1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.43 0.36 1.12 0.24 0.24 0.7 0.1 0.2 0.32 0.19 0.23 0.29 0.01 0.01 0.0 0.01 0.3 0.46 0.11 1.62 0.58 0.0 0.13 0.07 0.23 0.14 0.22 0.44 0.22 0.17 0.2 0.14
45.05 30.35 40.4 17.34 23.02 31.44 19.87 18.42 25.42 22.12 23.14 29.28 0.09 1.39 0.2 0.52 9.34 10.78 4.0 17.59 17.61 0.0 4.22 2.9 4.26 13.34 9.21 15.54 12.33 7.9 12.59 10.1
0.9 0.3 0.83 0.52 0.92 0.81 0.3 0.38 0.33 0.36 0.35 0.46 0.01 0.12 0.1 0.05 0.48 0.5 0.15 0.57 0.0 0.0 0.15 0.06 0.18 0.29 0.16 0.16 0.3 0.28 0.26 0.26
3.2 2.37 5.41 1.75 1.04 1.7 0.57 0.68 0.95 1.76 0.61 1.15 0.0 0.62 0.26 0.0 0.47 10.4 0.75 0.39 0.0 0.0 0.17 0.3 0.0 2.14 1.12 0.99 0.16 0.32 0.8 0.77
3.83 2.99 9.83 2.54 3.17 6.74 1.97 3.08 3.66 2.17 4.05 2.01 0.31 0.8 0.24 0.45 1.24 12.05 1.05 0.2 0.0 4.0 0.38 0.67 0.46 0.92 0.81 2.59 2.91 0.79 2.17 1.32
24.48 21.68 20.96 11.66 18.32 20.08 9.51 12.36 12.8 10.52 16.24 16.02 0.13 0.5 0.54 0.86 36.59 5.95 12.13 0.93 1.69 0.0 18.74 11.74 7.02 13.02 10.4 13.62 41.52 25.1 41.52 33.61
2.51 1.38 1.34 0.94 2.37 2.11 0.89 1.13 1.82 1.67 0.72 1.64 0.29 1.37 2.29 0.26 0.77 3.56 0.64 0.97 0.93 0.0 0.79 0.69 0.53 1.59 0.74 2.32 1.3 1.48 1.3 0.92
0.6 0.62 0.26 0.23 0.34 0.38 0.19 0.2 0.34 0.33 0.25 0.32 0.09 0.25 0.13 0.03 0.53 0.51 0.18 0.0 0.0 0.0 0.19 0.19 0.33 0.26 0.25 0.41 0.49 0.42 0.56 0.52
19.91 14.83 14.95 7.42 11.25 14.79 6.75 6.27 10.52 8.05 7.41 8.99 0.06 1.74 0.2 0.36 10.55 9.37 2.73 1.01 1.04 0.0 3.43 2.09 0.8 3.53 3.23 5.75 8.22 6.65 9.61 6.89
1.37 1.68 2.99 0.38 1.94 1.88 0.59 0.43 0.88 0.63 0.8 1.28 0.0 0.16 0.19 0.0 0.44 0.64 0.29 0.0 0.0 0.0 0.3 0.25 0.0 0.11 0.74 0.47 0.75 0.69 0.68 0.33
17.29 10.88 19.62 5.18 9.98 16.09 5.92 6.16 8.4 8.34 7.05 8.2 0.0 0.89 0.39 0.18 3.63 7.01 1.01 0.1 0.26 0.0 1.23 1.01 0.53 4.18 4.08 4.98 4.82 3.12 4.05 3.03
3.67 3.97 4.13 1.81 1.83 3.82 2.47 1.89 2.51 3.25 2.78 4.04 1.41 0.58 0.72 1.61 1.78 7.75 1.8 0.58 2.05 7.92 1.3 1.61 1.97 2.06 2.07 4.63 1.75 2.2 2.12 2.38
3.5 2.96 1.76 0.84 1.06 3.45 1.4 1.86 0.94 2.27 2.45 2.17 0.15 0.23 0.29 0.08 2.17 5.08 0.71 0.0 0.0 0.0 0.67 0.4 5.37 2.09 5.17 6.11 2.91 1.81 1.86 1.44
7.42 3.43 6.72 1.45 3.24 6.51 2.62 3.03 2.73 2.95 1.92 2.4 0.0 0.3 0.09 0.24 1.23 3.05 0.57 0.0 0.0 0.0 0.44 0.22 0.97 0.65 0.77 0.73 2.14 1.54 1.59 1.87
1.78 1.85 1.07 0.71 0.41 1.43 0.93 0.77 0.5 0.29 1.41 1.53 0.08 0.53 0.23 0.12 0.33 1.2 0.3 0.21 0.0 0.0 0.34 0.19 0.0 0.31 0.36 1.22 0.76 0.48 0.65 0.66
