Heatmap: Cluster_349 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
5.42 26.67 9.33 0.01 0.01 0.01 47.7 49.49 14.24 1.84 18.4 0.35 20.67 18.9 6.15 5.71 16.73 14.82 44.22 1.01 0.53 0.47 0.52 0.36 6.69 0.68 0.7 0.73 0.4 0.37 0.31 0.47 0.52 0.2 0.4 0.59 0.55 0.56 0.36 0.09 0.17 0.16 0.26 8.65 16.84 15.92 109.6 48.11 10.05
0.5 4.61 0.15 0.04 0.0 2.1 0.59 2.34 3.95 0.6 3.97 0.0 0.27 0.22 0.0 0.0 4.19 0.37 10.36 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 2.89 1.77 6.84 3.99
11.34 5.01 0.08 0.0 0.01 0.02 24.91 20.74 13.17 5.0 8.87 1.9 14.92 14.95 2.16 2.0 10.01 3.81 23.98 3.54 1.71 1.58 1.27 1.51 36.59 1.53 3.56 1.61 1.24 1.44 1.48 1.81 1.44 0.9 1.28 2.32 1.72 2.18 2.29 0.95 0.71 0.85 0.9 4.9 2.6 8.56 69.62 23.83 19.76
3.15 4.82 0.37 0.11 0.04 1.84 6.61 6.05 10.18 0.25 3.52 0.98 4.62 3.32 0.08 0.11 6.21 4.65 19.83 0.2 0.16 0.15 0.11 0.2 0.16 0.1 0.14 0.14 0.07 0.27 0.17 0.45 0.14 0.03 0.11 0.16 0.15 0.12 0.15 0.07 0.08 0.11 0.07 0.74 3.55 11.53 10.69 25.54 40.23
2.74 5.21 0.09 0.0 0.0 0.0 0.74 0.34 2.75 0.08 1.95 0.01 0.88 3.19 0.0 0.0 4.46 1.26 2.51 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.33 1.95 0.57 5.7 14.48
0.37 15.98 0.4 0.0 0.07 0.0 14.03 14.48 40.7 0.08 3.02 1.87 11.05 24.27 0.0 0.0 1.89 12.46 0.0 0.02 0.18 0.48 0.32 0.28 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.52 1.54 0.46 1.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.48 0.72 16.1 35.37 67.83 60.37
0.47 7.96 0.12 0.0 0.09 0.0 3.89 2.74 1.09 1.86 5.76 0.11 1.16 3.24 0.05 0.3 1.92 1.88 20.07 0.18 0.04 0.05 0.03 0.14 0.73 0.0 0.02 0.0 0.04 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 1.86 1.64 8.62 18.91 44.55 28.36
0.05 0.57 0.13 3.23 1.61 7.72 1.92 2.82 0.04 10.56 6.0 0.95 0.3 3.34 0.14 0.49 0.02 0.45 0.0 0.84 0.16 0.01 0.18 0.01 1.97 0.0 0.03 0.17 0.08 0.26 0.09 0.44 0.13 0.0 0.0 0.09 0.22 0.32 0.12 0.24 0.31 0.44 0.52 0.51 0.18 0.46 34.67 33.82 46.31
1.84 11.75 0.38 0.0 0.0 0.04 5.97 6.79 1.65 2.39 5.49 0.06 3.19 3.83 0.16 0.08 0.44 2.11 2.67 0.27 0.27 0.24 0.18 0.19 0.95 0.15 0.14 0.4 0.21 0.5 0.36 0.31 0.16 0.12 0.24 0.18 0.25 0.38 0.24 0.03 0.1 0.07 0.08 2.12 0.44 0.79 16.41 5.52 3.32
8.92 15.39 4.99 0.1 0.05 0.49 17.83 16.26 6.89 5.07 11.58 9.65 6.81 10.04 5.67 6.9 9.22 8.61 15.77 7.94 0.58 0.76 0.32 0.54 2.58 5.46 6.29 0.67 0.21 0.87 0.5 0.92 0.64 0.42 0.4 0.44 0.61 0.44 0.5 0.56 0.86 0.87 1.13 29.97 21.12 21.65 78.24 40.86 17.43
