.5 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.03 0.04 0.87 0.4 0.0 0.18 0.1 0.05 0.05 0.05
AMTR_s00002p00261470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.452)
 0.89 1.0 0.32 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.52 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
AMTR_s00003p00195190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.176)
 1.0 0.59 0.71 0.12 0.25 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06 0.07 0.11 0.76 0.53 0.08 0.03 0.13 0.08 0.22 0.06 0.09
AMTR_s00003p00271440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.458)
 1.0 0.78 0.66 0.0 0.25 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.13 0.38 0.05 0.82 0.58 0.03 0.09 0.06 0.04 0.03 0.06
AMTR_s00007p00158970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.121)
 0.4 0.21 0.46 1.0 0.09 0.02 0.07 0.01 0.27 0.17 0.09 0.14 0.06 0.98 0.45 0.1 0.11 0.04 0.03 0.13 0.02 0.17
AMTR_s00007p00213180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.196)
 1.0 0.67 0.5 0.05 0.01 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.51 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.05
AMTR_s00007p00258170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.310)
 0.67 0.54 0.41 0.37 0.01 0.01 0.01 0.02 0.18 0.14 0.08 0.09 0.06 1.0 0.13 0.01 0.03 0.04 0.04 0.31 0.02 0.04
AMTR_s00009p00266980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.400)
 1.0 0.37 0.28 0.53 0.12 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.08 0.09 0.05 0.26 0.38 0.02 0.03 0.04 0.01 0.18 0.0 0.18
AMTR_s00010p00102390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.57)
 0.81 1.0 0.13 0.05 0.17 0.04 0.02 0.0 0.02 0.01 0.08 0.07 0.66 0.3 0.19 0.12 0.15 0.23 0.25 0.34 0.17 0.13
AMTR_s00010p00261380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.453)
 0.86 0.66 0.47 0.67 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.28 0.3 1.0 0.64 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.09
AMTR_s00012p00264150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.357)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.51 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0
AMTR_s00013p00255370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.244)
 1.0 0.71 0.18 0.37 0.26 0.4 0.61 0.14 0.51 0.35 0.13 0.27 0.15 0.37 0.8 0.35 0.19 0.12 0.09 0.22 0.16 0.1
1.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.92 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
AMTR_s00022p00067280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.47)
 0.91 1.0 0.39 0.07 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.03 0.93 0.47 0.01 0.0 0.0 0.01 0.17 0.01 0.01
AMTR_s00030p00130440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.78)
 0.92 0.37 0.48 0.07 0.24 0.02 0.03 0.05 0.07 0.06 0.1 0.13 0.14 1.0 0.48 0.05 0.03 0.02 0.02 0.1 0.02 0.14
AMTR_s00030p00215650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.161)
 0.76 1.0 0.42 0.08 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.57 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.2 0.01 0.02
AMTR_s00030p00236350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.200)
 0.44 0.43 0.34 1.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.05 0.7 0.2 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 0.01 0.02
AMTR_s00033p00020480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.6)
 1.0 0.38 0.21 0.42 0.1 0.01 0.04 0.05 0.09 0.11 0.25 0.26 0.22 0.72 0.51 0.17 0.13 0.18 0.17 0.24 0.34 0.18
AMTR_s00033p00173430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.123)
 0.41 0.21 0.34 0.91 0.11 0.01 0.01 0.04 0.04 0.08 0.09 0.12 0.2 1.0 0.18 0.22 0.01 0.08 0.18 0.11 0.11 0.16
AMTR_s00041p00050300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.22)
 0.99 1.0 0.54 0.13 0.08 0.01 0.02 0.03 0.05 0.05 0.2 0.3 0.31 0.76 0.35 0.06 0.13 0.1 0.09 0.12 0.03 0.38
AMTR_s00044p00096750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.67)
 1.0 0.78 0.57 0.39 0.29 0.25 0.17 0.03 0.3 0.29 0.43 0.53 0.63 0.8 0.73 0.33 0.37 0.37 0.4 0.53 0.19 0.65
AMTR_s00045p00134660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.135)
 0.28 1.0 0.31 0.0 0.11 0.0 0.0 0.16 0.03 0.08 0.02 0.0 0.17 0.52 0.17 0.02 0.03 0.02 0.03 0.04 0.0 0.21
AMTR_s00047p00047710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.8)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.18 0.31 0.31 0.78 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.02
AMTR_s00047p00210100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.150)
 0.73 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.19 0.41 0.29 0.77 0.53 0.19 0.25 0.39 0.16 0.11 0.17 0.16
AMTR_s00049p00044160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.21)
 1.0 0.35 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.18 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
AMTR_s00049p00204490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.221)
 0.86 0.61 0.71 0.67 0.22 0.09 0.02 0.04 0.06 0.07 0.05 0.09 0.21 1.0 0.18 0.25 0.02 0.07 0.11 0.37 0.1 0.04
AMTR_s00051p00194000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.79)
