Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.75 0.73 0.74 0.66 0.76 0.75 0.65 0.74 0.66 0.65 0.7 0.63 0.46 0.56 1.0 0.62 0.39 0.26 0.54 0.23 0.6 0.64 0.44 0.49 0.75 0.37 0.43 0.38 0.37 0.38 0.41 0.39
0.36 0.26 0.23 0.33 0.39 0.6 0.56 0.51 0.79 0.59 0.45 0.48 0.68 0.45 0.65 1.0 0.32 0.37 0.71 0.26 0.08 0.85 0.43 0.38 0.16 0.33 0.25 0.24 0.47 0.47 0.43 0.46
0.88 0.56 0.58 0.59 0.57 0.48 0.73 0.74 0.74 0.84 0.81 0.87 0.39 0.86 0.32 0.58 0.32 0.25 0.48 0.18 0.86 0.2 0.37 0.47 0.38 0.49 0.36 0.36 0.48 0.46 1.0 0.82
0.54 0.46 0.51 0.43 0.65 0.59 0.4 0.48 0.51 0.55 0.5 0.48 0.46 0.51 0.96 0.52 0.26 0.22 0.46 0.1 1.0 0.19 0.34 0.34 0.2 0.43 0.38 0.41 0.37 0.42 0.17 0.21
0.42 0.44 0.46 0.58 0.63 0.72 0.81 0.81 0.79 0.74 0.64 0.55 0.37 0.71 1.0 0.46 0.51 0.38 0.42 0.28 0.63 0.3 0.45 0.37 0.81 0.34 0.77 0.81 0.61 0.69 0.39 0.33
0.6 0.63 0.66 0.57 0.48 0.69 0.63 0.46 0.58 0.65 0.7 0.64 0.46 0.55 0.61 0.54 0.45 0.34 0.4 0.14 0.8 1.0 0.62 0.6 0.74 0.35 0.39 0.44 0.43 0.43 0.4 0.42
0.59 0.42 0.66 0.55 0.61 0.71 0.93 0.85 0.93 0.92 0.91 0.85 0.94 0.28 0.45 0.96 0.66 0.47 0.98 0.06 0.37 0.87 0.89 1.0 0.25 0.55 0.68 0.6 0.76 0.71 0.79 0.62
0.5 0.42 0.62 0.51 0.5 0.55 0.57 0.62 0.71 0.57 0.65 0.69 0.48 0.36 0.62 0.5 0.5 0.34 0.57 0.1 1.0 0.77 0.71 0.74 0.6 0.58 0.39 0.37 0.56 0.64 0.38 0.32
0.65 0.71 0.54 0.57 0.55 0.57 0.67 0.76 0.77 0.9 0.73 0.89 0.74 0.74 0.45 0.81 0.34 0.3 0.81 0.13 0.82 0.04 0.55 0.61 1.0 0.65 0.37 0.33 0.48 0.47 0.69 0.86
0.95 0.93 0.91 0.83 0.91 1.0 0.87 0.83 0.77 0.94 0.8 0.81 0.73 0.67 0.9 0.8 0.61 0.63 0.8 0.48 0.69 0.5 0.55 0.59 0.59 0.74 0.97 0.99 0.62 0.63 0.59 0.62
0.7 0.42 0.36 0.28 0.33 0.41 0.56 0.95 0.86 0.82 1.0 0.73 0.89 0.43 0.15 0.79 0.26 0.21 0.8 0.24 0.26 0.15 0.5 0.65 0.13 0.45 0.17 0.15 0.43 0.41 0.19 0.21
0.5 0.49 0.5 0.58 0.61 0.58 0.57 0.58 0.61 0.69 0.71 0.63 0.62 0.68 0.68 0.58 0.41 0.34 0.4 0.51 0.77 0.43 0.47 0.53 1.0 0.38 0.38 0.35 0.35 0.36 0.33 0.36
