Heatmap: Cluster_134 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo103175	-0.73	-0.46	-0.38	-0.09	-0.05	-0.07	-0.15	-0.18	-0.25	-0.32	-0.24	-0.43	-0.11	0.65	1.23	-0.03	-0.35	-0.25	0.13	1.53	-0.13	0.05	-0.75	-0.87	0.72	0.39	0.35	0.14	-0.48	-0.51	-1.39	-1.38
Smo104121	-0.91	-0.85	-0.86	-0.43	-0.23	0.11	-0.3	-0.06	-0.2	-0.27	-0.32	-0.42	0.4	0.29	0.67	0.27	-0.09	-0.26	0.2	1.04	0.38	0.25	0.18	0.23	0.4	0.2	-0.1	-0.25	-0.27	-0.09	-0.55	-0.22
Smo105150	-0.45	-0.54	-0.42	-0.41	-0.47	-0.48	-0.97	-0.75	-0.83	-0.6	-0.84	-0.54	0.74	1.57	0.75	0.52	-0.76	-0.53	0.39	1.15	1.0	-0.6	-0.35	-0.12	2.01	-2.11	-1.84	-1.8	-0.98	-0.93	-0.79	-0.5
Smo109521	-0.49	-0.67	-0.62	-0.41	-0.38	-0.38	-0.38	-0.31	-0.32	-0.26	-0.31	-0.33	0.51	1.07	1.44	0.43	-0.54	-0.65	0.16	0.4	0.74	0.39	-0.26	-0.09	0.92	-0.07	-0.52	-0.71	-0.47	-0.52	-0.71	-0.71
Smo109639	-0.19	-0.24	-0.05	-0.11	-0.2	0.04	-0.16	-0.3	-0.37	-0.04	-0.23	-0.44	0.33	1.2	1.38	0.69	-0.58	-0.57	0.07	0.95	0.21	-1.48	-0.1	0.13	0.21	-0.58	-0.4	-0.2	-0.63	-0.51	-1.03	-0.98
Smo115428	-1.03	-1.09	-1.21	-0.93	-1.03	-1.06	-0.94	-0.71	-0.57	-0.71	-0.73	-0.74	0.4	1.75	2.0	-0.13	-1.12	-1.05	-0.68	1.42	1.44	-0.87	-0.88	-0.67	1.54	0.24	-0.55	-0.9	-1.35	-1.25	-1.04	-0.68
Smo115638	-0.28	-0.2	-0.29	-0.07	0.08	0.3	-0.11	0.03	-0.17	-0.25	-0.14	-0.59	0.36	1.11	1.18	0.3	-0.61	-0.44	0.13	0.31	-0.92	-0.71	-0.02	0.12	1.12	-0.72	-0.5	-0.4	-0.56	-0.5	-0.45	-0.41
Smo118714	-0.53	-0.48	-0.18	-0.33	-0.22	-0.19	-0.12	-0.17	-0.25	-0.31	-0.17	-0.47	0.47	0.66	0.94	0.01	-0.15	-0.1	-0.24	0.05	0.95	-0.27	-0.32	-0.34	1.12	-0.05	-0.03	-0.01	-0.4	-0.23	-0.46	-0.53
Smo118734	-0.14	-0.06	-0.12	-0.21	0.1	0.03	-0.2	0.09	-0.01	0.14	-0.13	-0.12	0.43	-0.04	0.19	0.59	-0.75	-0.94	0.28	1.35	-0.83	-1.44	-0.13	0.04	0.59	0.27	0.45	0.2	-0.43	-0.53	-1.02	-0.94
Smo119068	-0.07	-0.23	-0.42	-0.21	-0.11	-0.15	-0.09	-0.17	-0.13	-0.17	-0.23	-0.18	-0.16	0.72	1.26	-0.05	-0.56	-0.54	-0.2	0.41	0.22	0.36	-0.52	-0.22	1.17	-0.1	0.15	-0.01	-0.6	-0.51	-0.68	-0.67
Smo122849	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.73	-	-	-	-0.55	2.67	1.95	0.4	-3.67	-2.91	-0.5	0.95	1.29	-	-1.3	-0.36	2.9	1.21	-0.12	0.34	-2.0	-1.99	-1.59	-1.65
