Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.42 0.74 1.0 0.81 0.59 0.7 0.67 0.45 0.41 0.63 0.31 0.27 0.03 0.01 0.01 0.0 0.1 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.43 0.07 0.21 0.27 0.13 0.08 0.07 0.06
0.92 1.0 0.98 1.0 0.8 0.84 0.65 0.58 0.8 0.82 0.88 0.97 0.01 0.08 0.04 0.05 0.05 0.08 0.13 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.14 0.24 0.43 0.34 0.06 0.1 0.07 0.03
0.47 0.87 1.0 0.72 0.64 0.71 0.76 0.64 0.7 0.63 0.62 0.54 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.47 0.37 0.41 0.01 0.02 0.0 0.01
0.79 0.81 0.76 0.69 0.67 0.76 0.73 0.76 0.85 1.0 0.89 0.89 0.25 0.18 0.48 0.6 0.27 0.23 0.34 0.44 0.39 0.37 0.35 0.32 0.12 0.37 0.34 0.35 0.31 0.32 0.41 0.46
0.62 0.84 0.96 0.81 0.61 0.92 1.0 0.77 0.88 0.63 0.91 0.58 0.0 0.0 0.0 0.01 0.44 0.27 0.64 0.0 0.0 0.11 0.05 0.06 0.39 0.34 0.48 0.56 0.18 0.23 0.13 0.08
0.65 0.88 1.0 0.65 0.59 0.71 0.46 0.49 0.52 0.51 0.51 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.12 0.08 0.09 0.14 0.02 0.04 0.01 0.02
0.86 0.99 0.97 0.92 0.6 1.0 0.78 0.52 0.89 0.56 0.68 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.09 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.32 0.07 0.31 0.23 0.04 0.09 0.12 0.04
0.8 0.82 0.88 0.83 0.7 0.82 0.8 0.73 1.0 0.94 0.86 0.71 0.41 0.29 0.49 0.37 0.34 0.28 0.24 0.36 0.1 0.1 0.35 0.35 0.12 0.26 0.29 0.36 0.28 0.33 0.31 0.33
0.33 0.73 0.6 0.57 0.32 0.66 0.69 0.67 1.0 0.93 0.59 0.77 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.46 0.23 0.27 0.0 0.0 0.06 0.19 0.12 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.91 0.87 0.88 1.0 0.98 0.84 0.72 0.82 0.75 0.79 0.56 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.06 0.25 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.41 0.33 0.43 0.63 0.08 0.15 0.05 0.05
0.37 0.67 1.0 0.81 0.61 0.6 0.77 0.53 0.89 0.46 0.54 0.31 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.04 0.19 0.02 0.02 0.0 0.04 0.05 0.08 0.09 0.56 0.72 0.1 0.14 0.03 0.02
0.68 0.76 0.79 0.82 0.89 1.0 0.86 0.86 0.92 0.84 0.78 0.73 0.53 0.32 0.35 0.53 0.33 0.44 0.5 0.47 0.55 0.62 0.43 0.43 0.51 0.49 0.39 0.38 0.34 0.3 0.32 0.31
0.32 0.46 0.76 0.7 0.63 0.64 0.85 0.54 0.93 0.48 0.54 0.31 0.0 0.0 0.0 0.01 0.24 0.11 0.3 0.05 0.11 0.0 0.06 0.08 0.18 0.12 0.78 1.0 0.21 0.27 0.08 0.05
0.55 0.59 0.91 0.69 0.66 0.6 0.82 0.56 0.67 0.7 0.72 0.6 0.08 0.08 0.17 0.06 0.51 0.25 0.32 0.16 0.0 0.0 0.24 0.14 0.13 0.55 1.0 0.98 0.33 0.31 0.4 0.38
0.25 0.38 0.66 0.66 0.53 0.42 0.76 0.42 1.0 0.61 0.59 0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.1 0.51 0.03 0.4 0.01 0.08 0.04 0.14 0.03 0.3 0.29 0.21 0.28 0.14 0.2
0.65 0.85 1.0 0.87 0.79 0.91 0.82 0.65 0.82 0.66 0.66 0.58 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.43 0.26 0.27 0.29 0.04 0.06 0.04 0.06
