Heatmap: Cluster_228 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00079350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.39)
0.0 0.47 0.0 0.1 0.21 0.0 0.07 0.0 0.27 0.22 0.9 0.96 0.41 0.34 0.33 0.39 1.0 0.72 0.59 0.32 0.69 0.3
AMTR_s00002p00118630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.74)
0.16 0.47 0.27 0.03 0.07 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 1.0 0.8 0.54 0.37 0.15 0.46 0.97 0.76 0.45 0.24 0.25 0.33
AMTR_s00005p00265200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.223)
0.42 0.41 0.0 0.1 0.23 0.0 0.06 0.0 0.03 0.03 0.92 1.0 0.27 0.17 0.11 0.29 0.61 0.74 0.61 0.2 0.5 0.17
AMTR_s00009p00184050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.114)
0.16 0.39 0.05 0.05 0.07 0.03 0.05 0.0 0.08 0.08 0.89 0.66 0.39 0.17 0.09 0.64 1.0 0.56 0.53 0.55 0.35 0.39
AMTR_s00010p00227470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.255)
0.2 0.2 0.54 0.13 0.3 0.01 0.08 0.17 0.18 0.17 1.0 0.88 0.37 0.35 0.37 0.34 0.78 0.64 0.58 0.45 0.23 0.32
AMTR_s00011p00222440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.98)
0.33 0.18 0.24 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.99 0.83 0.34 0.15 0.12 0.26 1.0 0.52 0.49 0.46 0.21 0.4
AMTR_s00011p00229900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.109)
0.21 0.08 0.38 0.08 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.83 0.72 0.33 0.11 0.18 0.46 1.0 0.39 0.46 0.4 0.19 0.35
AMTR_s00012p00191170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.122)
0.0 0.29 0.32 0.13 0.16 0.0 0.16 0.04 0.15 0.16 1.0 0.66 0.31 0.33 0.13 0.25 0.91 0.51 0.46 0.29 0.18 0.66
AMTR_s00017p00219360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.167)
0.0 0.47 0.0 0.07 0.07 0.0 0.04 0.0 0.04 0.04 0.89 0.8 0.46 0.08 0.12 0.18 1.0 0.42 0.32 0.13 0.06 0.44
AMTR_s00019p00168020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.166)
0.0 0.33 0.0 0.04 0.11 0.0 0.05 0.0 0.08 0.05 0.84 1.0 0.23 0.24 0.15 0.22 0.7 0.51 0.47 0.25 0.16 0.19
AMTR_s00019p00252390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.421)
0.3 0.51 0.22 0.0 0.31 0.0 0.15 0.0 0.14 0.14 0.9 0.8 0.59 0.35 0.29 0.24 1.0 0.67 0.37 0.18 0.21 0.56
AMTR_s00020p00234520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.106)
0.07 0.43 0.02 0.1 0.08 0.0 0.07 0.04 0.11 0.1 0.83 0.77 0.5 0.32 0.2 0.46 1.0 0.52 0.55 0.48 0.5 0.36
AMTR_s00022p00074370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.54)
0.55 0.14 0.05 0.5 0.27 0.04 0.09 0.02 0.21 0.16 0.92 0.93 0.5 0.43 0.57 0.46 1.0 0.65 0.87 0.63 0.43 0.43
AMTR_s00022p00221290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.278)
0.1 0.61 0.22 0.08 0.08 0.0 0.05 0.01 0.07 0.06 0.82 0.79 0.35 0.3 0.17 0.58 1.0 0.65 0.61 0.43 0.64 0.42
AMTR_s00025p00221910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.311)
0.23 0.65 0.33 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.66 0.49 0.13 0.12 0.32 1.0 0.43 0.52 0.35 0.32 0.42
AMTR_s00029p00058110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.52)
0.04 0.32 0.08 0.08 0.12 0.0 0.03 0.01 0.08 0.06 0.89 0.83 0.17 0.17 0.21 0.38 1.0 0.5 0.42 0.45 0.23 0.37
AMTR_s00029p00058780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.53)
0.17 0.37 0.08 0.25 0.16 0.0 0.06 0.0 0.1 0.11 1.0 0.88 0.51 0.27 0.29 0.38 0.94 0.55 0.51 0.59 0.18 0.51
AMTR_s00029p00206820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.298)
