Heatmap: Cluster_183 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-1.97 -0.16 -1.26 -0.11 -0.35 -1.71 -0.97 -1.13 -1.27 -1.03 -1.37 -0.87 0.41 -0.12 0.68 0.27 0.46 2.01 0.49 0.94 -0.54 1.86 0.86 0.35 -2.6 -1.28 -2.24 -0.84 -0.21 -0.68 -0.29 -0.41
-0.44 -1.5 -1.42 -1.63 -1.96 -1.86 -0.69 -0.07 -0.1 0.21 0.35 0.34 0.74 -1.02 -3.01 0.45 -1.36 -1.36 1.59 1.41 -0.05 -1.15 -1.0 0.23 -1.46 2.35 -1.89 -2.17 0.07 -0.2 0.27 0.23
-0.88 -3.17 -0.57 -4.21 0.18 -0.21 -1.08 -0.34 -0.35 -2.26 -3.65 -0.61 0.0 1.91 1.83 0.35 0.28 1.0 -0.02 -1.11 -0.07 2.05 0.2 0.48 -0.32 - -0.88 -2.37 -0.43 -0.34 -2.08 -1.24
0.02 -0.26 -0.18 -0.14 -0.23 -0.08 -0.21 -0.28 0.09 0.08 -0.27 0.11 1.31 -0.85 0.52 1.38 -0.69 -0.97 0.65 0.58 -0.48 -2.83 0.37 1.02 -1.96 0.21 -1.86 -1.94 0.05 0.16 -0.88 -0.43
-1.25 -0.99 -0.74 -0.8 -0.54 -1.03 -0.98 -1.09 -1.32 -0.55 -0.88 -1.03 0.7 -0.37 -0.03 1.0 0.04 0.98 1.14 0.94 -0.02 0.82 0.29 0.24 0.35 -0.51 -0.53 -0.76 -0.21 -0.02 0.89 0.0
-1.38 -1.92 -1.53 -0.98 -1.02 -2.01 -0.51 -0.96 0.47 -0.23 -0.1 -0.77 -1.93 -0.27 0.39 -0.06 0.9 1.92 -2.09 1.18 0.28 0.89 -0.19 0.66 -0.78 0.67 -1.03 - 1.21 0.59 -0.13 -1.48
-0.81 -0.26 -0.47 -0.28 -0.14 -0.46 -0.32 -1.03 -0.67 -0.78 -0.7 -1.17 -0.05 1.04 1.17 0.16 -0.75 0.51 -0.05 0.97 0.68 1.61 0.34 0.41 -0.8 -0.24 -0.21 -0.22 -0.69 -0.78 -1.07 -1.19
0.49 0.37 0.12 0.08 0.06 0.01 -0.22 0.08 0.36 0.76 0.58 0.51 1.04 0.48 -0.51 0.75 -0.84 -0.71 0.2 -0.17 -1.69 -2.99 -0.21 -0.05 -2.64 0.57 -0.54 -0.53 -0.5 -0.35 -0.55 -0.32
-0.72 -1.22 -2.58 -1.05 -1.64 -0.8 -1.36 -1.15 -1.43 -1.57 -1.35 -1.28 0.55 1.48 0.98 0.71 0.17 -0.14 0.45 1.48 0.21 1.14 0.24 0.46 0.32 -1.16 -1.05 -1.58 0.36 0.3 -0.03 0.13
0.08 0.22 0.14 0.13 0.07 0.17 -0.14 -0.02 0.08 -0.04 0.09 -0.1 0.83 0.46 0.17 0.79 -0.15 -0.54 -0.27 -0.11 -1.02 -2.52 0.42 0.58 -1.45 -0.78 -0.82 -0.76 -0.45 -0.4 0.8 0.37
