Heatmap: Cluster_217 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo106537	0.33	0.43	0.5	0.54	0.5	0.49	0.63	0.53	0.56	0.57	0.51	0.44	0.52	1.0	0.49	0.43	0.49	0.37	0.19	0.12	0.23	0.07	0.36	0.35	0.49	0.26	0.26	0.34	0.37	0.41	0.37	0.31
Smo110185	0.43	0.45	0.54	0.44	0.37	0.38	0.29	0.31	0.5	0.56	0.55	0.45	1.0	0.86	0.06	0.87	0.24	0.34	0.31	0.29	0.4	0.02	0.53	0.41	0.77	0.79	0.31	0.31	0.21	0.21	0.13	0.15
Smo110768	0.78	0.6	0.62	0.64	0.68	0.59	0.62	0.8	0.83	0.86	0.99	0.86	0.72	1.0	0.12	0.81	0.34	0.15	0.55	0.23	0.39	0.01	0.69	0.82	0.65	0.95	0.71	0.73	0.46	0.52	0.39	0.43
Smo119400	0.68	0.43	0.4	0.48	0.49	0.42	0.45	0.51	0.62	0.66	0.62	0.63	0.67	0.52	0.5	0.77	0.42	0.4	0.71	0.07	0.13	0.04	0.56	0.67	0.59	1.0	0.66	0.73	0.62	0.62	0.59	0.59
Smo122509	0.39	0.44	0.32	0.46	0.31	0.39	0.32	0.47	0.46	0.45	0.5	0.42	0.85	0.65	0.62	1.0	0.12	0.13	0.61	0.05	0.2	0.0	0.47	0.67	0.25	0.92	0.6	0.63	0.26	0.3	0.2	0.18
Smo139369	0.43	0.36	0.27	0.33	0.31	0.29	0.3	0.46	0.47	0.52	0.47	0.57	0.53	1.0	0.51	0.69	0.43	0.36	0.67	0.17	0.18	0.04	0.38	0.45	0.35	0.93	0.49	0.46	0.59	0.59	0.54	0.58
Smo142582	0.44	0.41	0.39	0.38	0.34	0.4	0.36	0.44	0.51	0.56	0.59	0.56	0.71	0.72	0.51	0.68	0.35	0.3	0.66	0.05	0.1	0.17	0.43	0.45	0.58	1.0	0.45	0.52	0.5	0.48	0.47	0.48
Smo143664	0.4	0.49	0.57	0.65	0.62	0.59	0.55	0.6	0.49	0.49	0.44	0.43	0.58	1.0	0.26	0.54	0.38	0.23	0.35	0.11	0.33	0.03	0.58	0.56	0.61	0.51	0.53	0.52	0.35	0.37	0.38	0.54
Smo146320	0.67	0.61	0.54	0.67	0.68	0.67	0.78	0.84	0.8	0.81	0.73	0.72	0.53	1.0	0.73	0.62	0.39	0.3	0.47	0.19	0.32	0.3	0.42	0.47	0.75	0.62	0.78	0.71	0.4	0.38	0.53	0.55
Smo152998	0.45	0.56	0.53	0.53	0.55	0.55	0.55	0.57	0.6	0.62	0.61	0.55	0.92	1.0	0.38	0.93	0.28	0.25	0.61	0.15	0.17	0.01	0.48	0.55	0.6	0.86	0.62	0.67	0.35	0.38	0.38	0.4
Smo153173	0.58	0.59	0.63	0.59	0.61	0.54	0.66	0.77	0.71	0.75	0.78	0.69	0.71	1.0	0.73	0.73	0.45	0.38	0.73	0.2	0.13	0.14	0.6	0.65	0.4	0.98	0.96	0.86	0.56	0.56	0.74	0.75
Smo157018	0.44	0.4	0.4	0.47	0.5	0.49	0.56	0.62	0.72	0.7	0.62	0.59	0.6	0.62	0.61	0.64	0.42	0.35	0.44	0.29	0.18	0.31	0.51	0.53	0.61	1.0	0.92	0.86	0.48	0.46	0.54	0.59
Smo166719	0.71	0.65	0.66	0.74	0.71	0.72	0.65	0.79	0.77	0.86	0.76	0.78	0.89	1.0	0.46	0.7	0.34	0.36	0.56	0.15	0.23	0.04	0.59	0.65	0.92	0.74	0.66	0.59	0.4	0.43	0.54	0.66
Smo168397	0.41	0.36	0.37	0.41	0.43	0.46	0.33	0.47	0.45	0.48	0.41	0.38	1.0	0.93	0.23	1.0	0.13	0.11	0.3	0.05	0.12	0.03	0.59	0.94	0.54	0.61	0.32	0.37	0.21	0.23	0.14	0.15
