Heatmap: Cluster_229 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
18.61 10.27 21.46 0.32 0.4 0.29 8.63 7.68 7.42 6.07 6.27 9.34 26.34 19.77 5.13 4.41 4.19 7.06 18.04 6.82 3.88 2.57 3.56 2.22 17.82 3.1 7.97 4.33 3.57 1.51 2.3 1.77 2.33 2.29 2.22 4.02 2.97 3.15 2.64 1.4 0.59 0.97 0.76 4.02 8.26 7.17 3.29 6.08 20.22
7.35 22.15 14.03 0.25 0.37 11.03 5.07 5.26 1.13 0.14 0.71 0.33 0.02 0.15 0.0 0.0 0.11 0.03 0.34 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.26 0.03 0.04 0.0 0.05
16.51 30.42 18.92 3.22 0.46 2.87 13.13 16.47 0.24 2.45 10.53 0.0 11.34 23.73 0.0 0.0 25.04 20.21 0.0 2.02 0.54 0.0 0.09 0.0 5.84 0.0 0.0 0.8 0.0 1.52 0.99 1.41 0.0 0.0 1.23 3.26 2.81 1.05 0.32 1.05 0.47 0.7 0.48 5.7 0.0 0.0 5.84 2.08 7.67
1.26 2.01 3.02 0.07 0.0 0.03 1.02 0.68 0.13 0.21 0.48 0.0 0.24 0.22 0.0 0.0 0.69 0.14 0.0 0.42 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.15 0.19 0.41 0.67 1.13
15.3 8.19 15.22 1.92 0.64 0.73 5.27 4.95 1.97 1.59 3.35 0.48 0.33 1.05 0.09 2.7 1.64 0.16 1.28 0.52 0.24 0.35 0.36 0.15 0.0 0.59 0.73 0.08 0.14 0.17 0.1 0.29 0.24 0.03 0.25 0.53 0.26 0.25 0.3 0.02 0.05 0.07 0.1 0.32 0.4 0.3 0.13 0.15 0.25
19.08 16.12 44.05 23.45 2.66 10.26 44.59 34.9 11.41 13.94 22.67 21.38 20.51 18.74 4.65 4.18 40.19 21.52 11.76 5.36 1.15 1.09 1.09 0.88 0.96 2.53 5.95 1.08 1.13 0.45 1.02 0.7 1.09 0.92 1.23 1.45 0.79 1.0 0.95 0.89 1.41 0.92 1.9 12.98 6.37 12.17 70.62 131.96 165.36
21.14 86.9 34.26 0.01 0.13 2.91 2.45 0.59 8.73 1.97 8.19 0.46 3.35 4.81 0.0 0.0 5.21 6.26 5.13 0.03 0.14 0.23 0.18 0.18 0.24 0.0 0.0 0.22 0.18 0.31 0.32 0.11 0.13 0.06 0.23 0.26 0.2 0.31 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.46 4.09 11.84 0.86 0.0
4.67 4.32 16.29 0.54 0.98 1.8 5.42 3.79 1.82 1.62 2.28 2.09 3.0 2.91 0.47 1.0 6.26 1.19 7.41 0.97 0.16 0.23 0.16 0.24 0.41 0.31 0.25 0.12 0.06 0.14 0.13 0.08 0.11 0.21 0.12 0.17 0.28 0.25 0.41 0.05 0.11 0.01 0.1 0.94 0.07 0.12 4.87 3.74 7.41
21.66 25.79 57.22 6.54 0.18 18.67 10.22 12.22 7.25 3.29 6.27 0.71 8.58 6.47 0.48 0.0 23.28 7.98 12.64 0.97 0.64 0.33 0.33 0.35 0.53 2.28 2.91 0.51 0.21 0.52 1.7 1.19 1.75 0.0 0.23 0.44 0.68 0.0 0.63 0.04 0.13 0.22 0.03 0.36 1.08 2.63 9.48 14.66 23.02