-1.34 -0.67 -0.42 -0.97 -0.47 -0.51 -0.6 -0.69 -0.68 -0.69 -1.25 -1.02 -0.14 -0.08 0.68 -0.12 0.13 0.25 -0.09 0.09 0.31 1.86 0.14 0.11 -1.14 -0.2 0.73 0.35 0.05 0.01 0.16 0.79
-1.82 -1.37 -1.99 -1.6 -1.59 -1.53 -1.37 -1.89 -1.9 -1.84 -1.87 -1.38 0.56 0.4 1.27 0.59 0.05 0.25 0.5 1.71 0.81 1.86 0.12 0.2 0.28 -1.81 -1.25 -1.93 0.21 0.01 0.25 0.51
0.12 -0.19 -0.47 -0.42 -0.41 -0.35 -0.44 -0.2 -0.24 -0.08 0.0 0.06 0.05 0.72 0.23 0.27 -0.53 0.14 0.25 0.06 0.55 0.65 0.1 0.3 -0.98 0.07 -0.67 -0.58 0.16 0.12 -0.18 0.28
-0.49 -0.36 -0.33 -0.35 -0.27 -0.29 -0.42 -0.6 -0.59 -0.61 -0.55 -0.65 0.68 0.94 1.05 0.87 -0.19 0.53 0.23 0.57 -0.0 0.6 0.2 0.24 -1.05 -0.42 -0.52 -0.42 -0.28 -0.22 -0.4 -0.19
-0.65 -0.61 -0.48 -0.51 -0.53 -0.55 -0.57 -0.37 -0.41 -0.62 -0.46 -0.64 0.82 0.78 0.55 1.03 -0.28 -0.29 0.57 0.43 0.28 0.84 0.17 0.3 0.4 -0.89 -1.19 -1.08 0.04 0.01 -0.05 0.12
-0.7 -0.71 -0.64 -0.61 -0.52 -0.68 -0.8 -0.54 -0.4 -0.48 -0.47 -0.65 1.09 1.1 0.6 1.04 -0.32 0.25 0.19 -0.29 0.31 1.42 -0.06 0.31 0.1 -0.83 -1.02 -1.36 -0.02 -0.03 -0.36 -0.16
0.43 0.26 0.13 0.11 0.21 0.21 0.1 0.19 0.46 0.45 0.32 0.2 0.44 0.37 -0.47 0.71 -0.37 -0.59 -0.22 -0.32 -1.97 -0.95 0.4 0.61 -0.52 -0.08 -0.67 -0.64 -0.52 -0.41 -0.47 -0.31
-0.74 -0.51 -0.49 -0.27 -0.08 0.17 0.07 -0.06 -0.2 -0.32 -0.54 -0.61 0.35 -0.33 1.19 0.57 -0.24 0.06 0.34 0.13 -0.43 1.54 0.27 0.36 -0.81 -0.32 -0.72 -0.65 0.09 0.03 -0.78 -0.87
-0.4 -0.35 -0.24 -0.3 -0.22 -0.03 -0.11 -0.21 -0.1 -0.11 -0.24 -0.32 0.11 0.58 1.01 0.01 -0.07 0.42 -0.23 0.26 -0.15 0.86 0.39 0.53 -1.53 -1.29 -0.57 -0.68 -0.07 0.02 0.04 0.26
0.17 0.29 0.23 -0.21 -0.08 -0.32 -0.3 -0.37 0.15 0.13 0.32 0.0 0.56 0.8 0.2 1.11 -0.9 -0.46 0.38 -0.22 -2.84 -1.75 -0.04 0.12 -3.63 0.65 -0.39 -0.76 -0.02 0.27 -0.28 0.44
-0.99 -0.91 -0.84 -1.11 -0.68 -0.71 -0.99 -0.88 -0.83 -0.6 -1.19 -0.83 1.37 0.71 0.05 0.45 0.19 0.81 1.39 0.91 -0.8 -1.21 0.54 0.61 0.5 -1.07 -1.37 -1.62 0.35 0.29 -0.05 0.45