0.84 0.7 0.61 0.56 0.57 0.59 0.57 0.63 0.72 0.87 0.83 0.87 0.87 1.0 0.6 0.97 0.38 0.65 0.54 0.64 0.52 0.32 0.68 0.86 0.29 0.75 0.33 0.29 0.46 0.45 0.54 0.56
0.3 0.39 0.62 0.74 0.7 0.71 0.76 0.8 0.78 0.79 0.71 0.57 0.27 0.75 0.26 0.33 0.4 0.3 0.3 0.04 1.0 0.0 0.86 0.67 0.57 0.65 0.45 0.5 0.44 0.41 0.26 0.36
0.64 0.64 0.74 0.63 0.57 0.52 0.64 0.77 0.87 0.98 1.0 0.8 0.75 0.85 0.11 0.63 0.28 0.3 0.48 0.33 0.5 0.12 0.45 0.47 0.36 0.67 0.25 0.29 0.47 0.49 0.29 0.32
0.9 0.9 1.0 0.85 0.91 0.93 0.79 0.81 0.82 0.81 0.84 0.75 0.66 0.56 0.51 0.66 0.42 0.41 0.57 0.57 0.88 0.27 0.63 0.64 0.56 0.59 0.59 0.67 0.5 0.54 0.51 0.52
0.61 0.56 0.55 0.63 0.76 0.67 0.74 0.82 0.91 0.85 0.98 0.75 0.93 0.54 0.76 1.0 0.64 0.59 0.94 0.45 0.48 0.71 0.87 0.91 0.64 0.76 0.49 0.44 0.84 0.84 0.69 0.74
0.68 0.65 0.58 0.61 0.58 0.61 0.61 0.67 0.78 0.87 0.79 0.81 1.0 0.86 0.31 0.96 0.45 0.47 0.65 0.18 0.52 0.04 0.76 0.85 0.82 0.54 0.54 0.53 0.56 0.57 0.65 0.67
0.5 0.52 0.54 0.61 0.53 0.55 0.6 0.63 0.62 0.65 0.61 0.5 0.36 0.74 0.46 0.63 0.5 0.47 0.66 0.37 1.0 0.19 0.65 0.69 0.78 0.64 0.46 0.61 0.58 0.65 0.34 0.41
0.44 0.07 0.12 0.2 0.14 0.14 0.21 0.46 0.22 0.25 0.19 0.08 1.0 0.47 0.13 0.57 0.01 0.12 0.73 0.0 0.06 0.0 0.05 0.11 0.22 0.94 0.32 0.14 0.2 0.17 0.26 0.11
0.55 0.62 0.62 0.68 0.7 0.91 0.92 0.88 0.88 0.72 0.73 0.64 0.4 0.46 0.87 0.4 0.77 0.61 0.59 0.28 0.57 0.19 0.65 0.58 0.88 0.34 0.94 1.0 0.73 0.77 0.34 0.35
0.61 0.59 0.48 0.64 0.54 0.52 0.58 0.58 0.63 0.77 0.71 0.67 0.71 0.67 0.42 0.53 0.36 0.26 0.62 0.12 0.91 0.13 0.76 0.41 0.33 0.35 0.3 0.27 0.38 0.41 1.0 0.88
0.66 0.74 0.64 0.73 0.81 0.78 0.69 0.74 0.87 0.85 0.77 0.64 0.57 0.51 0.75 0.62 0.44 0.46 0.56 0.25 0.8 0.54 0.6 0.59 1.0 0.61 0.44 0.48 0.45 0.42 0.25 0.28
0.56 0.71 0.55 0.6 0.59 0.56 0.71 0.74 0.95 0.96 0.79 0.54 0.43 0.99 0.9 0.49 0.2 0.2 0.74 0.11 0.5 0.21 0.41 0.42 1.0 0.67 0.2 0.21 0.32 0.36 0.36 0.36
0.7 0.86 0.67 0.75 0.84 0.67 0.65 0.61 0.65 0.73 0.65 0.65 0.77 0.68 1.0 0.82 0.51 0.32 0.59 0.44 0.74 0.24 0.61 0.74 0.83 0.43 0.46 0.37 0.52 0.57 0.48 0.51