4.91 4.29 0.57 4.11 0.39 3.16 3.42 2.16 3.74 4.68 1.3 5.84 0.28 1.86 0.84 0.38 0.77 20.6 0.42 0.0 1.86 0.0 0.34 0.76 0.0 0.6 0.66 1.33 1.41 0.7 1.47 1.41
1.3 1.6 1.08 0.25 0.55 1.82 0.57 0.63 1.01 0.78 1.37 1.73 0.26 0.44 0.77 0.37 0.82 6.16 0.64 0.16 0.0 0.0 0.24 0.24 0.0 0.38 0.24 0.0 1.82 1.07 2.04 1.18
1.1 0.7 0.96 0.31 0.54 1.27 0.71 0.54 0.72 0.32 0.63 0.75 0.02 0.2 0.07 0.02 0.42 0.72 0.16 0.19 0.13 0.0 0.11 0.18 0.27 0.28 0.43 0.49 0.46 0.27 0.29 0.11
3.29 4.33 2.42 0.92 0.93 5.08 2.38 2.37 2.98 1.13 1.93 2.43 0.15 1.75 0.47 0.32 1.98 10.29 0.81 1.61 0.88 1.62 0.43 0.27 3.49 0.36 0.95 2.52 1.75 2.0 2.0 1.37
1.43 1.08 1.16 0.34 0.5 1.16 0.76 0.63 0.59 0.96 1.04 0.86 0.0 0.0 0.18 0.16 0.33 0.97 0.28 0.1 0.24 0.0 0.05 0.0 0.0 0.42 0.59 0.45 0.52 0.1 0.65 0.4
0.43 0.36 1.12 0.24 0.24 0.7 0.1 0.2 0.32 0.19 0.23 0.29 0.01 0.01 0.0 0.01 0.3 0.46 0.11 1.62 0.58 0.0 0.13 0.07 0.23 0.14 0.22 0.44 0.22 0.17 0.2 0.14
26.04 18.97 28.35 8.36 9.66 24.18 10.31 14.18 15.04 6.34 7.34 19.19 0.89 1.12 3.06 1.44 15.25 84.02 5.74 4.78 0.0 0.0 7.82 4.85 2.68 1.59 5.82 5.35 21.6 11.44 19.71 15.53
26.25 17.46 22.26 7.46 13.02 14.98 8.19 7.0 10.21 7.49 17.25 13.24 0.21 3.25 0.62 0.87 9.97 23.49 4.09 21.17 0.0 0.0 4.01 2.89 0.0 9.17 7.0 6.37 18.46 8.11 19.18 14.84
2.79 1.51 2.54 1.36 0.53 1.98 1.59 0.76 1.44 1.46 1.84 1.48 0.21 0.36 0.17 0.03 0.62 1.96 0.31 0.0 0.28 0.0 0.17 0.4 1.25 1.17 0.75 1.53 0.8 0.57 0.61 0.4
5.66 3.68 5.28 1.66 2.33 4.26 2.27 1.67 3.38 2.07 2.35 2.34 0.06 0.78 0.58 0.1 1.41 2.25 0.31 1.39 0.0 0.0 0.4 0.38 0.15 1.28 0.95 1.8 1.76 0.88 2.03 1.35
1.41 1.2 1.38 0.59 0.99 1.78 0.74 0.49 0.63 0.8 0.51 0.76 0.0 0.46 0.25 0.06 0.72 0.96 0.14 0.1 0.0 0.0 0.23 0.15 0.3 0.44 0.44 0.47 0.65 0.43 0.58 0.66
2.5 1.18 1.86 1.02 0.96 1.81 0.45 0.47 1.45 0.62 0.84 0.87 0.25 0.98 0.33 0.49 0.89 2.24 0.65 1.19 0.77 3.76 0.47 0.53 0.37 0.37 0.81 0.9 1.56 1.06 0.89 0.81
7.79 6.26 12.21 2.48 6.12 6.93 2.68 2.69 5.68 4.25 4.76 3.95 0.23 0.62 0.66 0.19 3.15 8.34 0.74 0.0 10.85 0.0 0.89 0.71 3.02 2.86 2.58 3.91 3.54 2.2 3.53 2.6
1.45 0.47 1.48 0.36 0.28 1.47 1.13 0.13 1.44 1.24 0.65 1.55 0.52 0.96 0.2 0.19 1.33 5.05 0.64 0.0 0.0 5.65 0.5 0.72 1.11 0.74 1.12 0.42 2.0 1.57 1.89 1.8
1.62 0.8 0.79 0.97 0.69 0.51 0.57 0.57 0.61 0.38 0.51 0.72 0.05 0.33 0.09 0.21 1.77 1.02 1.63 0.05 0.39 0.0 1.3 0.74 1.2 1.04 0.54 0.64 1.08 1.56 1.27 0.74
