1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_174 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.4 0.6 0.63 0.61 0.66 0.57 0.55 0.55 0.51 0.49 0.45 0.42 0.82 0.49 0.29 1.0 0.37 0.26 0.49 0.1 0.18 0.06 0.54 0.52 0.29 0.61 0.54 0.62 0.35 0.4 0.21 0.2
0.37 0.37 0.45 0.52 0.54 0.41 0.77 0.74 0.6 0.67 0.57 0.44 1.0 0.65 0.53 0.76 0.4 0.23 0.48 0.16 0.05 0.05 0.35 0.37 0.06 0.58 0.47 0.36 0.49 0.47 0.6 0.56
0.66 0.77 0.79 0.8 0.7 0.66 0.85 0.92 0.92 1.0 0.93 0.86 0.94 0.92 0.62 0.86 0.46 0.31 0.59 0.08 0.09 0.25 0.64 0.6 0.14 0.9 0.82 0.83 0.51 0.54 0.5 0.36
0.17 0.26 0.4 0.42 0.35 0.34 1.0 0.66 0.65 0.66 0.51 0.41 0.56 0.35 0.59 0.42 0.1 0.07 0.2 0.0 0.02 0.02 0.02 0.05 0.03 0.45 0.19 0.2 0.11 0.13 0.16 0.15
0.8 0.83 0.82 0.76 0.9 0.88 0.73 0.78 0.76 0.8 0.74 0.67 1.0 0.68 0.84 0.6 0.53 0.35 0.56 0.07 0.1 0.46 0.36 0.24 0.21 0.58 0.85 0.95 0.43 0.45 0.43 0.38
0.54 0.57 0.62 0.63 0.64 0.61 0.62 0.77 0.73 0.82 0.78 0.67 0.74 0.88 1.0 0.72 0.41 0.37 0.54 0.26 0.18 0.28 0.49 0.55 0.28 0.71 0.47 0.45 0.45 0.46 0.49 0.58
0.14 0.16 0.23 0.17 0.09 0.22 0.17 0.23 0.18 0.25 0.26 0.24 1.0 0.1 0.8 0.92 0.08 0.12 0.19 0.03 0.01 0.0 0.12 0.16 0.03 0.27 0.16 0.24 0.13 0.11 0.15 0.21
0.52 0.56 0.59 0.64 0.61 0.52 0.86 0.8 0.69 0.72 0.75 0.62 1.0 0.68 0.51 0.77 0.48 0.35 0.52 0.06 0.11 0.2 0.41 0.46 0.19 0.43 0.29 0.22 0.59 0.58 0.66 0.63
0.57 0.66 0.8 0.72 0.67 0.68 0.9 1.0 0.91 0.94 0.79 0.66 0.84 0.57 0.32 0.85 0.43 0.31 0.55 0.05 0.52 0.01 0.59 0.5 0.16 0.57 0.4 0.41 0.56 0.48 0.85 0.56
0.41 0.44 0.52 0.56 0.55 0.48 0.7 0.64 0.7 0.79 0.67 0.59 1.0 0.64 0.73 0.72 0.26 0.21 0.22 0.01 0.01 0.0 0.42 0.44 0.04 0.56 0.39 0.36 0.25 0.27 0.36 0.4
0.79 0.74 0.75 0.84 0.83 0.75 0.75 0.8 0.89 0.88 0.9 0.83 0.85 0.95 1.0 0.75 0.55 0.41 0.64 0.24 0.3 0.23 0.78 0.89 0.45 0.86 0.7 0.7 0.51 0.57 0.6 0.66
0.3 0.22 0.36 0.59 0.72 0.65 0.75 1.0 0.7 0.82 0.7 0.49 0.51 0.92 0.44 0.35 0.39 0.18 0.87 0.28 0.3 0.12 0.4 0.4 0.82 0.82 0.96 0.78 0.34 0.33 0.52 0.66
0.41 0.32 0.31 0.3 0.3 0.27 0.29 0.35 0.39 0.48 0.51 0.48 1.0 0.62 0.55 0.49 0.16 0.13 0.23 0.08 0.17 0.19 0.2 0.23 0.31 0.61 0.35 0.32 0.19 0.19 0.19 0.25