0.09 0.46 0.03 0.14 0.09 0.08 0.05 0.0 0.11 0.1 1.0 0.69 0.4 0.26 0.15 0.61 0.84 0.84 0.7 0.54 0.72 0.41
AMTR_s00029p00238480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.400)
0.21 0.41 0.41 0.17 0.06 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.94 0.97 0.54 0.29 0.3 0.2 1.0 0.46 0.32 0.42 0.2 0.51
0.24 0.07 0.08 0.17 0.08 0.05 0.03 0.0 0.06 0.06 0.91 1.0 0.46 0.32 0.2 0.31 0.56 0.61 0.55 0.32 0.4 0.27
AMTR_s00047p00204350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.135)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 1.0 0.11 0.1 0.07 0.27 0.5 0.73 0.38 0.26 0.15 0.18
AMTR_s00047p00204360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.136)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 1.0 0.19 0.12 0.06 0.14 0.63 0.4 0.5 0.23 0.07 0.19
AMTR_s00049p00191680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.202)
0.06 0.52 0.04 0.15 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.95 0.75 0.31 0.15 0.12 0.34 1.0 0.64 0.65 0.31 0.55 0.28
AMTR_s00057p00026390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.10)
0.02 0.69 0.12 0.17 0.3 0.02 0.27 0.04 0.39 0.34 0.85 0.83 0.41 0.48 0.41 0.48 1.0 0.78 0.67 0.56 0.75 0.33
AMTR_s00057p00192540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.216)
0.23 0.0 0.0 0.22 0.07 0.0 0.03 0.02 0.04 0.04 0.96 1.0 0.46 0.28 0.19 0.49 0.55 0.89 0.56 0.5 0.52 0.27
AMTR_s00059p00024750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.9)
0.32 0.77 0.39 0.06 0.5 0.01 0.26 0.03 0.17 0.19 0.86 0.86 0.58 0.38 0.15 0.39 1.0 0.7 0.67 0.38 0.44 0.55
AMTR_s00059p00105450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.80)
0.34 0.32 0.79 0.13 0.32 0.0 0.07 0.01 0.09 0.09 0.9 0.94 0.79 0.54 0.32 0.66 1.0 0.64 0.72 0.57 0.43 0.46
AMTR_s00060p00151140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.89)
0.17 0.47 0.0 0.1 0.06 0.0 0.06 0.0 0.06 0.06 1.0 0.8 0.48 0.2 0.18 0.2 0.91 0.59 0.45 0.23 0.2 0.59
AMTR_s00061p00167160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.171)
0.34 0.38 0.36 0.31 0.31 0.11 0.17 0.12 0.17 0.15 1.0 0.77 0.48 0.34 0.44 0.5 0.78 0.67 0.7 0.59 0.2 0.38
AMTR_s00062p00101520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.74)
0.28 0.15 0.32 0.11 0.08 0.01 0.06 0.08 0.08 0.08 0.94 0.78 0.43 0.22 0.17 0.23 1.0 0.65 0.47 0.59 0.29 0.52
AMTR_s00065p00209640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.204)
0.28 0.42 0.18 0.05 0.25 0.0 0.03 0.03 0.06 0.09 0.86 0.94 0.48 0.17 0.28 0.74 1.0 0.66 0.51 0.49 0.16 0.58
AMTR_s00065p00210150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.206)
0.24 0.27 0.09 0.04 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.65 0.47 0.17 0.14 0.32 1.0 0.72 0.63 0.34 0.3 0.52
AMTR_s00067p00142170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.132)
0.01 0.53 0.0 0.07 0.08 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.97 0.95 0.36 0.17 0.09 0.38 1.0 0.72 0.59 0.25 0.23 0.38
AMTR_s00077p00181380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.205)
0.15 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 0.17 0.01 0.21 0.23 1.0 0.93 0.51 0.32 0.18 0.39 0.7 0.7 0.47 0.4 0.42 0.35
AMTR_s00087p00144100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00087.47)
0.19 0.45 0.24 0.17 0.24 0.01 0.06 0.03 0.1 0.09 1.0 0.94 0.46 0.39 0.33 0.51 0.93 0.7 0.54 0.59 0.53 0.34
AMTR_s00101p00117720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.91)
