Heatmap: Cluster_229 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.71 0.39 0.81 0.01 0.02 0.01 0.33 0.29 0.28 0.23 0.24 0.35 1.0 0.75 0.19 0.17 0.16 0.27 0.68 0.26 0.15 0.1 0.14 0.08 0.68 0.12 0.3 0.16 0.14 0.06 0.09 0.07 0.09 0.09 0.08 0.15 0.11 0.12 0.1 0.05 0.02 0.04 0.03 0.15 0.31 0.27 0.12 0.23 0.77
0.33 1.0 0.63 0.01 0.02 0.5 0.23 0.24 0.05 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 1.0 0.62 0.11 0.02 0.09 0.43 0.54 0.01 0.08 0.35 0.0 0.37 0.78 0.0 0.0 0.82 0.66 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.05 0.0 0.0 0.04 0.11 0.09 0.03 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.19 0.0 0.0 0.19 0.07 0.25
0.42 0.67 1.0 0.02 0.0 0.01 0.34 0.22 0.04 0.07 0.16 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.23 0.05 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.06 0.14 0.22 0.37
1.0 0.54 0.99 0.13 0.04 0.05 0.34 0.32 0.13 0.1 0.22 0.03 0.02 0.07 0.01 0.18 0.11 0.01 0.08 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.04 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02
0.12 0.1 0.27 0.14 0.02 0.06 0.27 0.21 0.07 0.08 0.14 0.13 0.12 0.11 0.03 0.03 0.24 0.13 0.07 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.04 0.07 0.43 0.8 1.0
0.24 1.0 0.39 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.1 0.02 0.09 0.01 0.04 0.06 0.0 0.0 0.06 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.14 0.01 0.0
0.29 0.27 1.0 0.03 0.06 0.11 0.33 0.23 0.11 0.1 0.14 0.13 0.18 0.18 0.03 0.06 0.38 0.07 0.45 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 0.3 0.23 0.46
0.38 0.45 1.0 0.11 0.0 0.33 0.18 0.21 0.13 0.06 0.11 0.01 0.15 0.11 0.01 0.0 0.41 0.14 0.22 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.05 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.17 0.26 0.4
0.41 0.4 1.0 0.14 0.07 0.93 0.21 0.23 0.23 0.24 0.26 0.17 0.13 0.13 0.02 0.02 0.53 0.11 0.1 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.1 0.05 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.08 0.05 0.16 0.17 0.1
0.43 0.67 1.0 0.11 0.0 0.44 0.53 0.36 0.05 0.14 0.22 0.45 0.28 0.14 0.12 0.08 0.9 0.29 0.13 0.41 0.09 0.06 0.09 0.02 0.08 0.05 0.06 0.06 0.1 0.11 0.03 0.25 0.15 0.02 0.13 0.09 0.13 0.09 0.02 0.09 0.1 0.12 0.15 0.56 0.09 0.1 0.29 0.18 0.08
0.78 0.37 0.59 0.06 0.04 0.9 0.25 0.17 0.14 0.14 0.13 0.05 0.01 0.03 0.01 0.0 1.0 0.12 0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.23 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.09 0.09 0.07 0.03 0.03 0.01
0.67 0.55 1.0 0.01 0.03 0.56 0.5 0.37 0.39 0.24 0.3 0.07 0.04 0.14 0.02 0.11 0.65 0.03 0.12 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.09 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01
0.31 0.74 1.0 0.04 0.01 0.86 0.43 0.37 0.02 0.67 0.3 0.0 0.15 0.18 0.01 0.0 0.71 0.09 0.0 0.07 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.23 0.01 0.01 0.18 0.06 0.11
0.26 1.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.56 0.06 0.25 0.01 0.31 0.41 0.02 0.01 0.41 0.58 0.54 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.12 0.28 0.91 0.7 0.32
1.0 0.42 0.81 0.15 0.14 0.24 0.66 0.54 0.22 0.37 0.35 0.29 0.46 0.39 0.43 0.37 0.64 0.27 0.62 0.46 0.11 0.03 0.1 0.09 0.28 0.18 0.22 0.1 0.07 0.08 0.05 0.09 0.09 0.05 0.11 0.11 0.09 0.13 0.16 0.11 0.19 0.12 0.2 0.53 0.42 0.35 0.33 0.36 0.65
