Heatmap: Cluster_205 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
5.81 10.52 0.33 0.22 1.13 2.45 0.44 1.02 1.55 0.22 0.95 0.91 6.43 3.22 0.59 0.39 3.11 2.19 1.98 3.95 0.62 0.43 0.67 0.66 1.17 1.81 1.42 0.66 0.64 0.58 0.52 0.92 0.65 0.45 0.72 0.76 0.78 0.65 0.67 0.56 0.8 0.83 1.08 4.84 4.13 1.76 1.19 1.06 0.96
3.1 14.24 0.84 0.7 1.42 3.56 0.21 0.27 0.98 0.07 0.3 0.18 0.41 2.77 0.35 0.39 0.59 0.51 0.67 1.26 0.37 0.42 0.31 0.59 0.3 1.48 0.61 0.33 0.3 0.37 0.36 1.84 0.34 0.13 0.43 0.59 0.39 0.53 0.42 0.4 0.77 0.65 1.21 0.66 0.88 1.3 0.26 0.07 0.12
4.13 24.14 1.47 0.53 0.74 2.95 0.34 0.59 1.32 0.18 1.12 2.28 2.27 1.86 0.55 0.54 1.35 1.17 0.17 2.56 0.71 0.7 0.2 0.56 0.98 3.29 2.24 1.11 0.75 0.66 0.64 1.58 0.82 0.38 0.63 0.73 0.58 0.99 0.81 0.82 1.16 1.07 1.61 1.59 1.35 1.34 0.41 0.16 0.16
3.57 9.92 0.27 0.23 0.93 2.52 0.4 0.71 0.63 0.24 0.88 0.3 3.19 2.21 0.2 0.3 1.29 1.63 0.39 1.99 0.25 0.1 0.24 0.19 0.34 1.2 0.83 0.35 0.29 0.26 0.18 0.37 0.26 0.15 0.24 0.32 0.39 0.28 0.25 0.22 0.33 0.34 0.49 1.86 1.57 0.61 0.49 0.44 0.31
1.18 8.25 0.19 0.3 0.44 0.65 0.12 0.16 0.25 0.07 0.5 0.14 0.58 3.89 0.12 0.22 0.27 0.68 0.09 0.7 0.03 0.03 0.06 0.03 0.18 0.66 0.61 0.01 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.04 0.1 0.01 0.06 0.04 0.06 0.03 0.08 0.02 0.06 0.69 0.6 0.19 0.17 0.09 0.08
2.81 15.32 0.31 0.29 0.66 2.77 0.29 0.58 0.9 0.18 0.77 0.31 4.49 3.44 0.12 0.34 1.67 1.69 1.16 2.0 0.12 0.06 0.15 0.16 0.78 1.01 0.79 0.14 0.12 0.17 0.08 0.27 0.12 0.09 0.13 0.13 0.12 0.2 0.19 0.08 0.14 0.16 0.23 2.92 2.71 0.94 0.42 0.38 0.32
3.52 15.17 1.19 0.64 0.54 1.5 0.67 1.05 0.47 0.23 1.35 0.2 6.76 6.47 0.21 0.37 3.11 1.44 0.47 1.24 0.21 0.11 0.21 0.11 0.4 0.58 0.61 0.22 0.15 0.19 0.16 0.27 0.22 0.17 0.17 0.23 0.19 0.18 0.16 0.17 0.23 0.2 0.28 1.39 0.98 0.85 0.93 0.59 0.43
4.62 10.47 0.7 0.3 2.0 4.56 0.49 1.14 1.11 0.28 1.18 0.58 5.45 2.93 0.37 0.53 2.83 1.79 1.18 1.93 0.43 0.49 0.57 0.37 0.39 1.36 0.78 0.76 0.44 0.45 0.42 0.7 0.51 0.26 0.5 0.48 0.46 1.17 0.77 0.37 0.68 0.64 0.84 0.8 1.35 0.83 0.9 0.66 0.72
1.79 13.12 0.14 0.18 0.59 1.35 0.03 0.05 1.53 0.02 0.13 0.0 0.13 0.09 0.0 0.0 0.12 0.16 0.0 0.43 0.01 0.01 0.09 0.06 0.21 1.18 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.13 0.57 0.62 0.0 0.0 0.0
7.14 25.83 0.32 1.09 1.83 7.23 3.08 4.54 0.18 0.38 2.04 0.16 4.44 4.21 0.09 0.02 4.7 1.61 0.06 2.57 0.18 0.07 0.13 0.15 0.87 0.65 0.5 0.25 0.23 0.14 0.25 0.4 0.14 0.11 0.3 0.36 0.23 0.2 0.11 0.19 0.24 0.31 0.39 3.11 2.08 0.83 0.81 0.64 0.42
4.84 22.39 0.35 0.96 0.59 4.66 0.78 1.52 0.24 0.13 1.18 0.14 1.75 16.3 0.13 0.05 2.29 1.12 0.33 1.06 0.08 0.2 0.04 0.21 0.37 0.76 0.8 0.08 0.06 0.08 0.13 0.14 0.1 0.07 0.18 0.14 0.1 0.02 0.01 0.07 0.09 0.13 0.13 1.2 0.87 0.6 0.46 0.2 0.15
1.42 5.82 0.44 0.24 1.18 2.15 0.08 0.12 1.67 0.03 0.09 0.2 0.21 0.79 0.1 0.29 0.16 0.27 0.23 0.39 0.17 0.2 0.08 0.48 0.25 1.02 0.43 0.28 0.12 0.21 0.17 1.22 0.25 0.14 0.33 0.32 0.22 0.32 0.26 0.15 0.31 0.24 0.51 0.14 0.7 1.25 0.02 0.05 0.04