1.52 2.6 2.73 0.67 4.71 1.48 0.66 1.73 0.3 0.67 0.8 1.27 0.28 0.4 0.15 0.21 1.41 0.92 0.56 1.58 0.0 0.0 1.34 0.74 0.0 0.57 0.66 1.56 2.73 2.1 2.65 1.98
2.11 1.73 2.36 1.75 1.86 2.2 1.29 1.64 1.47 1.62 1.63 1.53 0.16 1.43 0.36 0.31 0.74 0.82 0.95 0.07 0.06 0.0 0.8 0.64 0.15 1.79 1.3 2.12 0.57 0.75 0.73 0.66
55.57 36.07 60.03 17.63 32.89 54.62 20.66 15.37 32.09 21.39 22.0 29.07 0.07 3.06 0.38 0.49 19.84 20.48 4.01 34.19 20.44 2.24 4.93 4.21 12.79 8.83 8.49 12.27 23.38 14.01 21.9 17.91
13.73 9.38 9.84 5.49 7.53 10.8 5.04 3.56 8.4 7.38 6.66 8.36 0.02 0.78 0.31 0.37 4.84 6.87 2.62 0.58 0.31 0.19 2.09 1.76 1.23 2.4 2.04 3.74 6.56 4.17 6.46 5.96
1.68 1.36 0.78 0.48 0.71 0.78 1.08 0.47 0.55 0.56 0.54 0.72 0.07 0.36 0.28 0.14 1.57 1.85 0.55 2.56 0.16 0.0 0.6 0.4 0.86 0.27 0.42 1.22 1.71 1.31 1.76 0.89
3.17 2.43 2.17 1.66 1.05 3.63 1.39 2.24 2.55 1.63 3.61 3.47 0.37 1.2 0.48 0.54 1.77 6.06 1.58 0.0 0.0 0.22 1.41 1.49 3.61 0.47 0.54 0.69 2.38 2.66 3.12 1.79
1.84 1.98 2.24 0.8 1.15 1.23 0.96 1.11 1.11 0.82 1.05 1.61 0.06 0.47 0.1 0.17 1.55 1.43 0.81 0.07 0.09 0.0 0.59 0.66 0.49 2.98 1.68 4.06 1.08 1.0 0.83 0.26
3.6 1.74 2.26 1.72 3.81 2.53 1.71 1.39 2.65 3.2 2.12 2.3 0.1 0.81 0.61 0.55 0.8 2.93 0.85 0.61 0.0 0.0 0.63 1.89 3.31 0.49 1.11 0.76 1.27 1.02 1.4 1.08
2.33 1.06 1.54 2.09 2.54 1.28 1.33 0.93 1.36 1.57 1.55 1.43 0.32 0.5 0.61 0.84 0.24 1.39 0.66 0.11 0.09 0.0 0.51 1.14 0.69 0.34 0.21 0.25 0.82 0.62 0.69 0.7
1.32 0.98 0.97 0.65 1.41 1.22 0.65 1.05 1.5 1.57 1.14 0.57 0.19 0.31 0.38 0.79 0.29 1.66 0.61 0.37 0.28 0.0 0.78 1.27 0.75 0.15 0.3 0.2 0.6 0.86 0.6 0.57
0.43 0.36 1.12 0.24 0.24 0.7 0.1 0.2 0.32 0.19 0.23 0.29 0.01 0.01 0.0 0.01 0.3 0.46 0.11 1.62 0.58 0.0 0.13 0.07 0.23 0.14 0.22 0.44 0.22 0.17 0.2 0.14
481.86 314.43 466.91 184.95 247.42 347.15 189.92 194.78 327.79 237.24 190.57 235.67 0.88 0.0 0.0 2.82 75.7 289.6 16.4 13.12 64.82 4.49 37.02 30.88 26.54 3.92 0.0 3.91 126.39 79.15 136.97 115.34
1.52 1.01 1.15 1.0 0.93 0.98 1.04 0.94 1.45 1.03 0.77 1.14 0.18 0.39 0.55 1.9 0.43 4.13 0.95 0.0 0.14 0.0 1.08 1.43 0.74 0.38 0.59 0.74 0.82 0.96 0.85 0.48
14.92 9.68 16.25 5.14 7.59 12.68 5.36 4.68 7.88 5.8 5.12 6.73 0.16 0.85 0.22 0.35 3.91 7.49 1.43 0.53 0.62 0.0 1.38 1.25 0.49 2.84 3.64 3.93 4.69 3.48 4.67 3.96