0.22 5.33 0.01 0.02 0.0 0.03 0.63 0.59 11.98 0.24 1.22 0.5 3.35 3.36 0.0 0.48 0.58 7.13 0.0 0.19 0.03 0.05 0.02 0.04 0.63 0.57 0.19 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.38 0.72 2.39 18.75 22.56 4.06
22.42 77.02 5.14 0.07 0.03 0.06 57.26 39.41 70.35 5.97 51.7 36.33 23.13 43.12 0.65 0.86 45.21 37.4 70.34 2.55 5.22 4.99 4.64 3.87 1.78 0.3 0.22 5.08 3.97 4.28 3.37 3.3 4.34 2.75 3.37 4.61 4.84 7.33 5.95 0.92 3.05 2.32 4.21 13.66 22.95 119.68 182.45 241.4 183.85
4.59 4.65 1.03 0.08 0.0 0.01 2.68 2.86 2.06 1.2 3.25 1.85 3.36 4.84 1.84 1.57 2.29 3.44 3.6 5.44 0.29 0.31 0.34 0.38 0.97 4.64 4.88 0.2 0.26 0.27 0.16 0.5 0.17 0.16 0.35 0.54 0.29 0.32 0.42 0.23 0.28 0.52 0.38 5.94 8.82 10.48 8.53 11.79 11.23
30.73 59.32 8.38 0.01 0.06 0.1 13.52 18.28 33.45 8.21 20.39 25.59 8.45 10.86 1.33 1.38 27.94 9.15 27.88 1.23 1.48 1.23 1.47 1.13 2.72 2.41 2.8 1.18 1.17 1.29 1.0 1.52 1.68 0.53 1.31 1.73 1.58 1.68 1.46 0.74 1.05 1.09 1.32 4.67 10.71 25.19 51.85 79.33 32.05
0.82 0.18 0.59 0.05 0.02 0.03 0.26 0.2 0.69 0.57 2.37 0.01 0.04 0.06 0.0 0.03 0.08 0.28 6.64 0.84 0.12 0.0 0.12 0.05 0.36 0.73 1.07 0.07 0.07 0.06 0.06 0.1 0.07 0.05 0.03 0.19 0.09 0.15 0.12 0.06 0.12 0.12 0.2 0.19 0.12 0.16 2.04 6.42 8.23
7.53 27.9 5.79 2.82 1.28 0.3 5.85 5.04 5.09 1.56 6.94 0.39 3.87 6.64 2.69 2.19 6.75 5.74 8.01 3.83 0.37 0.31 0.29 0.34 2.26 1.47 1.8 0.48 0.26 0.53 0.34 0.58 0.34 0.19 0.36 0.44 0.49 0.42 0.41 0.15 0.2 0.19 0.31 7.0 20.95 15.58 31.52 15.37 18.54
6.33 7.4 1.12 5.32 2.12 0.28 5.37 4.84 8.06 3.07 9.11 0.0 1.35 4.08 5.86 3.74 9.27 4.21 7.0 6.65 0.19 0.08 0.09 0.08 0.83 8.02 11.05 0.1 0.09 0.09 0.45 0.15 0.1 0.12 0.32 0.09 0.0 0.08 0.0 0.06 0.12 0.21 0.13 5.37 9.01 20.02 21.0 66.21 91.52
44.73 51.06 7.72 50.79 25.61 4.62 61.02 66.82 15.68 18.1 48.24 17.78 73.72 79.96 43.63 53.49 43.23 61.39 44.37 55.55 8.33 6.32 7.81 7.26 134.29 22.43 21.83 8.26 6.33 11.18 11.18 12.05 5.53 5.52 5.18 9.12 5.97 6.56 8.01 7.65 7.14 9.02 9.7 100.73 105.34 69.87 88.41 32.48 17.33
23.24 15.18 2.61 1.12 0.02 0.0 1.17 0.42 8.43 0.4 7.9 0.38 5.65 14.99 0.0 0.0 18.36 6.98 7.76 0.22 0.02 0.01 0.0 0.02 0.16 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.64 1.83 11.79 5.8 71.35 117.11
