Heatmap: Cluster_138 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00087350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.43)
0.01 0.0 0.0 0.18 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.15 0.05 0.01 0.05 1.0 0.08 0.21 0.19 0.51 0.28 0.76
AMTR_s00002p00240830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.301)
1.0 0.01 0.0 0.17 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.62 0.21 0.0 0.03 0.05 0.61 0.12 0.06 0.04 0.05 0.99
AMTR_s00002p00262970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.469)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.45 1.0 0.0
AMTR_s00002p00263400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.478)
0.55 0.03 1.0 0.2 0.36 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.66 0.56 0.59 0.3 0.47 1.0 0.5 0.54 0.59 0.39 0.41 0.76
AMTR_s00007p00142460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.94)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.14 1.0
AMTR_s00007p00217240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.202)
0.57 0.23 0.6 0.22 0.03 0.01 0.11 0.04 0.13 0.13 0.46 0.28 0.23 0.22 0.06 0.48 1.0 0.23 0.2 0.56 0.24 0.45
AMTR_s00007p00262050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.332)
0.31 0.0 0.01 0.02 0.16 0.02 0.07 0.12 0.26 0.16 0.45 0.73 0.65 0.44 0.09 0.29 0.54 0.54 1.0 0.33 0.18 0.63
AMTR_s00010p00195330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.177)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.89 0.18 0.13 0.29 0.03 0.54 0.69 0.43 0.05 0.51 0.67
AMTR_s00012p00230920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.186)
0.08 0.19 0.15 0.14 0.19 0.01 0.13 0.01 0.12 0.24 0.29 0.26 0.29 0.18 0.13 0.01 0.24 0.21 0.2 0.04 0.04 1.0
AMTR_s00014p00251930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.132)
0.0 0.12 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.58
AMTR_s00016p00022060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.7)
0.52 0.0 0.1 0.04 0.18 0.0 0.01 0.09 0.03 0.03 0.35 0.51 0.7 0.27 0.15 0.46 0.36 0.45 0.42 0.26 0.24 1.0
AMTR_s00016p00195680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.160)
0.27 0.23 0.03 0.12 0.12 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.53 0.46 0.43 0.46 0.27 1.0 0.51 0.44 0.39 0.3 0.22 0.85
AMTR_s00019p00124000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.101)
0.16 0.0 0.01 0.25 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.22 0.31 0.19 0.12 1.0 0.16 0.21 0.39 0.27 0.4 0.56
AMTR_s00020p00173350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.62)
0.49 0.64 0.13 0.08 0.32 0.27 0.26 0.21 0.34 0.35 0.57 0.64 0.85 0.63 0.67 0.61 0.68 0.68 0.68 1.0 0.5 1.0
AMTR_s00022p00064170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.44)
0.03 0.0 0.0 0.02 0.29 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 1.0 0.63 0.21 0.04 0.13 0.05 0.12 0.36 0.35 0.22 0.5 0.3
AMTR_s00023p00034050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.11)
0.42 0.24 0.01 0.09 0.38 0.0 0.04 0.0 0.04 0.06 0.42 0.45 0.69 0.49 0.45 0.14 0.63 0.58 0.71 0.45 0.23 1.0
AMTR_s00025p00245040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.387)
0.64 0.04 0.0 0.02 0.27 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.51 0.46 1.0 0.68 0.27 0.15 0.8 0.63 0.89 0.37 0.22 0.99
AMTR_s00026p00153500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.77)
0.54 1.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.18 0.32 0.2 0.51 0.88 0.92 0.43 0.28 0.36 0.59 0.73 0.88 0.81 0.48 0.4 0.95
AMTR_s00030p00245020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.222)
1.0 0.0 0.38 0.05 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.41 0.45 0.27 0.14 0.1 0.27 0.43 0.28 0.28 0.31 0.31 0.82
AMTR_s00037p00085580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.30)
0.39 0.22 0.26 0.44 0.47 0.0 0.09 0.07 0.08 0.08 0.4 0.48 0.41 0.42 0.28 1.0 0.3 0.54 0.59 0.42 0.3 0.52
AMTR_s00039p00189000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.151)
0.71 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.08 0.12 0.08 0.57 0.56 0.62 0.1 0.12 0.0 0.25 0.64 0.36 0.03 0.01 1.0
0.03 0.05 0.02 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.51 0.49 0.84 0.57 0.85 0.45 0.43 0.33 0.39 0.8 0.03 1.0