0.23 0.72 0.41 0.09 0.39 0.01 0.06 0.0 0.08 0.07 0.91 0.9 0.52 0.31 0.21 0.7 1.0 0.66 0.64 0.41 0.31 0.45
AMTR_s00104p00136740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.66)
0.39 0.22 0.26 0.29 0.22 0.01 0.06 0.07 0.25 0.14 0.82 1.0 0.46 0.27 0.36 0.36 0.78 0.44 0.46 0.39 0.42 0.37
AMTR_s00109p00056900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.42)
0.16 0.19 0.25 0.01 0.14 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.88 0.71 0.58 0.25 0.35 0.53 1.0 0.45 0.44 0.39 0.19 0.53
AMTR_s00111p00071660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.41)
0.15 0.05 0.2 0.24 0.09 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 1.0 0.53 0.24 0.19 0.11 0.32 0.86 0.48 0.61 0.3 0.17 0.43
AMTR_s00115p00126760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00115.20)
0.11 0.56 0.34 0.13 0.27 0.01 0.04 0.06 0.12 0.12 0.82 0.81 0.48 0.26 0.28 0.32 1.0 0.49 0.46 0.35 0.36 0.46
AMTR_s00119p00032770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.17)
0.05 0.07 0.01 0.15 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.83 0.28 0.16 0.16 0.21 0.68 0.54 0.48 0.31 0.29 0.23
AMTR_s00119p00132020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.107)
0.11 0.31 0.16 0.08 0.15 0.01 0.1 0.02 0.18 0.16 0.89 0.72 0.46 0.38 0.22 0.33 1.0 0.64 0.53 0.3 0.44 0.42
AMTR_s00122p00082000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.30)
0.21 0.49 0.23 0.07 0.17 0.0 0.07 0.0 0.13 0.12 0.76 0.68 0.35 0.26 0.33 0.27 1.0 0.55 0.4 0.35 0.2 0.49
AMTR_s00122p00126300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.63)
0.0 0.64 0.32 0.01 0.25 0.0 0.06 0.07 0.06 0.05 1.0 0.84 0.5 0.28 0.21 0.5 0.99 0.64 0.63 0.64 0.43 0.54
AMTR_s00131p00018340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.2)
0.41 0.44 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.09 0.1 0.83 1.0 0.31 0.23 0.13 0.25 0.49 0.75 0.65 0.21 0.26 0.21
AMTR_s00131p00074200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.45)
0.06 0.07 0.02 0.01 0.21 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.94 1.0 0.24 0.19 0.2 0.26 0.77 0.38 0.32 0.18 0.09 0.47
AMTR_s00133p00010820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.1)
0.08 0.44 0.36 0.08 0.47 0.0 0.1 0.04 0.09 0.11 0.8 1.0 0.64 0.3 0.23 0.53 0.79 0.66 0.66 0.31 0.19 0.47
AMTR_s00156p00058400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.29)
0.29 0.67 0.22 0.02 0.17 0.0 0.05 0.0 0.04 0.04 0.63 0.73 0.33 0.21 0.11 0.47 1.0 0.64 0.73 0.32 0.2 0.29
AMTR_s00159p00086290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00159.35)
0.26 0.37 0.0 0.18 0.18 0.0 0.04 0.02 0.03 0.03 0.96 0.68 0.48 0.19 0.2 0.58 0.5 1.0 0.69 0.3 0.5 0.31
AMTR_s00164p00059220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.25)
0.34 0.5 0.24 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.89 0.73 0.4 0.28 0.38 0.31 1.0 0.68 0.46 0.55 0.35 0.38
AMTR_s00165p00068240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00165.46)
0.5 1.0 0.72 0.24 0.48 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.85 0.87 0.53 0.29 0.29 0.32 0.96 0.76 0.71 0.36 0.38 0.43
AMTR_s00179p00033790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00179.7)
0.12 0.13 0.44 0.02 0.35 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.77 0.51 0.26 0.26 0.39 0.75 0.58 0.72 0.46 0.61 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)