0.05 -0.19 -0.27 -0.14 0.09 -0.22 -0.05 0.14 0.32 0.46 0.43 0.27 0.52 -0.06 -0.4 0.35 -0.59 -0.38 0.13 0.12 0.74 -1.24 0.07 0.36 -0.17 -0.27 -0.79 -0.68 -0.21 -0.17 -0.17 0.23
-0.26 -0.3 -0.36 -0.3 -0.24 -0.38 -0.44 -0.47 -0.28 -0.34 -0.37 -0.31 0.11 1.11 0.8 -0.08 -0.25 0.46 0.05 0.56 -0.28 0.92 0.09 0.28 -1.05 -0.19 0.04 -0.05 -0.29 -0.28 -0.25 0.01
-0.21 -0.41 -0.36 -0.38 -0.18 -0.31 -0.23 0.13 0.17 0.02 0.26 -0.06 0.15 0.15 -0.58 0.31 -0.56 -0.34 -0.0 0.11 0.88 -0.33 0.25 0.35 0.33 0.41 0.01 -0.2 -0.28 -0.3 -0.06 0.11
-0.03 -0.46 -0.23 -0.14 0.21 -0.11 -0.07 0.43 0.18 0.14 0.39 0.24 0.22 -0.23 -0.05 0.3 -0.46 -0.99 0.46 -0.79 -0.23 -1.84 -0.1 -0.02 -0.05 1.05 0.34 0.35 -0.22 -0.07 -0.36 -0.32
0.32 -0.17 -0.39 -0.12 -0.5 -0.51 -0.37 0.45 0.53 0.52 0.31 0.44 -0.61 -1.95 -1.78 0.09 -0.58 0.45 0.67 0.38 -0.5 0.78 -0.32 -0.12 -1.91 0.64 -0.65 -1.49 0.11 -0.08 0.43 0.7
-0.65 -0.81 -0.89 -0.8 -0.82 -0.73 -1.16 -0.8 -0.82 -1.03 -0.68 -0.7 1.06 0.5 0.09 0.95 0.06 1.04 0.78 -0.32 -0.04 -0.11 0.78 0.92 -0.53 -2.28 -2.11 -2.7 0.31 0.28 0.88 1.0
-0.35 -0.44 -0.11 -0.15 -0.01 -0.08 -0.13 -0.57 -0.31 -0.63 -0.4 -0.52 0.46 1.42 0.86 0.13 -0.18 0.23 -0.11 -0.2 0.06 1.19 -0.11 -0.12 -1.74 -0.02 0.34 0.11 -0.42 -0.37 -0.87 -0.92
-0.17 -0.83 -0.92 -0.56 -0.55 -0.59 -0.73 -0.15 -0.32 -0.02 -0.08 0.05 1.04 0.21 -0.53 1.3 -0.89 -0.34 0.45 0.71 0.31 -0.11 0.26 0.73 -0.53 0.5 -1.02 -1.09 -0.03 0.01 -0.2 0.12
-0.33 -0.77 -0.79 -0.44 -0.57 -0.58 -0.64 -0.31 -0.16 -0.14 -0.18 -0.2 0.72 0.91 0.58 0.79 -0.21 0.97 0.09 0.02 -0.07 0.88 0.2 0.25 -0.69 -1.02 -0.82 -1.1 0.04 0.06 -0.04 -0.02
0.15 -0.18 -0.45 -0.32 -0.28 -0.48 -0.41 -0.12 0.25 0.3 0.26 0.35 0.69 -0.22 -0.43 0.5 -0.85 -1.11 0.23 0.11 0.06 -1.56 -0.12 0.4 0.31 1.06 0.16 -0.31 -0.24 -0.16 -0.18 -0.02
-2.45 -2.48 -1.58 -1.62 -1.86 -1.99 -1.98 -2.06 -2.12 -1.59 -1.38 -1.86 1.03 -0.74 -0.53 1.71 -1.06 -1.66 -0.47 1.4 0.69 -1.08 0.91 1.83 1.28 0.28 -0.51 -0.48 -0.12 0.09 1.1 0.34
