Heatmap: Cluster_169 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
1.59 5.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.45 4.82 -1.01 - - 0.34 - - - - -2.24 - - -0.22 - - - 0.09 - -1.99 - -0.36 -1.47 -0.4 - - 0.16 - - - - 2.27 - - 1.92 - - - - -1.44 -0.71 - - -2.95 0.18 1.07 - - -
- 5.13 - - - - - - 1.78 - -2.87 - - 1.25 - - -0.81 -1.68 - -4.32 - - - -0.6 - - - - - - - 2.71 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.82 4.87 - - - - - - -0.06 - -3.65 1.87 1.78 0.88 - - - - - -1.1 - - - 0.99 - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.96 5.12 - - - - - - 0.01 - -4.62 - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.7 5.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.53 - - - - - - - - 1.61 - - - - - - - -
- 5.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.58 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.75 3.83 - - - - - - - - - 1.73 - - - - - - - 0.05 2.21 0.63 1.22 0.54 - - - - - - - 1.44 - - - - - - - 2.18 3.32 0.6 - - - - - - -
2.04 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.61 4.44 -0.26 -1.28 2.83 - -1.64 - -0.05 -1.26 -1.81 - - - - - - -1.46 - - -3.75 - -2.04 -3.51 - -0.15 - - 0.57 0.24 0.09 2.74 - - - - 0.11 - - -3.09 -1.86 -1.02 -3.09 1.37 - - - - -
- 4.87 - - 0.75 - - - 0.34 - -2.93 - - - - - - -2.72 - - -1.66 - -1.01 -0.88 - 1.38 - - - - - 1.31 2.53 - - - - - - 0.1 -1.6 - 1.46 -2.24 - - - - -
- 5.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.0 - - - - - - - - - 1.5 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.33 4.79 0.06 - - - - - 1.2 - - -0.35 - 2.62 - - -1.46 - - -5.19 - - -1.6 0.09 - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - -0.83 - - - - 1.58 - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.48 4.81 - - - - - - - - -2.78 0.6 0.87 2.67 - - -0.09 - - -1.93 -2.54 -0.7 -2.25 -1.58 - - - - - 1.19 - 1.81 - - - - - - - - 0.37 - -1.06 -1.98 - - - - -
3.28 4.56 - - - - - - 1.33 - -2.31 - - - - - - - - - - - - 1.08 3.03 - - - - - - 1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.23 5.34 - - - - - - - - -0.27 - - - - - - - - - - - - 0.87 - - - - - - - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.07 4.26 -2.62 - -0.68 3.35 -2.92 - -1.18 - -3.85 2.26 - -0.3 - 2.6 -2.48 0.41 - - - -3.4 -2.15 - - - -0.3 - - - 0.56 1.06 - - - - - - - -2.63 -3.32 - - - - - - - -
0.05 4.47 - - - - - - -1.36 - -4.47 0.24 - 0.44 - - -2.01 -2.3 - -0.71 -2.0 - -1.65 -0.35 3.23 - - - 0.4 - - -0.03 - - - 1.93 - - - -2.96 -2.58 -2.3 -1.3 -1.48 - 1.91 - - -
0.67 4.11 0.17 - - 2.28 - -1.66 -0.52 - -0.83 - - 3.3 - - - - - -3.17 - - -2.4 - 2.82 - - - - - - 1.57 - - - - - - - -1.48 -1.15 - - - - - - 0.74 -
- 5.6 - - - - - - - - -0.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.36 4.82 - - - 0.99 - -1.43 - - -6.65 - - - - - - -1.19 - - - - - - - - - - - - - 1.96 - - - - 1.9 - - - -2.08 - - - - 2.15 - 2.4 -
-0.82 4.79 - - - - - - - - -2.24 0.84 - 1.43 - - - - - - -1.37 - 0.08 - - - - - - - - 2.85 - - - 2.46 - - - 0.16 -0.39 - - - - - - - -