0.53 0.69 0.73 0.71 0.67 0.63 0.8 0.76 0.77 0.89 0.79 0.76 0.88 0.78 0.66 1.0 0.38 0.24 0.41 0.08 0.06 0.04 0.26 0.26 0.26 0.61 0.67 0.66 0.45 0.48 0.35 0.37
0.2 0.19 0.39 0.52 0.42 0.36 0.88 1.0 0.83 0.87 0.58 0.44 0.86 0.26 0.13 0.57 0.16 0.09 0.08 0.01 0.02 0.01 0.17 0.17 0.17 0.61 0.21 0.16 0.2 0.19 0.14 0.1
0.29 0.5 0.44 0.49 0.41 0.44 0.4 0.35 0.41 0.31 0.27 0.28 0.94 0.7 1.0 0.79 0.11 0.25 0.16 0.26 0.08 0.19 0.34 0.64 0.2 0.13 0.08 0.09 0.17 0.25 0.09 0.15
0.64 0.67 0.72 0.75 0.79 0.74 0.73 0.84 0.78 0.79 0.73 0.7 0.89 1.0 0.98 0.97 0.4 0.38 0.65 0.36 0.24 0.3 0.59 0.65 0.25 0.69 0.66 0.67 0.46 0.47 0.51 0.49
0.49 0.6 0.69 0.63 0.62 0.6 0.75 0.79 0.78 0.83 0.74 0.68 0.73 0.79 0.63 0.77 0.33 0.27 0.35 0.06 0.14 0.19 0.64 0.67 0.16 1.0 0.93 0.84 0.39 0.38 0.55 0.63
0.65 0.68 0.75 0.81 0.78 0.74 0.83 1.0 0.92 0.93 0.93 0.82 0.75 0.77 0.63 0.81 0.44 0.32 0.61 0.0 0.19 0.45 0.58 0.62 0.64 0.92 0.74 0.81 0.48 0.53 0.41 0.41
0.69 0.76 0.87 0.86 0.86 0.92 0.89 0.95 0.95 1.0 0.95 0.8 0.84 0.76 1.0 0.83 0.4 0.37 0.69 0.24 0.49 0.16 0.62 0.69 0.57 0.78 0.94 0.84 0.47 0.48 0.76 0.78
0.4 0.34 0.41 0.39 0.44 0.45 0.44 0.45 0.43 0.47 0.42 0.37 1.0 0.43 0.69 0.76 0.23 0.2 0.36 0.04 0.05 0.05 0.49 0.59 0.07 0.29 0.27 0.32 0.31 0.36 0.2 0.19
0.49 0.47 0.51 0.62 0.54 0.49 0.5 0.58 0.54 0.56 0.49 0.5 0.66 1.0 0.75 0.53 0.29 0.1 0.25 0.0 0.02 0.01 0.38 0.41 0.05 0.54 0.47 0.48 0.31 0.3 0.31 0.35
0.23 0.15 0.16 0.17 0.23 0.18 0.15 0.26 0.21 0.36 0.23 0.26 1.0 0.75 0.47 0.56 0.04 0.15 0.11 0.0 0.16 0.0 0.04 0.06 0.36 0.3 0.2 0.27 0.05 0.07 0.06 0.08
0.47 0.59 0.71 0.8 0.76 0.76 0.77 1.0 1.0 0.99 0.86 0.79 0.52 0.66 0.66 0.53 0.45 0.32 0.47 0.09 0.08 0.02 0.55 0.5 0.76 0.81 0.84 0.73 0.49 0.5 0.34 0.5
0.52 0.63 0.63 0.56 0.68 0.58 0.5 0.58 0.9 0.92 0.8 0.64 0.89 0.93 1.0 0.95 0.29 0.36 0.69 0.02 0.13 0.05 0.44 0.41 0.26 0.78 0.67 0.54 0.34 0.31 0.38 0.49
0.07 0.03 0.35 0.53 0.33 0.33 1.0 0.94 0.48 0.64 0.83 0.29 0.0 0.0 0.12 0.04 0.03 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.95 0.08 0.33 0.07 0.04 0.0 0.0