0.92 0.7 0.63 1.0 0.4 0.99 0.53 0.27 0.61 0.66 0.63 0.72 0.0 0.1 0.11 0.04 0.05 0.01 0.01 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.41 0.03 0.02 0.0 0.01
0.59 0.96 1.0 0.51 0.66 0.59 0.49 0.44 0.5 0.44 0.55 0.31 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.09 0.06 0.06 0.15 0.02 0.02 0.01 0.01
0.29 0.59 1.0 0.64 0.8 0.79 0.76 0.42 0.68 0.93 0.47 0.37 0.28 0.15 0.44 0.74 0.48 0.1 0.36 0.0 0.09 0.0 0.59 0.43 0.4 0.33 0.46 0.66 0.51 0.46 0.44 0.23
0.79 0.99 0.94 0.93 0.82 0.93 0.84 0.83 0.98 1.0 0.87 0.85 0.49 0.37 0.54 0.5 0.47 0.29 0.43 0.11 0.58 0.63 0.51 0.5 0.23 0.34 0.33 0.46 0.42 0.5 0.43 0.5
0.7 0.86 0.98 0.98 0.74 1.0 0.83 0.45 0.79 0.73 0.66 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.06 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0
0.57 0.86 0.9 0.99 1.0 0.88 0.73 0.97 0.88 0.99 0.64 0.68 0.21 0.03 0.03 0.15 0.1 0.25 0.08 0.0 0.0 0.0 0.2 0.11 0.0 0.2 0.12 0.09 0.09 0.11 0.12 0.1
0.76 0.91 0.96 0.73 0.92 1.0 0.95 0.77 0.88 0.78 0.71 0.68 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.18 0.15 0.0 0.0 0.03 0.09 0.04 0.4 0.43 0.82 0.77 0.1 0.15 0.12 0.12
0.73 0.94 0.99 0.85 0.8 1.0 0.74 0.63 0.78 0.63 0.65 0.52 0.17 0.09 0.07 0.15 0.11 0.07 0.13 0.42 0.07 0.21 0.13 0.16 0.45 0.41 0.36 0.44 0.1 0.11 0.11 0.1
0.61 0.99 0.91 0.86 0.85 0.91 1.0 0.38 0.76 0.68 0.52 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.03 0.06 0.19 0.01 0.02 0.01 0.0
0.46 0.73 0.98 0.84 0.77 0.82 0.79 0.59 1.0 0.49 0.61 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.29 0.56 0.53 0.01 0.03 0.01 0.01
0.74 0.72 0.73 0.71 0.72 0.59 0.68 0.76 0.81 1.0 0.81 0.78 0.24 0.24 0.42 0.78 0.26 0.28 0.37 0.45 0.26 0.13 0.35 0.32 0.24 0.45 0.43 0.38 0.32 0.34 0.43 0.45
0.47 0.71 1.0 0.72 0.91 0.83 0.54 0.51 0.82 0.49 0.55 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
0.61 0.68 0.79 0.82 0.7 0.79 0.9 0.9 1.0 0.86 0.74 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.12 0.13 0.06 0.06 0.02 0.02
0.63 0.89 0.61 0.96 0.65 0.61 0.45 0.47 1.0 0.92 0.97 0.85 0.05 0.05 0.06 0.12 0.01 0.01 0.15 0.27 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.07 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0
0.53 0.83 1.0 0.84 0.8 0.83 0.7 0.7 0.83 0.65 0.61 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.46 0.2 0.36 0.41 0.01 0.03 0.01 0.01
0.57 1.0 0.82 0.78 0.43 0.54 0.32 0.3 0.44 0.46 0.49 0.58 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.15 0.11 0.02 0.02 0.01 0.01
0.79 0.8 1.0 0.64 0.66 0.74 0.54 0.74 0.62 0.61 0.68 0.57 0.0 0.0 0.0 0.03 0.19 0.08 0.21 0.0 0.4 0.0 0.17 0.1 0.26 0.4 0.2 0.41 0.13 0.12 0.07 0.05
0.81 0.92 1.0 0.95 0.89 0.88 0.85 1.0 0.85 0.69 0.95 0.74 0.05 0.25 0.28 0.05 0.04 0.06 0.07 0.0 0.0 0.03 0.06 0.05 0.1 0.3 0.22 0.33 0.04 0.05 0.04 0.05
