Heatmap: Cluster_220 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
LOC_Os01g10240.1	-1.8	4.88	0.02	-1.94	-	-	-	-	-0.39	-3.04	-0.35	-	-	-0.96	-	-	-2.98	-	3.27	-3.46	-3.16	-	-2.98	-3.21	1.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.93	-2.51	-	-3.49	0.17	-0.3	-	-	-
LOC_Os01g23920.1	-	5.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.64	2.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.01	-
LOC_Os01g24590.1	0.75	5.52	-	-	-	-	-	-	-	-	0.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g25430.1	0.4	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g27180.1	-0.89	5.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g36570.1	-	4.78	-	-	-	-	0.64	-	-	2.89	-1.55	-	-	2.85	-	-	2.03	-	-	-3.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.43	-	-	-	-	-
LOC_Os01g38600.1	-1.82	4.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.17	-	-	-0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g49800.1	2.06	5.25	-	-	-	-	-	-	0.72	-	-4.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.74	-	-	-	-	-	-	-	2.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os02g13690.1	0.08	5.35	-	-	-	-	-	-	1.05	1.08	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os02g32410.1	-0.14	5.46	-	-	-	-	-	-	1.59	-	-1.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.17	-	-	-	-	-
LOC_Os02g32870.1	0.26	4.9	-1.53	-0.2	-1.26	0.3	-2.88	-1.41	-0.37	-5.04	0.09	-3.03	-	1.08	-	-	-3.98	-2.35	-	0.66	-2.14	-3.11	-2.88	-2.36	-	-1.68	-0.77	0.42	-	-	-	0.5	-1.34	-	0.49	-	-0.47	-	-	-	-5.03	-4.33	-1.45	-0.5	-1.83	-1.65	-	-	-
LOC_Os02g44210.1	0.36	5.51	-	-	0.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g27520.1	0.08	4.68	1.62	0.19	0.46	1.09	1.81	2.16	-1.07	-	-2.89	-3.44	-0.87	0.33	-	-	-2.63	-1.47	-	-1.29	-5.2	-	-	-1.33	-	-	-0.37	-	-	-	-	-0.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.86	-3.95	-2.5	-0.56	-1.5	-	-	-	-
LOC_Os03g43870.1	-1.0	5.43	-	-	-	-	-0.29	-	-	-	-0.35	-	-	1.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g45910.1	0.04	5.21	-	0.91	2.37	-	-	-	-	-	-1.93	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g62120.1	0.61	4.92	-	-	-	-	-2.07	-	0.92	-	-2.06	-	-	-	2.27	-	-1.66	-2.96	-	-3.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.2	0.51	0.51	-	-	0.76
LOC_Os03g62130.1	-0.71	4.9	0.33	-	-	-	-1.09	-1.08	2.25	-	-0.96	-	-	-	-	-	-	-2.57	-	-	-	-	-	-	3.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.78	-	-	-	-	-
LOC_Os04g02400.1	-	4.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.61	-	-	-0.52	-	4.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.85	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g21470.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g23000.1	-1.16	5.46	-	-	-	-	-0.52	-	-	-	-0.52	-	-	-	-	-	-0.73	-0.96	-	-3.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.59	-	-	-	-	-
LOC_Os04g31310.1	1.57	5.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g55630.1	0.91	4.9	0.11	-0.46	-	-	-2.45	-0.29	1.88	-2.73	-0.32	-	-	-	-	-	-2.67	-0.82	-	-0.88	-2.95	-	-2.52	-	1.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.76	-	-	-	-	-1.68	-1.26	-1.68	-	0.0	-	-0.38	-	-6.75	-
LOC_Os05g08250.1	1.02	4.85	-1.27	-	0.04	-	0.34	-0.95	-1.07	-	-1.48	0.68	2.99	-	-	-	-1.59	-1.48	-	-6.31	-2.01	-	-	-2.54	-	-	-	0.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.94	-	-1.82	-0.45	-0.9	-	-	-	-	-
LOC_Os05g09150.1	-1.91	4.9	-	-1.21	-	-0.16	-1.05	1.87	-	-	-1.13	-	0.17	-	-	-	-2.28	-3.37	-	-4.2	-	-	-2.58	-	-	-	-	-	-	1.41	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.69	-	-	1.05	0.68	-
LOC_Os05g13480.1	0.36	5.38	-	-	-	-	-	-0.76	-	-	-3.18	-	-	1.44	-	-	-	-2.16	-	-4.54	-	-0.48	-1.13	-1.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.42	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os05g14710.1	-0.49	5.32	-	0.39	-	0.79	-	-1.61	0.67	-	-1.53	-	-	1.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.31	-	-	-	-	-