11.39 4.3 0.68 0.12 0.01 0.06 1.1 0.26 2.02 0.18 3.41 0.83 4.61 8.47 0.0 0.02 7.18 3.34 6.39 0.05 0.02 0.02 0.02 0.01 0.41 0.01 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 1.25 6.33 4.01 30.19 61.74
20.88 19.68 4.9 0.13 0.02 3.07 25.88 20.63 19.7 20.32 33.31 17.23 19.13 22.3 4.79 5.07 40.35 16.23 216.03 7.02 2.48 2.18 2.02 2.45 28.49 6.58 4.53 2.28 2.47 7.25 4.59 3.5 2.51 0.69 1.29 1.82 1.59 1.83 1.72 8.35 7.08 8.58 9.14 4.19 11.92 19.83 36.39 41.46 26.8
19.17 17.68 1.05 0.48 0.01 0.07 1.71 0.84 4.7 0.38 6.37 0.22 2.88 6.48 0.04 0.03 19.06 2.65 6.07 0.06 0.1 0.11 0.09 0.1 0.53 0.15 0.2 0.08 0.06 0.09 0.08 0.08 0.1 0.01 0.06 0.13 0.03 0.07 0.08 0.01 0.03 0.02 0.03 0.35 0.78 6.43 4.21 32.75 49.87
2.0 2.78 0.46 0.24 0.01 0.0 0.87 0.78 0.8 0.32 1.19 0.25 1.28 2.4 0.29 0.29 1.24 1.56 4.3 0.73 0.25 0.22 0.21 0.19 0.11 0.4 0.33 0.2 0.14 0.37 0.28 0.22 0.35 0.02 0.34 0.53 0.39 0.37 0.3 0.04 0.1 0.05 0.09 1.25 2.31 2.38 8.58 10.71 5.9
0.1 0.23 1.01 0.01 0.0 0.06 0.23 0.11 0.55 0.27 0.74 0.05 0.04 0.34 0.03 0.0 0.39 0.12 0.8 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.62 0.67 1.57 7.36 4.28
1.36 0.66 2.77 0.53 0.05 0.94 3.17 2.9 1.69 0.58 1.21 0.08 1.14 2.41 0.32 0.32 0.96 1.05 3.0 1.19 0.26 0.02 0.16 0.04 0.18 0.3 0.7 0.22 0.18 0.05 0.1 0.28 0.17 0.09 0.25 0.35 0.11 0.15 0.32 0.1 0.14 0.11 0.14 4.29 1.78 3.08 8.22 19.87 10.73
20.12 47.56 8.64 1.89 1.89 3.04 35.41 35.1 12.58 16.08 20.09 31.85 24.14 30.82 15.28 10.93 16.72 20.83 33.21 38.96 2.19 2.35 2.02 2.05 26.0 18.69 39.58 1.65 1.74 1.9 2.53 3.31 1.5 1.29 1.7 2.95 2.42 2.52 3.45 1.64 2.38 1.73 2.09 72.4 63.96 67.07 92.99 24.55 40.98
0.04 0.26 0.0 0.45 0.22 0.3 0.03 0.05 0.08 0.23 0.89 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.05 0.02 5.29 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.36 0.99 1.96 5.55 13.0
19.71 62.56 3.42 0.02 0.09 1.19 30.58 30.37 8.65 2.36 15.17 0.67 24.52 24.7 15.76 17.19 4.17 14.43 0.87 9.43 1.92 1.71 1.85 1.61 22.55 12.21 7.63 1.82 1.61 4.71 4.79 5.82 1.61 0.98 2.42 3.86 2.27 2.54 3.0 1.75 2.84 2.51 3.16 22.16 25.97 21.76 6.45 0.25 0.02
0.96 1.87 0.49 0.05 0.0 0.0 0.78 0.8 0.88 0.21 0.79 0.11 0.36 0.12 0.1 0.14 1.12 0.21 0.0 0.43 0.01 0.01 0.0 0.01 0.15 0.08 0.21 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 1.61 0.81 2.02 1.05 2.11