4.05 35.22 1.68 1.26 4.99 12.89 1.54 2.65 5.15 0.55 0.65 3.74 11.51 12.64 6.28 0.71 2.53 4.12 6.8 3.29 0.22 0.35 0.18 0.73 2.93 4.11 6.02 0.63 0.23 0.4 0.0 1.26 0.0 0.11 0.53 0.31 0.15 0.47 0.21 0.12 0.28 0.32 0.52 3.69 2.54 2.18 0.26 1.01 0.78
1.47 7.16 0.5 0.3 1.76 1.97 0.17 0.13 0.42 0.06 0.12 0.15 0.2 0.87 0.23 0.22 0.25 0.24 0.48 0.77 0.25 0.29 0.2 0.38 0.14 0.99 0.31 0.25 0.21 0.22 0.14 1.13 0.25 0.11 0.36 0.37 0.29 0.29 0.25 0.27 0.47 0.43 0.72 0.36 0.59 0.78 0.12 0.07 0.02
4.01 20.87 1.49 0.43 1.55 9.08 0.29 0.34 3.27 0.28 0.88 1.13 1.47 3.74 0.39 0.31 1.02 1.33 1.29 1.38 0.39 0.74 0.74 2.09 0.18 2.8 1.53 0.36 0.33 0.5 0.38 3.24 0.38 0.35 0.6 0.68 0.8 0.74 0.56 0.28 0.56 0.5 0.81 0.9 1.73 2.47 0.23 0.19 0.1
0.78 3.96 0.04 0.02 0.26 0.38 0.13 0.03 0.02 0.0 0.08 0.0 0.34 0.19 0.0 0.0 0.15 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
8.33 18.23 0.36 0.83 1.54 4.19 1.37 2.53 0.44 0.42 1.35 0.56 10.02 4.77 0.38 0.41 3.55 2.87 1.5 7.09 0.58 0.54 0.59 0.6 1.39 3.05 2.57 0.53 0.41 0.56 0.35 0.73 0.44 0.38 0.73 0.8 0.61 0.76 0.73 0.5 0.83 0.74 1.12 9.66 7.7 2.63 1.23 0.93 0.94
8.71 30.39 1.34 2.56 4.81 15.28 2.16 3.22 2.51 0.82 2.19 1.33 11.98 12.62 0.92 1.21 5.77 3.93 4.1 7.26 0.69 1.02 0.91 0.84 1.39 5.43 5.69 0.62 0.63 0.63 0.54 1.02 0.58 0.41 0.67 0.96 0.77 0.69 0.66 0.56 1.04 0.82 1.16 8.19 6.3 2.8 1.36 0.9 0.69
0.04 0.27 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
1.77 5.61 1.31 0.66 3.43 3.2 0.56 0.62 0.23 0.65 0.86 0.52 0.72 1.58 1.2 1.09 0.97 0.66 3.13 0.93 0.42 0.06 0.6 0.04 0.5 0.8 0.14 0.54 0.89 0.56 0.66 0.88 0.53 0.75 0.67 0.48 0.52 0.34 0.32 0.42 0.49 0.69 0.71 3.59 0.22 0.5 1.32 0.65 0.06
0.04 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.56 0.01 0.0 0.01 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.14 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0
4.89 29.02 0.86 1.05 0.76 3.26 5.66 6.24 0.88 1.39 2.59 5.54 28.45 17.11 0.0 1.91 14.95 5.35 6.2 13.77 0.76 1.23 0.39 1.2 5.97 2.81 5.12 0.34 0.28 0.62 0.0 1.16 0.3 0.38 1.63 1.42 0.0 1.31 1.99 0.53 0.72 0.74 0.79 13.94 13.05 5.38 1.0 1.05 0.22
0.11 0.55 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.05 0.0 0.01 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 3.06 0.11 0.24 0.83 0.84 0.08 0.07 0.07 0.0 0.08 0.06 0.14 1.52 0.0 0.03 0.05 0.1 0.0 0.04 0.04 0.01 0.01 0.03 0.07 0.15 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.02 0.04 0.06 0.1 0.04 0.07 0.01 0.01 0.05 0.05 0.04 0.05 0.05 0.05 0.0 0.02 0.0
0.04 0.17 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 2.07 0.13 0.09 0.16 1.09 0.11 0.27 0.18 0.06 0.32 0.3 1.18 0.73 0.17 0.07 0.31 0.27 0.06 0.2 0.03 0.02 0.01 0.03 0.06 0.17 0.05 0.03 0.03 0.04 0.01 0.07 0.01 0.01 0.05 0.02 0.07 0.08 0.04 0.05 0.05 0.09 0.11 0.37 0.22 0.35 0.07 0.02 0.02
0.02 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.64 28.86 2.43 1.59 0.94 1.41 1.9 2.21 0.66 0.84 0.99 1.49 3.13 3.18 0.68 0.69 3.57 1.26 0.55 2.29 0.65 0.04 0.15 0.19 0.0 13.95 1.77 0.6 0.11 0.3 0.27 0.93 0.77 0.31 0.36 0.99 0.61 0.92 0.81 0.46 0.97 0.81 1.32 1.52 1.26 0.51 1.22 0.53 1.55
0.12 0.81 0.05 0.01 0.03 0.06 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.15 0.01 0.02 0.02 0.01 0.08 0.05 0.06 0.02 0.01 0.01 0.05 0.02 0.08 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.05 0.05 0.0 0.04 0.04 0.01 0.0 0.0
