Heatmap: Cluster_306 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
-1.74 4.42 -1.96 - 1.1 2.71 - -3.67 -0.61 - -2.66 -0.71 -2.45 - - - - -3.39 - -3.58 -0.71 -1.39 -1.64 0.37 - -0.55 - -1.45 - -1.21 - 2.59 0.18 - -1.12 -0.46 - -0.93 - -1.38 -0.59 0.14 0.16 -4.7 - -2.09 - - -
-3.23 3.99 -1.29 0.49 2.91 3.23 0.76 -0.51 -1.11 -1.88 -3.18 -1.17 -1.68 -1.02 -3.63 -3.61 -6.12 -0.19 - -1.06 -3.68 -1.38 -3.47 -0.44 -1.24 -0.12 -1.34 -4.75 - -4.77 -3.03 1.0 -3.71 -4.34 -3.09 -3.17 -3.18 -2.39 -3.23 -3.57 -3.55 -2.32 -2.62 -0.55 -0.54 -1.7 -4.04 - -
0.09 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.73 4.16 - - - - - - 2.61 - -2.27 - - - - - - - - 0.22 - -0.21 - - 4.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.0 0.15 - - - - - 3.28 - - - - 2.01 - - - - - - - - - 1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.98 5.15 - - - 0.95 - - - - -4.07 - - 1.76 - - - - - - -1.07 - - 0.34 - - - - - - - 1.97 - - - - - - - -0.92 0.05 -1.07 - - - - - - -
1.58 5.0 - - - - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.32 4.95 - - - - - - 2.58 - - - - - - - - - - - - - - 2.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.74 - - - - -
- 4.61 -2.07 - - 1.78 - -2.92 2.45 - - -17.24 - -0.09 - - -3.19 -1.86 - -3.02 -3.02 -3.07 - 0.19 1.57 0.01 - - - - - 2.75 - - 0.37 - - - - - -3.05 -2.34 -2.42 - - - - - -
-0.94 4.5 -1.24 -2.46 -1.65 2.69 -4.49 -0.96 -1.48 - -2.85 -2.9 -2.72 -0.13 - -1.19 -3.08 -0.87 -23.21 -1.32 -1.81 -2.1 -1.92 0.82 - -1.46 -1.4 - - - -2.74 1.57 - - 0.46 -2.54 -1.06 -0.75 -2.4 -1.11 0.68 -0.11 0.81 -3.81 -2.09 -1.1 - - -
0.33 5.11 - - - - - - - - - - - 2.85 - - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.39 4.33 1.42 - - - - - 1.66 - -4.04 0.3 - 1.09 - - -1.83 -2.88 - -3.19 -0.69 -0.92 -3.33 0.38 - - - - - 0.99 - 3.2 1.27 - - - - - - -2.51 -1.95 - -1.68 -2.6 - - - - 0.31
-1.18 4.52 1.55 - - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - 0.13 - - 1.36 - - - - - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.19 4.97 -1.46 - - 1.14 - - - - -3.23 0.29 0.1 3.18 - - - -1.11 - - -1.75 - -2.19 - - - - - - - - 0.31 - - - - - - - -1.96 - - - - - - - - -
-1.1 4.11 -3.48 - - 2.24 -3.41 0.35 0.76 - -1.78 -1.84 2.16 2.24 - - -1.31 -4.3 - -0.85 -1.9 - -2.38 -0.57 - - - - 0.35 - - 1.21 - - - - - - - -3.7 -2.15 -1.76 -0.65 1.28 - - 1.11 1.03 -
-0.9 4.08 - - - - - - 3.0 - - - - 2.34 - - - - - - - -2.07 - 0.84 - - - 2.23 - - - 2.9 - - - 2.02 - - - -1.88 - - - - - - - - -
1.53 4.75 - -0.19 - - - - - - 0.95 - - - - - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - 1.67 -
- 4.73 0.35 - 0.68 2.78 -1.82 - - - -1.19 - 1.54 - - - - -2.41 - - - - -2.23 - - - - - - - - 3.04 - - - - - - - -0.9 - - - - - -25.88 - - -
- 4.44 - - - - - - 2.79 - - - - 4.02 - - - -2.63 - -0.79 -1.21 -1.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.64 -0.62 - 0.69 - - - - - -