0.67 3.03 0.42 0.78 0.01 0.0 4.12 4.34 0.62 0.9 2.08 1.02 2.08 2.25 1.66 1.54 0.4 3.25 0.3 2.0 0.47 0.35 0.47 0.34 0.44 1.67 4.69 0.61 0.61 0.17 0.21 1.06 0.37 0.42 0.27 0.34 0.33 0.26 0.39 0.19 0.2 0.15 0.26 6.73 3.31 2.41 1.71 0.08 0.02
7.85 19.35 2.97 0.0 0.03 0.0 1.66 1.61 18.7 0.2 11.57 0.06 3.46 5.18 0.0 0.0 11.7 4.42 61.34 0.07 0.0 0.04 0.04 0.05 0.4 1.71 1.1 0.0 0.17 0.0 0.19 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.11 10.11 55.05 88.74 157.2 133.96
1.27 3.98 0.49 0.0 0.0 0.0 0.77 0.62 0.23 0.17 1.55 0.26 0.41 0.18 0.28 0.86 0.99 0.34 1.84 0.18 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.22 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 1.11 2.15 3.83 0.93 4.33 10.93
16.3 35.17 3.03 0.2 0.02 0.61 34.31 21.35 9.75 5.16 19.27 7.55 20.34 23.27 23.84 17.2 13.82 24.45 12.68 14.2 1.48 1.45 1.43 2.05 35.79 3.52 11.21 1.68 1.36 1.38 1.27 1.89 1.43 0.54 0.85 1.07 0.85 1.16 1.17 0.67 1.0 0.99 1.36 25.66 17.94 12.36 65.22 36.33 7.5
0.72 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.96 0.03 0.2 4.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 21.53 22.63 5.27
2.46 1.94 0.18 0.68 0.36 3.91 0.41 0.35 0.73 0.44 1.05 0.03 0.9 1.49 0.13 0.14 1.94 0.68 0.84 0.18 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.06 0.07 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.0 0.03 0.05 0.02 0.06 0.02 0.04 0.01 0.01 0.02 0.03 0.42 0.21 0.76 0.61 5.31 6.67
0.23 0.49 0.08 0.0 0.24 0.1 0.09 0.14 0.98 0.1 2.63 0.44 1.58 2.2 0.21 0.36 5.4 2.35 1.86 0.87 0.46 0.34 0.41 0.55 0.19 1.29 1.59 0.32 0.34 0.1 0.09 0.09 0.29 0.07 0.28 0.51 1.37 0.44 0.25 0.0 0.01 0.01 0.01 0.32 1.89 2.65 3.16 17.37 29.34
1.6 2.52 0.14 1.53 0.03 0.0 1.02 0.87 0.12 0.1 1.34 0.02 0.19 0.38 0.3 0.38 1.22 0.28 2.96 0.15 0.02 0.01 0.0 0.0 0.47 0.22 0.14 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.02 0.02 0.39 0.16 0.58 1.37 4.86 15.52
2.75 6.87 0.37 0.0 0.02 0.0 0.92 0.76 1.08 0.79 2.81 2.81 3.11 3.48 0.65 0.46 3.59 1.25 2.88 0.55 0.67 0.38 0.54 0.45 0.28 0.16 0.16 0.36 0.3 0.41 0.27 0.93 0.52 0.25 0.74 0.73 0.68 0.6 0.7 0.24 0.27 0.45 0.43 3.14 6.92 5.99 9.76 8.48 8.38
1.1 1.46 0.11 0.01 0.03 0.0 0.89 0.58 1.93 0.2 1.17 0.07 0.34 1.54 0.04 0.15 2.88 0.58 13.71 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.36 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.53 1.01 2.07 5.5 0.23 0.3
