Heatmap: Cluster_236 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
LOC_Os01g21830.1	2.14	4.99	2.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g28850.1	2.61	4.06	2.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g32740.1	-	4.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g36470.1	2.35	4.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.02	-	-	-	-	-	-	1.21	-	-	-	-	-	-	-	3.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g36880.1	2.8	5.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g52420.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g59370.1	0.13	3.73	3.76	1.87	-	-	-	-	-0.71	-	-1.79	-5.24	-	-	-	-	-3.02	0.06	-	0.93	-	-2.39	0.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.25	-	-	-	-	-	0.6	-	-	-	-0.33	-	-	-	-
LOC_Os02g15840.1	3.13	5.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os02g20900.1	0.76	5.46	-	-	-	-	-	-	-	-	1.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os02g42400.1	-0.11	4.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.18	0.92	-	-	4.53	-	-
LOC_Os03g06690.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g16560.1	0.93	4.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.06	-	-	4.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g22910.1	1.93	5.0	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g25945.1	1.87	5.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g56170.1	-	5.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.98	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g01270.1	2.55	4.17	-	-	-	-	-	-	3.01	-	-0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.15	0.58	-	-	1.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.28	2.74	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g07910.1	-	4.61	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g25840.1	0.9	-	-	-	-	-	1.5	-	2.99	-	-3.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	-	-	-	-	-	-	-	1.37	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g30710.1	-0.18	2.15	-2.65	-1.3	-12.12	-0.07	-2.13	-3.47	-0.06	-	-1.63	0.41	-	3.45	-	-	-0.05	-1.86	-	0.54	-0.06	-0.15	0.22	-1.24	-	0.44	-0.74	-1.56	-4.11	1.29	0.24	2.46	-	-	0.54	0.66	-	1.0	-	-1.02	0.27	0.82	-0.05	-4.31	-	-	-16.9	0.24	-8.99
LOC_Os05g30650.1	-	4.4	-	-	-	-	1.82	-	-	-	0.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.13	-	-	-	-	-
LOC_Os06g13510.1	-	3.96	-	-	-	-	-	0.95	-	-	-	3.3	3.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.41	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g18164.1	0.69	0.34	0.87	-2.89	-1.76	0.8	-3.19	-2.49	0.55	-5.11	-0.95	0.07	-1.73	2.11	-2.74	-0.96	-3.12	0.15	-0.54	0.39	-0.3	-0.9	-0.15	-0.96	-0.51	0.94	1.45	0.19	-0.18	-0.29	-0.66	1.35	-0.26	-	0.18	-0.62	-1.62	0.33	0.21	-0.87	-0.27	-0.17	0.35	-2.3	1.64	1.34	-2.36	-0.7	-0.8
LOC_Os06g46640.1	2.41	2.16	-	-	-	-	-	-	4.56	-	-1.66	3.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g09160.1	2.83	5.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g14500.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g29020.1	-2.9	3.58	0.95	-	-	-	-0.79	-	0.66	-	-	-	-	-	-	-	-1.41	-	-	-	-	1.06	-1.81	1.15	-	-	0.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.85	-	2.89	-	-1.19	-	0.31	-	-4.6	-	1.25	-	-
LOC_Os07g30260.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g30494.1	-	-	5.26	-	-	-	-	-	-	-	3.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g32970.1	3.48	5.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g35950.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g07030.1	-	5.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g12320.1	1.71	4.96	0.45	3.41	-	-	-	-	-	-	0.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g15770.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g18740.1	-3.78	2.06	1.55	-4.58	0.55	0.32	-	-	0.44	-	-1.97	-3.09	-	3.94	-	-0.76	-4.76	-1.6	-	-2.74	-0.46	0.69	0.02	-5.28	0.58	-	-	0.65	-0.42	-	1.14	1.79	-	-	1.07	-	0.06	-0.46	-	-0.29	-0.84	0.37	0.41	-7.18	-2.89	-	-	-	-