LOC_Os05g27670.1	-2.44	4.69	-	1.43	-	1.91	-0.77	0.72	-0.94	-0.1	0.64	-	-	2.82	-	-	-	-	-	-2.71	-	-	-2.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.84	0.99	-	-	-	-2.79	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g33590.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g34410.1	-0.05	5.29	-	-	-	-	-	-	3.12	-	-2.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g36720.1	0.98	5.07	-	-	-	-	-	-1.85	0.56	1.11	-0.92	-	-	-0.02	-	-	-0.51	-2.42	-	-7.56	-1.32	-1.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.62	-0.26	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g06400.1	1.25	5.43	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-2.46	-	-	-	-	-	-	-0.64	-	0.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g08590.1	0.61	5.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g19390.1	0.7	5.13	-	-	-1.36	-	-	-0.96	1.04	-	-1.45	-	0.4	0.89	-	-	-0.41	-1.46	-	-0.23	-	-	-2.15	-2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.65	1.0	0.19	-	-	-
LOC_Os07g39370.1	0.43	5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g03280.1	-2.21	5.43	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-1.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g10690.1	-0.54	5.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.89	-	-	0.82	-	-	-1.27	-1.8	-	-3.8	-	-	-	-	-	1.98	2.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.68	-	-	-1.71	-	-	-	-	-
LOC_Os08g15490.1	0.21	5.33	-	-	-	-	-	-	-	2.42	1.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g15630.1	1.28	5.21	-	-0.63	1.65	-	-	-	-	-	-2.7	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.13	-0.89	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g32450.1	-	5.1	-	-	3.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g32470.1	2.27	5.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g38520.1	-2.22	5.27	-	1.35	-0.02	-	2.18	0.38	-	-	-3.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os09g23710.1	1.04	5.49	-	-	-	-	-	-	-	-	0.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.32	-	-	-	-	-
LOC_Os09g24190.1	0.41	4.84	-1.02	-2.58	-5.7	-1.42	2.22	2.24	-0.35	-4.17	-1.74	-2.01	-0.76	-1.98	-1.46	-0.82	-0.08	-1.15	-1.21	-1.39	-5.18	-5.72	-4.86	-5.86	-4.78	-1.69	-2.53	-5.83	-4.49	-	-6.34	-4.48	-3.33	-	-5.99	-3.76	-5.95	-4.41	-4.66	-4.97	-4.32	-4.36	-3.98	-1.06	-1.14	-1.51	-2.12	-1.94	-2.25
LOC_Os09g27560.1	1.03	5.44	-	-	-	-	-	-	1.66	-	-2.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g03290.1	-	5.38	-	-	-	2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g03520.1	0.65	5.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.74	-	-	-	-	-
LOC_Os10g11640.1	-0.83	5.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g11970.1	-2.37	5.31	-0.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g29300.1	0.22	5.22	-	-	-	-	-	-	-	0.63	-3.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.72	-	-	-	-	-	2.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.77	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g32750.1	1.04	5.03	-	0.69	-1.65	-	0.06	-2.26	1.5	-0.92	-1.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.3	0.65	1.32	0.84	-	-
LOC_Os11g09050.1	0.95	4.75	-0.15	-1.93	-1.86	1.25	-1.81	-	-	-	-0.15	-	1.74	2.66	-	-	-2.4	-2.47	-	-0.89	-	-	-	-2.41	-	-	-	-	-	-	-	-1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.06	-	-	-2.67	-	-0.31	-	0.93	0.02
LOC_Os11g11030.1	-	5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.58	-	-	-	-	-	-	-	-	0.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g11310.1	-	5.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g25620.1	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g27940.1	-	5.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.57	-	-	1.68	-	-	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g28330.1	-0.61	4.99	-	-	-	-	-	-	2.07	-	-1.94	-	-	-	-	-	-0.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.31	-	-	2.36	-	-	-	-
LOC_Os11g32630.1	1.34	5.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.32	-	-	0.71	-	-	-	-	-	-0.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.45	-	-	-
LOC_Os12g23210.1	-	5.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g24140.1	1.86	5.05	-	0.98	-	-	-	-	3.01	-1.29	-1.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.74	-	-	-	-	-
LOC_Os12g34200.1	-0.16	4.94	-	-	-	1.11	-	-	-0.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.81	-	-	-1.7	-	-	-	-	2.83	-	0.93	-	-	-	1.01	-	-	-	-	-	-	1.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g35750.1	1.48	5.38	-	-	-	-	-	-	2.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g39060.1	-0.21	5.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g42440.1	2.02	5.31	-	-	-	-	-1.45	-	-0.18	-	-3.64	-	-	1.76	-	-	-	-0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.