 0.04 1.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.1 0.75 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00053p00025460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.9)
 1.0 0.67 0.54 0.02 0.14 0.03 0.2 0.01 0.25 0.21 0.06 0.07 0.27 0.93 0.23 0.02 0.07 0.06 0.09 0.24 0.03 0.21
AMTR_s00053p00223120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.175)
 0.5 0.57 0.24 0.27 0.35 0.48 0.49 0.15 0.27 0.34 0.08 0.06 1.0 0.67 0.74 0.41 0.21 0.05 0.06 0.3 0.05 0.26
AMTR_s00057p00042010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.20)
 1.0 0.93 0.9 0.25 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.05 0.71 0.37 0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.01 0.03
AMTR_s00059p00124920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.99)
 1.0 0.7 0.11 0.0 0.15 0.15 0.07 0.04 0.08 0.08 0.02 0.03 0.12 0.56 0.24 0.22 0.0 0.07 0.06 0.13 0.0 0.47
AMTR_s00060p00096990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.41)
 1.0 0.21 0.42 0.79 0.11 0.52 0.13 0.25 0.08 0.16 0.04 0.05 0.02 0.97 0.26 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.0 0.02
AMTR_s00066p00168520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.194)
 0.51 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.14 0.4 0.38 0.2 0.1 0.0 0.04 0.11 0.0 0.05
AMTR_s00067p00165630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.166)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.16 0.12 0.21 0.43 0.1 0.37 0.06 0.05 0.05 0.11 0.09 0.29
AMTR_s00078p00164770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.152)
 1.0 0.66 0.52 0.3 0.06 0.01 0.03 0.02 0.11 0.08 0.06 0.16 0.04 0.85 0.17 0.06 0.05 0.02 0.02 0.12 0.01 0.05
AMTR_s00079p00027120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.5)
 1.0 0.62 0.81 0.13 0.14 0.17 0.0 0.02 0.01 0.01 0.11 0.12 0.22 0.87 0.68 0.17 0.04 0.03 0.08 0.1 0.04 0.15
AMTR_s00084p00178010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00084.48)
 0.77 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03
AMTR_s00088p00059900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.36)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.18 0.41 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
AMTR_s00096p00165210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.111)
 0.93 0.52 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.01
AMTR_s00100p00110640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.33)
 1.0 0.93 0.82 0.26 0.12 0.06 0.02 0.05 0.06 0.06 0.02 0.01 0.02 0.56 0.18 0.0 0.01 0.01 0.01 0.17 0.01 0.01
AMTR_s00103p00058570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.28)
 0.23 1.0 0.43 0.09 0.51 0.39 0.17 0.16 0.43 0.35 0.46 0.45 0.58 0.58 0.62 0.3 0.56 0.29 0.27 0.18 0.21 0.4
AMTR_s00105p00157120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00105.79)
 0.16 1.0 0.1 0.05 0.3 0.0 0.08 0.0 0.14 0.1 0.12 0.19 0.44 0.46 0.29 0.05 0.04 0.1 0.06 0.06 0.06 0.13
AMTR_s00106p00073400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.46)
 0.19 0.02 0.27 0.73 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.49 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.06
AMTR_s00106p00141160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.113)
 0.79 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.27 0.74 0.15 0.13 0.03 0.01 0.09 0.22 0.12 0.32
AMTR_s00111p00113030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.88)
 0.24 0.22 0.18 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.12 0.7 0.22 0.13 0.03 0.02 0.11 0.71 0.07 0.11
AMTR_s00115p00032780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00115.2)
 1.0 0.64 0.66 0.44 0.12 0.25 0.08 0.01 0.04 0.07 0.05 0.05 0.12 0.69 0.71 0.12 0.0 0.01 0.03 0.28 0.02 0.04
AMTR_s00129p00061730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.34)
 1.0 0.55 0.36 0.11 0.11 0.04 0.13 0.02 0.12 0.13 0.05 0.06 0.07 0.62 0.17 0.03 0.04 0.03 0.04 0.1 0.02 0.05
AMTR_s00129p00062010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.35)
 1.0 0.68 0.34 0.07 0.16 0.0 0.3 0.0 0.31 0.28 0.02 0.03 0.11 0.9 0.2 0.04 0.12 0.04 0.02 0.13 0.0 0.08
AMTR_s00131p00119200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.93)
 1.0 0.47 0.26 0.1 0.36 0.12 0.07 0.07 0.09 0.11 0.04 0.03 0.23 0.93 0.43 0.01 0.07 0.01 0.0 0.1 0.0 0.04
AMTR_s00139p00079430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00139.15)
 0.93 1.0 0.4 0.43 0.36 0.52 0.4 0.15 0.28 0.29 0.22 0.21 0.46 0.81 0.75 0.14 0.19 0.22 0.27 0.09 0.2 0.26
AMTR_s00146p00085750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.51)
 1.0 0.46 0.5 0.86 0.04 0.01 0.02 0.03 0.31 0.18 0.04 0.04 0.06 0.82 0.45 0.02 0.01 0.01 0.01 0.42 0.01 0.03
AMTR_s00146p00089610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.56)
 0.55 1.0 0.16 0.1 0.16 0.01 0.24 0.01 0.22 0.21 0.21 0.3 0.31 0.3 0.22 0.09 0.15 0.11 0.08 0.03 0.08 0.15
AMTR_s00150p00033570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00150.6)
 1.0 0.44 0.2 0.04 0.07 0.12 0.05 0.0 0.06 0.06 0.09 0.15 0.52 0.55 0.26 0.03 0.04 0.09 0.08 0.14 0.03 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)