LOC_Os08g18750.1	-5.06	0.66	-1.34	-6.29	-	0.27	-	-14.47	-22.46	-	-4.96	-	-	4.44	-	-	-	-6.36	-	-1.86	0.89	-3.65	-0.49	-3.47	0.16	-	-	1.02	0.38	0.14	0.22	2.0	1.86	-1.58	-24.03	1.2	1.29	-	-	-2.44	-4.84	-0.55	-0.47	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g18810.1	-1.21	4.27	-1.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-22.41	4.71	-	-	-	-	-	-	1.05	-11.93	-1.17	-2.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-26.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g23189.1	3.61	4.79	-	-	-	-	-	-	3.09	-	-0.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g35640.1	2.28	5.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g43100.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g13020.1	-	4.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.81	-	-	0.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g15040.1	1.23	5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g16410.1	-	5.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.31	-	-	-	-0.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.68	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g21590.1	3.56	5.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g24400.1	-3.12	-0.37	-3.03	-	-	0.44	-	-2.76	1.39	-3.11	-2.8	-2.66	-	2.96	-	-	-4.32	-3.59	-	-3.4	0.88	0.53	0.46	-1.72	-	-1.82	-	-	0.57	-0.53	2.09	2.68	2.15	0.81	0.69	-	1.2	0.79	-0.01	-0.76	0.29	-0.18	0.42	-1.75	-	-	-2.52	-	-
LOC_Os09g25530.1	3.02	5.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g29640.1	-0.19	5.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.87	-	-	-	-	-	-	-	-	1.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g04460.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g04870.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g06620.1	-	5.15	-	-	-	-	-	-	-	3.38	1.02	-	-	-	-	-	-	0.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g07584.1	-0.72	4.42	-0.11	-	-	1.23	-	-	-	-	-	0.44	-	3.42	-	-	-	-	-	-	-1.41	-1.37	-2.39	-0.38	-	1.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.57	-	-1.68	-	-	-	-2.24	-	-	-	-	-
LOC_Os10g08520.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g10010.1	-0.3	4.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	0.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g20910.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g22184.1	-	5.07	-	-	-	-	-	-	3.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g02500.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g08420.1	2.4	4.93	-	-	-	-	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g17270.1	-0.01	0.36	-	-1.65	-2.73	-2.35	-2.91	-0.71	-	-1.89	-2.59	-3.24	1.67	3.11	-	-2.65	-1.01	-0.49	-	-0.24	0.53	-1.32	0.46	-1.87	-	-2.39	-2.97	0.12	-	1.03	0.4	1.66	0.12	-0.98	1.69	0.81	-0.83	0.95	1.02	-0.97	-0.84	-0.22	-0.45	-2.82	-1.18	-0.41	-0.56	1.23	0.25
LOC_Os11g17280.1	-2.87	0.67	-2.53	-5.27	-	1.59	-	-3.2	-0.92	-	-2.27	-3.41	-	4.46	-	-	-	-1.87	-	-2.01	-1.28	1.6	0.51	-1.65	-	0.23	-0.59	-0.16	0.52	-	-0.64	2.34	-1.08	-	1.55	-1.25	-	-	-3.12	-4.18	-3.01	-0.13	-2.34	-1.49	-	-	-	-	-
LOC_Os11g42180.1	0.53	4.73	0.56	-	-	-	-	-	2.32	-	-3.16	-	-	-	-	-	-0.54	-1.26	-	-	-1.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.43	-	-	-	-	-	-	-	-	0.64	-	-	-0.95	-	-	-	-	-
LOC_Os12g02560.1	-	5.05	-	-	-	-	-	-	-	-	0.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g11530.1	-	4.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g12980.1	3.37	5.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g14270.1	-4.05	4.41	-1.49	-	-	-	-	-1.99	-	-	-	-	-	4.25	-	-	-	-	-	-3.02	-	-2.47	-	-0.07	-	-	-3.94	-	-	-	-	1.58	-	-	1.7	-	-	-	-	-	-1.35	-	-	-3.08	-	-	-	-	-
LOC_Os12g16790.1	-	4.94	-0.85	0.1	-	2.79	-	-	-	-	-	-	-	0.83	-	-	-	-1.68	-	1.2	-2.1	-	-1.24	0.35	-	-	-	-	-	-	-	1.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.34	-	-1.48	-2.23	-15.75	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.