Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
-2.61 1.46 -2.76 -1.27 2.23 -1.01 0.29 -3.27 -1.53 2.66 4.03 1.41 -4.39 -2.34 - - -6.41 -2.16 - -2.04 -2.06 -3.92 -4.63 -3.56 2.54 -3.47 -3.29 - - -2.81 -1.5 -0.9 - 0.01 -1.31 -3.04 -3.14 -1.29 - -3.22 -3.94 -2.79 -2.09 -1.2 0.48 -2.0 -1.39 - -2.87
-2.54 3.12 - - - 5.15 - - - - 0.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.98 -1.3 -0.68 - -6.54 -3.56 -6.8 -6.42 1.15 1.44 1.68 3.45 -5.73 0.11 1.05 -0.92 -1.76 -0.58 0.79 -1.32 -4.49 -0.75 -4.82 -0.04 -2.77 1.33 1.28 -3.73 -4.14 -3.53 - -3.57 -4.45 -4.44 - -3.87 -4.04 - -5.11 -3.22 -1.96 -1.68 -2.62 -2.99 3.08 2.28 -2.71 - -
2.09 3.91 0.88 - - - - - - 3.89 3.62 - - - - - - - - - - - - -0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.2 3.4 - - - - - - - 0.25 1.5 2.14 - - - - - - - - -0.25 - -0.05 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - 0.46 - - - - -
-0.73 2.98 -3.02 -2.87 - 1.58 -3.33 - 1.85 0.05 0.99 - - 4.0 - - - -4.38 2.74 -1.62 - -2.09 - -1.24 1.17 -0.2 - - - - - -1.03 - - - 0.86 - - - - -3.48 - - - - - 0.42 - -
-4.42 2.69 - -1.87 - - -1.75 - - - 3.02 - - 3.17 - - - - - -5.48 - - - -1.36 4.46 - - - - - - - - - - - - 0.24 - -1.49 -2.14 -1.3 -2.37 - - - - - -
-2.28 4.43 - - - - -0.05 -1.33 -1.44 -0.67 1.62 -1.31 - 3.93 - - -2.17 -0.91 - -6.65 - - -2.91 -0.93 - 0.2 - - - - - 1.19 - - - - - 0.07 - - - - -2.24 -3.61 - - - - -
-1.18 4.74 - - - - - - 0.94 - 0.68 - - - - - - - - 0.9 - - - - 3.88 - - - - - - 0.78 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.0 -1.91 -2.98 -6.71 -5.94 -2.82 -2.83 -4.0 -3.01 -0.58 0.41 -3.78 -0.11 -0.89 -5.48 -1.11 -6.22 -3.32 -1.75 0.97 -2.61 -2.63 -2.69 -2.81 4.95 -2.3 -3.07 -4.14 -2.23 -1.16 -1.85 -1.45 -1.86 -2.06 -2.51 -4.3 -4.58 -2.8 -4.57 -3.96 -3.89 -4.48 -3.96 1.74 1.44 -0.33 -1.98 - -7.0
1.31 4.47 - - - - - - 2.27 - 0.83 1.25 - - - - 0.61 - - - - - - -0.73 - - - - - - - 0.95 - - - - - - - -0.37 - 0.24 - - - 3.24 - - -
- 5.34 - - - - - - - - 1.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.2 5.24 - - - - - - -18.45 -0.83 2.09 -17.69 - - - - - -22.91 - - - -1.18 -0.2 -1.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.85 5.37 - - - - - - - - 1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.07 3.25 - -2.16 -1.43 -1.32 1.5 2.23 2.45 3.3 3.12 - -1.7 1.49 - - - -0.98 - -0.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.63 - - 0.63 - - -0.81 -1.19 -
0.64 3.74 - - - - - - - 4.27 1.78 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - 0.61 - - - - -
0.8 5.1 - - - - - - 3.32 - 0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.16 - - - - - - - -
-3.14 3.44 - -1.06 - - - - 2.25 - 1.97 - - 3.99 - - - - - - -1.35 - -0.75 -0.12 - - - - - 1.94 - 0.22 1.75 - - - - - - - -2.0 - - - 1.27 - - - -
3.55 3.78 - - - - - - 2.79 - 2.42 - - - - - - - - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.32 - - - -
1.21 3.49 0.84 -4.52 - 0.27 0.79 -1.23 1.83 - -0.05 - - 0.1 - - -1.23 0.78 - 0.05 -3.34 -2.47 - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - -2.83 - -1.64 -1.99 0.51 1.43 - 1.0 1.85 2.33
0.49 4.9 1.31 - 2.9 - - - - - 2.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.78 2.55 -0.54 2.25 3.12 2.63 -1.26 -1.25 2.82 - 1.71 - - - - - - -1.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.58 - - - - 1.53 0.89 - - 2.15
