Heatmap: Cluster_335 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
ChrSy.fgenesh.mRNA.75	0.04	0.03	0.01	0.0	0.05	1.0	0.04	0.04	0.07	0.01	0.04	0.02	0.0	0.0	0.07	0.1	0.01	0.02	0.17	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03
ChrSy.fgenesh.mRNA.76	0.05	0.07	0.01	0.0	0.02	1.0	0.06	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.09	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02
LOC_Os01g38780.1	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
LOC_Os01g54940.1	0.1	0.06	0.08	0.05	0.05	1.0	0.07	0.08	0.11	0.07	0.09	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.1	0.04	0.06	0.07	0.03	0.04	0.04	0.04	0.08	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.07	0.07	0.09	0.05	0.03	0.03	0.1	0.09	0.11
LOC_Os01g56020.1	0.07	0.03	0.02	0.02	0.04	1.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.07	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08
LOC_Os02g06240.1	0.01	0.03	0.01	0.03	0.11	1.0	0.05	0.03	0.01	0.0	0.02	0.14	0.03	0.01	0.01	0.0	0.04	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0
LOC_Os02g37020.1	0.06	0.03	0.03	0.02	0.06	1.0	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02
LOC_Os02g40600.1	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os02g55090.1	0.2	0.08	0.12	0.08	0.06	1.0	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.05	0.04	0.04	0.02	0.11	0.03	0.08	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.04	0.04	0.05	0.05
LOC_Os02g56340.1	0.01	0.04	0.02	0.16	0.04	1.0	0.07	0.06	0.0	0.02	0.05	0.0	0.07	0.05	0.0	0.0	0.09	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.0
LOC_Os03g03590.1	0.05	0.05	0.02	0.01	0.05	1.0	0.05	0.06	0.03	0.02	0.02	0.1	0.05	0.05	0.13	0.12	0.04	0.08	0.02	0.07	0.04	0.05	0.03	0.05	0.06	0.1	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.08	0.12	0.09	0.1	0.07	0.03
LOC_Os03g07970.1	0.16	0.06	0.1	0.07	0.13	1.0	0.07	0.08	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.07	0.09	0.06	0.01	0.04	0.13	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.27	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01
LOC_Os03g18350.1	0.1	0.03	0.09	0.04	0.04	1.0	0.04	0.04	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.03	0.09	0.2
LOC_Os03g43590.1	0.04	0.18	0.01	0.03	0.02	1.0	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.2	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0
LOC_Os03g59730.1	0.01	0.03	0.01	0.1	0.04	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
LOC_Os03g60200.1	0.1	0.04	0.02	0.01	0.06	1.0	0.04	0.04	0.06	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.0	0.0	0.07	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.1
LOC_Os04g04740.1	0.03	0.08	0.07	0.0	0.02	1.0	0.06	0.07	0.0	0.01	0.03	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.02	0.0	0.03	0.01	0.01
LOC_Os04g29510.1	0.01	0.02	0.0	0.01	0.16	1.0	0.05	0.06	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
LOC_Os04g34900.1	0.0	0.02	0.0	0.01	0.05	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os04g39890.1	0.0	0.09	0.01	0.01	0.0	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.05	0.06	0.05
LOC_Os05g05550.1	0.07	0.04	0.06	0.05	0.03	1.0	0.03	0.06	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.04	0.0	0.04	0.0	0.02	0.04	0.07	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.04	0.05	0.03	0.06	0.05	0.08	0.08	0.04	0.02	0.0	0.01	0.01
LOC_Os05g15100.1	0.01	0.12	0.0	0.02	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os05g16170.1	0.0	0.01	0.01	0.01	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os05g19300.1	0.06	0.1	0.03	0.11	0.02	1.0	0.04	0.07	0.02	0.0	0.03	0.0	0.08	0.11	0.06	0.09	0.02	0.06	0.03	0.1	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.14	0.11	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01
LOC_Os05g20914.1	0.04	0.04	0.08	0.09	0.27	1.0	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.02	0.09	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.03	0.0	0.01	0.01
LOC_Os06g24910.1	0.03	0.08	0.08	0.0	0.04	1.0	0.13	0.11	0.01	0.03	0.02	0.0	0.18	0.12	0.0	0.0	0.33	0.07	0.0	0.06	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.1	0.0	0.0	0.04	0.05	0.06
LOC_Os07g10810.1	0.05	0.08	0.06	0.1	0.04	1.0	0.09	0.1	0.11	0.07	0.07	0.02	0.08	0.07	0.02	0.05	0.09	0.04	0.07	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.03	0.03	0.06	0.08	0.04
LOC_Os07g25650.1	0.08	0.18	0.09	0.06	0.09	1.0	0.05	0.06	0.04	0.03	0.03	0.05	0.1	0.08	0.04	0.03	0.14	0.06	0.05	0.05	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.03
LOC_Os07g33921.1	0.0	0.01	0.03	0.0	0.01	1.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os07g45010.1	0.08	0.08	0.02	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.1	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.01	0.16	0.07	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0
LOC_Os08g06780.1	0.0	0.03	0.0	0.04	0.03	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os08g13850.1	0.0	0.08	0.03	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os08g17000.1	0.05	0.07	0.08	0.14	0.03	1.0	0.1	0.07	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.08	0.08	0.02	0.02	0.03	0.0	0.1	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.08	0.02	0.01	0.0
LOC_Os09g01160.1	0.0	0.02	0.0	0.03	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os09g01970.1	0.03	0.18	0.01	0.04	0.09	1.0	0.03	0.03	0.05	0.01	0.02	0.03	0.12	0.15	0.06	0.05	0.05	0.08	0.1	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.04	0.02
LOC_Os09g14019.1	0.08	0.11	0.13	0.07	0.09	1.0	0.09	0.08	0.03	0.02	0.03	0.03	0.11	0.07	0.04	0.07	0.13	0.08	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03
LOC_Os09g15980.1	0.03	0.09	0.03	0.06	0.05	1.0	0.07	0.07	0.03	0.03	0.02	0.02	0.08	0.06	0.02	0.05	0.09	0.02	0.08	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01
LOC_Os09g20650.1	0.1	0.07	0.03	0.03	0.06	1.0	0.06	0.06	0.05	0.04	0.03	0.07	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.07	0.06	0.03	0.01
LOC_Os09g21430.1	0.04	0.02	0.05	0.0	0.04	1.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.09	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05
LOC_Os11g04920.1	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	1.0	0.06	0.06	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0
LOC_Os11g07550.1	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	1.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os11g12010.1	0.05	0.0	0.05	0.0	0.03	1.0	0.23	0.23	0.0	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os12g10910.1	0.08	0.03	0.06	0.0	0.02	1.0	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.07	0.02	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.1
LOC_Os12g14160.1	0.03	0.06	0.05	0.18	0.08	1.0	0.05	0.07	0.01	0.02	0.03	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04
LOC_Os12g41590.1	0.02	0.01	0.02	0.07	0.08	1.0	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.08	0.08	0.07	0.03	0.04	0.01	0.05	0.0	0.05	0.06	0.04	0.06	0.07	0.02	0.04	0.01	0.11	0.09	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.09	0.06	0.08	0.07	0.01	0.0	0.01	0.07	0.01	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)