Smo182335	0.53	0.61	0.59	0.63	0.62	0.57	0.65	0.74	0.73	0.74	0.75	0.65	0.54	1.0	0.55	0.64	0.39	0.31	0.53	0.11	0.26	0.04	0.52	0.51	1.0	0.78	0.76	0.78	0.44	0.47	0.61	0.67
Smo229487	0.35	0.51	0.53	0.54	0.51	0.5	0.76	0.65	0.65	0.6	0.59	0.54	0.39	1.0	0.44	0.39	0.4	0.22	0.24	0.19	0.15	0.17	0.25	0.23	0.49	0.26	0.55	0.55	0.39	0.4	0.32	0.29
Smo229892	0.32	0.27	0.28	0.31	0.33	0.26	0.24	0.27	0.33	0.35	0.37	0.35	1.0	0.8	0.22	0.75	0.07	0.07	0.22	0.09	0.33	0.04	0.13	0.25	0.45	0.29	0.11	0.11	0.17	0.17	0.13	0.12
Smo229997	0.56	0.57	0.55	0.58	0.51	0.55	0.54	0.61	0.58	0.65	0.68	0.68	0.67	0.71	0.72	0.6	0.35	0.22	0.65	0.07	0.04	0.15	0.44	0.51	0.53	1.0	0.66	0.66	0.45	0.48	0.5	0.6
Smo233315	0.4	0.57	0.59	0.89	0.8	0.83	0.91	0.81	0.85	0.8	0.76	0.57	0.41	1.0	0.82	0.46	0.59	0.36	0.23	0.1	0.38	0.22	0.65	0.52	0.75	0.29	0.48	0.48	0.46	0.49	0.3	0.33
Smo267186	0.56	0.51	0.49	0.54	0.54	0.54	0.52	0.69	0.7	0.72	0.71	0.65	0.81	0.76	0.5	0.66	0.34	0.28	0.73	0.1	0.15	0.08	0.58	0.66	0.66	1.0	0.78	0.81	0.46	0.49	0.61	0.58
Smo268243	0.53	0.4	0.3	0.33	0.38	0.35	0.4	0.45	0.52	0.51	0.52	0.56	0.17	0.55	0.34	0.34	0.24	0.25	0.37	0.15	0.2	0.11	0.21	0.24	0.28	0.72	1.0	0.84	0.31	0.36	0.39	0.39
Smo270846	0.72	0.58	0.52	0.54	0.5	0.39	0.4	0.56	0.55	0.58	0.64	0.76	0.64	0.66	0.21	0.62	0.33	0.29	0.43	0.09	0.25	0.02	0.44	0.47	0.61	1.0	0.76	0.76	0.37	0.38	0.39	0.47
Smo271123	0.59	0.48	0.43	0.54	0.57	0.61	0.58	0.78	0.71	0.69	0.74	0.61	0.38	0.65	0.46	0.52	0.32	0.28	0.47	0.21	0.4	0.18	0.36	0.35	0.53	0.55	1.0	0.8	0.44	0.47	0.62	0.65
Smo403080	0.55	0.53	0.47	0.57	0.58	0.54	0.57	0.54	0.57	0.61	0.56	0.54	0.74	0.89	0.44	0.79	0.33	0.27	0.52	0.06	0.22	0.17	0.37	0.39	0.21	1.0	0.93	0.9	0.32	0.34	0.56	0.37
Smo407067	0.38	0.32	0.4	0.42	0.42	0.39	0.41	0.45	0.51	0.56	0.55	0.39	0.69	0.76	0.5	1.0	0.24	0.29	0.56	0.1	0.12	0.12	0.4	0.45	0.37	0.78	0.43	0.48	0.31	0.35	0.24	0.28
Smo409045	0.48	0.54	0.64	0.54	0.63	0.44	0.78	0.68	0.76	0.88	0.85	0.76	0.7	0.69	0.27	1.0	0.25	0.12	0.41	0.03	0.12	0.01	0.34	0.46	0.36	0.89	0.42	0.64	0.4	0.4	0.24	0.23
Smo414233	0.37	0.47	0.49	0.49	0.52	0.49	0.53	0.59	0.54	0.61	0.59	0.54	1.0	0.83	0.22	0.98	0.22	0.31	0.57	0.18	0.22	0.0	0.51	0.53	0.64	0.39	0.33	0.32	0.33	0.34	0.31	0.35
Smo414565	0.53	0.68	0.73	0.8	0.7	0.85	0.81	0.66	1.0	0.87	0.51	0.65	0.74	0.89	0.75	0.65	0.25	0.39	0.08	0.0	0.02	0.0	0.03	0.04	0.72	0.11	0.17	0.23	0.22	0.25	0.07	0.09
