Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100345	-5.54	-	-	-	-	-	-	-3.97	-	-5.97	-	-	-	-4.79	-	-	-5.51	-4.86	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.61
Smo101484	-	-	0.73	-	-	-	-	-	-	-	-0.77	-	0.03	-	-	0.23	-	-	4.68	-	-	-	-	-	-	-	0.94	-	-	-	-	-
Smo110504	-	-	-	0.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.27	4.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo119899	-	-	-	-	-	-6.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	-	-1.02	-	-	-	-	-	-4.25	-	-	-4.77	-	-5.56
Smo122361	-7.68	-6.81	-6.03	-	-	-	-	-	-	-	-6.21	-	-5.45	-	-6.02	-5.85	-4.57	-2.1	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.66	-5.59	-	-7.7
Smo126324	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.99	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo137590	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo19633	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	1.0	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo24152	-	-	-	-	-	-4.47	-4.65	-	-	-3.94	-	-	-4.36	-	-3.53	-	-	-3.86	4.87	-	-	-	-3.57	-4.59	-1.06	-2.43	-1.22	-0.73	-2.54	-1.93	-4.55	-
Smo25501	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.64	4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo36119	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.45	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo403115	-	-	-	-	-	-	-1.89	-	-	-	-	-	-1.5	-	-	-	-	-1.71	4.89	-	-	-	-	-	-	-	-	0.53	-	-	-	-
Smo403198	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo403410	-2.12	-1.75	-1.65	-2.02	-1.94	-1.75	-2.03	-2.08	-1.82	-2.15	-2.14	-2.51	-7.02	-7.73	-10.08	-6.97	-5.61	-2.69	4.82	-	-	-	-5.23	-4.58	-2.82	-3.82	-4.62	-3.69	-5.15	-5.94	-5.51	-4.56
Smo404224	-4.73	-	-	-	-	-3.31	-	-3.61	-	-	-3.12	-3.32	-3.0	-1.55	-0.87	-	-1.57	-	4.82	-	0.68	-	-	-2.08	-	-	-	-	-	-	-3.19	-
Smo404401	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo405418	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo406668	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.73	-	-	-	-	-	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo406739	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo407388	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.73	4.82	-	-	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-
Smo409732	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-7.33	-	-	-	-2.64	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.26
Smo409956	-	-	-	-	-	-	-	-0.64	-	0.72	-	-	-	-0.34	-	-1.14	-1.17	-	4.72	-	-	-	-	-	-	-0.33	-	-	-	-0.29	-	-
Smo411155	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo411173	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.38	-	-	-	-	-	4.9	-	-	-	-	-0.47	-	-	-	-	-0.57	-	-	-
Smo411325	-1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.45	-	-0.3	-	-	4.83	-	0.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo411859	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.02	-	-	-	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo412520	-	-	-	-3.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.39	-	-1.59	-	4.94	-	-	-	-	-	-0.64	-	-	-	-	-2.65	-	-
Smo412521	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.96	-0.28	4.89	-	-	-	-1.01	-1.03	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo413719	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo414596	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-
Smo415597	-2.96	-	-	-1.29	-	-	-1.17	-	-2.41	-	-	-	-0.84	-1.25	-	-	-	0.24	4.78	-	-	-	-	-	0.03	-	-	-	-2.13	-	-	-
Smo415793	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-20.57	0.85	-	-	-10.77	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo416703	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo416705	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.74	-
Smo417068	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417072	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417086	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417590	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.43	-	4.72	-	-	-	1.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417699	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.74	4.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo419116	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo419131	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo420065	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo420068	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo421197	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	-	-	-	-	-0.39	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo421682	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo422359	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.38	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo422425	-	-	-2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.02	-1.37	-2.91	-	-	0.76	4.75	-1.92	-	-	-	-	-0.16	-	-	-	-0.24	-1.16	-	-
Smo422814	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo423941	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	4.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo425085	-4.64	-5.75	-5.28	-4.77	-3.68	-3.29	-3.22	-3.21	-2.85	-3.54	-4.22	-4.07	-5.44	-7.06	-5.41	-5.72	-3.13	-1.41	4.9	-7.92	-7.59	-4.4	-4.15	-4.04	-4.04	-5.24	-3.78	-4.85	-3.3	-3.03	-4.36	-4.42
Smo427082	-8.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.65	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo427139	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo428754	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo430841	-	-	-	-	-	-1.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo6134	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.68	-3.73	-	-	-6.5	-	-6.34	-6.35	-1.77	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.44	-3.71
Smo6245	-	-	-0.84	-	-	-	0.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.8	-	-	-	-	-	-	0.65	-	-	-	-	-	-
Smo62850	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo6561	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo66137	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	1.03	-	-	-	-	-
Smo69980	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.21	-	-	4.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.3	-	-	-
Smo76771	-2.58	-1.86	-3.08	-2.95	-2.93	-1.27	-1.91	-1.63	-1.65	-2.2	-3.64	-2.07	-1.04	-0.78	-3.09	-0.33	-1.19	0.29	4.39	-2.98	-	-	-0.79	-1.3	-0.63	-1.25	-2.39	-1.29	-1.2	-0.97	-1.12	-0.91
Smo77903	-	-7.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.57	-	-7.42	-4.99	-1.89	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.56	-5.6	-6.67
Smo79117	-	0.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.99	-	-	4.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo81343	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.54	-	-	-	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo86191	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo93661	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.65	4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.