Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
LOC_Os01g16300.1	2.53	5.13	-	-	-	-	-	-	3.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g22200.1	-1.34	3.29	-	-8.78	-	0.6	-0.93	-	-	-	-	-0.93	3.52	-	-	-	-	1.42	-	-1.8	-2.61	-1.12	-2.31	1.32	-	-	-	3.09	-	1.21	-	1.39	-	-	-	-	-	1.68	-	-0.29	-2.13	-	-1.33	-1.01	-	-	-	-	-
LOC_Os01g26150.1	-1.0	2.37	-	-	0.43	4.3	-	-	-0.71	-	-1.91	-1.38	-	0.27	-	-	-	-2.0	-	-1.45	-0.02	-0.46	-0.52	-0.41	-	-	-	0.07	-	2.31	-	0.15	-	-	0.4	0.08	-	0.84	-0.11	-0.8	-0.54	0.44	0.33	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g38200.1	1.93	4.4	-	-	-	4.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os01g60500.1	-0.59	4.23	-	-	2.13	3.74	-	-	-	-	-	1.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.63	-	-	-	-	-	0.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.45	-	-	-	-	-
LOC_Os02g19070.1	-2.9	1.64	-	-	-	5.21	-	-2.22	-	-	-6.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.0	-	-	-	-	2.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.81	-	-2.83	-	-0.75	-1.3	-	-	-	-	-
LOC_Os02g19320.1	0.79	4.01	1.61	-	2.72	4.03	-	-	-	-	-1.41	-	-	2.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os02g27140.1	-3.66	2.59	0.17	2.2	0.24	5.1	-	-2.06	-	-2.3	-4.06	-	-0.18	-	-	-	-	-2.16	-	-4.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os02g28450.1	-0.65	3.67	-	-	-	4.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.58	-	-2.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.76
LOC_Os02g45230.1	2.54	3.96	-	-	1.41	4.02	-1.17	-	-	-	-0.85	-	-	-	-	-	0.24	-3.56	-	-	-	-0.76	-2.05	-0.65	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.37	-1.19	-	-	-	-	-
LOC_Os02g50870.1	-1.45	3.87	-	-	4.04	2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.04	-	-	-	1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.89	1.1	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g33509.1	-	2.45	-	0.52	-	5.22	-	-	-	-	-	-	-	2.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os03g38700.1	-1.92	0.83	-	2.43	3.12	4.59	1.28	-2.47	-	-	-4.02	-	-	0.65	-	-	-	-5.87	-	-0.74	-3.71	0.12	-	-	-	-	-0.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.26	-	-3.54	-	-	-	-4.55	-0.56	-	-	-	-
LOC_Os03g54830.1	2.77	4.27	-	0.23	2.28	3.97	-0.64	-	-	-	-3.0	-	-	-	-	-	-	-1.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g14100.1	-	4.1	-	-	-	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g28530.1	-	1.33	-	0.56	0.09	5.42	-	-0.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.59	-	-	-	-	-
LOC_Os04g30950.1	-	4.73	-	-	-	-	3.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g40760.1	2.9	3.72	-	-1.16	-0.52	4.4	0.87	-	-0.03	-1.13	-1.27	-	-	-	-	-	0.72	-	-	-3.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.28	-	-	-	-	-	-
LOC_Os04g54030.1	1.32	4.72	-	-	-	4.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.23	-	-	-	-	-	0.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os05g12010.1	-	1.81	-	-	1.98	5.35	-	-	-	-	-0.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os05g18640.1	-1.28	0.65	-	-1.21	0.57	5.18	1.55	1.62	-	-	-5.34	-2.5	-	-2.32	-	-	-2.75	-5.44	-	-4.34	-4.75	-	-	-4.93	-	-	-	-	-0.99	-	-	-	-	-	-	-0.96	-1.02	-	-	-2.67	-3.48	-3.36	-3.87	-	-	-2.0	-	-	-
LOC_Os05g36950.1	-	3.81	-	-	3.47	4.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g14790.1	-	4.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.05	-	-	-	-	-	-	0.74	-	1.03	1.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.92	-	1.99	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g17300.1	-1.06	1.76	-	-0.81	-	5.25	-	-	1.58	1.28	-0.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g21020.1	-5.41	-0.84	-	-	2.24	4.19	0.94	0.77	-	-3.34	-5.54	2.25	1.4	0.48	-	-	-6.51	1.13	-	-3.43	-0.5	-0.35	-0.7	0.9	-0.26	-	-	-1.87	-1.8	-0.85	-1.43	-0.84	0.15	-	-1.76	-0.31	-1.46	-0.82	-0.72	-	-	-	-	-7.0	-	-	-	-	-