-6.12 - - - - - - - - - -2.79 -3.72 1.46 -0.29 1.81 1.24 1.71 1.47 0.23 -1.39 - 0.39 1.49 -0.02 - 0.17 -1.67 -1.32 1.15 0.98 0.9 0.78
0.54 0.52 -0.33 0.02 -0.55 -0.54 -0.48 -0.36 -0.24 -0.21 0.0 0.52 -0.31 0.65 0.68 0.68 -0.5 -2.06 -0.16 0.2 0.62 1.29 0.15 0.15 0.21 -0.35 -1.05 -1.86 -0.69 -0.83 -0.35 -0.24
-0.39 0.07 0.26 0.28 0.24 -0.1 0.04 -0.02 -0.17 -0.23 0.38 0.41 -4.67 -3.41 -1.63 -3.86 0.02 1.26 0.2 0.95 -0.18 1.21 1.46 0.82 -3.07 -0.58 -1.19 -0.53 -0.77 -1.21 -0.57 -0.12
- - - 1.5 - - - - - - - - 1.71 1.37 - 1.89 - 2.19 - - - 3.14 1.72 - - - - - - - 1.56 -
0.15 0.2 0.1 -0.01 -0.22 -0.21 -0.21 -0.14 -0.27 -0.21 -0.17 -0.35 0.23 -1.07 -1.3 1.35 -0.84 -0.34 1.38 0.84 -3.56 - 0.52 0.52 -1.03 0.52 -0.06 0.01 -0.26 -0.11 0.12 -0.35
-0.74 -0.42 -0.78 -0.28 -0.14 -0.03 -0.07 0.03 -0.32 -0.14 -0.23 -0.65 0.04 0.31 1.29 0.2 -0.19 0.68 0.09 0.32 -0.33 1.52 -0.23 -0.12 -1.11 -0.48 -0.26 -0.58 -0.04 -0.11 -0.5 -0.33
0.0 -0.21 -0.33 -0.63 -0.6 -0.7 -0.79 -0.44 -0.17 -0.06 -0.05 -0.15 0.58 0.34 -0.88 0.83 -1.49 -0.61 0.98 -1.77 -1.04 0.52 0.41 0.7 1.03 1.31 -0.1 -0.25 -0.85 -0.86 -0.23 -0.15
-5.1 - - - 0.01 - - -3.46 - - - - -0.01 -1.56 -0.42 0.44 0.77 -1.19 0.58 1.95 -1.55 1.91 1.99 1.75 1.03 -0.48 -2.24 -0.66 0.6 0.77 -0.78 0.12
-0.21 -0.63 -1.48 -0.37 -0.19 -0.6 -0.68 -0.04 -0.24 -0.04 0.01 0.07 1.62 -1.35 -2.16 1.09 -0.74 -0.48 1.52 0.95 0.17 0.75 0.14 0.8 -1.53 -1.46 -2.32 -3.18 -0.22 -0.31 -0.13 0.22
0.34 0.28 0.29 0.16 0.06 0.12 -0.15 -0.13 0.1 0.0 0.04 -0.01 0.34 -0.03 0.14 0.69 -0.23 -0.5 0.44 -0.45 -0.32 -0.82 0.11 0.22 -0.29 -0.21 -0.67 -0.74 -0.21 -0.02 0.06 0.18
-5.58 -6.42 -4.79 -8.37 - -5.09 - -4.06 -5.33 -4.03 -8.0 -4.63 1.48 0.86 1.21 1.12 0.93 1.36 1.1 -0.02 -1.17 1.45 0.74 0.9 -1.39 -0.96 -0.83 -1.32 0.72 0.78 0.46 0.77
-3.47 - - -4.78 -5.34 -1.59 -1.88 -2.11 -3.46 -2.25 -2.82 -2.88 0.53 -3.06 -1.21 0.64 0.33 -0.28 -0.51 0.88 0.71 -0.6 0.67 0.96 1.19 0.26 -0.62 1.81 -0.06 0.42 2.43 0.13
