1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00268500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.423)
 0.0 0.0 0.0 0.54 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.45 0.04
AMTR_s00002p00220120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.235)
 0.13 0.26 0.05 1.0 0.26 0.0 0.15 0.04 0.18 0.14 0.64 0.15 0.23 0.33 0.24 0.1 0.23 0.06 0.06 0.08 0.03 0.21
AMTR_s00003p00232740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.231)
 0.71 0.33 0.55 1.0 0.33 0.0 0.27 0.21 0.65 0.51 0.87 0.53 0.47 0.56 0.48 0.21 0.4 0.73 0.55 0.28 0.24 0.26
AMTR_s00005p00079980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.13)
 0.18 0.0 0.0 0.38 0.09 0.0 0.19 0.0 0.05 0.1 0.92 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.25 0.0 1.0 0.2 0.13 0.08
AMTR_s00006p00035230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.8)
 0.05 0.0 0.0 0.45 0.07 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 1.0 0.33 0.35 0.33 0.07 0.44 0.28 0.7 0.92 0.63 0.61 0.32
AMTR_s00007p00070690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.37)
 0.42 0.16 0.02 1.0 0.22 0.12 0.59 0.02 0.4 0.43 0.61 0.65 0.6 0.43 0.22 0.44 0.4 0.53 0.52 0.43 0.29 0.38
AMTR_s00010p00231390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.266)
 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.54 0.28 0.03 0.19 0.02 0.04 0.27 0.17 0.31 0.35 0.09 0.1
AMTR_s00012p00185720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.117)
 0.22 0.64 0.1 0.48 0.52 0.04 0.13 0.0 0.08 0.09 1.0 0.57 0.89 0.46 0.45 0.34 0.64 0.26 0.42 0.37 0.17 0.47
AMTR_s00015p00258920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00015.124)
 0.05 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.04 0.03 0.3 0.89 0.12 0.1 0.03 0.13 0.0 0.45 0.96 0.18 0.6 0.06
AMTR_s00019p00081500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.58)
 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.33 0.23 0.0 0.38 0.38 0.89 0.7 0.38 0.21 0.11 0.49 0.8 0.47 0.37 0.13 0.23 0.27
AMTR_s00022p00063350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.42)
 0.02 0.75 0.0 1.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.7 0.58 0.27 0.16 0.15 0.12 0.22 0.29 0.22 0.44 0.21 0.24
AMTR_s00025p00086340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.68)
 0.21 0.08 0.01 1.0 0.33 0.01 0.04 0.01 0.04 0.04 0.37 0.27 0.3 0.36 0.22 0.24 0.45 0.34 0.35 0.22 0.19 0.26
AMTR_s00029p00180960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.242)
 0.5 1.0 0.92 0.63 0.41 0.01 0.56 0.17 0.59 0.53 0.45 0.4 0.5 0.64 0.44 0.22 0.66 0.3 0.33 0.48 0.18 0.47
AMTR_s00032p00104030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.65)
 0.01 0.49 1.0 0.27 0.36 0.01 0.23 0.02 0.53 0.23 0.31 0.19 0.35 0.6 0.26 0.18 0.4 0.22 0.27 0.2 0.23 0.32
AMTR_s00038p00221870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.195)
 0.05 0.06 0.42 1.0 0.34 0.01 0.08 0.22 0.13 0.14 0.79 0.5 0.53 0.26 0.14 0.24 0.29 0.44 0.56 0.29 0.11 0.15
AMTR_s00039p00231770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.220)
 0.4 1.0 0.92 0.91 0.26 0.02 0.42 0.12 0.64 0.44 0.74 0.65 0.27 0.28 0.17 0.19 0.6 0.33 0.37 0.07 0.19 0.3
AMTR_s00040p00228500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.272)
 0.06 0.0 0.0 0.73 0.15 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.9 0.28 0.55 0.07 0.16 0.19 0.61 0.0 0.17 0.15 1.0 0.1
AMTR_s00045p00019160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.2)
 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.73 0.16 0.14 0.09 0.04 0.05 0.38 0.1 0.09 0.16 0.27 0.07
AMTR_s00045p00115420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.111)
 0.17 0.17 0.28 1.0 0.12 0.49 0.14 0.13 0.11 0.11 0.63 0.25 0.17 0.19 0.37 0.18 0.06 0.04 0.12 0.51 0.1 0.54
0.0 0.0 0.0 1.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.29 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00047p00220400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.171)
 0.24 0.5 0.69 0.97 0.27 0.15 0.59 0.29 0.52 0.51 1.0 0.8 0.72 0.53 0.35 0.45 0.99 0.74 0.57 0.48 0.66 0.65
AMTR_s00048p00063790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.25)
 0.05 0.02 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.23 0.04 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00049p00200660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.213)
 0.38 0.0 0.03 0.72 1.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.03 0.71 0.44 0.23 0.33 0.37 0.0 0.26 0.19 0.48 0.23 0.44 0.16
AMTR_s00053p00097900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.54)
 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.64 0.06 0.0 0.01 0.0 0.14 0.0 0.28 0.0 1.0 0.02
AMTR_s00053p00210360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.162)
 0.03 0.0 0.08 1.0 0.35 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.39 0.23 0.27 0.2 0.22 0.13 0.46 0.22 0.13 0.22 0.13 0.22
AMTR_s00059p00176060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.180)
