1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
1.51 0.0 0.25 0.14 0.19 0.39 0.0 1.32 0.0 0.3 0.0 0.0 0.09 0.93 0.0 2.93 0.19 68.64 7.26 0.0 0.46 0.0 1.25 0.93 5.74 17.66 4.86 0.0 1.99 3.04 3.58 1.87
1.38 0.97 0.92 0.92 1.34 1.42 0.58 0.84 0.85 0.57 0.79 1.17 0.46 0.53 0.38 0.73 1.31 4.78 0.65 0.28 2.53 1.63 0.54 0.51 0.32 0.47 0.63 0.48 1.91 1.49 1.58 0.83
0.12 0.17 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.38 0.0 0.34 0.1 5.78 0.15 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.18 0.18 3.88 0.31 0.0 3.51 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.25 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.19 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.19 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.16 10.28 9.13 12.4 13.73 14.51 13.3 15.23 13.31 13.51 13.16 12.5 12.01 17.35 20.49 14.52 9.94 30.07 13.74 14.9 24.83 3.32 11.51 12.34 21.92 24.26 19.69 19.79 8.99 8.91 7.95 5.81
0.0 0.26 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.08 34.1 0.22 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.45 1.07 1.84 2.91
2.01 3.55 1.62 0.8 1.4 4.11 2.54 3.96 0.0 2.23 3.06 7.27 0.0 0.0 0.0 0.11 11.08 62.81 22.74 0.0 47.35 0.0 16.77 5.82 0.0 0.0 5.38 0.0 6.13 4.73 12.56 6.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.11 1.39 1.79 1.96 2.77 4.76 3.75 6.97 4.48 2.72 1.87 6.36 0.0 0.0 0.0 0.45 23.95 148.85 43.11 0.0 0.87 0.0 50.22 13.1 17.18 4.26 13.91 2.06 15.84 13.61 30.91 13.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.03 0.06 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 5.43 1.7 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.51 0.16 0.04 0.0 0.1 0.08 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 3.81 0.02 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.34 0.0 0.49 0.0 0.13 0.52 0.23 0.0 0.0 0.39 0.14 3.07 0.42 0.26 4.78 1.93 0.12 0.0 1.83 0.0 0.01 0.0 0.0 0.22 0.33 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.54 0.0 0.0 107.84 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.28 1.55 0.91 1.28 2.35 2.41 0.95 2.81 3.91 5.38 5.84 3.06 43.51 7.51 0.58 113.08 0.31 408.0 6.68 0.0 0.0 0.0 1.54 0.93 95.17 34.31 13.9 0.26 1.67 4.41 3.15 2.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.59 0.14 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.26 0.23 1.41 0.55 0.0 0.0 0.0 0.13 0.22 0.13 0.21 0.25 0.3 0.32 0.29 0.22 0.12
0.57 0.57 0.18 0.05 0.17 0.88 0.49 0.85 0.83 0.5 0.18 0.43 0.0 0.0 0.0 0.03 2.29 23.83 2.97 0.35 1.23 0.0 2.76 0.52 0.96 1.49 3.01 0.49 3.28 1.63 2.48 1.11
0.07 0.04 0.07 0.1 0.09 0.05 0.12 0.48 0.2 0.07 0.11 0.17 0.1 0.09 0.14 0.15 1.48 11.63 4.63 0.0 6.07 0.0 2.47 0.66 2.55 0.55 0.43 0.0 2.02 0.68 0.75 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 34.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 13.68 1.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.02 1.32 0.76 0.45 0.24 0.19 0.45 0.49 0.56 0.62 0.53 0.62 0.03 3.25 0.64 0.21 3.87 44.73 8.36 0.04 0.08 0.0 0.14 0.12 0.0 0.44 0.0 0.0 3.83 2.85 1.01 1.05
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 2.44 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.12 0.12 0.22 0.2 0.02 0.09
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 7.76 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.51 0.29 0.0 0.29 0.47 1.7 0.07 0.29 0.75 0.16 1.05 0.0 0.0 0.0 0.64 9.1 90.99 9.46 2.62 11.83 0.0 10.04 2.33 5.05 1.52 2.63 1.05 16.94 7.92 9.79 6.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.22
0.06 0.07 0.0 0.08 0.11 0.11 0.11 0.14 0.22 0.03 0.04 0.04 0.06 0.07 0.04 0.07 0.02 7.82 0.41 0.0 0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.02 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.24 0.21 2.37 0.94 0.0 0.0 0.0 0.84 0.61 0.0 0.0 0.0 0.57 0.54 0.0 0.32 0.49
6.23 4.13 0.82 1.71 1.0 5.61 2.63 8.15 7.23 4.62 5.57 3.83 0.11 0.0 0.0 0.04 13.54 210.58 45.23 0.0 2.44 0.0 2.68 0.45 2.75 110.51 27.66 0.75 5.09 2.43 3.97 2.93
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 3.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.35 0.27 0.45 0.12 0.49 0.84 0.85 0.28 0.66 0.65 0.64 0.19 1.0 0.41 0.2 0.04 8.77 0.07 0.11 3.0 0.0 0.1 0.07 0.0 0.57 0.24 0.22 0.07 0.07 0.03 0.07
0.14 0.02 0.07 0.27 0.0 0.36 0.04 0.11 0.22 0.13 0.07 0.07 0.14 0.08 0.01 0.17 0.33 5.16 1.81 0.0 1.6 0.0 0.56 0.69 0.67 0.1 0.06 0.11 0.36 0.29 0.27 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.68 0.27 0.14 0.07 0.18 0.25 0.49 0.34 1.0 0.25 0.51 4.18 0.16 0.21 0.6 15.06 58.39 22.85 0.0 0.17 0.0 4.06 3.16 1.39 0.89 1.13 0.52 8.47 14.02 3.98 4.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.17 0.14 0.43 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.45 0.21 1.08 0.68 0.15 11.21 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.15 0.14 0.0
0.63 16.41 20.23 0.0 26.15 5.75 0.0 7.24 5.73 3.76 9.63 3.37 4.6 34.32 6.61 42.65 4.14 895.12 42.65 0.0 0.0 0.0 6.96 19.22 188.28 207.02 173.63 28.41 11.27 25.02 19.05 21.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.0 0.09 0.0 0.0 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 7.68 1.01 0.0 0.0 0.0 1.96 0.56 0.0 0.0 2.62 0.56 1.52 0.79 1.41 0.45
0.15 0.0 0.09 0.0 0.0 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 7.68 1.01 0.0 0.0 0.0 1.96 0.56 0.0 0.0 2.62 0.56 1.52 0.79 1.41 0.45

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)