Heatmap: Cluster_126 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.69 2.47 0.95 0.17 -0.75 4.89 -3.32 -1.73 -0.78 - -1.54 -2.71 -2.01 -1.46 1.62 0.04 -1.4 -2.33 - -3.57 -4.67 - -3.19 - - - - - - - - -0.43 - - - - - - - - -4.84 -3.85 - - - -1.74 - - -1.49
-1.94 3.08 - -1.67 0.56 4.63 - - - - -1.39 3.11 - 1.54 - - - - - - -2.25 - - - - - - - - - - 0.13 - - - - - - - - -2.57 -2.07 - -3.55 - - - - -
0.09 4.93 - 1.81 1.59 3.21 -0.2 - - - - - - - - - - - - - - - - -0.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.78 1.58 - 2.94 -0.12 4.35 0.84 1.46 - - -0.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.31 - - 0.49 3.27 -
2.34 4.38 - - - 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.46 - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.2 4.35 - - - 3.4 - - 0.73 - -0.47 - - - - - - - - -1.27 -0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.03 - 0.08 - 2.09 3.04 - - -
1.34 4.86 1.03 - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - -0.25 - - -0.4 -0.16 - - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - -
- 2.69 -2.72 -0.51 -1.04 4.36 - -0.06 - 2.76 -0.39 - - -0.09 - - -4.78 -7.15 - - -2.35 -4.39 -2.29 -2.64 - -1.91 - - - 1.77 - 1.47 - - - 1.75 - - - -3.34 - - -0.7 - - - - - -
2.43 2.41 - - 0.88 5.18 - - - - -1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.42 - - - 4.6 - - - - - - - - - - - -0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.21 - 0.79 - - - - - -
- 4.21 - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.1 1.51 - -2.02 -0.51 4.6 -1.91 1.02 - -0.81 -1.05 -1.42 - -2.38 - - 0.62 -1.56 - -2.67 -4.52 -3.51 - -5.32 -0.28 - -0.73 - - - - -2.48 - - - - - - - - -4.25 - -3.26 0.06 2.11 1.95 0.5 0.05 -0.96
0.34 2.04 1.16 - - 5.11 - - - - -3.1 2.05 - 1.03 - - - -0.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.02 4.3 - 0.33 1.17 4.55 - - - - -1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.42 4.24 - - - 3.85 - - - -0.38 -0.6 - - - - - - -2.72 - - - - - - - - - 3.3 - - - 1.16 - - - - - - - -0.52 - - - - - - - - -
1.06 3.64 -1.41 1.85 1.24 3.18 -2.36 -2.35 0.2 -3.59 -1.88 0.3 - 1.26 - - -0.32 -0.98 - -1.9 -2.86 - -2.76 -1.76 - -0.5 0.71 - 0.44 - - -0.47 - - - - - - - - -2.76 - - -0.91 - -1.21 2.39 -0.62 -
-0.58 3.24 -0.59 - - 4.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.97 - 0.55 - - 3.47 - - - -
-1.47 3.11 -0.53 - 3.19 4.28 - - - - -4.46 - - 2.93 - - 1.27 - - - -1.98 - - -1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.28 1.53 - -0.74 -0.24 5.36 - - -0.83 - -4.11 - -0.42 - - - - -3.72 - -1.62 - - - - - - - - - - - -2.38 - - - - - -0.69 - -3.2 -3.91 - -2.86 -0.47 - - - - -
-1.37 4.93 - - - 3.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.23 - - - - -
0.84 4.78 - - - 4.14 - - - - -5.49 - - - - - - - - -3.99 - - - - - - - - - - - 1.04 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.87 2.95 - -1.74 - 4.52 - -2.2 -1.05 - -3.12 0.45 - - - 3.17 -2.34 0.23 - - -2.44 - -2.44 - - 0.61 - - - - - - - - - 0.99 - - - - -0.5 -0.69 - - - - - - -