0.52 0.51 0.57 0.6 0.61 0.56 0.71 0.73 0.73 0.74 0.75 0.56 1.0 0.95 0.83 0.63 0.45 0.33 0.71 0.0 0.01 0.0 0.63 0.83 0.04 0.64 0.51 0.56 0.44 0.5 0.47 0.49
0.18 0.16 0.18 0.16 0.18 0.16 0.15 0.27 0.31 0.34 0.29 0.22 1.0 0.4 0.66 0.99 0.03 0.03 0.12 0.0 0.0 0.05 0.18 0.42 0.06 0.4 0.2 0.15 0.09 0.11 0.06 0.07
0.32 0.36 0.63 0.54 0.52 0.65 0.46 0.39 0.44 0.36 0.37 0.31 0.99 0.78 0.75 0.58 0.1 0.09 0.2 0.0 0.06 0.01 0.18 0.25 0.33 0.44 0.97 1.0 0.14 0.16 0.1 0.07
0.54 0.49 0.36 0.35 0.4 0.38 0.3 0.31 0.39 0.41 0.36 0.35 1.0 0.41 0.41 0.79 0.26 0.29 0.37 0.13 0.03 0.08 0.48 0.58 0.02 0.2 0.25 0.22 0.23 0.27 0.22 0.25
0.56 0.56 0.5 0.55 0.61 0.56 0.55 0.56 0.57 0.63 0.54 0.49 1.0 0.7 0.66 0.82 0.26 0.3 0.49 0.15 0.13 0.07 0.49 0.51 0.19 0.68 0.65 0.63 0.31 0.31 0.36 0.39
0.58 0.64 0.81 0.75 0.97 1.0 0.77 0.9 0.75 0.71 0.69 0.47 0.6 0.52 0.41 0.52 0.25 0.16 0.27 0.13 0.0 0.07 0.63 0.57 0.27 0.48 0.92 0.85 0.26 0.24 0.17 0.21
0.87 0.77 0.77 0.76 0.74 0.69 0.38 0.46 0.72 0.65 0.64 0.6 0.9 0.92 0.71 0.89 0.51 0.32 0.5 0.01 0.08 0.09 0.38 0.39 0.2 0.64 0.96 1.0 0.34 0.45 0.35 0.37
0.51 0.63 0.6 0.72 0.68 0.57 0.65 0.79 0.71 0.67 0.72 0.56 1.0 0.83 0.83 0.83 0.24 0.14 0.33 0.04 0.08 0.02 0.3 0.28 0.18 0.64 0.78 0.77 0.28 0.29 0.37 0.4
0.5 0.63 0.65 0.76 0.73 0.67 0.64 0.58 0.61 0.57 0.54 0.48 0.77 1.0 0.63 0.83 0.26 0.16 0.3 0.1 0.07 0.08 0.29 0.2 0.24 0.51 1.0 0.98 0.28 0.33 0.24 0.27
0.51 0.54 0.67 0.71 0.8 0.78 0.67 0.67 0.61 0.58 0.55 0.45 0.81 0.75 0.36 1.0 0.43 0.38 0.63 0.06 0.26 0.03 0.63 0.72 0.34 0.81 0.71 0.8 0.42 0.46 0.36 0.36
0.49 0.36 0.35 0.49 0.51 0.44 0.52 0.68 0.75 0.77 0.74 0.69 0.97 1.0 0.94 0.68 0.31 0.23 0.41 0.04 0.05 0.01 0.33 0.36 0.12 0.75 0.58 0.57 0.38 0.41 0.41 0.4
0.38 0.51 0.59 0.68 0.55 0.62 0.64 0.63 0.73 0.82 0.71 0.55 1.0 0.9 0.75 0.76 0.36 0.36 0.37 0.0 0.0 0.0 0.66 0.63 0.03 0.71 0.41 0.39 0.26 0.3 0.26 0.31
0.62 0.6 0.65 0.73 0.74 0.69 0.93 0.9 0.74 0.8 0.66 0.6 0.84 0.74 0.24 1.0 0.25 0.26 0.33 0.0 0.02 0.0 0.54 0.56 0.1 0.47 0.7 0.66 0.34 0.35 0.66 0.45
0.27 0.33 0.31 0.34 0.35 0.34 0.28 0.33 0.33 0.49 0.45 0.4 1.0 0.49 0.71 0.83 0.08 0.09 0.09 0.02 0.11 0.02 0.25 0.3 0.27 0.27 0.23 0.3 0.11 0.12 0.08 0.09
