Heatmap: Cluster_303 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
LOC_Os01g09830.1	0.01	0.07	0.0	0.15	0.22	0.0	0.02	0.02	0.0	0.02	1.0	0.0	0.02	0.04	0.0	0.0	0.02	0.09	0.09	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.15	0.14	0.09	0.18	0.11
LOC_Os01g13450.1	0.39	0.71	0.02	0.33	0.15	0.02	0.1	0.04	0.09	0.29	1.0	0.02	0.06	0.02	0.0	0.0	0.18	0.03	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.04	0.28	0.04	0.15	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.31
LOC_Os01g15990.1	0.09	0.54	0.01	0.01	0.0	0.01	0.11	0.13	0.02	0.02	0.36	0.0	0.07	0.06	0.01	0.0	0.05	0.09	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	1.0	0.29	0.1
LOC_Os01g16440.1	0.17	0.42	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.04	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
LOC_Os01g24030.1	0.36	0.31	0.04	0.0	0.0	0.05	0.04	0.03	0.1	0.01	1.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.01	0.06	0.41	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03	0.12
LOC_Os01g24720.1	0.34	0.48	0.01	0.01	0.0	0.0	0.23	0.18	0.01	0.11	1.0	0.0	0.09	0.1	0.0	0.0	0.14	0.18	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.08	0.05	0.05
LOC_Os01g57040.1	0.0	0.09	0.03	0.23	0.15	0.01	0.0	0.01	0.12	0.0	1.0	0.0	0.06	0.07	0.0	0.0	0.03	0.85	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.03	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.23	0.03	0.0
LOC_Os02g18650.1	0.04	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.02	0.86	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os02g35970.1	0.13	0.5	0.01	0.0	0.0	0.0	0.18	0.17	0.69	0.01	0.55	0.05	0.65	1.0	0.13	0.24	0.16	0.62	0.92	0.15	0.1	0.2	0.1	0.15	0.03	0.01	0.01	0.1	0.09	0.06	0.07	0.05	0.11	0.01	0.07	0.09	0.07	0.08	0.08	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.17
LOC_Os02g49720.1	0.02	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.17	0.17	0.68	0.14	0.83	0.05	0.17	0.1	0.0	0.0	0.12	0.19	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0
LOC_Os03g06700.1	0.3	0.18	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.35	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.14	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os03g25300.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.07	1.0	0.33	0.0
LOC_Os03g45230.1	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.03	1.0	0.0	0.15	0.07	0.06	0.0	0.01	0.05	0.0	0.07	0.01	0.0	0.0	0.01	0.06	0.09	0.12	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
LOC_Os03g47230.1	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.14	0.0	0.02	1.0	0.05	0.05	0.07	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os03g53690.1	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.2	0.93	0.0	0.1	0.86	0.0	0.0	0.01	0.19	0.28	0.0	0.01	0.17	0.01	0.09	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06	1.0	0.98
LOC_Os03g57490.1	0.13	0.57	0.02	0.04	0.06	1.0	0.08	0.08	0.34	0.05	0.62	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.06	0.02	0.16	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.22	0.11	0.11	0.1	0.02
LOC_Os03g60720.1	0.49	0.7	0.09	0.0	0.0	0.01	0.19	0.14	0.27	0.19	0.85	0.01	0.09	0.13	0.0	0.0	0.43	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.04
LOC_Os03g63970.1	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.84	0.4	0.06	0.65	0.01	0.11	0.1	0.1	0.14	0.16	0.12	0.19	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.12	0.07	0.11	0.31	0.08
LOC_Os04g10569.1	0.12	0.58	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.14	0.71	0.01	0.03	0.11	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.01	0.02	0.09	0.0	0.02	0.02	0.0	0.04	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.18	0.19	1.0	0.08	0.06
LOC_Os04g25790.1	0.09	0.37	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.0	0.04	0.49	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.19	0.07	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.03	0.06	0.04
LOC_Os04g28250.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.0	0.03	0.06	0.0	0.0	0.01	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02
LOC_Os05g01790.1	0.01	0.14	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.07	0.0	0.47	0.01	0.09	0.11	0.0	0.0	0.02	0.13	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.1	0.84	1.0	0.27