Smo123780	-0.46	-0.37	-0.27	-0.22	-0.34	-0.03	-0.02	0.07	-0.06	0.13	0.13	-0.26	0.25	0.17	0.85	0.35	-0.4	-0.91	0.24	0.95	0.32	0.73	-0.24	0.02	-0.42	-0.16	-0.73	-0.15	-0.12	-0.02	-0.52	-0.5
Smo126226	-0.05	0.09	-0.38	-0.42	-0.58	-0.23	-0.07	-0.51	-0.21	-0.35	-0.23	-0.27	-0.95	0.47	1.25	0.05	0.44	0.22	0.13	0.15	1.0	0.8	0.19	-0.02	0.65	-2.09	-1.19	-1.58	0.0	0.21	-0.71	-0.51
Smo126257	-0.16	0.1	-0.22	0.09	-0.29	-0.17	0.29	-0.19	0.3	0.3	0.11	0.12	0.24	0.57	1.3	0.56	-0.3	0.02	-1.44	0.77	0.66	-1.65	-0.3	-0.44	0.6	-2.23	-1.17	-0.9	-0.16	0.1	-0.85	-0.96
Smo126842	-0.64	-0.56	-0.3	-0.17	0.1	0.38	0.28	0.41	0.01	-0.25	-0.22	-0.64	0.6	-0.39	0.7	0.13	-0.17	0.22	0.21	0.05	-0.8	0.34	0.24	0.36	-0.55	-0.06	0.23	0.43	-0.2	-0.02	-0.77	-0.86
Smo127479	-0.25	-0.47	-0.42	-0.43	-0.42	-0.4	-0.54	-0.71	-0.67	-0.72	-0.73	-0.79	0.26	1.13	1.33	0.02	-0.67	-0.0	-0.44	1.77	0.42	0.73	-0.42	-0.37	0.9	-0.48	-0.06	-0.19	-0.9	-0.86	-1.16	-0.82
Smo137828	1.17	0.58	0.39	-0.11	-0.31	0.39	0.06	0.29	0.52	0.73	0.65	1.1	-4.61	0.03	-1.0	-5.19	-2.15	-0.7	-2.76	2.5	0.68	-1.66	-3.12	-1.94	-1.19	-0.19	-0.56	0.33	-1.19	-2.54	-2.0	-2.38
Smo143005	-0.76	-0.62	-0.89	-0.58	-0.79	-0.62	-0.62	-0.47	-0.13	-0.29	-0.35	-0.24	0.3	0.78	0.53	0.17	-0.48	-0.37	-0.3	1.58	1.23	1.84	-0.45	-0.35	-0.12	-0.52	-1.17	-1.23	-0.26	-0.39	-0.6	-0.78
Smo145221	-0.35	-0.32	-0.47	-0.18	0.07	-0.05	-0.19	-0.15	-0.25	-0.2	-0.46	-0.33	0.22	0.86	1.29	0.41	-0.42	-0.78	0.17	1.4	-0.09	-0.7	-0.41	-0.18	1.0	-0.42	-0.55	-0.43	-0.41	-0.21	-1.11	-1.08
Smo148621	-0.43	-0.44	-0.5	-0.37	-0.43	-0.17	-0.44	-0.34	-0.36	-0.23	-0.47	-0.38	0.34	0.74	1.45	0.53	-0.06	0.02	0.26	0.57	0.75	0.1	-0.05	0.07	0.27	-0.81	-1.05	-1.09	-0.07	-0.06	-0.28	-0.38
Smo148678	-0.61	-0.52	-0.66	-0.1	0.33	0.29	0.46	0.25	0.15	0.03	-0.26	-0.54	0.67	1.11	1.69	0.59	-0.96	-0.96	-0.2	-0.2	-0.75	-1.52	-0.75	-0.41	0.94	-0.42	-0.57	-0.9	-0.73	-0.6	-0.37	-0.09
Smo148966	-0.46	-0.38	-0.32	-0.32	-0.34	-0.16	-0.27	-0.24	-0.3	0.0	-0.14	-0.3	0.43	0.85	0.89	0.64	-0.6	-0.43	-0.22	0.61	1.42	0.15	-0.08	0.11	0.66	-0.06	-1.12	-1.1	-0.59	-0.63	-0.97	-0.87