-1.13 4.52 -1.1 -19.24 0.44 2.93 - - 0.24 - -3.51 -1.01 - - - - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - 2.44 - - 0.88 - - - 0.62 -1.78 - -2.29 - - 1.73 - - - -
-0.14 4.17 - - -0.47 2.65 - -3.04 -0.11 - -2.78 - -1.12 2.8 - - - -1.02 - -2.45 -2.54 -1.82 -1.61 -0.75 - -0.11 - - 0.74 - 0.25 -0.1 - - - 0.14 - - - -1.26 -1.31 -0.55 -0.96 -0.74 0.74 1.18 - - -
1.76 4.26 0.82 - - - - - - - -1.72 2.44 - 2.23 - - - - - - - -0.66 - 0.82 - - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - - - - -
0.36 4.63 - - - - - - 2.49 1.84 -2.75 - 2.24 2.27 - - - - - -1.28 - - - - - - - - - - - 1.18 - - - - - - - - - - - 0.41 - - - - -
-1.78 5.11 - - 0.63 1.99 - -1.67 - - - - - - - - 1.1 -4.25 - -3.39 -0.93 - - -1.17 - - - - - - - 2.15 - - - - - - - - -2.36 - - -0.88 - - - - -
-0.55 4.9 - - - - - - -0.36 - -0.22 - - - - - - - - - - - - -1.03 2.83 - - - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.19 3.16 0.2 - - - - - 1.54 - -2.12 - - 4.7 - - -2.34 - - - -2.32 - - -2.09 - - - - - - - 1.54 - - - - - 0.91 - - - - - - - - 1.94 - -
-1.48 3.35 -1.42 -2.7 2.19 0.57 -1.62 -2.13 1.25 - -1.71 -1.27 -1.26 3.39 - - -0.29 -2.07 0.57 -1.11 -0.96 -2.4 -1.59 -0.05 - 0.1 - - - -0.75 - 1.83 - - -0.91 -0.19 -2.01 1.12 - -2.96 -1.13 -1.85 -0.38 -0.77 - -3.06 -0.23 - -
- 4.79 - - - 2.84 - - 2.58 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.81 4.79 - - - - - - 3.53 - - - - - - - 0.21 - - - - - - -1.19 - - - - - - - 1.71 - - 2.11 - - - - - - - - -2.25 - - - - -
-1.06 4.3 - - 0.54 - - - - - - - - 4.46 - - - -2.03 - - -1.0 -2.22 - 0.23 - - - - - - - -0.46 - - - - - - 1.28 - - - - - - - - - -
-4.3 4.68 - - - -0.2 - -1.6 - - -5.92 - - 3.85 - - - - - -0.14 -2.84 - -1.92 -0.29 - - 1.42 - - - - 0.23 - - - - - - - - -3.28 - -1.86 - - 0.39 - - -
- 4.32 - -1.16 - 3.09 - - 0.69 - -4.12 -0.94 - 1.28 - - - -4.3 - -4.05 -2.37 - -2.54 0.42 - - - - - - - 2.73 - - 2.43 - - - - -2.39 -1.55 - 0.03 - - - - - -
-2.14 4.35 -0.55 - - 2.91 -1.72 - - - -2.61 - - 3.11 - - -2.65 - - - - -2.54 - -0.74 - - - - - - - 2.82 - - 1.52 - - - - - -1.89 - - - - - - - -
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.66 4.57 0.04 -2.4 - 3.37 -3.47 -3.47 1.25 - -2.97 - 0.29 0.32 - - -3.68 -0.66 - -1.11 - -0.87 -3.26 0.68 - - - - - -0.0 - -0.08 - - - - - - - -2.99 -4.18 -1.22 -1.82 1.01 - - - - -
- 3.99 - 1.63 - - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.76 - - - - - - - - - - - 3.16 - - 3.17 - -
-3.59 3.56 - -0.32 1.15 2.64 -3.59 - - - -4.03 -2.42 -0.81 -1.73 - - -3.75 - - -0.41 -0.38 -1.22 -0.56 -1.75 - -0.14 - 1.48 - 2.06 - 1.76 1.04 0.11 0.96 - - -0.48 0.45 -1.19 -1.1 -2.53 -0.09 -3.61 1.24 - -0.38 - -
-0.14 4.45 - - - - - - 3.26 - -4.1 - - 3.78 - - - - - - -3.09 -2.61 -1.2 -1.15 - - - - - - - 0.37 - - - - - - - - - -1.68 - - - - - - -
-0.79 4.65 0.38 - 0.59 0.62 - - - - - -0.38 - 1.04 - - - - - - -1.25 - -0.28 -0.67 - - - - - - - -0.68 - - -15.1 1.2 - 2.75 1.05 - - 0.53 0.06 -3.06 - - - - -
-2.14 4.74 - 1.91 - 1.95 2.37 -0.37 -1.62 - - - - - - - - -2.32 - -3.59 - -3.91 - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.81 - - - 2.01 -