Smo415640	0.61	0.68	0.69	0.62	0.6	0.58	0.49	0.48	0.56	0.56	0.6	0.49	0.41	0.98	0.09	0.95	0.49	0.39	0.32	0.1	0.19	0.05	0.81	1.0	0.85	0.45	0.4	0.46	0.37	0.47	0.26	0.39
Smo416268	0.49	0.54	0.55	0.64	0.64	0.59	0.65	0.71	0.74	0.71	0.7	0.67	0.83	1.0	0.59	0.7	0.42	0.37	0.64	0.05	0.18	0.02	0.78	0.9	0.78	0.77	0.81	0.7	0.46	0.49	0.52	0.54
Smo416466	0.87	0.87	0.76	1.0	0.87	0.86	0.85	0.96	0.88	0.92	0.83	0.9	0.75	0.96	0.95	0.82	0.49	0.35	0.6	0.39	0.63	0.29	0.62	0.59	0.95	0.85	0.85	0.69	0.44	0.51	0.56	0.56
Smo427302	0.51	0.38	0.24	0.33	0.35	0.35	0.4	0.43	0.49	0.47	0.48	0.52	0.19	0.57	0.37	0.43	0.26	0.07	0.47	0.02	0.15	0.03	0.22	0.23	0.18	0.71	1.0	0.83	0.33	0.39	0.49	0.46
Smo429425	0.44	0.37	0.31	0.42	0.42	0.32	0.29	0.46	0.5	0.43	0.5	0.39	0.71	0.59	0.62	0.63	0.26	0.29	0.91	0.0	0.06	0.02	0.47	0.49	0.06	0.63	0.81	0.76	0.26	0.32	0.49	1.0
Smo437757	0.18	0.19	0.25	0.29	0.29	0.32	0.25	0.5	0.32	0.43	0.3	0.29	0.87	0.7	0.11	0.74	0.12	0.14	0.29	0.02	0.04	0.06	0.65	1.0	0.23	0.38	0.33	0.32	0.27	0.27	0.33	0.28
Smo438108	0.42	0.49	0.63	0.62	0.62	0.61	0.53	0.57	0.51	0.56	0.56	0.44	1.0	0.78	0.31	0.8	0.4	0.29	0.47	0.23	0.35	0.14	0.62	0.65	0.7	0.76	0.65	0.63	0.42	0.44	0.35	0.36
Smo439156	0.49	0.58	0.69	0.71	0.85	0.86	0.86	0.63	0.77	0.69	0.75	0.54	0.82	1.0	0.73	0.65	0.64	0.53	0.37	0.1	0.14	0.07	0.88	0.9	0.71	0.31	0.43	0.5	0.59	0.69	0.46	0.42
Smo440757	0.66	0.65	0.67	0.72	0.82	0.72	0.68	0.72	0.77	0.72	0.74	0.65	1.0	0.9	0.73	0.93	0.51	0.41	0.83	0.37	0.38	0.36	0.7	0.78	0.81	0.86	0.81	0.81	0.51	0.55	0.34	0.44
Smo440990	0.38	0.39	0.39	0.48	0.51	0.5	0.41	0.49	0.44	0.44	0.41	0.39	1.0	0.72	0.04	0.49	0.25	0.24	0.42	0.06	0.11	0.0	0.77	0.9	0.41	0.75	0.74	0.74	0.27	0.32	0.25	0.24
Smo441682	0.42	0.57	0.54	0.54	0.6	0.52	0.66	0.53	0.56	0.58	0.48	0.48	0.87	0.7	0.37	1.0	0.4	0.45	0.51	0.19	0.49	0.34	0.74	0.76	0.43	0.71	0.74	0.72	0.46	0.45	0.52	0.6
Smo444026	0.23	0.28	0.35	0.41	0.41	0.36	0.3	0.34	0.35	0.35	0.34	0.26	1.0	0.79	0.14	0.94	0.23	0.18	0.39	0.11	0.08	0.03	0.6	0.57	0.17	0.41	0.47	0.52	0.26	0.27	0.16	0.22
Smo444239	0.42	0.42	0.35	0.38	0.42	0.38	0.48	0.65	0.66	0.72	0.62	0.52	0.77	0.77	0.2	1.0	0.11	0.07	0.55	0.01	0.15	0.0	0.16	0.34	0.15	0.72	0.63	0.58	0.24	0.26	0.23	0.27
Smo444240	0.69	0.62	0.8	0.81	0.68	0.78	0.77	0.83	0.83	0.7	0.68	0.68	0.7	1.0	0.72	0.67	0.38	0.18	0.57	0.09	0.06	0.18	0.51	0.62	0.49	0.53	0.86	0.65	0.43	0.46	0.49	0.54
Smo63437	0.53	0.64	0.76	0.8	0.88	0.86	0.94	0.92	0.94	0.92	0.92	0.72	0.56	0.96	1.0	0.39	0.54	0.35	0.32	0.26	0.12	0.24	0.63	0.7	0.52	0.45	0.71	0.77	0.45	0.47	0.43	0.44