Smo150230	-0.29	-0.09	-0.16	-0.37	-0.43	-0.41	-0.52	-0.58	-0.68	-0.5	-0.51	-0.59	0.04	0.8	0.31	-0.03	-0.72	-0.27	-0.22	0.72	1.18	0.82	-0.37	-0.19	1.33	-0.68	-0.53	-0.81	-0.82	-0.79	0.67	0.35
Smo152721	-0.21	-0.4	-0.72	-0.58	-0.93	-0.69	-0.91	-0.8	-0.6	-0.49	-0.28	-0.28	-0.03	0.9	0.52	-0.16	-0.98	0.39	-0.2	2.07	0.88	1.54	-0.82	-0.67	-0.44	0.47	-0.18	-0.6	-1.04	-1.02	-0.95	-0.56
Smo154058	-0.69	-0.54	-0.42	0.02	0.0	0.25	0.2	0.23	0.13	-0.07	-0.54	-0.41	-0.26	0.44	0.73	-0.02	-0.24	-0.27	-0.04	0.57	0.07	-0.27	-0.45	-0.27	1.3	-0.01	0.2	0.22	-0.37	-0.29	-0.73	-0.88
Smo164064	-0.07	-0.04	-0.18	0.02	0.14	0.2	-0.36	-0.23	-0.15	-0.28	-0.23	-0.38	0.35	0.47	1.22	0.64	0.06	-0.56	0.17	0.86	0.06	-0.01	0.2	0.4	0.52	-0.75	-1.14	-0.7	-0.46	-0.35	-1.7	-1.59
Smo166463	-0.26	-0.12	-0.06	-0.05	-0.15	-0.01	-0.24	-0.37	-0.26	-0.42	-0.66	-0.37	0.31	1.22	0.62	0.31	-0.5	0.1	0.17	0.98	0.35	0.25	-0.15	-0.0	0.64	-0.82	-0.51	-0.79	-0.47	-0.48	-0.55	-0.5
Smo166966	-0.17	0.01	-0.03	-0.12	-0.09	-0.35	-0.53	-0.47	-0.53	-0.43	-0.29	-0.55	0.58	0.33	-0.28	1.37	-0.87	-1.28	0.78	1.54	0.47	-3.33	-0.49	0.14	0.51	0.51	-0.08	-0.38	-0.45	-0.42	-0.6	-1.38
Smo168360	-0.42	0.45	-0.25	-0.34	-0.2	0.07	-0.09	-0.27	0.04	-0.19	-0.79	-0.72	-1.1	-0.2	1.17	-0.19	-0.66	-0.26	-0.1	1.88	0.69	1.01	-1.24	-0.95	-0.12	-0.32	0.48	-0.21	-0.76	-0.68	-0.75	-0.85
Smo169962	-0.15	-0.22	-0.28	-0.02	-0.18	-0.07	-0.43	-0.33	-0.31	-0.13	-0.23	-0.12	0.01	0.23	0.81	0.14	-0.47	-0.6	0.12	0.11	0.69	0.12	0.05	0.24	0.58	0.09	0.2	-0.11	-0.26	-0.3	-0.24	-0.08
Smo170654	-0.26	-0.08	-0.3	-0.11	-0.49	-0.11	-0.13	-0.08	0.04	-0.15	-0.23	-0.2	0.21	0.99	0.6	0.32	-0.33	-0.43	0.15	0.83	0.45	0.29	0.14	0.26	0.21	-1.25	-1.29	-1.2	-0.22	-0.05	-0.16	-0.02
Smo170980	-0.1	-0.08	-0.24	0.05	0.1	0.17	0.11	0.04	-0.22	-0.24	-0.28	-0.26	0.01	0.57	1.14	0.12	-0.53	-0.93	-0.04	0.27	-0.37	-0.09	-0.21	-0.01	0.73	0.11	0.39	0.25	-0.64	-0.66	-0.6	-0.63
Smo171760	-0.28	-0.07	-0.1	-0.05	-0.19	-0.07	-0.11	-0.43	-0.26	-0.46	-0.16	-0.44	0.23	0.48	1.01	0.39	-0.02	0.05	0.24	0.45	0.44	0.38	0.28	0.28	0.27	-1.63	-1.05	-0.92	-0.17	-0.06	-0.32	-0.18
