Heatmap: Cluster_205 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00002p00223210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.243)	0.03	0.04	0.06	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.96	0.62	0.36	0.35	0.39	0.27	1.0	0.6	0.49	0.22	0.25	0.41
AMTR_s00002p00261280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.450)	0.09	0.04	0.01	0.16	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.73	0.16	0.02	0.12	0.4	1.0	0.35	0.38	0.2	0.12	0.22
AMTR_s00003p00270010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.424)	0.36	0.17	0.01	0.17	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.77	0.29	0.23	0.14	0.22	0.6	0.49	0.49	0.25	0.17	0.3
AMTR_s00005p00212300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.91)	0.0	0.26	0.0	0.02	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.95	0.68	0.28	0.05	0.05	0.2	1.0	0.87	0.42	0.3	0.27	0.15
AMTR_s00006p00053180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.15)	0.48	0.41	0.33	0.01	0.1	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.91	0.35	0.14	0.19	0.28	0.59	0.53	0.46	0.28	0.14	0.34
AMTR_s00007p00240820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.253)	0.05	0.07	0.0	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.5	0.34	0.18	0.06	0.25	1.0	0.44	0.67	0.19	0.47	0.14
AMTR_s00010p00181420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.153)	0.55	0.43	0.65	0.12	0.08	0.01	0.02	0.0	0.03	0.02	1.0	0.83	0.4	0.22	0.1	0.42	0.76	0.8	0.73	0.19	0.42	0.28
AMTR_s00010p00223040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.243)	0.01	0.07	0.04	0.09	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.65	0.45	0.1	0.12	0.54	0.96	0.68	0.51	0.17	0.43	0.37
AMTR_s00010p00249150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.345)	0.12	0.37	0.02	0.19	0.08	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.89	0.67	0.31	0.09	0.12	0.32	1.0	0.37	0.33	0.31	0.28	0.41
AMTR_s00016p00199170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.165)	0.0	0.09	0.19	0.21	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.52	0.38	0.04	0.2	0.13	1.0	0.61	0.43	0.34	0.28	0.17
AMTR_s00019p00224250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.288)	0.64	0.4	0.12	0.19	0.07	0.0	0.02	0.0	0.04	0.03	1.0	0.74	0.46	0.16	0.08	0.16	0.82	0.48	0.38	0.15	0.1	0.27
AMTR_s00021p00026070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.7)	0.0	0.29	0.0	0.0	0.1	0.0	0.02	0.02	0.05	0.04	0.8	0.54	0.36	0.18	0.29	0.25	1.0	0.45	0.5	0.22	0.35	0.27
AMTR_s00021p00061660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.29)	0.0	0.23	0.04	0.11	0.05	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.76	0.49	0.22	0.11	0.08	0.15	1.0	0.26	0.24	0.12	0.16	0.31
AMTR_s00022p00054670	0.4	0.39	0.04	0.26	0.08	0.07	0.06	0.03	0.1	0.08	1.0	0.72	0.31	0.15	0.12	0.45	0.87	0.63	0.74	0.17	0.23	0.29
AMTR_s00022p00055260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.34)	0.58	0.25	0.0	0.12	0.04	0.0	0.03	0.0	0.09	0.05	0.85	0.72	0.13	0.11	0.09	0.51	1.0	0.65	0.67	0.13	0.51	0.23
AMTR_s00022p00223160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.282)	0.08	0.04	0.24	0.06	0.2	0.0	0.17	0.0	0.16	0.15	0.98	1.0	0.5	0.31	0.12	0.24	0.88	0.7	0.75	0.29	0.28	0.27
AMTR_s00022p00248380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.375)	0.19	0.02	0.07	0.07	0.1	0.0	0.06	0.05	0.26	0.21	0.85	0.7	0.36	0.25	0.21	0.42	1.0	0.76	0.61	0.22	0.61	0.3
AMTR_s00023p00250230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.238)	0.0	0.45	0.14	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.63	0.17	0.19	0.08	0.14	0.83	0.28	0.21	0.07	0.2	0.15
AMTR_s00023p00250480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.239)	0.14	0.36	0.13	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.69	0.35	0.25	0.14	0.14	0.63	0.26	0.25	0.12	0.11	0.23