- 5.37 - - - - - - - - - - - - - - 0.66 - - - - 1.5 - 1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.35 5.21 - - - - - - - - -4.83 - - - - - - - - - - - - 0.4 - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.87 4.14 0.15 - - 0.93 - - - - 0.21 1.5 - - - - -2.07 -0.45 3.59 -2.0 -2.72 -0.08 -3.08 -1.06 - 0.52 0.58 - - 0.98 - 1.99 - - - - - - - - - - -2.35 - - - - - -
-0.35 5.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.7 - 1.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.44 5.27 - - - - - - - - - - - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.5 - 1.17 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.35 - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.94 - - - - - - - - - - - 3.32 - - -0.83 -1.05 - -2.46 - - - -0.24 - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.3 - - - - - 1.26 - - -18.24 - 3.31 - - - - 0.4 - -2.44 0.77 - - - - 3.13 - - - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.8 4.77 - 1.58 - 2.08 3.39 1.48 -1.49 - -2.29 - - - - - - -2.19 - -3.46 - -3.78 - -2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.04 4.9 - - - 1.3 - - 3.32 - - - - - - - -0.24 - - - -1.35 - - 0.89 - - - - - - - 0.2 - - - - - - - - -1.48 - - - - - - - -
-4.66 4.28 - -1.97 - 1.88 -3.04 - -1.73 -1.9 -1.97 - - 1.29 - - - -2.39 - -6.8 -0.25 -1.74 - - - - - - - - 0.95 1.42 0.22 - 1.39 - - 2.62 - -1.02 0.82 0.08 1.55 -2.71 - - - - -
-1.97 5.21 1.5 - - - - - - - -0.8 0.5 - - - - - - - - - -1.47 - -1.28 - - - - - - - 1.61 - - - - - - - - - - - - - 1.66 - - -
- 3.74 - 0.7 1.83 - -0.47 0.7 - -2.31 -4.56 - - 2.01 - - - - - -0.14 -3.03 -2.14 -5.25 - - - - - 0.74 -3.33 - 0.96 - - - - - - - -1.26 -0.9 -2.4 0.29 -0.51 - - 3.64 1.73 -
-1.75 4.71 -1.26 - - - - - 1.79 - -4.18 -0.5 - - - - - -3.04 - - - - - -1.45 - 0.82 - - - - - 2.0 - - - - - - - - - - 0.25 -3.19 3.08 0.88 - - -
0.83 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.58 - - - - - - - - - - - - 2.06 - - - -
2.24 5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.54 - - - - - - - - 1.52 - - - - - 5.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.71 - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.16 5.25 - - - - - - 1.69 - - - - - - - - - - -3.39 - - 0.14 0.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.31 - - - - -
0.34 2.48 - - - - - - 1.12 - -0.56 - 4.04 - - - - - - 2.22 - - -0.77 0.75 - - 3.53 - - - - 1.92 - - - - - - - -0.66 - - - - - - - - -
-0.59 4.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.82 - - - - - 3.0 3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.48 5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.01 - - - 2.04 - - - - -0.9 - - 1.27 - - -0.79 - - -2.12 - - - -0.57 - - - - - - - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.05 4.78 - - 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.07 4.75 - - 2.1 - - - 1.02 - -3.61 1.01 0.87 - - - - -1.44 - - -1.82 - -1.54 0.97 - - - - - - - 2.76 - - - - - - - -1.37 - - -0.55 - - - - - -
-3.06 4.69 - -0.68 -0.05 1.65 0.92 - - - -3.58 - - 2.06 - - - -3.59 - 0.71 - -2.7 -1.82 0.12 - 0.58 0.52 - - - - 2.02 - - - - - - - - - - - 0.15 - -0.4 - - -
0.07 4.65 -1.43 - - 2.71 - - 1.34 - -4.13 - - 0.53 - - - - - - -2.74 -1.0 - 0.57 - 1.1 - - - - 0.66 2.57 - - - - - - - -9.19 - - - -2.97 - - - - -