Smo177892	-0.37	-0.4	-0.42	-0.02	-0.37	-0.05	-0.37	-0.33	-0.22	-0.41	-0.42	-0.27	0.18	0.9	1.0	0.47	-0.53	0.71	0.25	0.79	0.68	0.16	0.2	0.28	0.34	-1.23	-1.19	-1.76	-0.29	-0.36	-0.59	-0.28
Smo179259	-0.52	-0.3	-0.3	-0.27	-0.33	-0.29	-0.27	-0.54	-0.56	-0.67	-0.65	-0.57	0.6	1.17	0.92	0.74	-0.2	-0.16	0.42	0.56	0.03	0.04	0.38	0.48	-0.06	-0.55	-0.48	-0.38	-0.14	-0.07	-0.42	-0.51
Smo18122	-0.35	-0.31	-0.79	-0.33	-0.41	-0.18	-0.13	-0.28	-0.35	-0.23	-0.48	-0.34	0.57	0.3	0.78	0.14	0.35	0.67	-0.15	-0.44	0.89	1.01	-0.31	-0.31	0.03	-1.43	-1.1	-1.36	0.24	0.17	0.23	0.34
Smo183048	-0.17	-0.24	-0.07	-0.22	-0.1	-0.12	-0.13	-0.19	-0.2	-0.35	-0.27	-0.42	0.12	0.78	0.44	0.49	-0.56	-0.44	0.23	1.18	0.34	1.11	-0.2	-0.08	0.15	-0.36	-0.39	-0.38	-0.34	-0.28	-1.13	-1.19
Smo184747	-0.15	-0.12	-0.17	0.01	0.1	0.07	0.08	0.07	-0.08	-0.2	-0.19	-0.35	0.01	0.02	1.18	0.27	-0.21	-0.32	0.24	0.72	-0.02	0.02	-0.22	-0.05	-0.91	0.04	-0.16	-0.25	-0.03	-0.02	-0.37	-0.43
Smo185086	-0.34	-0.33	-0.5	-0.35	-0.32	-0.27	-0.38	-0.41	-0.23	-0.32	-0.35	-0.32	0.02	0.56	0.75	-0.02	-0.15	-0.12	-0.1	1.17	0.83	1.33	0.03	0.19	0.18	-1.23	-1.17	-1.24	-0.24	-0.24	-0.25	-0.08
Smo228959	-0.42	-0.89	-0.9	-0.33	-0.39	0.16	-0.05	0.08	0.36	0.27	0.27	0.08	0.1	0.7	0.28	0.45	-0.48	-0.96	-0.1	1.13	0.57	0.68	-0.81	-0.83	1.03	-0.96	-0.43	-0.11	-0.06	0.05	-1.34	-1.85
Smo229065	-0.36	-0.07	-0.6	-0.28	-0.84	-0.52	-0.67	-0.66	-0.35	-0.42	-0.55	-0.58	0.28	1.04	0.82	0.47	-0.37	0.28	0.23	-0.02	0.78	0.28	0.07	0.0	1.5	-0.39	-0.12	-0.13	-0.45	-0.52	-1.28	-0.8
Smo230673	-0.48	-0.42	-0.45	-0.6	-0.68	-0.53	-0.71	-0.64	-0.47	-0.45	-0.36	-0.52	0.42	1.01	0.98	0.33	-0.95	-1.13	0.0	0.79	1.7	0.4	-0.3	-0.07	1.49	-0.33	-1.14	-0.99	-0.6	-0.65	-0.99	-0.55
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Smo409480	-1.2	-1.64	-2.35	-1.62	-1.97	-1.45	-1.47	-0.97	-1.17	-1.15	-1.03	-1.1	0.86	1.43	0.32	1.23	-0.72	0.29	1.72	1.34	0.26	-0.03	-0.06	0.35	-1.32	-0.63	-1.93	-2.74	0.38	0.33	0.63	0.7