0.43 0.47 0.56 0.58 0.46 0.53 0.57 0.66 0.74 0.93 0.75 0.61 1.0 0.78 0.46 0.68 0.35 0.33 0.43 0.05 0.0 0.24 0.58 0.65 0.07 0.57 0.44 0.31 0.48 0.51 0.26 0.3
0.61 0.68 0.66 0.64 0.81 0.82 0.6 0.67 0.69 0.74 0.66 0.53 0.58 0.59 0.5 0.7 0.19 0.16 0.35 0.16 0.19 0.1 0.29 0.2 0.29 0.68 0.92 1.0 0.31 0.33 0.25 0.29
0.52 0.43 0.29 0.43 0.59 0.59 0.39 0.51 0.41 0.43 0.48 0.44 0.71 0.87 1.0 0.83 0.41 0.48 0.85 0.16 0.11 0.16 0.62 0.72 0.09 0.14 0.16 0.19 0.5 0.43 0.46 0.52
0.53 0.48 0.44 0.52 0.49 0.58 0.42 0.43 0.52 0.53 0.5 0.53 1.0 0.72 0.96 0.85 0.29 0.32 0.62 0.27 0.08 0.24 0.65 0.8 0.06 0.19 0.14 0.15 0.32 0.34 0.28 0.35
0.23 0.21 0.25 0.29 0.35 0.31 0.22 0.2 0.18 0.23 0.26 0.22 0.88 0.34 0.74 1.0 0.07 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.39 0.5 0.01 0.08 0.07 0.11 0.13 0.22 0.07 0.08
0.42 0.39 0.45 0.57 0.61 0.69 0.82 0.91 0.86 0.84 0.69 0.52 0.8 1.0 0.88 0.79 0.33 0.29 0.51 0.09 0.11 0.09 0.47 0.49 0.19 0.53 0.83 0.81 0.41 0.47 0.38 0.41
0.02 0.13 0.23 0.2 0.12 0.1 1.0 0.56 0.32 0.47 0.3 0.23 0.33 0.18 0.1 0.05 0.03 0.05 0.11 0.15 0.06 0.04 0.04 0.04 0.02 0.22 0.08 0.05 0.08 0.09 0.18 0.15
0.28 0.28 0.24 0.31 0.18 0.2 0.19 0.22 0.32 0.37 0.45 0.33 0.95 0.17 0.79 1.0 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.19 0.01 0.15 0.06 0.06 0.04 0.06 0.04 0.02
0.47 0.52 0.42 0.46 0.46 0.48 0.49 0.42 0.39 0.35 0.4 0.41 1.0 0.77 0.69 0.78 0.21 0.12 0.3 0.0 0.0 0.0 0.3 0.78 0.13 0.25 0.12 0.12 0.19 0.21 0.1 0.11
0.2 0.28 0.51 0.25 0.27 0.53 0.27 0.31 0.55 0.36 0.11 0.34 0.83 0.61 0.68 0.48 0.09 0.11 0.47 0.03 0.05 0.0 0.11 0.11 0.19 0.3 1.0 0.4 0.23 0.26 0.16 0.11
0.44 0.47 0.48 0.54 0.61 0.36 0.65 0.62 0.75 0.77 0.75 0.72 1.0 0.8 0.99 0.84 0.33 0.18 0.53 0.08 0.0 0.01 0.57 0.7 0.1 0.89 0.43 0.39 0.38 0.41 0.32 0.39
0.66 0.63 0.7 0.79 0.78 0.8 0.8 1.0 0.84 0.86 0.85 0.76 0.66 0.79 0.72 0.7 0.33 0.26 0.63 0.47 0.32 0.17 0.43 0.48 0.39 0.88 0.67 0.63 0.4 0.4 0.62 0.71
0.64 0.85 0.89 0.88 0.88 0.84 0.91 0.9 0.74 0.79 0.7 0.71 0.69 0.8 0.62 0.73 0.5 0.47 0.71 0.21 0.32 0.02 0.65 0.58 0.49 0.75 1.0 1.0 0.54 0.53 0.61 0.59