0.43 0.33 0.33 0.37 0.38 0.27 0.35 0.68 0.71 0.71 0.64 0.57 0.65 0.48 0.32 0.87 0.07 0.16 0.88 0.03 0.07 0.0 0.14 0.28 0.09 1.0 0.4 0.26 0.25 0.24 0.3 0.36
0.46 0.42 0.46 0.52 0.52 0.53 0.64 0.72 0.71 0.66 0.66 0.63 0.28 0.87 0.76 0.41 0.49 0.37 0.47 0.27 0.6 0.12 0.5 0.43 1.0 0.49 0.56 0.58 0.52 0.56 0.47 0.36
0.49 0.47 0.49 0.57 0.62 0.7 0.68 0.73 0.77 0.71 0.67 0.57 0.56 1.0 0.89 0.68 0.68 0.65 0.72 0.16 0.93 0.25 0.72 0.77 1.0 0.63 0.89 0.8 0.7 0.78 0.67 0.76
0.46 0.42 0.43 0.45 0.39 0.42 0.51 0.53 0.62 0.71 0.57 0.64 0.17 1.0 0.34 0.32 0.3 0.01 0.31 0.1 0.68 0.0 0.36 0.32 0.78 0.42 0.3 0.26 0.45 0.43 0.46 0.44
0.67 0.7 0.62 0.53 0.54 0.52 0.49 0.56 0.62 0.92 0.99 0.86 0.75 0.84 0.6 1.0 0.38 0.92 0.64 0.08 0.91 0.05 0.61 0.68 0.38 0.75 0.33 0.35 0.45 0.38 0.65 0.59
0.22 0.09 0.27 0.13 0.19 0.35 0.44 0.45 0.52 0.34 0.34 0.25 0.15 0.14 0.21 0.15 0.12 0.25 0.15 0.0 1.0 0.22 0.08 0.09 0.14 0.2 0.35 0.43 0.16 0.16 0.16 0.17
0.12 0.16 0.07 0.3 0.26 0.23 0.22 0.36 0.82 0.67 0.57 0.33 0.22 0.42 0.63 0.65 0.46 0.65 0.64 0.0 0.05 0.0 0.72 1.0 0.0 0.27 0.28 0.17 0.4 0.61 0.76 0.7
0.3 0.26 0.43 0.37 0.14 0.32 0.25 0.57 0.49 0.37 0.5 0.45 0.07 0.19 0.11 0.07 0.09 0.24 0.38 0.0 1.0 0.0 0.18 0.19 0.1 0.28 0.38 0.13 0.08 0.08 0.21 0.55
0.28 0.31 0.32 0.42 0.36 0.58 0.73 0.74 0.91 1.0 0.95 0.52 0.55 0.47 0.7 0.85 0.22 0.65 0.51 0.09 0.55 0.27 0.77 0.94 0.26 0.34 0.22 0.31 0.6 0.58 0.65 0.64
0.75 0.57 0.43 0.37 0.34 0.37 0.37 0.43 0.5 0.58 0.63 0.6 0.75 1.0 0.2 0.94 0.38 0.31 0.46 0.02 0.79 0.01 0.47 0.43 0.31 0.56 0.36 0.33 0.54 0.47 0.75 0.52
0.84 0.82 0.71 0.71 0.78 0.73 0.67 0.65 0.61 0.64 0.57 0.61 0.51 0.38 0.53 0.72 0.7 0.69 1.0 0.19 0.35 0.55 0.69 0.7 0.36 0.38 0.34 0.36 0.68 0.72 0.43 0.39
0.4 0.28 0.28 0.23 0.23 0.27 0.3 0.37 0.29 0.44 0.36 0.33 0.43 0.71 0.26 1.0 0.29 0.16 0.49 0.03 0.68 0.03 0.44 0.53 0.24 0.37 0.21 0.24 0.43 0.36 0.41 0.3