259.99 254.01 638.82 90.5 45.9 596.72 136.76 147.17 148.0 156.25 166.42 107.42 85.54 84.99 14.39 14.17 335.52 72.8 62.04 33.92 5.38 4.36 3.89 4.81 64.51 28.99 37.02 5.66 3.22 3.75 3.02 5.68 4.01 4.07 4.1 6.64 4.22 5.93 5.0 3.95 5.14 5.26 6.44 59.45 52.69 32.63 101.37 106.88 64.02
0.49 0.77 1.15 0.12 0.0 0.51 0.61 0.42 0.06 0.16 0.25 0.51 0.33 0.16 0.14 0.09 1.03 0.34 0.15 0.47 0.1 0.07 0.1 0.03 0.1 0.05 0.07 0.07 0.11 0.13 0.03 0.29 0.18 0.03 0.15 0.1 0.14 0.1 0.02 0.1 0.12 0.13 0.18 0.64 0.1 0.11 0.33 0.2 0.09
3.34 1.56 2.54 0.27 0.17 3.83 1.09 0.73 0.61 0.58 0.55 0.2 0.03 0.15 0.04 0.0 4.27 0.5 0.0 0.19 0.03 0.05 0.03 0.02 0.99 0.04 0.43 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 0.07 0.0 0.1 0.0 0.04 0.04 0.06 0.07 0.02 0.01 0.39 0.41 0.28 0.12 0.14 0.03
4.96 4.14 7.46 0.05 0.22 4.15 3.76 2.78 2.88 1.81 2.24 0.49 0.26 1.08 0.12 0.83 4.88 0.23 0.88 0.28 0.11 0.07 0.13 0.02 0.0 0.7 0.13 0.1 0.12 0.25 0.12 0.2 0.15 0.3 0.04 0.23 0.05 0.05 0.09 0.04 0.19 0.08 0.24 0.14 0.36 0.07 0.01 0.02 0.07
12.97 31.21 41.93 1.52 0.6 35.97 18.02 15.71 0.64 27.89 12.61 0.2 6.37 7.54 0.22 0.11 29.74 3.81 0.0 2.89 0.63 0.03 0.65 0.02 1.12 0.51 0.53 0.92 0.57 0.51 0.63 1.18 0.54 0.64 0.74 0.81 0.52 0.77 0.72 0.91 1.06 0.98 1.44 9.75 0.48 0.43 7.38 2.5 4.68
28.21 106.98 53.39 0.0 0.09 0.34 15.26 15.46 60.42 6.69 27.23 1.18 33.41 44.35 2.05 0.74 43.87 61.72 58.05 0.77 0.29 0.45 0.33 0.3 5.51 0.34 0.71 0.13 0.2 0.37 0.39 0.58 0.53 0.0 0.08 0.53 0.27 0.28 0.43 0.0 0.01 0.01 0.0 15.67 13.09 29.63 97.04 74.62 33.9
18.67 7.8 15.1 2.81 2.63 4.39 12.4 10.03 4.04 6.85 6.62 5.4 8.51 7.25 8.05 7.0 11.92 5.01 11.54 8.61 2.09 0.65 1.95 1.69 5.19 3.3 4.15 1.86 1.22 1.58 0.93 1.71 1.64 0.99 2.07 2.04 1.68 2.39 2.99 2.07 3.64 2.32 3.78 9.83 7.8 6.52 6.19 6.78 12.05
4.93 6.98 4.58 0.05 0.0 0.15 3.48 2.46 6.92 0.75 1.71 0.91 1.1 1.9 0.04 0.0 15.63 0.89 4.68 0.7 0.22 0.03 0.19 0.16 0.32 0.07 0.0 0.18 0.1 0.14 0.21 0.08 0.19 0.03 0.1 0.2 0.1 0.16 0.15 0.19 0.2 0.38 0.35 2.79 1.78 2.68 2.57 1.91 2.71
10.7 2.91 8.88 0.28 0.06 4.76 1.24 0.85 3.8 0.24 1.27 0.63 0.82 1.06 0.09 0.09 21.08 0.51 3.92 0.15 0.23 0.18 0.24 0.16 0.4 0.02 0.09 0.49 0.19 0.3 0.31 0.29 0.18 0.12 0.1 0.27 0.21 0.19 0.12 0.18 0.32 0.33 0.51 0.38 0.4 1.25 3.17 2.01 5.65
3.0 0.89 2.4 0.0 0.0 0.02 0.15 0.22 0.4 0.0 0.39 0.14 0.2 0.24 0.0 0.0 3.21 0.16 0.64 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.21 0.34 1.05