0.55 0.9 1.0 0.86 0.82 1.0 0.95 0.64 0.94 0.65 0.79 0.51 0.06 0.04 0.02 0.08 0.07 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.22 0.42 0.28 0.44 0.05 0.11 0.06 0.03
0.76 0.81 0.94 1.0 0.91 0.95 0.7 0.59 0.75 0.73 0.91 0.8 0.04 0.36 0.16 0.05 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.1 0.21 0.17 0.03 0.03 0.03 0.02
0.49 0.69 1.0 0.8 0.78 0.97 0.84 0.44 0.67 0.37 0.58 0.38 0.05 0.02 0.04 0.05 0.06 0.06 0.08 0.04 0.09 0.11 0.06 0.08 0.11 0.07 0.17 0.17 0.06 0.09 0.1 0.08
0.19 0.41 0.63 0.47 0.91 0.54 0.47 0.59 1.0 0.82 0.43 0.25 0.03 0.01 0.0 0.01 0.13 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.13 0.29 0.12 0.09 0.16 0.11 0.18 0.14
0.51 0.68 1.0 0.8 0.54 0.94 0.83 0.68 0.88 0.63 0.59 0.46 0.02 0.03 0.06 0.03 0.01 0.03 0.05 0.11 0.01 0.01 0.02 0.03 0.39 0.13 0.44 0.31 0.02 0.02 0.02 0.02
0.56 0.69 0.77 0.71 0.64 0.78 0.72 0.78 1.0 0.71 0.61 0.58 0.02 0.28 0.24 0.04 0.01 0.01 0.0 0.06 0.08 0.14 0.01 0.03 0.07 0.14 0.07 0.27 0.02 0.01 0.0 0.0
0.67 0.73 0.94 0.94 0.72 0.99 0.84 0.56 1.0 0.67 0.75 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01
0.5 0.65 1.0 0.78 0.56 0.5 0.69 0.9 0.73 0.98 0.76 0.5 0.06 0.09 0.15 0.07 0.05 0.02 0.02 0.39 0.26 0.12 0.04 0.03 0.11 0.05 0.19 0.13 0.04 0.02 0.01 0.02
0.61 0.69 0.8 0.55 0.93 0.71 0.89 0.38 1.0 0.55 0.89 0.68 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.33 0.23 0.26 0.01 0.02 0.01 0.01
0.56 0.76 0.93 0.72 0.77 0.79 1.0 0.57 0.83 0.68 0.84 0.54 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.52 0.5 0.75 0.04 0.05 0.05 0.01
0.38 0.55 0.68 0.58 0.53 0.66 0.64 0.37 0.52 0.33 0.44 0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.51 0.57 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.68 0.96 1.0 0.84 0.64 0.92 0.71 0.47 0.82 0.59 0.73 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 1.0 0.99 0.61 0.57 0.55 0.3 0.51 0.7 0.66 0.6 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.82 1.0 0.89 0.75 0.73 0.77 0.86 0.7 0.83 0.7 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.67 0.12 0.09 0.08 0.01 0.04 0.01 0.0
0.58 0.83 1.0 0.93 0.78 0.91 0.78 0.49 0.73 0.61 0.64 0.57 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.03 0.01 0.01 0.0 0.04 0.04 0.09 0.16 0.21 0.21 0.05 0.06 0.06 0.05
0.53 0.78 0.96 0.77 0.79 0.83 1.0 0.51 0.81 0.5 0.75 0.5 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.5 0.88 0.01 0.02 0.0 0.0
0.42 0.63 0.67 0.92 0.51 0.68 0.77 0.61 1.0 0.6 0.66 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.27 0.36 0.4 0.02 0.08 0.06 0.04
0.6 0.69 0.79 0.72 0.87 0.92 1.0 0.98 0.84 0.86 0.73 0.67 0.56 0.38 0.53 0.42 0.36 0.27 0.32 0.25 0.55 0.64 0.54 0.49 0.22 0.31 0.45 0.4 0.37 0.36 0.42 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)