LOC_Os05g13970.1	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1	0.0	0.0	0.74	0.05	0.02	0.17	0.13	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.94	1.0	0.42	0.24	0.09
LOC_Os05g28350.1	0.0	0.04	0.0	0.22	0.37	0.47	0.02	0.02	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02
LOC_Os05g30780.1	0.06	0.16	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.12	0.55	0.01	0.02	0.21	0.0	0.0	0.18	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.2	0.3	1.0
LOC_Os05g48040.1	0.1	0.95	0.04	0.0	0.0	0.04	0.19	0.26	0.51	0.09	0.67	0.36	0.27	0.2	0.02	0.01	0.13	0.25	0.65	0.07	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.11	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.17	1.0	0.37	0.95	0.41	0.04
LOC_Os06g04540.1	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.06	0.42	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.45	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.12	0.09	0.31	0.06	0.02
LOC_Os06g35950.1	0.05	1.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.02	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.04	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.09	0.11	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.02	0.0
LOC_Os06g36000.1	0.04	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.6	0.03	1.0	0.01	0.09	0.23	0.0	0.08	0.15	0.22	0.0	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.18	0.19	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.13	0.15	0.05	0.02	0.02
LOC_Os07g32820.1	0.18	0.34	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.13	0.23	0.2
LOC_Os08g01700.1	0.42	0.22	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.05	0.04	0.13	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.01	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0
LOC_Os08g02520.1	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	1.0	0.01	0.13	0.17	0.0	0.0	0.03	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.0
LOC_Os08g31660.1	0.18	0.14	0.01	0.0	0.0	0.0	0.11	0.04	0.11	0.08	0.43	0.0	0.05	0.09	0.03	0.03	0.23	0.12	0.29	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.14	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.49	0.41	1.0	0.62	0.36
LOC_Os08g33300.1	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	1.0	0.26	0.11	0.86	0.02	0.08	0.05	0.0	0.0	0.13	0.17	0.31	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.51	0.25	0.32	0.18	0.08
LOC_Os08g35110.1	0.17	0.55	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.31	0.0	1.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.41	0.14	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.09	0.47	0.11	0.03
LOC_Os09g33555.1	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.27	1.0	0.15	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.02	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.09	0.0	0.01	0.13	0.0	0.0	0.09	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os10g01720.1	0.0	0.29	0.04	0.0	0.0	0.17	0.58	0.76	0.06	0.04	0.33	0.0	0.13	0.42	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.12	0.02
LOC_Os10g24090.1	0.46	0.55	0.01	0.11	0.01	0.07	0.43	0.51	0.12	0.13	1.0	0.01	0.34	0.33	0.07	0.08	0.44	0.16	0.38	0.4	0.0	0.0	0.0	0.01	0.28	0.22	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.11	0.08	0.18	0.22	0.22
LOC_Os11g09800.1	0.92	0.93	0.01	0.09	0.0	0.2	0.03	0.01	0.07	0.1	1.0	0.0	0.08	0.03	0.0	0.0	0.45	0.2	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.02	0.13	0.0	0.03
LOC_Os11g13710.1	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.64	0.0	0.71	0.03	0.04	0.26	0.0	0.0	0.16	0.39	0.54	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.79	0.59	0.71
LOC_Os11g25990.1	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.18	0.2	0.01	0.01	0.0	0.54	0.0	0.07	0.04	0.03	0.06	0.04	0.26	0.15	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.0	0.04	0.07	0.03	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.07	0.0	0.24	0.49	0.37	0.03	0.0
LOC_Os11g39000.1	0.0	0.01	0.11	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.03	0.0	0.25	0.0	0.15	0.09	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	1.0	0.33	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)