Smo74418	0.57	0.51	0.52	0.63	0.62	0.59	0.6	0.66	0.72	0.71	0.68	0.63	0.77	0.85	0.51	1.0	0.4	0.28	0.69	0.09	0.17	0.03	0.48	0.56	0.36	0.83	0.98	0.91	0.53	0.54	0.85	0.81
Smo75561	0.46	0.59	0.67	0.64	0.54	0.48	0.61	0.7	0.78	0.71	0.6	0.59	1.0	0.84	0.55	0.52	0.42	0.45	0.45	0.12	0.05	0.11	0.66	0.79	0.39	0.83	0.76	0.55	0.37	0.39	0.43	0.57
Smo77390	0.25	0.29	0.35	0.41	0.43	0.47	0.63	0.74	0.8	0.73	0.64	0.54	0.48	0.3	0.64	0.4	0.29	0.35	0.48	0.35	0.28	0.16	0.39	0.46	0.57	1.0	0.79	0.73	0.34	0.38	0.37	0.45
Smo79056	0.55	0.5	0.42	0.47	0.61	0.51	0.41	0.49	0.48	0.51	0.49	0.46	0.95	0.85	0.39	1.0	0.29	0.19	0.62	0.07	0.42	0.21	0.38	0.48	0.6	0.55	0.4	0.4	0.35	0.34	0.24	0.23
Smo81755	0.78	0.49	0.45	0.48	0.54	0.55	0.51	0.54	0.52	0.58	0.57	0.63	0.38	0.47	0.48	0.45	0.41	0.34	0.69	0.11	0.08	0.22	0.4	0.42	0.43	0.74	1.0	1.0	0.47	0.49	0.55	0.54
Smo81947	0.35	0.52	0.6	0.61	0.64	0.58	0.82	0.58	0.53	0.55	0.45	0.44	0.88	0.74	0.36	1.0	0.26	0.22	0.68	0.25	0.29	0.18	0.5	0.63	0.46	0.95	0.52	0.64	0.32	0.35	0.21	0.18
Smo82941	0.5	0.32	0.37	0.4	0.54	0.5	0.52	0.66	0.6	0.69	0.69	0.51	0.77	0.61	0.54	1.0	0.35	0.24	0.9	0.0	0.0	0.22	0.56	0.66	0.01	0.89	0.81	0.78	0.54	0.57	0.62	0.97
Smo85111	0.5	0.45	0.42	0.49	0.45	0.44	0.44	0.6	0.6	0.6	0.64	0.58	0.75	0.69	0.69	0.78	0.31	0.22	0.77	0.29	0.18	0.14	0.57	0.68	0.55	1.0	0.52	0.5	0.41	0.43	0.39	0.42
Smo90714	0.44	0.53	0.53	0.54	0.54	0.53	0.45	0.44	0.54	0.54	0.48	0.44	1.0	0.81	0.04	0.99	0.23	0.12	0.51	0.06	0.39	0.08	0.58	0.64	0.8	0.33	0.43	0.47	0.32	0.33	0.19	0.18
Smo90744	0.62	0.49	0.58	0.58	0.64	0.62	0.67	0.8	0.87	0.92	0.87	0.75	0.7	0.81	0.5	0.85	0.34	0.31	0.5	0.3	0.45	0.28	0.63	0.61	0.37	0.98	0.87	1.0	0.59	0.61	0.47	0.5
Smo92217	0.56	0.41	0.46	0.46	0.5	0.57	0.51	0.64	0.66	0.73	0.68	0.65	0.65	0.89	0.52	0.84	0.32	0.12	0.65	0.26	0.18	0.04	0.39	0.43	0.44	1.0	0.54	0.54	0.46	0.45	0.41	0.47
Smo92777	0.59	0.51	0.46	0.59	0.52	0.58	0.71	0.8	0.76	0.97	0.83	0.85	0.58	0.91	0.72	0.94	0.35	0.27	0.55	0.17	0.3	0.18	0.43	0.54	0.78	1.0	0.92	0.86	0.43	0.44	0.71	0.79
Smo99225	0.47	0.55	0.74	0.77	0.74	0.71	0.67	0.66	0.7	0.61	0.67	0.57	0.48	1.0	0.59	0.37	0.45	0.41	0.31	0.21	0.4	0.22	0.51	0.44	0.64	0.42	0.65	0.77	0.44	0.47	0.3	0.24
Smo99818	0.37	0.42	0.55	0.46	0.46	0.46	0.73	0.65	0.59	0.77	0.8	0.78	0.42	0.4	0.32	0.79	0.23	0.14	0.49	0.01	0.05	0.0	0.38	0.38	0.02	1.0	0.22	0.28	0.52	0.61	0.28	0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)