- 2.59 - -0.42 1.89 2.85 -0.62 - - 3.37 3.81 - - 1.42 - - -1.82 -0.48 - - -2.66 - -0.38 - - - - - - - - 0.69 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.36 - - - - - - - - 3.23 - - 4.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-6.07 0.28 -2.9 -4.53 -4.69 0.92 -3.39 -3.9 -0.37 1.93 3.17 4.01 -2.55 -2.5 -0.41 -1.76 -7.02 -1.96 2.44 -0.42 -4.31 -3.05 -4.54 -3.29 1.15 -2.75 -1.34 -3.3 -5.13 -3.13 -4.08 -3.55 -3.88 -2.19 -2.02 -1.45 -3.72 -3.72 -3.23 -4.69 -5.35 -5.79 -4.39 -1.16 0.99 -0.47 -5.19 - -
1.97 4.48 - - - - - - 2.3 - 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.73 3.09 - - 2.94 2.89 - - -0.74 - 1.47 - 0.52 2.13 - - -3.14 -1.33 - - - -3.39 -3.84 -1.28 1.45 - - - - - 0.34 -0.07 - - - - - - - - - - - -1.9 -0.04 - 1.56 -0.22 0.87
1.12 2.94 - 0.07 0.15 4.38 -2.56 - - -0.58 1.07 - - 2.79 - - -0.09 -2.22 - - -4.27 - - -3.37 - - - - 2.01 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.03 - - -
-0.46 4.03 - - - - - - - - 2.29 2.84 - - - - - 0.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.17 - - -
- 4.95 - 0.76 3.2 - - - - - 0.8 - - - - - - - - - -0.35 - - - - - - - - - - 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.44 3.58 -0.13 - 0.56 3.87 - - 0.94 0.94 2.26 -2.2 - 0.81 - - -2.44 - - -3.21 -4.05 -2.77 -2.08 -0.24 - - - - - - -0.52 2.3 -0.35 - - - - - - -1.15 -1.94 -1.56 -2.24 - - - - - -
2.02 2.37 - - 2.58 3.69 - - - - 1.03 - - - - - - - - - 1.32 1.57 -0.89 0.58 - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - 0.68 - - - - - - -
-4.46 3.05 - -3.88 -1.01 0.08 -3.05 -3.63 -2.25 - 0.32 0.53 - 0.09 - - -1.89 -1.19 - -1.22 0.74 -1.68 -1.02 -0.99 - -0.95 - 1.05 -0.84 2.01 0.04 -0.12 0.84 1.51 -0.46 0.59 0.62 -0.84 1.72 0.77 0.84 0.75 1.23 -2.12 - - -1.57 0.06 -1.81
- 5.02 - - - - - - - 2.81 2.28 - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.77 - - -1.24 -0.85 - - - - -
0.6 3.52 - - - - - - - 4.21 3.23 - - 2.74 - - - - - - - -1.94 - -1.65 - - - - - - - -0.35 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.21 4.64 - - - - - - - 0.93 3.13 1.94 - - - - - -1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - -
- 3.27 1.11 - - - - - 1.72 - 1.19 - 3.47 4.11 - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.2 5.14 - - - - - - - - 2.86 2.05 - - - - - - - - 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.86 1.41 -1.42 0.14 - 1.78 -0.61 -1.6 2.57 - 3.74 - - 2.04 - - -2.83 -5.18 - -14.39 -1.03 -2.93 -1.07 -0.94 - - - - - - - 1.59 - - 1.57 - - 2.36 - -1.93 -3.32 -0.35 -0.94 - - 1.13 - - -
-0.7 4.37 0.03 0.75 - - -0.03 -2.03 2.59 2.31 3.0 - - 0.8 - - - -1.46 - - -1.54 -1.41 - -2.04 - - - - - - - -0.73 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - -
-1.86 2.35 -2.8 -1.76 -0.47 4.08 - -1.77 -0.35 0.26 2.78 -0.18 - 2.04 - - 0.05 -3.44 - - - -3.23 - - - - - - - - - -1.47 - - 1.78 - - - - - -3.25 -2.3 -1.29 -1.87 - - 1.16 - 1.64
- 1.64 - -2.86 2.28 3.12 -0.53 -1.17 0.63 2.14 2.45 -1.55 - 1.07 - - - -4.19 - 0.35 -1.33 0.31 -2.2 -3.03 - - - - - -0.12 - 1.45 - - - - - 2.0 - -2.69 -2.18 -0.04 0.9 -4.01 0.48 0.65 - - -
-1.76 4.81 - - - - 1.56 -0.02 - - 2.31 - - 1.81 - - -0.17 2.29 - - - - - - - - - - - - - 1.28 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.09 3.57 - - - - - - 0.94 - 2.34 - - 2.51 - - 0.82 - - - 1.21 0.34 0.45 1.53 - - - - - - - 1.98 3.14 - - - - - - - - - - - - - - - -