2.78 2.3 3.02 0.48 0.79 0.02 1.12 1.32 0.6 1.64 1.27 0.58 0.27 0.57 0.08 0.04 0.9 0.26 0.5 0.17 0.09 0.01 0.05 0.04 0.04 0.32 0.05 0.09 0.02 0.16 0.07 0.17 0.06 0.02 0.11 0.03 0.12 0.14 0.04 0.06 0.12 0.11 0.14 0.33 0.91 0.31 0.24 0.6 0.36
4.52 4.3 9.73 1.63 0.26 8.82 9.92 9.63 3.64 1.1 1.97 0.34 1.34 4.08 0.04 0.25 4.17 0.53 0.13 0.37 0.04 0.06 0.04 0.05 0.0 0.09 0.07 0.02 0.08 0.0 0.02 0.14 0.08 0.05 0.21 0.02 0.07 0.06 0.13 0.02 0.06 0.06 0.07 0.91 0.06 0.09 0.01 0.06 0.02
0.16 0.54 2.03 0.21 0.06 1.4 0.76 1.03 0.05 0.16 0.2 0.35 0.95 0.78 0.05 0.0 0.36 0.39 0.0 0.33 0.17 0.03 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.18 0.19 0.14 0.38 0.14 0.0 0.08 0.08 0.11 0.05 0.3 0.18 0.13 0.39 0.33 1.14 0.03 0.02 0.06 0.0 0.02
2.6 1.57 2.1 1.08 0.14 1.44 2.28 2.4 0.85 1.08 1.35 0.31 0.91 1.23 0.0 0.0 1.04 0.36 0.0 0.15 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.45 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.06 0.88 0.42 0.82 0.65 1.62 3.27
5.35 8.1 15.09 3.36 0.32 0.58 0.56 0.94 1.14 0.57 2.15 0.0 0.62 0.67 0.0 0.0 2.13 0.75 10.01 0.7 0.0 0.0 0.02 0.0 0.85 0.28 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.22 0.0 0.0 0.0 0.53
2.47 0.57 2.17 1.04 0.56 2.66 1.04 0.78 0.64 0.23 0.66 0.54 0.19 0.3 0.17 0.17 1.28 0.2 1.26 0.09 0.06 0.05 0.06 0.06 0.39 0.04 0.14 0.11 0.02 0.06 0.03 0.17 0.06 0.06 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.03 0.04 0.17 0.23 0.35 0.75 1.01 0.87
6.68 4.76 8.06 5.53 2.17 12.7 3.48 3.37 5.2 3.39 3.39 5.28 2.21 2.67 2.46 1.47 11.92 1.59 3.89 3.15 0.5 0.62 0.49 0.21 1.75 3.02 3.92 0.54 0.57 0.63 0.25 0.71 0.22 0.31 0.52 0.23 0.47 0.5 0.78 0.48 0.69 0.66 0.55 0.91 1.17 0.94 0.19 0.18 0.0
16.08 17.09 15.98 2.76 0.38 1.87 2.62 2.74 2.09 2.85 2.88 0.53 0.72 0.84 1.78 2.26 17.48 0.32 2.19 4.44 1.53 0.04 0.22 0.03 0.25 1.52 1.53 0.89 1.18 0.76 0.74 1.1 0.94 0.85 1.19 1.66 1.22 1.08 2.41 0.4 0.63 0.4 0.7 4.95 0.27 0.28 0.0 0.07 0.19
69.26 85.69 127.35 20.55 12.94 2.96 81.48 76.44 96.87 9.46 8.0 0.13 0.05 0.2 0.28 0.0 210.24 2.13 0.0 0.25 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.08 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0