0.54 2.4 - -0.25 - 5.21 - - - -1.66 -3.74 - - - - - -1.46 - - - -2.01 - - - - - - - - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - -
-0.63 2.99 - - - 4.02 -0.24 -1.82 0.03 -3.06 -1.16 - - -0.98 - - - -0.48 - -3.76 -3.18 - - - 3.64 0.31 - - - - - -1.52 - - - 0.37 - - - - -3.08 - - 0.73 - - 1.58 - -
0.44 4.83 - - - 3.75 - - 1.22 - -0.84 - - - - - - - - - - - - -0.25 - - - - - - - 1.06 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.09 - - - - 5.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.96 2.45 -0.12 3.2 2.8 4.14 -1.41 -1.2 - - -3.89 - - - - - 0.41 0.91 - -2.95 -4.4 -4.57 -3.9 -4.86 - - - - -0.58 0.12 -3.46 -1.04 - -0.63 -2.74 - - - - -2.82 -2.11 -2.55 -1.26 -4.84 - - - - -
-2.56 5.08 - - - 3.88 - - - - -1.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.96 3.66 -0.27 - - 4.76 - - - - - - - - - - -0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.51 2.91 -2.42 -0.92 1.93 4.72 -3.95 -3.95 1.43 -4.19 -5.12 -2.36 -1.73 -2.11 - - -4.14 -3.82 - -3.23 -2.79 -2.91 -3.25 -0.91 - -1.14 0.66 - - - - -0.33 - - - - - - - -4.05 -2.75 -1.85 -2.38 -1.41 - -1.8 - -0.22 -
-0.41 3.66 -0.76 - 2.24 4.6 - - - - -4.61 - - - - - - -1.08 - -0.05 - -1.4 - -1.38 - - - - - - - -0.72 - - - - - - - -2.5 -2.47 - -1.74 1.4 - - - - -
2.07 3.86 - - 2.13 4.19 -1.28 -1.27 1.13 - -4.23 - - - - - - - - - -1.4 - -1.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.74 - -0.62 - - - - - 1.57
-0.28 3.77 - - - 5.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.49 - - - 5.57 - - - - -4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.26 - - - 3.28 - - - - -2.29 - - - - - - -0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.67 3.87 - - - 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.12 2.02 -4.19 2.54 2.6 4.39 -5.13 -4.12 -1.01 - -3.4 - 0.37 1.64 - -0.77 -1.82 -0.86 - -1.18 -5.97 - -1.98 -5.95 -0.62 -0.52 - - - - - -2.82 - - - - - - - -4.05 -2.72 -1.21 -1.03 -0.88 -0.53 -1.74 - -1.29 -
- 3.67 - - 3.61 4.49 - - - - -1.95 - - - - - -0.4 - - - - - -0.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.78 1.67 -1.17 - 2.2 5.15 -2.18 - -0.86 - -5.47 -3.33 - 0.21 - - - -3.12 - -5.79 -5.15 -4.48 - -2.5 - 0.5 - - - - - -2.01 - - - - - - - -4.67 -4.43 -24.44 -4.77 - -0.99 -2.09 - - -
1.44 2.4 -1.18 0.24 0.5 4.46 0.79 -1.08 - - -2.08 - 1.25 - - - 1.88 -0.75 - -2.58 -0.42 -1.08 - - - 1.75 - - - - - 0.22 - - - - - - - -2.59 -2.24 -1.61 - -2.11 - - - - -
- 4.95 - - - 4.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.95 3.69 - 1.88 1.51 4.38 - - - - -1.74 - - - - - 1.44 -2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.06 - - - 1.75 -