0.32 0.45 0.29 0.0 0.0 0.01 0.22 0.16 0.44 0.05 0.11 0.06 0.07 0.12 0.0 0.0 1.0 0.06 0.3 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.18 0.11 0.17 0.16 0.12 0.17
0.51 0.14 0.42 0.01 0.0 0.23 0.06 0.04 0.18 0.01 0.06 0.03 0.04 0.05 0.0 0.0 1.0 0.02 0.19 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 0.15 0.1 0.27
0.93 0.28 0.75 0.0 0.0 0.01 0.05 0.07 0.12 0.0 0.12 0.04 0.06 0.08 0.0 0.0 1.0 0.05 0.2 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.07 0.11 0.33
0.92 0.76 1.0 0.16 0.26 0.01 0.37 0.44 0.2 0.54 0.42 0.19 0.09 0.19 0.03 0.01 0.3 0.09 0.17 0.06 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.1 0.02 0.03 0.01 0.05 0.02 0.05 0.02 0.01 0.03 0.01 0.04 0.05 0.01 0.02 0.04 0.03 0.05 0.11 0.3 0.1 0.08 0.2 0.12
0.46 0.43 0.98 0.16 0.03 0.89 1.0 0.97 0.37 0.11 0.2 0.03 0.13 0.41 0.0 0.02 0.42 0.05 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.08 0.26 1.0 0.1 0.03 0.69 0.37 0.51 0.02 0.08 0.1 0.17 0.47 0.38 0.02 0.0 0.18 0.19 0.0 0.16 0.09 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.09 0.07 0.19 0.07 0.0 0.04 0.04 0.05 0.03 0.15 0.09 0.07 0.19 0.16 0.56 0.02 0.01 0.03 0.0 0.01
0.79 0.48 0.64 0.33 0.04 0.44 0.7 0.73 0.26 0.33 0.41 0.1 0.28 0.37 0.0 0.0 0.32 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.14 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.27 0.13 0.25 0.2 0.5 1.0
0.35 0.54 1.0 0.22 0.02 0.04 0.04 0.06 0.08 0.04 0.14 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.14 0.05 0.66 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
0.93 0.21 0.82 0.39 0.21 1.0 0.39 0.29 0.24 0.09 0.25 0.2 0.07 0.11 0.06 0.06 0.48 0.07 0.47 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.15 0.01 0.05 0.04 0.01 0.02 0.01 0.06 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.07 0.09 0.13 0.28 0.38 0.33
0.53 0.37 0.63 0.44 0.17 1.0 0.27 0.27 0.41 0.27 0.27 0.42 0.17 0.21 0.19 0.12 0.94 0.13 0.31 0.25 0.04 0.05 0.04 0.02 0.14 0.24 0.31 0.04 0.04 0.05 0.02 0.06 0.02 0.02 0.04 0.02 0.04 0.04 0.06 0.04 0.05 0.05 0.04 0.07 0.09 0.07 0.01 0.01 0.0
0.92 0.98 0.91 0.16 0.02 0.11 0.15 0.16 0.12 0.16 0.16 0.03 0.04 0.05 0.1 0.13 1.0 0.02 0.13 0.25 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.09 0.09 0.05 0.07 0.04 0.04 0.06 0.05 0.05 0.07 0.1 0.07 0.06 0.14 0.02 0.04 0.02 0.04 0.28 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01
0.33 0.41 0.61 0.1 0.06 0.01 0.39 0.36 0.46 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.15 0.52 0.27 0.16 1.0 0.22 0.25 0.09 0.08 0.09 0.05 0.03 0.13 0.05 0.04 0.6 0.04 0.02 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.03 0.04 0.01
0.73 0.48 1.0 0.24 0.04 0.46 0.6 0.56 0.27 0.27 0.45 0.04 0.04 0.08 0.04 0.09 0.5 0.04 0.38 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.15 0.07 0.02 0.02 0.04
0.76 0.51 0.96 0.06 0.01 0.01 0.3 0.27 1.0 0.16 0.19 0.15 0.04 0.04 0.0 0.02 0.67 0.08 0.67 0.08 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.09 0.22 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.05 0.07 0.06 0.21 0.24