 0.0 0.82 0.09 0.49 0.15 0.0 0.01 0.0 0.04 0.03 1.0 0.42 0.32 0.13 0.14 0.22 0.58 0.42 0.39 0.55 0.23 0.17
AMTR_s00061p00197660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.235)
 0.83 0.09 0.0 0.6 0.11 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 1.0 0.1 0.32 0.25 0.37 0.0 0.67 0.03 0.0 0.0 0.01 0.11
AMTR_s00064p00048070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.9)
 0.3 0.0 0.02 1.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.38 0.76 0.26 0.13 0.04 0.18 0.28 0.27 0.49 0.09 0.16 0.18
AMTR_s00064p00110890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.41)
 0.44 0.14 0.11 1.0 0.56 0.0 0.14 0.04 0.15 0.15 0.55 0.51 0.43 0.39 0.33 0.47 0.51 0.48 0.54 0.39 0.53 0.34
AMTR_s00065p00128940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.83)
 0.0 0.47 1.0 0.73 0.15 0.02 0.73 0.01 0.54 0.51 0.62 0.49 0.44 0.57 0.55 0.27 0.55 0.23 0.18 0.25 0.13 0.33
AMTR_s00066p00168000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.193)
 0.0 0.28 0.32 1.0 0.22 0.07 0.1 0.0 0.09 0.07 0.49 0.14 0.36 0.33 0.25 0.31 0.32 0.58 0.73 0.58 0.97 0.14
AMTR_s00067p00068680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.44)
 0.64 0.77 0.01 0.53 0.43 0.0 0.15 0.0 0.2 0.15 1.0 0.44 0.67 0.57 0.45 0.2 0.51 0.37 0.37 0.37 0.38 0.33
AMTR_s00067p00206920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.231)
 0.0 0.06 0.12 1.0 0.27 0.0 0.31 0.01 0.18 0.19 0.82 0.28 0.29 0.33 0.09 0.05 0.64 0.31 0.25 0.67 0.1 0.25
AMTR_s00067p00207090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.232)
 0.01 0.0 0.04 0.8 0.11 0.0 0.18 0.0 0.17 0.16 0.95 0.46 0.16 0.31 0.07 0.12 1.0 0.5 0.37 0.71 0.25 0.24
AMTR_s00072p00121340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.60)
 0.0 0.0 0.0 0.77 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.36 0.23 0.0 0.28 0.61 0.03
AMTR_s00074p00067220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.16)
 0.0 0.04 0.0 0.34 0.52 0.0 0.03 0.0 0.06 0.05 1.0 0.53 0.38 0.31 0.21 0.11 0.52 0.23 0.26 0.42 0.3 0.26
AMTR_s00076p00068170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.16)
 0.0 0.37 0.0 0.44 0.1 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.48 0.25 0.34 0.21 0.15 0.41 0.34 0.35 0.27 0.25 1.0 0.2
AMTR_s00096p00102130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.59)
 0.0 0.0 0.0 0.63 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.03 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07
AMTR_s00097p00139510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00097.38)
 0.07 0.23 0.15 0.6 0.09 0.0 0.07 0.0 0.08 0.08 0.5 0.51 0.24 0.25 0.38 0.68 0.41 0.51 0.41 0.36 1.0 0.17
AMTR_s00104p00126820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.56)
 0.8 0.0 0.28 1.0 0.21 0.09 0.44 0.05 0.34 0.34 0.64 0.55 0.21 0.24 0.15 0.18 0.34 0.41 0.37 0.15 0.29 0.12
AMTR_s00107p00033530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00107.12)
 0.09 0.04 0.09 0.61 0.22 0.11 0.07 0.1 0.06 0.07 1.0 0.38 0.44 0.33 0.4 0.15 0.55 0.44 0.33 0.16 0.22 0.33
AMTR_s00109p00058750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.43)
 0.39 0.52 0.26 1.0 0.5 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.23 0.16 0.12 0.43 0.1 0.16 0.36 0.32 0.07 0.46 0.08
AMTR_s00110p00082690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.42)
 0.0 0.0 0.0 1.0 0.39 0.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.42 0.0 0.07 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.08 0.78 0.04
AMTR_s00111p00065220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.33)
 0.0 0.73 0.21 0.89 0.12 0.15 0.32 0.02 0.79 0.52 0.58 0.54 0.47 1.0 0.33 0.26 0.46 0.36 0.35 0.45 0.46 0.36
AMTR_s00119p00084090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.60)
 0.4 0.56 0.02 0.53 0.83 0.0 0.23 0.12 0.25 0.22 1.0 0.74 0.76 0.61 0.34 0.32 0.82 0.59 0.8 0.72 0.73 0.46
AMTR_s00190p00031580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00190.12)
 0.0 0.36 0.14 0.47 0.65 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 1.0 0.69 0.14 0.06 0.11 0.23 0.46 0.3 0.44 0.18 0.29 0.13
AMTR_s00204p00024590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00204.6)
 0.42 0.04 0.07 1.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.69 0.3 0.24 0.08 0.09 0.2 0.33 0.26 0.17 0.14 0.71 0.17
AMTR_s01033p00010870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01033.1)
 0.29 0.0 0.27 0.55 0.03 0.02 0.32 0.0 0.3 0.32 1.0 0.3 0.63 0.21 0.09 0.15 0.73 0.46 0.48 0.38 0.18 0.3
0.0 0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.1 0.1 0.29 0.42 0.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.64 0.51 0.14 0.08 0.09 0.0 0.6 0.34 0.21 0.22 1.0 0.14
AMTR_s04298p00004120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04298.1)
 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.1 0.08 0.96 0.41 0.17 0.34 0.13 0.12 0.81 0.08 0.12 0.23 0.21 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)