1.52 5.47 - - - - - - - - 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.36 - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.64 - - 2.0 4.98 - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.19 - - -
-1.24 2.18 0.95 0.21 0.85 0.14 2.16 2.41 -0.5 0.32 1.68 -0.97 -1.03 2.59 -0.29 - -0.0 -1.8 - -1.09 - - - - - - -1.56 - - - - - - - - - - - -0.88 - - - - -2.85 - - 0.93 1.95 2.76
- 4.0 - - - - - - - - 1.18 - - - - 4.63 - - - - - - - 0.49 - - - - - - - 1.57 - - - - - - - - - - 0.65 - - - - - -
0.72 2.4 0.25 - - - -0.3 -1.29 1.61 2.54 3.38 - - 1.1 - - 2.48 2.2 - -0.98 - - 0.44 - - - - - - 2.17 - 0.01 - - - - - - - - - - -0.5 - - - - - -
- 4.18 2.81 - - - 0.68 1.69 2.09 - 1.63 - - 2.52 - - - - - - 1.27 -0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.38 - - - - - -
-5.5 3.29 -1.22 -1.42 -2.09 2.44 -5.39 -4.39 - -2.05 3.03 4.05 -1.04 0.42 -1.01 - - -0.74 0.68 -0.47 - - - - - -1.29 -1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.92 0.01 -1.5 - - -
-2.04 2.98 - - - 2.92 1.39 -0.4 -0.11 -0.76 2.13 - 0.49 -0.33 - - -0.87 -0.01 3.34 -3.16 -2.39 -1.42 -2.92 -0.33 - - - - - - - 1.35 - - - - - 0.07 - -1.26 -0.24 -1.87 -1.36 -1.83 - - 0.2 - 0.68
0.49 4.68 - - - - - - 2.84 -0.81 2.63 2.14 - - - - -0.8 -0.55 - - - - - -0.58 - - - - - - - 0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.33 1.85 -3.31 - - 0.67 - - -0.52 4.24 4.42 - - 0.06 - - - -3.88 - - - - -2.27 - - - - - - - - -0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.21 4.58 - - - - - - - - 2.5 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - 3.14 - - - - - - - 0.09 - - 2.05 1.57 - - - - -
-3.58 1.87 0.26 -8.17 -8.49 -5.16 1.02 1.45 0.42 0.96 0.63 0.43 0.73 0.5 -0.88 -0.55 -2.19 0.83 0.21 0.2 -0.49 -1.38 -0.46 -0.5 -1.11 -0.68 -1.37 -0.24 -0.34 -0.47 -0.84 -0.37 -1.22 -1.36 -0.79 -0.43 -0.95 -0.8 -0.76 -1.33 -1.32 -0.62 -0.85 0.0 0.56 0.98 2.2 0.69 -1.65
-3.75 0.7 -2.67 -4.65 -2.95 -0.56 -4.08 -4.97 -0.67 -1.93 2.18 3.86 - 0.38 -2.96 -1.36 -3.67 -2.23 - -2.97 -5.36 -2.26 -4.78 -0.94 1.68 -0.79 -4.27 -1.53 - -1.34 -4.0 0.36 -2.84 - -1.82 - -3.97 - - -4.14 -4.84 -4.93 -3.08 -4.88 3.65 1.79 -1.21 -4.07 -4.47
1.21 5.49 - - - - - - - - 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.21 3.22 -0.47 -0.68 0.32 3.16 0.88 0.19 -0.17 -0.68 1.69 -2.68 1.18 0.68 - - -1.08 0.22 - 0.0 -1.04 -0.68 -0.18 -1.29 - -0.63 - - 1.04 0.58 - -0.06 -0.29 -0.01 - - - - - -4.08 -4.45 -3.32 -1.59 0.91 - -1.18 -0.65 - -
2.89 4.44 - - - - 0.54 - - 1.31 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.04 - 1.2 2.12 - - - - - -
-1.85 0.19 -2.61 -7.19 - -5.95 1.65 0.81 -3.24 0.44 1.33 -1.87 3.2 2.81 - - -2.57 1.64 - -0.86 -1.24 -5.51 -3.41 -6.94 - -2.21 -2.46 -3.13 -3.47 -0.25 -0.54 -1.06 -1.86 - -1.64 -1.51 -2.1 -0.39 -0.93 -4.87 -4.13 -2.88 -3.46 1.27 2.04 2.33 -0.74 - -3.41
-1.25 1.52 - - - 0.53 0.98 -1.89 - 1.08 2.47 4.14 1.44 - - - - 0.5 - -2.18 -0.58 - -1.51 0.42 - - - - - - - 1.73 2.57 - - - - - - -2.0 -2.41 - -1.77 - - - - - -
-0.71 4.95 - - - 2.16 - - 1.4 -0.3 3.03 - - - - - - -0.23 - -3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.83 - - -1.57 - - - - -
0.27 2.87 - -1.89 - 1.12 -2.06 - - - 1.21 - - - - - -20.03 -5.26 - - -0.41 -0.79 0.24 -4.79 - - - 3.43 - - - - 3.04 - 2.05 - - 2.13 - 1.12 -1.94 0.21 0.59 -1.53 - - - - -