18.06 14.95 51.88 26.52 16.18 99.02 21.63 24.45 8.5 7.68 8.69 5.02 3.28 13.07 4.87 3.86 59.54 3.73 1.55 5.71 0.48 0.6 0.64 0.61 1.72 4.17 4.43 0.53 0.5 0.59 0.48 0.51 0.42 0.43 0.42 0.27 0.23 0.39 0.5 0.33 0.53 0.45 0.52 3.47 1.49 1.4 2.65 3.55 0.86
3.68 2.41 5.03 1.22 0.19 2.31 3.04 2.8 1.35 1.37 2.27 0.2 0.18 0.39 0.2 0.44 2.52 0.18 1.94 0.54 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.43 0.75 0.04 0.0 0.02 0.01 0.07 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 1.08 0.78 0.37 0.09 0.08 0.22
3.74 2.52 4.7 0.3 0.07 0.07 1.45 1.33 4.91 0.81 0.91 0.73 0.21 0.18 0.0 0.1 3.29 0.39 3.31 0.39 0.11 0.07 0.12 0.03 0.11 0.42 1.08 0.03 0.07 0.03 0.1 0.25 0.0 0.0 0.02 0.11 0.11 0.08 0.13 0.06 0.13 0.06 0.13 0.11 0.25 0.35 0.3 1.05 1.16
19.2 38.21 82.56 0.85 0.55 36.1 39.7 32.53 54.74 21.41 23.11 3.41 13.67 16.63 0.62 2.27 59.23 16.97 8.21 5.03 1.65 0.73 1.66 0.99 2.14 2.4 3.53 2.5 1.33 0.9 0.24 1.29 1.64 1.03 2.67 1.43 0.96 2.52 0.9 0.6 0.98 1.41 1.4 9.56 8.0 10.76 37.43 49.11 36.81
3.89 1.65 5.41 0.08 0.41 14.92 0.31 0.27 1.66 0.06 1.21 0.0 0.77 1.49 0.0 0.0 7.38 1.61 0.0 0.1 0.03 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.21 0.0 0.01 0.0 0.06 0.36 0.45 0.79 0.97 1.09 2.95
3.89 1.65 5.41 0.08 0.41 14.92 0.31 0.27 1.66 0.06 1.21 0.0 0.77 1.49 0.0 0.0 7.38 1.61 0.0 0.1 0.03 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.21 0.0 0.01 0.0 0.06 0.36 0.45 0.79 0.97 1.09 2.95
18.47 34.18 22.09 0.04 0.0 0.48 4.64 3.19 4.5 5.86 13.95 0.18 6.81 11.48 4.21 5.25 13.69 12.87 6.4 3.32 0.17 0.08 0.17 0.25 17.53 1.28 1.75 0.3 0.84 0.37 0.25 0.24 0.15 0.07 0.0 0.27 0.33 0.06 0.09 0.09 0.08 0.11 0.08 16.67 19.24 8.58 15.07 7.09 4.42
1.35 3.47 2.77 0.04 0.0 0.24 1.73 1.94 0.14 0.29 0.41 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 2.98 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.04 1.43 4.94 1.81 0.31 3.23 2.52 2.92 1.78 0.46 0.8 0.14 0.04 0.1 0.03 0.03 4.02 0.08 1.08 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.3 0.2 0.11 0.18 0.24 0.14
1.03 2.22 4.86 0.05 0.0 0.03 0.13 0.25 0.54 0.14 0.2 0.96 1.14 1.14 0.28 0.28 2.74 0.81 3.19 0.08 0.02 0.0 0.02 0.0 0.46 0.05 0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.16 0.21 0.31 1.61 1.3
7.65 9.35 19.15 2.37 0.88 32.88 13.64 13.46 0.2 4.9 6.61 0.01 0.74 6.38 0.03 0.0 7.26 0.97 0.0 0.84 0.2 0.01 0.06 0.01 0.18 0.04 0.05 0.1 0.17 0.15 0.08 0.2 0.14 0.06 0.16 0.11 0.24 0.21 0.13 0.24 0.36 0.29 0.45 2.69 1.97 0.73 0.13 0.02 0.08