0.51 0.11 0.27 0.23 -0.18 -0.66 -0.26 -0.35 0.29 0.47 0.56 0.54 1.67 1.46 -3.57 -2.11 0.62 0.41 -0.94 -3.26 -2.45 -6.64 0.14 0.34 -0.75 -1.57 -2.07 -2.86 0.32 0.29 -0.16 0.55
-1.05 -1.29 -1.2 -0.93 -1.18 -1.41 -1.12 -0.28 -1.04 -0.66 -0.61 -1.2 1.63 -1.4 -4.75 0.51 -2.66 -4.94 -0.24 -5.38 -0.12 -4.07 -0.26 1.14 0.01 2.15 0.88 0.51 -1.66 -1.67 1.79 1.59
0.08 0.24 -0.03 0.06 -0.05 -0.25 -0.33 -0.29 0.03 0.28 0.39 0.18 -4.68 -2.73 -1.39 -2.84 0.44 -1.01 0.59 0.83 -0.67 0.38 1.25 0.86 -1.52 -0.21 -0.47 -0.59 -0.03 0.07 0.28 0.87
-0.07 -0.62 -0.68 -0.77 -0.78 -0.77 -1.06 -0.72 -0.39 -0.18 -0.06 -0.09 0.94 0.12 -0.39 0.96 -0.52 -0.52 0.57 0.04 -0.21 -0.19 0.11 0.46 0.57 1.09 -0.41 -0.66 -0.32 -0.16 0.37 0.66
-0.67 -0.52 -0.53 -0.35 -0.24 -0.45 -0.53 -1.16 -1.07 -1.06 -1.14 -1.18 0.38 0.95 -0.06 1.11 -0.6 0.75 0.42 0.13 -0.81 1.34 -0.32 -0.2 0.87 -0.57 0.38 0.54 -0.14 0.1 -0.53 -0.32
-0.6 -0.19 -0.23 -0.38 -0.46 -0.27 -0.37 -0.6 -0.62 -0.65 -0.58 -0.67 1.04 0.36 1.11 0.97 0.6 0.61 0.38 0.3 -1.82 0.64 0.42 0.17 -0.79 -0.78 -0.9 -0.89 -0.14 0.05 -0.16 -0.25
-0.48 -0.41 -0.24 -0.18 -0.29 -0.18 -0.33 -0.3 -0.31 -0.51 -0.41 -0.56 0.43 -0.6 -0.06 0.42 0.07 -0.82 0.29 0.8 0.15 -0.11 0.67 0.7 0.2 -0.21 0.39 0.37 0.21 0.24 -0.36 -0.58
-0.76 -0.96 -0.98 -0.99 -0.78 -0.6 -0.96 -0.61 -0.36 -0.36 -0.22 -0.42 1.11 0.34 0.48 1.02 -0.25 0.64 0.39 0.61 0.51 0.99 0.32 0.82 -1.04 -1.11 -2.06 -2.64 0.07 0.04 0.15 0.34
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-0.56 -0.81 -0.2 -0.22 -0.56 -0.1 -0.18 -0.46 -0.13 -0.66 -0.17 -0.87 0.36 0.09 0.02 0.21 -0.04 0.93 -0.06 0.03 -0.4 1.59 0.13 0.11 -1.68 -0.08 0.08 -0.14 -0.02 -0.13 0.25 0.25
-0.49 -0.62 -0.64 -0.79 -0.74 -0.51 -0.94 -0.77 -0.68 -0.81 -0.68 -1.03 -0.34 1.71 1.34 0.26 -0.64 0.16 0.01 1.2 0.55 1.45 -0.81 -0.81 -0.11 -0.48 -0.1 -0.86 -0.35 -0.23 -0.18 -0.19