AMTR_s00025p00178950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.215)	0.1	0.18	0.11	0.01	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	1.0	0.56	0.23	0.09	0.08	0.09	0.75	0.31	0.2	0.11	0.08	0.25
AMTR_s00025p00237300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.355)	0.1	0.55	0.47	0.01	0.08	0.02	0.05	0.0	0.05	0.04	1.0	0.93	0.32	0.13	0.06	0.54	0.87	0.79	0.64	0.13	0.38	0.18
AMTR_s00025p00247730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.399)	0.26	0.35	0.49	0.08	0.11	0.01	0.06	0.0	0.08	0.07	0.9	0.65	0.24	0.17	0.13	0.27	1.0	0.38	0.3	0.23	0.22	0.25
AMTR_s00027p00233840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.118)	0.17	0.37	0.0	0.0	0.15	0.0	0.01	0.01	0.02	0.04	1.0	0.77	0.59	0.11	0.07	0.17	0.65	0.46	0.65	0.21	0.04	0.23
AMTR_s00029p00164810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.213)	0.4	0.19	0.46	0.1	0.16	0.0	0.01	0.01	0.03	0.03	1.0	0.71	0.37	0.24	0.19	0.32	0.78	0.58	0.64	0.28	0.3	0.35
AMTR_s00029p00216320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.325)	0.28	0.78	0.35	0.03	0.07	0.08	0.04	0.0	0.09	0.07	1.0	0.84	0.55	0.25	0.09	0.45	0.95	0.81	0.8	0.23	0.38	0.44
AMTR_s00032p00092390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.58)	0.03	0.42	0.25	0.13	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.57	0.32	0.13	0.12	0.18	1.0	0.38	0.33	0.14	0.25	0.3
AMTR_s00036p00207520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.125)	0.42	0.0	0.0	0.07	0.07	0.01	0.05	0.0	0.09	0.05	0.74	0.54	0.21	0.11	0.07	0.29	1.0	0.52	0.36	0.14	0.33	0.17
AMTR_s00039p00125380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.79)	0.01	0.01	0.0	0.06	0.03	0.0	0.04	0.01	0.03	0.03	1.0	0.7	0.28	0.08	0.06	0.25	0.78	0.63	0.55	0.22	0.35	0.2
AMTR_s00040p00222820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.257)	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.96	0.7	0.21	0.1	0.05	0.15	1.0	0.57	0.45	0.16	0.28	0.2
AMTR_s00045p00059360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.43)	0.26	0.57	0.03	0.07	0.25	0.0	0.09	0.01	0.07	0.07	1.0	0.9	0.58	0.25	0.13	0.36	0.86	0.55	0.46	0.17	0.13	0.45
AMTR_s00048p00228530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.222)	0.0	0.21	0.12	0.07	0.07	0.0	0.02	0.01	0.05	0.04	1.0	0.58	0.43	0.19	0.13	0.15	1.0	0.56	0.46	0.2	0.23	0.24
AMTR_s00053p00133100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.83)	0.0	0.0	0.0	0.08	0.17	0.0	0.05	0.0	0.05	0.06	1.0	0.68	0.24	0.14	0.09	0.43	0.7	0.54	0.46	0.18	0.36	0.14
AMTR_s00055p00195550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.131)	0.01	0.1	0.1	0.07	0.04	0.02	0.06	0.0	0.17	0.08	0.96	0.66	0.14	0.16	0.07	0.36	1.0	0.53	0.4	0.16	0.25	0.23
AMTR_s00055p00195590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.132)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.1	0.0	0.22	0.11	1.0	0.37	0.33	0.23	0.09	0.19	0.97	0.25	0.32	0.19	0.19	0.27
AMTR_s00056p00040720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.23)	0.02	0.26	0.0	0.14	0.32	0.06	0.01	0.0	0.03	0.02	0.99	0.51	0.28	0.09	0.08	0.4	1.0	0.57	0.47	0.1	0.24	0.51
AMTR_s00057p00139000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.123)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.62	0.28	0.06	0.05	0.11	1.0	0.52	0.47	0.24	0.25	0.16
AMTR_s00058p00031570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.7)	0.12	0.17	0.18	0.06	0.1	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	1.0	0.66	0.41	0.21	0.16	0.32	0.64	0.5	0.51	0.17	0.09	0.31
AMTR_s00061p00106080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.82)	0.45	0.42	0.35	0.08	0.1	0.0	0.01	0.01	0.05	0.03	1.0	0.69	0.39	0.21	0.16	0.32	0.85	0.65	0.56	0.31	0.38	0.33
AMTR_s00061p00155550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.141)	1.0	0.51	0.2	0.28	0.17	0.0	0.21	0.08	0.2	0.22	0.94	0.89	0.64	0.34	0.14	0.46	0.84	0.7	0.79	0.33	0.31	0.36