0.84 4.81 - - - 2.72 -0.69 1.99 0.58 - - - - 1.52 - - 1.57 - - -3.44 - -0.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.02 3.63 - - - 4.44 - 0.04 1.45 - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.22 1.52 - 4.16 3.17 3.98 0.95 -0.52 - - -0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.09 4.04 - - - 3.09 - 1.09 0.44 - -0.51 - - 1.11 - - -2.71 -3.04 - 0.8 -2.34 - - 0.34 - 0.09 0.7 - - - 1.49 0.9 - 0.97 - - - - - - -1.03 -1.37 - -0.65 0.17 0.38 - - -
-4.36 0.56 -4.66 - 1.43 5.47 - - - -4.87 -4.67 - - -2.42 - - - - - - - -5.0 -4.69 - - - - - - - - -3.32 - - - - - - - -4.77 -3.79 - - - - - - - -
0.07 1.66 0.82 0.16 2.33 4.11 0.27 -3.1 - -1.13 -0.92 - 0.12 -0.07 - - -2.31 -3.71 - -0.15 -1.25 - -2.38 - - - - 1.34 - 0.1 - - - - 0.45 - 0.03 0.64 - - -1.61 -2.52 -0.8 -1.11 - - 1.0 1.24 -
0.77 4.52 - -0.28 - 4.48 - - 0.3 - -3.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.06 - 5.24 - - 2.33 - 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.02 3.06 - - 0.16 4.36 - - 1.82 - -2.13 - 0.07 - - - - - - -0.03 -2.38 - - - 3.31 - - - - - - 0.16 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.97 3.54 1.86 - - 3.59 1.17 1.87 - - -2.48 - - 2.0 - - -2.01 - - -1.28 - - - -1.12 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - -2.39 -1.37 -1.53 1.69 - - - - -
-0.51 3.06 - - 1.83 3.48 - - 0.37 - -1.19 - - - - - - -4.53 3.82 - 0.9 - - - - - - - - - - - 1.01 - - - - 0.74 0.79 -2.43 -1.68 - 0.69 - - - - - -
-1.38 2.02 - 2.11 1.41 4.86 0.92 2.31 0.27 - -4.11 - - -1.62 - - - - - - - - - -4.48 - - - - - - - -2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.24 4.7 - - - 2.71 - - 1.93 - - - 1.68 - - - - -1.45 - - -0.16 - -0.87 -0.7 - - - - - - - - - - - - - - - -0.75 -0.95 - - -1.38 - - 2.42 - -
-2.11 1.67 - -2.17 1.39 5.1 - - - -1.67 -0.57 0.63 - - - - - - - -1.16 - - -3.25 - - - - - - - - -0.71 - - - - - - - - - - - -3.7 0.95 - -0.09 0.82 -
- 4.68 0.87 - - 4.4 - - - - -5.04 - - - - - - - - - - - -1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.9 - - - 4.59 - - 0.92 - -1.72 1.2 - - - - - 0.64 - - - -0.7 - -0.4 - - - - - - - 0.91 - - - - - - - - -0.77 - - - - - - - -
-2.72 3.3 -2.57 -2.13 3.2 4.16 - - 2.41 - -3.37 - -0.84 -0.21 - - - -3.28 - -3.57 - -1.05 - -1.56 - - - - - - - -1.62 - - - -0.84 -0.7 - - -3.13 -2.34 -2.49 -2.87 - - 0.55 - - -
- 2.3 - 1.73 3.81 3.72 1.94 0.81 1.1 - - - - 0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - 1.21 -
-3.5 3.39 0.59 - 3.78 4.44 - - - - - - - 0.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.13 - - - - - - -
0.27 3.47 -0.26 -0.41 - 4.93 - - - - -4.94 - - - - 1.94 - -2.89 - -2.14 - -3.06 - -2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.39 0.72 - - 2.2 5.26 - - -2.65 -2.03 -1.63 -1.49 - - 0.22 - - -5.19 - -7.84 -4.22 - - -4.77 - - -1.09 - - - - - - - - - - - - - -4.7 - - -2.7 - -1.12 -1.01 - -
1.34 4.36 - - - 4.63 - - - - -1.42 - - - - - - - - - -0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.36 4.2 -1.37 0.31 0.88 2.56 -2.43 0.46 - -0.45 -2.39 0.87 1.05 1.97 - - 0.98 0.29 - -0.44 - - -2.89 -3.12 - - - - - - - -0.12 - - - - - - - -2.95 -2.58 -0.96 -0.9 0.62 - 0.51 - 0.16 -