AMTR_s00047p00144880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.65)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.24 0.07 0.01 0.02 0.32 0.23 0.21 0.21 0.04 0.37 1.0
AMTR_s00050p00223310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.89)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0
AMTR_s00051p00212980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.95)
0.67 0.31 0.28 0.04 0.23 0.18 0.05 0.0 0.04 0.04 0.48 0.44 0.68 0.25 0.22 0.6 0.42 0.43 0.47 0.53 0.31 1.0
AMTR_s00052p00111370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.36)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.05 0.06 0.31 0.22 0.38 0.2 0.16 0.03 0.11 0.23 0.28 0.18 0.12 1.0
AMTR_s00056p00162910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.142)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.65 0.33 0.19 0.24 0.99
AMTR_s00056p00215980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.208)
0.89 0.71 0.75 0.15 0.1 0.01 0.16 0.0 0.06 0.06 0.44 0.32 0.36 0.32 0.25 0.08 0.8 0.19 0.32 1.0 0.08 0.69
AMTR_s00059p00086700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.62)
0.18 0.24 0.04 0.0 0.07 0.01 0.06 0.04 0.06 0.07 0.72 0.59 0.22 0.2 0.09 0.36 0.54 0.62 0.25 0.17 0.31 1.0
AMTR_s00059p00182270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.196)
0.5 0.58 0.51 0.3 0.04 0.01 0.0 0.06 0.05 0.09 0.45 0.4 0.32 0.06 0.08 0.05 0.88 0.55 0.38 1.0 0.32 0.61
AMTR_s00061p00142810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.124)
0.19 0.49 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.29 0.51 0.25 0.21 0.51 0.43 0.41 0.23 0.13 0.55 1.0
AMTR_s00063p00116400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.25)
0.14 0.15 0.0 0.0 0.06 0.09 0.12 0.02 0.09 0.09 0.18 0.2 0.5 0.1 0.12 0.22 0.19 0.57 0.42 0.44 0.08 1.0
AMTR_s00066p00159430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.167)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.13 0.36 0.23 0.13 0.64 0.31 0.6 0.67 1.0 0.29 0.94
0.2 0.05 0.2 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.1 0.02 0.0 1.0 0.18 0.24 0.18 0.17 0.19 0.89
AMTR_s00068p00168490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.121)
0.47 0.52 1.0 0.15 0.26 0.26 0.36 0.17 0.33 0.3 0.57 0.45 0.45 0.45 0.63 0.59 0.77 0.43 0.52 0.94 0.38 0.61
AMTR_s00069p00114060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.77)
0.4 0.17 0.29 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.31 0.42 0.35 0.12 0.15 0.54 0.32 0.8 0.65 0.29 0.35 1.0
AMTR_s00071p00092570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.68)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.1 0.07 0.07 1.0 0.06 0.2 0.68 0.23 0.23 0.7
AMTR_s00071p00149400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.134)
0.0 0.0 0.89 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.22 0.38 0.02 0.01 0.47 0.67 0.33 0.22 0.18 0.23 1.0
AMTR_s00078p00074610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.45)
0.09 0.13 0.08 0.4 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.24 0.41 0.51 0.39 1.0 0.08 0.33 0.74 0.42 0.4 0.83
AMTR_s00078p00081800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.55)
0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.23 0.08 0.04 0.03 1.0 0.04 0.09 0.06 0.04 0.17 0.27
AMTR_s00078p00102770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.73)
1.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.11 0.11 0.42 0.61 0.29 0.06 0.05 0.02 0.51 0.29 0.22 0.09 0.18 0.66
AMTR_s00080p00087770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.30)
0.07 0.0 0.0 0.01 0.34 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.94 0.78 0.33 0.13 0.42 0.85 0.81 0.69 0.52 0.28 0.46 1.0
AMTR_s00088p00040490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.19)
0.15 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.4 0.51 0.07 0.06 0.64 0.3 0.96 0.44 0.18 0.14 1.0
AMTR_s00088p00059310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.34)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0
AMTR_s00089p00181240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.109)
0.26 0.43 0.25 0.02 0.05 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.49 0.55 0.63 0.43 0.35 0.57 0.55 0.51 0.56 0.77 0.07 1.0
