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Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00256880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.345)
 - - - - 4.28 - - - - - - - 0.22 - 0.43 - - - - - - -
AMTR_s00001p00270300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.460)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00001p00273080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.592)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00003p00121260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.84)
 - - - - 4.39 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - -
AMTR_s00003p00244580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.271)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00003p00267590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.388)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00003p00267600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.389)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00006p00108590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.39)
 - - - - 4.41 - - - - -0.54 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00013p00218720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.155)
 - - - - 4.41 - - - - - - - - -0.43 - - - - - - - -
AMTR_s00019p00175200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.177)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00020p00225890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.96)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00023p00247490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.227)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00026p00081160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.30)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00026p00249050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.138)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00028p00072140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.15)
 - - - - 4.38 - - - -0.25 - - - - - -1.76 - - - - - - -
AMTR_s00031p00056300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.21)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00039p00159020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.109)
 - - - - 4.41 - - - - - - - - - -0.58 - - - - - - -
AMTR_s00039p00159070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.110)
 - - - - 4.26 - 0.08 - -0.79 -0.81 - - - -0.59 - - - - - - - -
AMTR_s00041p00232840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.277)
 - - - - 4.33 - - - - - - - 0.97 - - - - - - - - -
AMTR_s00041p00236790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.295)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00045p00162090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.185)
 - - - - 4.13 - - - - - - - 2.18 - - - - - - - - -
AMTR_s00047p00172640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.96)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00048p00210130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.188)
 - - - - 4.33 - - - - - - - -0.48 - - - - - - - - 0.21
AMTR_s00052p00161010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.71)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00061p00118690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.95)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00064p00174720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.76)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00064p00199460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.95)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00065p00202790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.186)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00069p00152660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.120)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00076p00146670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.48)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00076p00193910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.85)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00082p00071250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00082.6)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00084p00122300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00084.37)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00098p00096250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.23)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00098p00096380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.25)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00103p00134680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.85)
 - - - - 4.4 - - - - - - - - -0.07 - - - - - - - -
AMTR_s00108p00090520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00108.13)
 - - - - 4.37 - - - - - - - - - 0.47 - - - - - - -
AMTR_s00117p00075630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.21)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00131p00116580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.91)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00144p00080610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.41)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00174p00057060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00174.24)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00180p00022260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00180.6)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00204p00019460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00204.4)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00207p00018950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00207.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00249p00016800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00249.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00285p00006800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00285.1)
 - - - - 4.31 - - - - - - - 1.1 - - - - - - - - -
AMTR_s00450p00011210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00450.1)
 - - - - 4.34 - - - - 0.8 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00501p00011790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00501.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s01022p00009300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01022.1)
 - - - - 4.34 - - - - - - - - - - - - - - 0.85 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.