-1.47 2.03 - -3.79 -1.35 5.28 - - 0.79 - -2.76 -3.03 - - - - -2.81 -5.85 - - - - -4.12 -3.81 - -0.87 - - - - - -0.69 - - - - - - - - - -4.11 -4.26 -4.49 - 0.04 -1.05 - -
- 2.69 - - - 5.36 - - - - -3.76 - -0.15 - - - - - - -5.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.1 - - - - -
1.09 3.04 - - - 4.49 - -0.24 3.18 - -3.92 - - -0.08 - - -1.78 -3.44 - - -2.16 - - -0.93 - 0.2 - - - - - 1.38 - - - - - - - - -3.18 - -2.1 - - - - - -
-0.87 0.44 - 1.15 - 5.43 - - - - - - - - - - -0.93 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.1 -2.13 -1.05 -0.55 5.51 -3.01 -0.76 - - -7.46 - - -2.44 - - - - - - - - - -3.8 - - - - - - - - - - - - - - - -3.81 - -5.4 - -5.69 - - - - -
-0.22 1.46 - 0.13 -0.51 5.3 - - 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.49 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - -
-3.3 3.35 -0.04 - - 4.91 1.29 - 1.04 - -2.32 - - - - - - - - - -2.6 - - -3.28 - 0.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - -
-1.11 1.99 -1.35 1.42 1.93 4.87 1.42 - - - -5.18 - -0.66 - - - -1.77 -1.31 - -1.6 - -3.12 - -1.42 - - - - - - - - - - - - - - - -1.66 -2.68 - - 1.64 - - - - -
- 4.13 - - - 4.4 - - 3.03 - -0.19 - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.31 1.5 -4.57 - 0.87 4.98 - - -1.64 - -6.34 -2.21 1.96 1.24 - - -4.85 - - -4.03 -6.32 -1.31 -2.69 -1.71 - - - - - - - -0.71 - - - -1.19 - - -1.39 -2.11 -1.72 -1.21 -1.81 -4.71 - -2.25 0.84 - -
0.21 2.57 -0.92 -0.26 3.43 4.18 - - - - -5.05 -0.83 - - - - - - - -2.71 -3.26 - -1.97 -1.43 - 0.7 - - 0.74 - - 0.46 - - - - - - - - - - - 2.47 - - - - -
-1.8 2.32 -3.28 0.78 -1.33 5.07 -0.64 -0.59 -2.0 -3.58 -2.45 - - - - - -0.3 -0.54 - - - - -2.97 -4.79 - - -1.28 - - - - -3.03 - - - - - 0.4 - -3.78 - - - -5.41 - -2.19 0.18 0.05 -
0.06 3.41 2.09 0.43 0.33 4.37 0.96 -0.51 - - -4.44 0.59 - - - - - - - - -2.45 -2.66 - -2.79 - - - - - - - 1.53 - - - - - - - -2.21 -0.81 -0.64 -0.41 - - - - - -
- - - - - 5.32 - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.02 4.91 - - - 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.13 - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.36 3.22 - -1.1 1.25 4.43 -0.77 - 0.74 - -5.43 -1.04 -0.35 1.98 - - - -0.81 - -1.55 - -1.07 - -0.38 - -0.57 - - - - - -0.19 - - - - - - -0.61 -3.84 - - -2.23 - -0.73 - - - -
-0.39 4.68 - - - 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.61 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.76 - - - 2.91 - - - - - - - - - - - - - - -1.13 - -2.03 - - - - - - - - 1.39 - - - 1.7 - 1.49 2.24 - -1.72 - - - - - - - -
- 2.7 -2.34 2.07 2.99 3.77 0.41 -0.79 -0.48 - -5.34 -26.31 - -0.16 - - -3.5 -0.35 - -4.37 - -2.65 -2.75 0.87 - 0.89 - - - 0.25 - -0.24 - - - - - 1.95 - -3.15 -0.48 -1.19 -1.76 -0.6 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.