LOC_Os06g22170.1	-	3.94	-	-	-	-	-	-	0.16	-	-1.59	-	-	-	-	-	-1.36	-	4.91	-0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g22200.1	-3.92	3.05	-	-	-	4.79	-1.28	-	-	-2.52	-1.8	-	-	-	-	-	-	-1.97	-	-3.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.02	-	-	-1.74	1.92	-	-	2.18	1.55	-
LOC_Os06g32320.1	-	4.24	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os06g41510.1	-3.17	2.19	-4.61	-3.59	-0.63	5.32	-	-5.46	-	-	-1.94	-	-0.9	-0.76	-	-	-	-5.36	-	-3.82	-4.97	-	-4.9	-	-1.06	-2.34	-	-	-	-2.01	-	-2.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.02	-0.62	-2.53	-	-	-
LOC_Os06g43730.1	-	4.05	-	-	-	4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g02730.1	1.59	4.5	-	-	-	4.02	-	-	2.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g08230.1	0.53	4.19	-	2.29	0.81	4.39	0.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.58	-	-	-	-0.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os07g28150.1	-0.57	3.81	-	-	-	4.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g03760.1	-0.39	3.1	-0.49	0.12	0.71	4.33	-	-2.87	1.33	-	-3.56	-1.28	2.33	2.25	-	-	-2.1	-1.77	-	-3.15	-	-	-3.11	-2.88	-	-	-	-	-	-	-	1.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g24800.1	-	3.06	-	2.89	-	4.47	1.28	2.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g24940.1	-	3.51	-	-	-	5.2	-	-	-	-	-0.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g29210.1	-	-	-	-	-	5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g34840.1	1.93	3.15	-1.44	0.13	0.76	3.39	1.6	-2.36	-1.9	-0.39	-1.34	-0.34	-	-1.53	-	-	0.71	-0.62	-	-1.07	-2.53	-2.35	-3.89	-2.71	-	-	1.72	-	-	-0.16	-	-2.06	-	-	-	-	-	0.62	-	-3.89	-3.74	-	-	0.01	1.52	1.59	-	-0.78	-
LOC_Os08g35080.1	1.65	2.08	-	2.43	-	5.06	1.48	-	-	-	-3.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g36850.1	-0.7	3.96	-	-	-	2.58	-	-0.02	2.13	-	-	-	-	-	4.32	-	-0.23	-	-	-	-	-	-	-0.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os08g42198.1	-0.48	2.51	-	-3.45	-0.69	4.16	1.29	0.03	-	1.55	-1.45	-1.28	-	-2.25	-	-	0.46	-1.65	-	-2.18	-4.38	-3.37	-	-5.18	-0.14	-	-	-	-	-	-	-2.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.12	1.67	2.25	1.08	0.64	0.18	-0.82
LOC_Os09g01950.1	-	5.15	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g01620.1	0.47	3.72	-	-	3.49	3.8	-	-	-	3.16	-1.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g03080.1	-0.75	3.17	-0.49	-1.1	2.73	4.07	-	-2.1	0.52	-	-	-	-	1.57	-	-	-2.33	0.18	-	-3.1	-0.65	-	-2.79	-0.88	-	-	-	-	-	-	-	2.29	-	-	-	-	-	-	-	-1.33	-0.7	-1.45	-0.0	-3.18	-	-	-	-	-
LOC_Os10g07986.1	0.78	4.48	-	-	-	4.07	-	-	-	-	-2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g09330.1	-2.12	2.6	-	-	-	4.93	-0.35	-	-	-	-	1.3	-	-	-	-	-	-5.09	-	-	-0.63	-	-	-	-	-	-	2.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.69	-1.1	-	-0.14	-	-	-	-	-	-
LOC_Os10g09920.1	-3.91	2.1	-	-1.46	-	4.97	-	-	-	-0.56	1.25	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-0.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.01	-	-	-	1.51	2.09
LOC_Os10g17000.1	-	4.1	-	-	2.89	4.5	-	-	-	-	-0.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g12580.1	-0.32	2.65	-0.02	-	-	4.88	-	-	2.22	-	-3.79	-	-	-	-	-	-	-0.14	-	0.51	-	-	-	-1.22	-	-	-	-	-	1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g25570.1	-1.86	2.19	-	-	-	5.14	-	-	0.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.28	-	-	-	-	-	-	-	2.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
LOC_Os11g28260.1	1.07	2.9	-	-	2.1	4.65	-	-	-	-0.83	0.03	1.0	-	-	-	-	-0.82	-	-	-	-	-0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.34	-	-
LOC_Os11g46830.1	-12.59	-6.04	-12.73	-	-	-	-	4.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.6	-	4.07	-14.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.98	-	-8.43	-	-	-	-	-	-
LOC_Os12g34419.1	-0.1	2.72	-	-	-	5.27	-	-	-	-	0.55	-	-	-	-	-	-	-0.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.51	-	-	-	-	-
LOC_Os12g35420.1	-2.16	2.5	-	-	-	5.3	-	-	-	-	-1.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.