0.14 0.93 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.03 0.84 0.0 0.12 0.01 0.15 0.13 0.0 0.0 0.48 0.15 0.67 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.17 0.9 0.83 4.99 5.56
0.33 0.79 0.25 0.02 0.39 0.1 0.12 0.04 0.1 0.13 1.72 0.25 0.08 0.44 0.05 0.0 0.09 0.08 18.08 0.03 0.11 0.08 0.11 0.06 0.06 0.0 0.02 0.1 0.13 0.0 0.02 0.1 0.03 0.03 0.1 0.07 0.03 0.03 0.04 0.16 0.06 0.12 0.07 0.38 0.18 1.61 12.63 21.58 28.88
60.73 292.85 21.01 0.12 0.17 0.18 372.23 359.59 92.52 50.27 147.27 9.15 122.21 185.35 95.13 105.46 32.2 169.8 91.95 56.73 34.91 35.68 33.9 34.05 148.32 27.23 36.65 39.41 23.71 52.35 48.93 68.06 28.8 14.48 23.7 36.84 20.04 30.21 35.22 15.61 23.39 32.04 37.4 101.57 97.84 192.86 173.94 52.76 2.88
11.31 10.93 0.93 0.0 0.02 0.1 7.44 6.0 3.08 1.49 6.16 4.78 2.36 2.0 4.43 3.78 4.11 1.33 43.63 1.84 0.24 0.21 0.24 0.37 0.17 0.85 1.0 0.28 0.0 0.04 0.03 0.15 0.31 0.05 0.26 0.5 0.26 0.21 0.19 0.16 0.4 0.22 0.35 8.44 13.46 21.66 10.63 48.48 114.05
2.86 1.46 0.27 0.0 0.05 2.07 1.17 0.92 3.23 1.01 0.84 0.45 0.6 0.82 0.15 0.12 2.81 0.78 1.37 0.24 0.06 0.07 0.04 0.0 0.08 0.13 0.09 0.05 0.03 0.05 0.01 0.04 0.07 0.0 0.01 0.11 0.06 0.09 0.08 0.04 0.09 0.05 0.08 0.25 0.87 0.6 3.34 14.47 12.47
73.67 199.95 23.21 3.04 0.38 2.24 44.73 43.99 48.26 20.57 73.24 66.54 40.87 59.56 23.69 20.89 47.85 33.01 277.47 22.16 2.68 2.53 2.39 2.75 118.27 16.14 15.28 3.62 2.02 6.2 4.65 5.51 2.22 2.01 1.92 3.04 2.08 2.89 2.94 2.11 2.37 2.82 3.33 30.51 52.03 93.1 149.23 120.03 92.73
0.95 0.69 0.25 0.0 0.0 0.0 6.46 6.78 16.73 0.28 1.02 2.01 1.53 2.29 0.0 0.0 2.72 2.24 4.07 0.01 0.18 0.28 0.19 0.29 0.0 0.0 0.0 0.64 0.13 0.24 0.07 0.11 0.27 0.0 0.1 0.13 0.2 0.07 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.43 0.49 4.12 10.16 18.95 31.8
77.62 163.23 17.94 0.0 0.0 0.0 4.39 4.44 81.37 3.51 45.69 0.63 42.88 73.02 0.0 0.0 102.88 60.78 438.36 0.0 0.11 0.04 0.04 0.04 3.17 0.06 0.0 1.54 0.1 0.07 0.07 0.07 0.07 0.09 0.0 0.13 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 2.89 18.86 236.37 81.57 689.0 1700.63
1.05 1.58 0.1 0.11 0.27 0.32 1.1 1.48 0.08 0.13 1.33 0.0 0.86 2.43 0.0 0.0 1.34 0.66 2.94 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 0.17 0.27 5.69 7.38 4.2

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)