AMTR_s00091p00088260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00091.34)
0.41 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.1 0.07 0.54 0.37 0.64 0.37 0.14 0.83 0.48 0.62 0.85 0.49 0.15 1.0
AMTR_s00101p00028030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.14 0.38 0.09 0.92 0.03 0.48 0.76 0.46 0.23 1.0
AMTR_s00110p00127330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.102)
0.0 0.28 0.06 0.18 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.34 0.14 0.14 0.18 1.0 0.16 0.28 0.21 0.03 0.2 0.22
AMTR_s00117p00091810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.33)
0.44 0.37 0.41 0.0 0.27 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.52 0.41 0.29 0.16 0.3 0.43 0.62 0.59 0.68 0.3 1.0
AMTR_s00117p00092890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.34)
0.18 0.24 0.99 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.6 0.25 0.23 0.12 0.33 0.71 0.49 0.46 0.64 0.6 1.0
AMTR_s00119p00058870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.39)
0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.24 0.38 0.06 0.01 0.01 0.21 0.7 0.37 0.06 0.01 1.0
AMTR_s00120p00119730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.59)
0.39 0.14 0.16 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.74 0.59 0.42 0.26 0.25 0.3 0.55 0.56 0.6 0.24 1.0
AMTR_s00124p00089000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00124.14)
0.02 0.19 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.1 0.43 0.18 0.19 0.09 0.35 1.0 0.56 0.55 0.62 0.48
AMTR_s00130p00100230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.47)
0.18 0.21 0.25 0.09 0.23 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.76 0.96 0.23 0.3 0.27 0.19 0.73 0.7 0.49 0.21 0.63 1.0
AMTR_s00146p00105370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.66)
0.43 0.32 0.15 0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.59 0.57 0.39 0.43 0.51 0.5 0.45 0.36 0.53 0.29 1.0
AMTR_s00149p00052800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.32)
0.14 0.09 0.28 0.0 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.45 0.47 0.58 0.45 0.29 0.62 0.28 0.26 0.28 0.28 1.0
AMTR_s00149p00074240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.53)
0.29 0.21 1.0 0.07 0.15 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.57 0.55 0.52 0.4 0.24 0.95 0.47 0.5 0.58 0.47 0.69 0.96
AMTR_s00153p00021590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00153.6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.33 0.02 0.0 0.01 0.02 0.51 0.02 0.94 1.0
AMTR_s00153p00022310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00153.7)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.31 0.0 0.0 0.0 0.05 0.56 0.02 0.32 1.0
AMTR_s00155p00059880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.32)
0.15 0.11 0.0 0.08 0.11 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.41 0.47 0.69 0.37 0.19 0.1 0.56 0.61 0.63 0.39 0.16 1.0
AMTR_s00159p00033510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00159.10)
0.28 0.32 0.03 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.09 0.05 0.27 0.34 0.23 0.05 0.28 0.01 0.28 0.68 0.23 0.03 0.02 1.0
AMTR_s00172p00029290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00172.4)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.18 0.24 0.42 0.01 0.04 0.11 0.34 0.42 0.11 0.98 1.0 0.58
AMTR_s00183p00047260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00183.23)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.2 0.0 0.09 0.14 0.21 0.55 0.44 0.16 0.1 0.06 0.53 0.48 0.66 1.0 0.29 0.63
AMTR_s00213p00016120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00213.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.39 0.04 0.05 0.11 0.73 0.43 0.63 1.0 0.43 0.71
AMTR_s00814p00012490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00814.1)
0.05 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.26 0.51 0.03 0.1 0.2 0.06 0.86 0.51 0.04 0.06 1.0
AMTR_s02697p00003610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02697.1)
0.04 0.0 0.0 0.05 0.33 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.59 0.7 0.6 0.61 0.67 1.0 0.57 0.32 0.35 0.58 0.0 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)