14.5 5.37 32.26 2.71 1.69 5.68 23.83 19.57 15.14 11.27 13.57 0.0 17.65 16.71 0.0 0.0 32.81 9.54 20.68 6.2 0.04 2.64 0.02 0.4 3.25 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 9.08 0.0 0.26 30.96 52.93 94.61
1.28 0.84 1.5 0.3 0.01 0.04 0.82 0.64 0.04 0.1 0.26 0.01 0.08 0.0 0.35 0.49 0.43 0.15 0.0 0.4 0.01 0.0 0.03 0.0 0.12 0.55 0.99 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.14 0.62 0.17 0.0 0.0 0.0
26.3 15.72 13.04 12.38 2.78 4.18 5.25 4.97 7.02 3.41 12.46 1.83 2.18 4.41 4.21 5.74 11.25 6.72 16.07 4.69 0.73 0.73 0.68 0.71 18.92 10.66 10.95 0.73 0.4 1.18 1.1 1.35 0.77 0.41 0.66 1.04 0.72 1.07 0.64 1.42 1.52 1.44 1.82 4.87 5.41 4.22 9.1 2.77 7.31
6.31 5.17 2.61 2.05 0.15 0.57 2.94 1.8 0.97 1.43 4.52 0.03 1.49 2.72 1.27 0.77 2.66 4.5 5.38 3.08 0.41 0.4 0.38 0.43 7.3 6.55 3.64 0.72 0.38 0.45 0.38 0.58 0.35 0.24 0.33 0.45 0.31 0.52 0.51 0.23 0.42 0.4 0.46 1.78 1.71 1.56 3.46 1.31 0.63
2.71 1.27 2.93 0.01 0.0 0.04 0.7 0.43 1.02 0.07 0.66 0.36 0.99 1.23 0.28 0.27 6.25 0.19 0.9 0.68 0.02 0.01 0.05 0.03 0.0 0.45 0.33 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.05 0.01 0.07 0.04 0.12 1.68 0.56 0.29 0.11 1.0 4.07
2.14 2.6 2.18 0.17 0.52 0.12 0.49 0.5 2.45 0.69 1.43 0.06 1.42 0.85 0.0 0.0 4.02 0.66 0.55 0.17 0.06 0.05 0.08 0.02 0.36 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.07 0.1 0.09 0.01 0.01 0.01 0.04 0.11 0.08 0.06 0.03 0.11 0.79
21.02 6.5 69.78 0.99 1.2 2.26 24.65 16.76 20.18 3.46 9.19 13.0 32.07 31.79 21.19 22.08 34.22 7.05 51.73 14.11 4.29 5.4 3.9 4.51 7.57 10.61 2.75 4.31 4.11 2.27 1.52 1.18 5.39 3.16 4.98 5.46 4.57 4.69 5.31 5.88 5.54 5.76 5.54 3.93 2.29 7.17 17.55 23.16 69.85
374.64 128.54 445.65 8.62 2.54 291.75 43.5 27.92 144.11 38.52 107.01 0.92 41.54 94.96 3.31 4.09 342.78 61.95 358.99 6.02 0.26 0.17 0.24 0.33 10.39 5.33 7.53 0.57 0.11 0.21 0.31 0.32 0.0 0.13 0.45 0.33 0.16 0.26 0.26 0.06 0.09 0.08 0.13 11.35 23.84 118.56 44.47 72.72 257.76
4.67 5.23 8.48 3.2 0.32 7.01 4.79 4.08 4.38 1.03 2.28 0.04 0.15 1.04 1.05 1.0 3.47 1.12 0.99 1.34 0.04 0.1 0.07 0.08 0.75 1.75 1.85 0.04 0.05 0.0 0.0 0.04 0.07 0.09 0.13 0.2 0.0 0.14 0.14 0.04 0.09 0.02 0.16 0.36 0.13 0.14 0.03 0.17 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)