AMTR_s00073p00176650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.53)	0.32	0.54	0.0	0.07	0.15	0.0	0.24	0.12	0.2	0.16	0.87	0.56	0.53	0.26	0.12	0.27	1.0	0.53	0.76	0.33	0.26	0.39
AMTR_s00078p00165690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.154)	0.0	0.4	0.1	0.05	0.16	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.92	0.76	0.37	0.12	0.11	0.31	1.0	0.34	0.38	0.13	0.1	0.27
AMTR_s00078p00169690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.160)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.13	0.0	0.0	0.0	0.2	0.12	0.89	0.42	0.43	0.08	0.14	0.34	1.0	0.54	0.57	0.33	0.54	0.09
AMTR_s00083p00130670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.35)	0.06	0.2	0.27	0.04	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	1.0	0.65	0.41	0.23	0.1	0.41	0.69	0.52	0.51	0.2	0.26	0.27
AMTR_s00085p00139780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.89)	0.17	0.07	0.09	0.05	0.12	0.02	0.04	0.0	0.04	0.05	1.0	0.77	0.51	0.19	0.13	0.4	0.91	0.65	0.56	0.41	0.43	0.25
AMTR_s00095p00117390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.73)	0.22	0.15	0.06	0.02	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.48	0.45	0.08	0.15	0.74	0.91	0.56	0.31	0.25	0.11	0.21
AMTR_s00099p00073810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.54)	0.27	0.66	0.61	0.02	0.15	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	1.0	0.87	0.36	0.11	0.15	0.25	0.72	0.64	0.5	0.27	0.19	0.33
AMTR_s00101p00153160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.129)	0.99	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.06	0.0	0.13	0.11	0.87	0.8	0.14	0.1	0.06	0.17	1.0	0.72	0.65	0.09	0.49	0.12
AMTR_s00106p00105070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.75)	0.3	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.44	0.17	0.06	0.05	0.39	1.0	0.32	0.38	0.13	0.36	0.17
AMTR_s00110p00099550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.61)	0.31	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.02	0.0	0.04	0.04	0.92	0.7	0.16	0.08	0.08	0.23	1.0	0.77	0.58	0.12	0.68	0.21
AMTR_s00111p00096320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.68)	0.55	0.5	0.55	0.0	0.08	0.01	0.04	0.0	0.05	0.05	1.0	0.99	0.34	0.19	0.11	0.28	0.76	0.6	0.54	0.2	0.27	0.39
AMTR_s00126p00091330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00126.43)	0.01	0.17	0.0	0.01	0.19	0.0	0.05	0.02	0.26	0.15	0.87	0.86	0.34	0.28	0.19	0.12	1.0	0.23	0.29	0.26	0.35	0.35
AMTR_s00147p00050220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.18)	0.47	0.48	0.38	0.17	0.09	0.16	0.06	0.0	0.03	0.03	1.0	0.81	0.43	0.35	0.19	0.38	0.75	0.87	0.7	0.29	0.38	0.25
AMTR_s00147p00079450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.38)	0.29	0.57	0.33	0.12	0.21	0.0	0.05	0.23	0.07	0.07	0.98	0.7	0.5	0.19	0.14	0.47	1.0	0.63	0.56	0.24	0.27	0.45
AMTR_s00148p00059020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.33)	0.13	0.08	0.13	0.0	0.12	0.0	0.11	0.13	0.22	0.18	1.0	0.9	0.48	0.26	0.15	0.26	0.88	0.72	0.48	0.26	0.25	0.3
AMTR_s00154p00022230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00154.6)	0.01	0.63	0.43	0.13	0.05	0.03	0.04	0.0	0.04	0.04	0.87	0.63	0.3	0.11	0.13	0.26	0.58	1.0	0.73	0.31	0.62	0.16
AMTR_s00167p00034910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00167.14)	0.18	0.23	0.15	0.1	0.08	0.0	0.05	0.04	0.13	0.21	1.0	0.79	0.25	0.09	0.12	0.51	1.0	0.45	0.43	0.29	0.15	0.4
AMTR_s00169p00027470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00169.14)	0.02	0.0	0.05	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0	0.76	0.27	0.1	0.07	0.31	0.6	0.73	0.48	0.11	0.52	0.19
AMTR_s00175p00048000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00175.21)	0.0	0.37	0.17	0.09	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.7	0.33	0.03	0.07	0.23	0.93	0.3	0.26	0.05	0.03	0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)