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Smo423875	-4.57	-4.94	-	-3.92	-7.03	-4.28	-3.73	-4.5	-5.32	-4.07	-5.54	-4.92	-1.55	1.26	2.33	-2.45	-3.41	-1.82	-0.95	2.26	1.12	2.59	-3.38	-4.11	0.25	1.29	1.29	1.71	-4.73	-4.25	-4.48	-4.35
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Smo437686	0.16	-0.3	-0.03	-0.3	-0.16	-0.23	-0.29	-0.75	-0.54	0.05	-0.13	-0.26	0.99	0.72	1.13	1.05	-0.87	-1.78	0.35	-0.16	-2.94	-1.1	-0.43	0.28	0.29	0.71	0.03	0.03	-0.97	-0.49	-0.23	0.28
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Smo437971	-0.64	-0.58	-0.67	-0.59	-0.48	-0.23	-0.1	0.0	-0.18	-0.3	-0.51	-0.48	-0.18	0.29	1.35	0.02	-0.59	-0.75	-0.4	1.08	0.01	1.44	-0.59	-0.47	-0.33	0.79	0.38	0.24	-0.45	-0.49	-0.56	-0.43
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Smo439260	-0.31	-0.66	-0.09	-0.7	-0.78	-0.59	-0.29	-0.39	0.05	0.05	0.45	-0.0	-0.26	0.96	1.43	-0.36	-0.73	-0.34	1.48	0.75	-6.01	-2.21	-0.48	-0.59	-1.17	-1.52	0.08	-0.41	-0.95	-0.82	0.8	1.37
Smo439394	-0.62	-0.4	-0.53	-0.41	-0.49	-0.16	-0.34	-0.42	-0.08	-0.24	-0.39	-0.37	0.44	0.71	0.89	0.54	-0.27	-1.26	-0.12	1.08	0.78	1.01	0.15	0.05	1.01	-0.88	-1.37	-1.65	-0.24	-0.3	-0.47	-0.8
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Smo92007	-0.04	-0.08	-0.16	-0.21	-0.21	0.11	-0.22	-0.34	-0.3	-0.41	-0.35	-0.4	0.27	0.99	1.33	0.41	0.22	0.58	0.29	0.42	-0.42	-0.17	0.1	0.08	-0.56	-1.6	-1.2	-1.29	-0.1	-0.15	-0.14	0.02
Smo92426	-0.32	-0.35	-0.81	-0.28	-0.11	-0.01	-0.15	0.08	0.2	0.02	-0.1	-0.37	0.65	0.4	0.45	0.76	-0.45	-0.52	-0.35	1.2	0.54	-0.32	0.08	0.13	-0.15	-0.4	-0.34	-0.27	-0.27	-0.15	-0.37	-0.69
Smo94581	-0.5	-0.69	-0.13	0.03	-0.17	0.39	0.09	-0.0	0.1	-0.07	0.07	-0.46	0.05	0.82	1.3	0.23	-0.21	-0.12	-0.26	0.56	-0.11	1.4	-0.34	-0.22	-0.96	-1.12	-1.21	-1.18	-0.37	-0.23	-0.57	-0.37
Smo97826	-0.04	0.28	0.3	-0.05	-0.11	0.52	-0.06	-0.46	-0.24	-0.04	0.04	-0.3	-1.25	0.7	-2.59	-0.46	-0.42	-0.58	-2.05	2.8	-0.49	-1.0	1.19	0.35	-1.25	-3.23	-1.43	-1.43	-0.4	-0.03	-1.58	-2.03
Smo99718	-0.75	-0.35	-0.4	-0.24	-0.26	-0.21	-0.43	-0.21	-0.48	-0.56	-0.64	-0.74	0.31	1.02	1.11	0.34	-0.49	-0.42	-0.08	0.85	-0.22	-0.45	-0.12	-0.14	1.43	0.3	0.16	0.13	-0.63	-0.53	-0.81	-0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.