0.74 5.21 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.12 -
-0.02 4.71 - - - 1.52 - -2.01 - - -2.99 0.84 - 2.23 - - - -4.3 - -0.3 - - - 0.41 - 0.92 - - - - - 0.61 - - - - - - - - -2.71 - - - 2.28 0.57 - - -
1.18 3.49 - - - - - - 3.38 0.04 0.03 - - - - - - - - - - - 0.4 1.28 - - - - - - - - - - - - - 4.27 - - - - - - - - - - -
2.13 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.44 4.4 - - - - - - - - - 1.71 - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - 3.84 - -
-4.65 4.07 - - - 0.58 - - -0.48 - -3.42 - 3.91 -0.6 - - -3.01 -3.16 - -0.49 -2.79 -0.91 -2.96 -0.2 - - - - - 2.08 - 2.0 - - - - - - - - -0.85 - - - - - - - 1.45
1.2 5.02 0.76 - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 - - - - - - 3.21 - -4.06 - - 1.63 - - - - - -5.45 -1.56 -1.98 - 0.18 - - - - - - - 1.54 - - - - - - - - -0.62 - - - - - - - -
- 4.76 0.39 - 1.52 1.61 - - - - - - - - - - - -2.4 - -0.03 -1.39 -2.35 -1.79 0.95 - - - 2.32 - - - 1.87 - - - - - - 0.79 - - - -26.98 -1.63 - - - - -
-0.71 4.67 -9.01 - - - - - 3.04 -0.92 -3.13 - - - - - - -1.24 - - -2.48 - - -0.03 2.35 - - - - - - 2.12 - - - - 1.44 - - -1.8 - - - - - - - - -
-1.13 5.17 - - - - -2.01 - 1.88 - -3.03 - - - 2.58 - - - - -5.41 - - -3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.2 - - -
-0.15 4.72 - - - - - - - - - 0.96 1.49 3.02 - - - 0.14 - -1.81 - -0.04 - -1.17 - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - -0.48 - - 0.16 - - - - -
- 5.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.13 4.39 -1.01 - - 3.02 -3.05 0.01 -1.83 - -0.47 - - 1.49 - - -0.95 -3.06 - -0.07 -2.47 -3.61 -1.98 0.04 - 0.46 1.09 - - - - 2.07 - - - - - - - -2.79 -1.48 -2.46 - -1.87 0.83 - - - -
-1.09 3.5 -2.71 -2.56 -0.72 1.45 -0.15 - -0.4 - -5.43 - - 4.13 - - -0.83 -2.94 - -2.21 -1.18 -3.4 -3.55 -1.44 - - - - - - - 1.5 0.24 - - - - - - -3.2 0.81 - -0.85 -0.8 - - - 0.64 1.97
-1.52 4.59 - - - - - - 4.48 - - - - - - - - - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.5 4.16 - - - - - - 1.76 - -1.6 - - 4.4 - - - - - - - - -0.39 -0.87 - - - - - - - 2.03 - - - - - - - - -1.0 - - - - - - - -
0.0 5.19 - - - - - -0.11 2.51 - -3.36 - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.81 - - - - -
1.43 4.63 -0.17 0.84 1.23 2.83 - - - -0.01 0.75 0.24 - - - - -0.95 - - - - -1.55 - -0.36 - - - - - - - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.45 5.19 1.35 - - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.18 4.74 -1.57 -1.72 1.2 2.25 -2.36 - 0.95 - -5.36 - - 0.11 - - - -3.03 - -1.65 - - - - - 0.4 - - - - - 1.02 - - - - - - - -2.68 -2.71 - -1.93 - 1.31 - 2.02 - -
-3.94 4.27 - - - 1.28 - - 3.24 - - - - 1.67 - - -2.75 -2.76 - -3.06 -3.38 -12.38 -2.94 1.32 - 0.63 - - - - - 1.94 - - - - 1.03 - - - -2.91 -1.44 -1.92 -0.78 - - - 1.38 -