0.96 0.79 0.75 0.63 0.69 0.73 0.55 0.62 0.68 0.9 0.81 0.8 0.85 0.94 0.98 1.0 0.35 0.46 0.57 0.54 0.56 0.19 0.5 0.55 0.59 0.72 0.41 0.41 0.39 0.59 0.34 0.32
0.45 0.29 0.21 0.63 0.37 0.49 0.56 0.43 0.31 0.45 0.4 0.4 0.09 0.61 1.0 0.13 0.09 0.66 0.15 0.4 0.64 0.08 0.07 0.1 0.75 0.3 0.56 0.35 0.0 0.05 0.0 0.02
0.4 0.55 0.74 0.54 0.52 0.41 0.66 0.69 0.96 1.0 0.86 0.78 0.33 0.59 0.1 0.25 0.38 0.27 0.12 0.23 0.51 0.05 0.73 0.63 0.45 0.47 0.8 0.65 0.49 0.4 0.35 0.42
0.66 0.67 0.58 0.67 0.69 0.66 0.61 0.64 0.67 0.69 0.6 0.59 0.8 0.6 1.0 0.89 0.39 0.3 0.57 0.58 0.5 0.28 0.5 0.55 0.36 0.75 0.53 0.53 0.39 0.4 0.29 0.27
0.34 0.38 0.39 0.43 0.34 0.42 0.5 0.52 0.64 0.61 0.55 0.58 0.56 0.69 0.37 1.0 0.3 0.48 0.39 0.02 0.76 0.12 0.52 0.55 0.37 0.38 0.26 0.26 0.39 0.36 0.37 0.41
0.55 0.65 0.58 0.38 0.56 0.5 0.29 1.0 0.56 0.57 0.87 0.43 0.33 0.07 0.03 0.11 0.22 0.0 0.19 0.0 0.47 0.0 0.23 0.24 0.25 0.74 0.55 0.53 0.19 0.2 0.13 0.1
0.57 0.61 0.87 0.61 0.51 0.55 0.87 0.7 0.57 0.67 0.82 0.65 0.21 0.21 1.0 0.38 0.49 0.27 0.62 0.19 0.77 0.2 0.24 0.32 0.08 0.3 0.11 0.21 0.4 0.48 0.41 0.36
0.27 0.26 0.21 0.22 0.36 0.12 0.45 0.35 0.33 0.7 0.39 0.5 0.53 0.93 0.49 0.63 0.28 0.37 0.64 0.04 0.7 0.09 0.37 0.45 0.11 0.72 0.6 0.46 0.48 0.48 1.0 0.76
0.59 0.52 0.36 0.68 0.7 0.75 0.76 0.59 0.53 0.82 0.38 0.9 0.44 0.58 0.65 0.41 0.2 0.33 0.32 0.0 1.0 0.0 0.25 0.21 0.21 0.56 0.45 0.68 0.17 0.18 0.12 0.15
0.61 0.54 0.55 0.54 0.49 0.43 0.61 0.62 0.75 0.91 0.91 0.69 0.88 0.61 0.3 0.64 0.55 0.35 1.0 0.11 0.07 0.39 0.38 0.39 0.09 0.71 0.37 0.56 0.52 0.5 0.36 0.31
0.28 0.21 0.19 0.22 0.23 0.14 0.12 0.47 0.44 0.56 0.42 0.46 0.53 0.14 0.03 0.81 0.05 0.19 1.0 0.0 0.01 0.08 0.23 0.95 0.27 0.93 0.2 0.06 0.2 0.14 0.29 0.18
0.58 0.6 0.64 0.71 0.65 0.59 0.58 0.65 0.73 0.67 0.61 0.57 0.32 0.44 0.61 0.33 0.33 1.0 0.38 0.04 0.76 0.02 0.33 0.25 0.21 0.34 0.3 0.33 0.28 0.29 0.46 0.6