0.43 0.54 0.67 0.62 0.7 0.65 0.84 0.91 0.93 1.0 0.94 0.68 0.98 0.68 0.86 0.73 0.58 0.54 0.41 0.12 0.12 0.23 0.57 0.52 0.1 0.56 0.47 0.48 0.54 0.57 0.57 0.61
0.22 0.33 0.52 0.7 0.65 0.63 0.78 0.97 0.76 0.77 0.6 0.45 0.76 0.86 0.39 0.74 0.37 0.28 0.49 0.36 0.51 0.06 0.59 0.59 1.0 0.93 0.5 0.44 0.42 0.38 0.51 0.68
0.19 0.21 0.27 0.29 0.27 0.27 0.32 0.39 0.36 0.43 0.36 0.32 1.0 0.53 0.35 0.41 0.15 0.11 0.18 0.06 0.07 0.02 0.22 0.25 0.19 0.46 0.32 0.34 0.14 0.15 0.16 0.18
0.5 0.41 0.44 0.48 0.66 0.51 0.52 0.55 0.52 0.52 0.45 0.4 1.0 0.62 0.43 0.86 0.27 0.24 0.46 0.05 0.01 0.02 0.52 0.66 0.39 0.65 0.82 0.83 0.32 0.37 0.28 0.39
0.62 0.6 0.58 0.65 0.74 0.78 0.39 0.37 0.47 0.42 0.43 0.33 0.64 0.96 0.64 0.99 0.55 0.3 0.74 0.01 0.03 0.06 0.53 0.51 0.13 0.55 0.88 1.0 0.36 0.47 0.18 0.22
0.46 0.51 0.56 0.74 0.88 0.77 0.7 0.63 0.51 0.52 0.46 0.4 0.92 0.52 0.26 1.0 0.43 0.13 0.65 0.02 0.07 0.01 0.47 0.35 0.13 0.85 0.68 0.75 0.43 0.47 0.25 0.27
0.49 0.38 0.29 0.37 0.3 0.3 0.3 0.25 0.34 0.35 0.39 0.3 0.84 0.65 0.84 1.0 0.25 0.35 0.08 0.02 0.01 0.05 0.48 0.9 0.21 0.18 0.14 0.15 0.2 0.21 0.12 0.1
0.6 0.6 0.6 0.67 0.7 0.58 0.65 0.7 0.78 1.0 0.79 0.74 0.74 0.62 0.71 0.76 0.44 0.33 0.4 0.29 0.02 0.3 0.6 0.71 0.1 0.42 0.33 0.42 0.46 0.49 0.43 0.49
0.11 0.19 0.49 0.73 0.61 0.53 0.98 1.0 0.7 0.56 0.39 0.24 0.67 0.5 0.18 0.56 0.25 0.22 0.4 0.06 0.15 0.09 0.35 0.3 0.06 0.65 0.24 0.21 0.24 0.23 0.29 0.31
0.6 0.67 0.71 0.71 0.79 0.72 0.79 0.98 0.84 0.9 0.83 0.72 0.71 0.52 0.89 0.65 0.38 0.31 0.63 0.02 0.13 0.3 0.54 0.61 0.46 0.93 0.86 1.0 0.5 0.5 0.26 0.33
0.5 0.55 0.6 0.62 0.6 0.56 0.73 0.61 0.69 0.74 0.62 0.55 0.81 0.94 0.33 1.0 0.27 0.24 0.62 0.04 0.04 0.02 0.31 0.31 0.14 0.67 0.64 0.73 0.39 0.44 0.31 0.31
0.47 0.48 0.55 0.64 0.6 0.58 0.66 0.79 0.75 0.73 0.68 0.58 0.66 1.0 0.63 0.69 0.46 0.37 0.48 0.0 0.01 0.02 0.38 0.33 0.12 0.67 0.82 0.77 0.46 0.47 0.55 0.58
0.66 0.76 0.76 0.8 0.74 0.76 0.82 0.93 0.94 0.95 0.84 0.81 0.73 0.83 0.71 0.96 0.43 0.26 0.77 0.14 0.32 0.39 0.48 0.5 0.51 1.0 0.8 0.89 0.5 0.52 0.5 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)