0.34 1.34 0.07 0.1 0.23 0.1 0.07 0.05 0.04 0.02 0.02 0.05 0.14 0.15 0.0 0.0 0.36 0.08 0.0 0.04 0.02 0.04 0.0 0.02 0.14 0.21 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0
0.05 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 3.02 0.05 0.0 0.18 0.8 0.0 0.02 0.23 0.01 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 0.01 0.04 0.05 0.09 0.02 0.24 0.05 0.0 0.0 0.0
0.42 1.51 0.06 0.04 0.3 0.58 0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.29 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.08 0.02 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04
0.22 1.06 0.0 0.38 0.02 0.11 0.09 0.12 0.1 0.04 0.03 0.01 0.23 0.15 0.0 0.0 0.24 0.1 0.0 0.13 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.14 0.02 0.01 0.01 0.02 0.06
1.36 11.1 0.17 0.38 0.37 2.29 0.13 0.71 0.05 0.51 0.54 0.07 2.61 1.66 0.46 0.46 1.6 0.88 1.48 1.47 0.02 0.08 0.07 0.05 0.47 1.74 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 2.17 0.85 0.66 0.3 0.13 0.23
0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
3.62 5.45 0.96 0.0 0.11 1.1 0.05 0.17 0.98 0.04 0.17 0.12 3.13 1.13 0.0 0.0 0.8 0.98 0.0 1.97 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.37 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.3 0.0 0.15 0.18 0.16 0.26 0.9 0.0 0.14 0.2 0.0 0.24
0.04 0.53 0.01 0.05 0.02 0.24 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.04 0.08 0.15 0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0
0.11 0.68 0.03 0.13 0.0 0.52 0.07 0.03 0.08 0.01 0.09 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.1 0.05 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06
0.04 0.22 0.0 0.0 0.03 0.07 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0
0.23 1.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.12 0.01 0.05 0.05 0.01 0.05 0.06 0.57 0.14 0.13 0.12 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.14 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.04 0.0 0.04 0.06
0.05 0.25 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.26 19.18 2.59 1.91 4.08 5.96 1.11 0.84 0.13 2.05 1.82 0.02 0.42 2.4 0.07 0.0 1.33 0.8 0.0 0.56 0.05 0.0 0.03 0.0 2.57 0.27 0.1 0.16 0.0 0.0 0.13 0.07 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.04 0.06 3.37 0.0 0.24 2.25 0.05 0.0
0.18 1.25 0.05 0.06 0.0 0.08 0.14 0.07 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.18 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.08 0.0 0.04 0.0
10.9 50.41 2.99 2.23 3.17 9.16 1.58 1.52 0.15 0.33 1.84 0.64 1.45 4.51 0.6 0.62 2.83 3.98 0.0 1.99 0.15 0.02 0.46 0.08 1.92 4.56 1.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.22 0.57 0.0 0.58 0.27 0.3 0.23 0.0 0.16 0.22 0.09 0.24 3.05 1.09 0.0 0.96 0.35 0.42
0.37 11.69 0.28 0.3 1.7 3.0 0.42 0.67 0.86 0.1 0.3 1.36 3.16 3.82 0.96 0.43 0.25 0.93 1.93 1.91 0.57 1.32 0.4 0.53 0.62 2.23 1.82 0.57 0.54 0.54 0.46 1.36 0.56 0.26 0.54 0.65 0.53 0.81 1.0 0.94 1.17 1.19 1.84 1.21 1.1 0.74 0.1 0.02 0.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)