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0.38 0.15 0.14 -0.05 0.14 0.24 -0.1 0.11 0.25 0.34 0.4 0.19 0.84 0.21 -1.1 0.49 -0.53 -0.91 0.19 -0.17 -2.09 -3.72 0.07 0.1 -1.75 0.87 0.24 0.14 -0.06 -0.04 -0.44 -0.48
-0.73 -0.76 -0.72 -0.69 -0.36 -0.52 -0.51 -0.37 -0.59 -0.67 -0.68 -1.07 0.98 0.74 1.29 0.93 0.01 -0.0 0.38 -0.09 -0.85 1.38 0.23 0.41 -0.74 -0.61 -0.74 -0.78 -0.18 -0.05 0.01 0.06
-0.26 -0.24 -0.31 -0.4 -0.37 -0.27 -0.48 -0.37 -0.32 -0.14 -0.35 -0.42 0.32 1.08 1.26 0.75 -0.39 0.07 -0.04 0.5 -1.19 0.83 0.21 0.15 -1.97 -1.03 -0.87 -0.89 -0.67 -0.47 0.58 0.7
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-0.62 -0.52 -0.69 -0.49 -0.69 -0.43 -0.72 -0.44 -0.37 -0.18 -0.62 -0.72 0.73 0.62 -0.14 0.97 -0.27 1.1 0.34 -0.79 0.71 1.38 0.52 0.46 -1.11 -0.52 -0.64 -1.03 -0.02 -0.13 -0.28 -0.37
-0.08 -0.1 -0.24 -0.46 -0.41 -0.24 -0.36 -0.17 0.19 0.1 0.38 0.07 0.76 -0.49 -0.97 0.33 -0.37 -0.5 -0.36 -0.79 -1.2 -0.28 -0.07 -0.09 0.29 0.76 0.48 0.36 -0.43 -0.39 0.63 0.93
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0.36 0.22 -0.01 0.12 0.09 -0.0 -0.05 -0.04 -0.1 0.03 -0.0 -0.19 0.75 0.49 -0.36 0.81 -0.21 -0.41 0.49 0.09 -1.99 -1.58 0.37 0.65 -1.09 -0.57 -1.01 -0.99 0.09 0.12 0.13 0.14
-2.05 -1.95 -0.83 -0.78 -0.94 -0.06 0.14 -0.36 -1.06 -1.14 -1.63 -2.7 0.46 -2.17 -0.03 0.21 1.39 1.52 -0.92 1.21 -0.86 -0.52 0.53 0.95 -1.56 -3.44 -3.5 -2.31 1.21 1.47 1.19 -0.27
-1.52 -1.18 -1.33 -1.33 -0.96 -1.23 -1.58 -1.55 -1.46 -1.76 -1.43 -1.79 0.83 0.9 1.42 0.82 0.18 0.81 0.72 0.18 -1.09 0.77 0.8 0.83 -3.65 -0.69 -0.08 -0.11 0.38 0.41 0.45 0.55
-0.52 -0.07 -0.17 -0.04 -0.07 0.0 -0.09 0.05 -0.06 0.07 0.08 -0.17 0.38 0.51 -0.1 0.41 -0.47 -0.88 0.51 -0.72 -1.29 -1.33 -0.01 -0.06 0.59 0.26 0.76 0.74 -0.22 -0.21 -0.25 -0.13
0.28 0.31 0.04 0.41 0.38 0.24 -0.06 -0.18 -0.01 0.12 0.26 -0.07 1.55 0.62 -3.39 0.71 1.32 1.16 -0.44 - - - -0.41 0.09 -4.76 -1.75 -1.91 -1.26 0.39 0.31 0.03 -0.83

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.