-1.07 4.87 - - - - -1.15 - - - -4.76 - - 3.29 - - -2.21 -2.29 - - - - -0.79 - - - - - - 2.24 - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.07 - 2.43 - - -0.2 -0.19 - - - 1.58 - - - - - - - -2.97 - - - - - - - - - - - 2.15 - - - - - - - - - - - -0.27 - - - - -
3.79 5.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.59 - - - - - - - - -0.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.4 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.06 -0.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.3 5.2 - - - - - - - - - 3.02 - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.27 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.18 5.24 - - - - - - - - - - - 2.08 - - - - - - -0.54 - -1.1 -0.13 - - - - - - - - - - - - - - - -0.63 -0.61 1.35 - - - - - - -
- 4.45 - - - - - - - - - - - 2.33 - - - - - - 0.22 - - -0.93 - - - - 3.8 - - - - - - - 2.38 - - - -1.35 - -0.11 - - - - - -
-2.83 4.62 -0.54 0.35 -0.18 2.39 - - - - - - - 3.29 - - - -2.94 - - -3.51 - - -0.09 - 0.45 - - - - - 1.63 - - - - - - - - -2.93 - - - - -0.52 - - -
-1.71 5.03 - -0.79 - - - -1.64 - - - - - 0.73 - - - - - -0.61 -1.89 - - - - 1.31 - - 2.14 - - 2.43 - - - - - - - - - - - -1.66 - - - - -
-1.4 5.01 - - - 1.29 - - - - -2.8 0.45 - - - - - - - - -1.56 - - -0.33 - - - - - - - 2.57 - - - - - 2.42 - - - - - - - - - - -
- 5.14 - - - - -1.12 - - - -0.21 - 0.73 - - - -0.08 -1.74 - - -1.16 - - -0.64 - - - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - 1.67 - - - - -
-1.51 4.74 - - - 1.5 - - 1.82 - - - - 1.23 - - - - - -5.53 - -0.17 - -2.49 - - - - - - - 2.2 - - - - - - - - - - -1.42 -2.87 1.3 2.17 - - -
-2.38 4.85 -3.05 - - - - - -0.75 - - -0.23 - 2.95 - - - - - -4.69 -3.13 -15.0 -2.05 1.16 - -0.03 - - - - - 0.52 - - - 1.29 - - - 0.3 0.77 -1.88 - - - - - - -
- 5.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.08 1.27 - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.73 - - - - - -2.0 - - -1.13 - - 2.58 - - -2.0 -0.5 - - -0.88 - - -0.9 - - - - - - 1.07 2.27 - - - - 1.34 - - - -0.98 -0.58 -0.87 -1.54 - 1.17 - - -
-2.59 4.65 - - - -0.22 -2.94 - 1.14 - -2.13 - 0.61 -1.08 2.36 - - - - -0.1 -1.55 -3.1 -1.32 -0.45 - 2.78 - - - - - 1.54 - - - - - - - -0.9 -3.41 - -2.16 -2.96 - - - - -
0.18 5.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.93 - 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.02 5.06 - - - - - - - - - - - - - - - -3.08 - -0.12 - - - 1.22 - 2.58 - - - - - 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.87 4.16 -2.2 - -22.52 - - - -0.85 - -6.62 - 0.16 - - - - -3.32 - -2.84 1.21 -2.29 -4.26 0.26 - - - 1.24 - 1.17 1.08 2.5 - - - 1.16 - - 1.74 1.19 0.74 0.62 0.62 - - - - - -
-2.59 4.06 - - -0.54 1.05 -1.12 - 1.65 -0.61 -1.01 -1.52 2.55 1.82 - - -3.33 -1.99 - -1.65 -0.63 -2.44 -1.33 -2.52 1.39 - - - - - - 3.16 - - - - - - - -1.17 -1.87 -2.43 -1.68 -4.19 - - - - -
- 4.51 - - - - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.72 4.7 - - - - - - - - - - - 1.45 - - - - - - - -0.59 - -0.4 4.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.