0.23 0.46 1.0 0.01 0.01 0.44 0.48 0.39 0.66 0.26 0.28 0.04 0.17 0.2 0.01 0.03 0.72 0.21 0.1 0.06 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.04 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.12 0.1 0.13 0.45 0.59 0.45
0.26 0.11 0.36 0.01 0.03 1.0 0.02 0.02 0.11 0.0 0.08 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.49 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.06 0.07 0.2
0.26 0.11 0.36 0.01 0.03 1.0 0.02 0.02 0.11 0.0 0.08 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.49 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.06 0.07 0.2
0.54 1.0 0.65 0.0 0.0 0.01 0.14 0.09 0.13 0.17 0.41 0.01 0.2 0.34 0.12 0.15 0.4 0.38 0.19 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.51 0.04 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.56 0.25 0.44 0.21 0.13
0.39 1.0 0.8 0.01 0.0 0.07 0.5 0.56 0.04 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.29 1.0 0.37 0.06 0.65 0.51 0.59 0.36 0.09 0.16 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.81 0.02 0.22 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.04 0.02 0.04 0.05 0.03
0.21 0.46 1.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.05 0.11 0.03 0.04 0.2 0.23 0.23 0.06 0.06 0.56 0.17 0.66 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.06 0.33 0.27
0.23 0.28 0.58 0.07 0.03 1.0 0.41 0.41 0.01 0.15 0.2 0.0 0.02 0.19 0.0 0.0 0.22 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0
0.15 0.06 0.34 0.03 0.02 0.06 0.25 0.21 0.16 0.12 0.14 0.0 0.19 0.18 0.0 0.0 0.35 0.1 0.22 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.33 0.56 1.0
0.85 0.56 1.0 0.2 0.0 0.03 0.54 0.43 0.03 0.07 0.17 0.01 0.05 0.0 0.23 0.33 0.29 0.1 0.0 0.26 0.01 0.0 0.02 0.0 0.08 0.37 0.66 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.09 0.42 0.11 0.0 0.0 0.0
1.0 0.6 0.5 0.47 0.11 0.16 0.2 0.19 0.27 0.13 0.47 0.07 0.08 0.17 0.16 0.22 0.43 0.26 0.61 0.18 0.03 0.03 0.03 0.03 0.72 0.41 0.42 0.03 0.02 0.04 0.04 0.05 0.03 0.02 0.02 0.04 0.03 0.04 0.02 0.05 0.06 0.05 0.07 0.19 0.21 0.16 0.35 0.11 0.28
0.86 0.71 0.36 0.28 0.02 0.08 0.4 0.25 0.13 0.2 0.62 0.0 0.2 0.37 0.17 0.11 0.37 0.62 0.74 0.42 0.06 0.05 0.05 0.06 1.0 0.9 0.5 0.1 0.05 0.06 0.05 0.08 0.05 0.03 0.04 0.06 0.04 0.07 0.07 0.03 0.06 0.05 0.06 0.24 0.23 0.21 0.47 0.18 0.09
0.43 0.2 0.47 0.0 0.0 0.01 0.11 0.07 0.16 0.01 0.11 0.06 0.16 0.2 0.04 0.04 1.0 0.03 0.14 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.27 0.09 0.05 0.02 0.16 0.65
0.53 0.65 0.54 0.04 0.13 0.03 0.12 0.12 0.61 0.17 0.36 0.01 0.35 0.21 0.0 0.0 1.0 0.16 0.14 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.2
0.3 0.09 1.0 0.01 0.02 0.03 0.35 0.24 0.29 0.05 0.13 0.19 0.46 0.46 0.3 0.32 0.49 0.1 0.74 0.2 0.06 0.08 0.06 0.06 0.11 0.15 0.04 0.06 0.06 0.03 0.02 0.02 0.08 0.05 0.07 0.08 0.07 0.07 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.06 0.03 0.1 0.25 0.33 1.0
0.84 0.29 1.0 0.02 0.01 0.65 0.1 0.06 0.32 0.09 0.24 0.0 0.09 0.21 0.01 0.01 0.77 0.14 0.81 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.27 0.1 0.16 0.58
0.55 0.62 1.0 0.38 0.04 0.83 0.56 0.48 0.52 0.12 0.27 0.0 0.02 0.12 0.12 0.12 0.41 0.13 0.12 0.16 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.21 0.22 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)