0.33 0.49 0.29 0.45 0.2 0.45 0.37 0.45 0.62 0.54 0.36 0.57 0.22 0.33 0.48 0.23 0.25 1.0 0.23 0.12 1.0 0.02 0.33 0.18 0.19 0.35 0.5 0.3 0.14 0.25 0.24 0.57
0.24 0.22 0.14 0.25 0.21 0.1 0.39 0.47 0.46 0.37 0.03 0.27 0.0 0.3 1.0 0.0 0.01 0.95 0.01 0.0 0.19 0.0 0.02 0.01 0.0 0.25 0.39 0.53 0.01 0.01 0.0 0.0
0.52 0.47 0.46 0.4 0.62 0.5 0.53 0.45 0.49 0.53 0.45 0.38 0.34 0.31 0.44 0.35 0.25 0.44 0.34 0.06 0.46 0.08 0.27 0.33 0.24 0.57 0.55 0.54 0.27 0.23 1.0 0.59
0.9 0.95 0.91 0.84 0.84 0.93 0.84 0.71 0.76 0.77 0.68 0.71 0.53 0.55 0.37 0.62 0.48 0.55 0.64 0.42 1.0 0.24 0.5 0.51 0.39 0.41 0.57 0.54 0.54 0.53 0.53 0.56
0.64 0.53 0.49 0.5 0.49 0.48 0.48 0.59 0.57 0.66 0.7 0.7 0.39 0.54 0.65 0.6 0.31 0.36 0.69 0.17 0.48 0.04 0.37 0.47 0.23 0.73 0.84 0.85 0.64 0.63 0.94 1.0
0.57 0.42 0.43 0.42 0.37 0.39 0.5 0.62 0.85 1.0 0.95 0.88 0.78 0.53 0.37 0.76 0.25 0.32 0.73 0.08 0.76 0.27 0.27 0.36 0.28 0.82 0.28 0.28 0.45 0.42 0.37 0.48
0.54 0.65 0.77 0.7 0.6 0.54 0.8 0.72 0.89 0.87 0.9 0.68 0.57 0.71 0.14 0.42 0.56 0.52 0.82 0.53 0.48 0.16 0.6 0.57 0.49 1.0 0.36 0.39 0.62 0.65 0.44 0.47
0.44 0.44 0.35 0.33 0.31 0.32 0.35 0.38 0.52 0.54 0.55 0.49 0.59 0.74 0.2 1.0 0.32 0.34 0.59 0.26 0.42 0.15 0.63 0.68 0.83 0.44 0.23 0.2 0.44 0.5 0.36 0.4
0.95 1.0 0.94 0.86 0.88 0.82 0.59 0.59 0.54 0.59 0.58 0.55 0.62 0.57 0.46 0.76 0.54 0.25 0.76 0.37 0.72 0.09 0.72 0.67 0.31 0.42 0.73 0.85 0.51 0.48 0.51 0.51
0.72 0.73 0.71 0.76 0.67 0.68 0.58 0.81 0.83 0.93 0.78 0.74 0.26 0.35 0.68 0.31 0.28 0.72 0.33 0.05 1.0 0.0 0.37 0.24 0.23 0.58 0.7 0.54 0.2 0.16 0.64 1.0
0.55 0.35 0.35 0.31 0.38 0.39 0.5 0.59 0.68 0.77 0.72 0.69 0.96 1.0 0.06 0.72 0.17 0.34 0.44 0.0 0.36 0.01 0.37 0.53 0.6 0.62 0.39 0.33 0.49 0.43 0.47 0.34
0.86 0.78 0.75 0.76 0.88 0.85 0.76 0.78 0.79 0.98 0.98 0.76 0.67 0.28 0.24 0.86 0.7 0.79 0.93 0.17 0.51 0.73 0.84 0.73 0.55 0.67 0.55 0.57 1.0 0.85 0.63 0.66
0.72 0.74 0.7 0.79 0.72 0.71 0.75 0.82 0.83 0.98 0.84 0.83 0.91 0.8 0.62 1.0 0.55 0.56 0.82 0.28 0.46 0.6 0.76 0.83 0.44 0.88 0.56 0.59 0.66 0.73 0.46 0.5