0.9 3.96 - - - - - - 2.9 - 4.01 - - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.58 - - - - - - - - -
1.8 3.39 - 1.31 1.04 - 0.43 2.02 - 1.19 2.63 - - 2.64 - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.64 - - - - -
-3.51 4.43 -1.58 2.24 - 0.82 - - - - 2.29 - 0.43 1.42 - - -0.41 - - -5.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.31 - - - - 2.2 0.36 2.23 - -
-1.35 3.36 3.55 - - 2.74 - - - -0.95 4.2 - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.78 - - - - - - - - 3.83 - - 4.59 - - - - - - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.87 1.67 - - - - - - 2.46 2.95 4.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.89 4.68 - - - - - - 3.17 - 2.08 - - - - - - - - - 1.18 - - 2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.95 1.0 - -5.25 -1.06 - - - 0.86 -5.57 2.21 2.04 - 4.16 - - -0.93 1.06 - -0.66 -2.63 1.11 -2.18 -3.74 - - -0.22 - - - - -0.19 - - -2.51 -2.57 -1.33 - - -3.35 -1.12 -3.84 -4.27 - 2.03 0.14 - - -
-4.75 1.63 -1.58 -0.06 -1.17 -1.68 0.43 -0.77 -0.07 0.09 0.83 -1.28 2.42 2.64 -1.29 - -4.17 1.94 - -1.76 -0.22 -5.12 -0.74 -4.25 - -1.99 -1.98 0.52 0.1 0.71 -0.5 -0.39 -0.64 -1.3 -0.23 0.49 -0.42 0.37 -0.1 -2.28 -1.71 -1.15 -1.4 -0.0 1.65 0.15 -2.88 -2.9 -0.48
- 5.03 - - - 3.77 - - - - 1.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.35 5.05 -0.03 - - - - - - 2.22 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.5 4.74 - - - - - - - - 0.48 - - - - - 0.35 - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - 3.47 - - -
-0.37 5.12 - - - - - - - - 2.03 - 2.56 - - - - - - - - - - 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - -
-0.86 2.9 - - 0.34 - - - - 1.7 3.46 - - - - - - - - - - - - - 4.14 - - - - - - 1.04 - - - - - - - - - - - - 2.52 - - - -
- 5.53 - - - - - - - - 1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.12 - - - 3.29 - - - 1.14 1.27 - - - - - 1.01 0.35 - -0.44 - - - - - - - - - - - - 2.15 - - - - - - - - - - - 1.47 1.39 - - 1.72
-0.57 5.36 0.85 - - - - - - - 1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.3 5.46 - - - - - - - - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.15 4.67 2.41 - - - 0.71 - - - 0.8 - - - - - 0.66 - - - - - - - - - - - - - - 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.83 3.22 2.23 3.16 2.2 -0.04 -3.33 -3.32 -0.95 0.46 1.65 0.9 -0.11 0.42 - - -1.06 0.67 2.74 -1.62 - - - - - - - - - - - -2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.88 3.91 - - - - - - 2.82 - 2.73 - - 4.08 - - - -1.06 - - - - - -1.15 - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.98 0.88 2.45 -0.75 -3.38 1.89 - - -0.93 0.63 2.94 2.18 -2.44 - - - -1.97 -3.66 - -0.83 -3.97 -3.37 -4.56 -5.1 2.67 0.32 - -1.11 -0.16 1.14 0.45 -1.44 -0.86 - - - - -1.34 - -3.68 -3.52 -2.51 -2.71 -0.98 0.93 1.54 - 0.01 -0.92
-5.62 0.91 -1.55 - - -0.72 -0.42 -3.98 -2.12 3.14 3.33 1.28 0.11 1.21 -0.37 0.48 - -0.31 0.6 0.65 -3.11 -1.93 -4.05 -2.32 2.8 -1.48 -1.17 - - 0.18 -1.75 -1.97 -1.64 -0.07 -2.62 -1.54 -2.72 - - -3.89 -4.24 -3.93 -3.12 -0.61 -0.03 -1.34 - - -
-1.4 4.3 -0.81 - - 3.18 - - 2.14 - 2.09 - 1.17 1.49 - - - -0.5 - - - - - -0.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.08 - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.