-0.71 4.6 - - - - - 0.91 - - - - - 3.94 - - 1.68 - - - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.02 3.82 -1.95 0.74 2.92 3.15 -0.07 -0.87 -1.46 -2.79 -3.39 -1.56 -0.99 -0.84 - -1.68 -5.23 -0.3 - -0.31 -3.14 0.29 -3.83 0.67 -0.05 0.41 -1.39 - - - - 0.39 - - - -1.81 -2.91 -2.05 -3.0 -2.69 -1.7 -1.41 -1.81 -1.87 -0.64 0.04 -3.11 - -
1.46 4.98 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.63 - - - 2.09 - - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - 0.02 - - - - -
-0.74 4.96 - 2.68 1.26 - - - - - -2.19 - - - - - - -1.91 - - - - - 0.35 - 2.48 - - - - - -0.34 - - - - - - - - - - - -2.14 - - - - -
- 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.05 4.61 -2.28 - - 0.73 - - 1.97 - - -0.99 1.11 -0.1 - - -2.69 -0.97 - 0.13 - -1.6 - 1.7 - 1.08 - - - - - 1.52 - - - - - - - -1.42 -0.42 -0.55 -1.67 -3.27 - 1.15 - - -
- 5.21 - 1.27 - 3.03 - - - - -2.06 - - - - - - 0.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.69 - - 0.23 2.05 - - 2.25 - - - - 2.66 - - - -0.64 - - - - - 1.2 - - - - - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.31 3.64 - 2.94 0.94 - - - 1.92 - -3.52 - - 2.85 - - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - 1.64 - - - - - - - - - - - - - - 2.9 0.98 -
-0.26 5.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - 1.59 - - - - - - - -0.43 - - - - - - - - -
0.26 4.76 -0.16 - -1.84 1.73 - - -0.05 - -3.85 - - 1.58 - - - -0.95 - 0.16 -2.69 -1.65 -3.15 0.3 2.05 0.48 - - - - - 0.42 - - - - - - - -2.71 -1.47 - - 0.34 - - - - -
-0.28 4.79 - - 2.02 - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.06 -0.51 - 0.42 1.95 -1.94 -1.03 1.4 -2.53 -2.9 - 3.29 - - - - -2.22 - -2.96 - -1.61 -2.48 -0.58 2.74 - - - - - - 1.99 - - - - - - - - -2.71 -1.43 - -2.83 - - - - -
-1.58 5.09 -2.01 - - 3.13 -1.92 - - - - - - - - - - - - -1.69 -2.15 - - 0.37 - - - - - - - 1.71 - - - - - - - -2.45 - - - - - - - - -
-1.56 4.96 - - -1.62 2.19 - - -0.06 - -0.1 - - 1.85 - - - -5.51 - - -2.55 - -3.36 -0.43 - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - -2.55 - - - - -
-2.23 4.87 - - - 3.28 - - -1.29 - -4.37 - -0.1 - - - -1.56 -0.3 - -1.69 -2.49 -0.86 -2.36 -0.39 - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - -1.32 - -0.89 -2.05 - 0.71 - - -
- 4.81 - - - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - - 2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.2 5.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.71 4.57 -0.29 - -2.47 0.87 -2.73 -2.26 -0.58 - -2.75 -1.42 2.01 0.47 -0.61 - -1.34 -1.11 - -0.72 -2.71 -2.9 -5.66 -0.09 - 1.89 - - - - - 0.86 - - - - - -1.1 - -2.92 -0.69 -0.87 -0.9 -0.94 0.68 0.67 - - -
1.0 4.96 - - 1.1 2.04 - - 2.06 - -3.47 - - 1.01 - - -1.6 - - - - - - -1.4 - - - - - - - -0.09 - - - - - - - - - - - 0.72 - - - - -
- 4.81 1.16 - - 2.38 - - 2.6 - -2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.43 - - - - -0.49 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.58 - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.51 - - - - - - 4.5 - - - - - - - 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.