0.68 0.65 0.55 0.67 0.53 0.6 0.53 0.55 0.61 0.79 0.65 0.7 0.59 0.52 0.51 0.61 0.38 0.41 0.66 0.07 1.0 0.12 0.54 0.55 0.26 0.45 0.46 0.41 0.5 0.51 0.62 0.76
0.56 0.44 0.44 0.4 0.39 0.36 0.42 0.44 0.48 0.72 0.78 0.79 1.0 0.52 0.25 0.88 0.19 0.37 0.43 0.02 0.62 0.01 0.58 0.77 0.57 0.74 0.34 0.3 0.45 0.46 0.31 0.37
0.72 0.76 0.8 0.86 0.73 0.78 0.78 0.86 0.82 0.94 0.9 0.74 0.79 0.78 0.97 0.72 0.52 0.55 0.66 0.19 0.89 0.32 0.8 0.84 0.31 0.81 0.84 0.82 0.52 0.52 1.0 0.87
0.65 0.6 0.57 0.72 0.77 0.73 0.6 0.66 0.77 0.76 0.8 0.61 0.59 0.67 1.0 0.68 0.46 0.45 0.61 0.14 0.76 0.71 0.5 0.54 0.51 0.41 0.51 0.49 0.49 0.54 0.43 0.47
0.34 0.58 0.72 0.71 0.65 0.63 0.85 0.8 0.98 0.97 0.81 0.65 0.58 0.77 0.14 0.57 0.61 0.49 0.38 0.21 0.7 0.08 0.84 0.85 0.58 0.52 0.78 1.0 0.48 0.56 0.46 0.51
0.52 0.53 0.59 0.65 0.71 0.62 0.69 0.64 0.77 0.75 0.76 0.67 0.43 1.0 0.54 0.32 0.6 0.48 0.27 0.24 0.85 0.1 0.64 0.42 0.82 0.17 0.41 0.39 0.56 0.57 0.46 0.44
0.94 0.83 0.83 0.81 0.77 1.0 0.69 0.78 0.78 0.86 0.82 0.78 0.56 0.57 0.92 0.64 0.48 0.31 0.66 0.31 0.78 0.0 0.48 0.54 0.09 0.46 0.55 0.68 0.44 0.45 0.56 0.5
0.67 0.62 0.55 0.52 0.44 0.45 0.49 0.5 0.65 0.73 0.69 0.77 0.46 0.48 0.85 0.51 0.33 0.48 0.53 0.36 1.0 0.09 0.33 0.36 0.65 0.14 0.13 0.13 0.39 0.4 0.31 0.38
0.83 0.83 0.85 0.78 0.82 0.87 0.88 0.94 0.93 1.0 0.92 0.85 0.76 0.61 0.73 0.81 0.59 0.56 0.79 0.46 0.66 0.44 0.65 0.64 0.42 0.91 0.6 0.65 0.66 0.69 0.61 0.68
0.44 0.55 0.64 0.72 0.7 0.63 0.7 0.7 0.68 0.55 0.6 0.51 0.28 0.57 0.78 0.35 0.42 0.27 0.41 0.44 0.82 0.46 0.41 0.41 1.0 0.42 0.56 0.49 0.39 0.39 0.29 0.23
0.56 0.51 0.5 0.47 0.46 0.57 0.54 0.52 0.62 0.56 0.58 0.49 0.41 0.85 0.51 0.63 0.5 0.49 0.68 0.33 1.0 0.04 0.64 0.54 0.21 0.62 0.82 0.74 0.53 0.53 0.72 0.76
0.47 0.56 0.62 0.55 0.43 0.47 0.56 0.74 0.54 0.58 0.56 0.53 0.06 0.31 0.18 0.06 0.07 0.52 0.28 0.0 1.0 0.02 0.1 0.14 0.39 0.62 0.26 0.14 0.23 0.16 0.33 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)