0.17 0.04 0.04 0.05 0.03 0.1 0.0 0.05 0.05 0.08 0.0 0.08 0.01 0.11 0.05 0.0 0.02 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.29 0.14 0.56 0.06 0.04 0.06 0.02
446.79 301.49 499.35 173.15 267.22 346.1 202.4 207.53 292.69 218.49 235.1 258.29 0.12 14.79 2.32 1.15 58.37 160.1 10.15 5.05 15.23 0.0 18.84 20.03 14.3 69.53 51.9 54.99 72.61 53.17 74.17 65.82
4.48 2.79 4.5 1.57 1.96 4.08 1.33 1.09 2.27 1.55 1.5 1.97 0.09 0.47 0.21 0.19 1.55 2.35 0.44 6.41 0.0 0.0 0.37 0.33 0.3 1.27 0.62 1.03 1.58 1.05 1.55 1.36
1.65 1.98 1.98 0.46 1.43 1.91 1.22 0.97 1.18 0.96 0.94 1.38 0.0 0.2 0.07 0.12 1.49 2.18 0.26 0.2 0.0 0.0 0.66 0.48 0.0 0.33 0.4 0.49 0.88 0.63 1.31 1.08
0.17 0.04 0.04 0.05 0.03 0.1 0.0 0.05 0.05 0.08 0.0 0.08 0.01 0.11 0.05 0.0 0.02 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.29 0.14 0.56 0.06 0.04 0.06 0.02
0.17 0.04 0.04 0.05 0.03 0.1 0.0 0.05 0.05 0.08 0.0 0.08 0.01 0.11 0.05 0.0 0.02 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.29 0.14 0.56 0.06 0.04 0.06 0.02
26.45 21.54 23.44 15.35 5.45 12.05 8.95 11.26 16.62 15.3 17.76 14.42 0.7 1.98 1.4 2.28 6.55 36.36 9.98 0.0 0.0 0.0 4.05 6.79 3.03 7.23 7.72 0.0 13.78 14.91 10.65 4.04
0.62 0.45 0.74 0.33 0.34 0.41 0.22 0.26 0.29 0.22 0.19 0.2 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.06 0.02 0.07 0.1
0.36 0.06 0.47 0.31 0.14 0.07 0.0 0.0 0.13 0.16 0.19 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.26 0.47 0.12 0.0 0.0 0.0 0.26 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.25 0.06
0.01 0.02 0.0 0.01 0.09 0.03 0.02 0.0 0.07 0.0 0.06 0.04 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.57 0.18 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.2 0.0 0.01 0.0 0.0
1.07 0.94 0.6 0.58 0.66 0.36 0.4 0.38 0.7 0.49 0.8 0.52 0.0 0.41 0.03 0.11 0.79 0.57 0.71 0.79 0.21 0.0 0.07 0.08 0.35 0.65 0.17 0.36 0.85 1.22 0.8 0.94
4.41 2.79 3.48 2.71 3.96 3.58 2.29 4.42 4.85 2.92 2.71 3.15 0.16 0.08 0.12 0.56 0.06 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.97 0.64 1.23 1.72 0.36 1.26 0.32 0.13 0.19 0.0
6.76 3.18 4.96 3.97 4.0 2.92 2.5 4.62 2.49 5.37 3.86 5.32 2.25 1.26 0.8 1.01 1.0 3.77 1.69 0.0 0.65 0.0 1.56 1.92 2.7 0.38 0.59 0.99 1.64 1.7 1.28 0.73
5.42 3.96 5.57 6.71 4.79 1.25 2.98 3.05 5.62 6.39 7.75 8.32 0.82 0.8 1.23 1.49 1.49 0.34 0.99 19.3 17.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.92 2.49 0.53 0.65 0.41 0.69
2.0 1.39 2.43 2.89 3.85 2.37 3.35 1.57 4.18 2.3 3.73 2.06 0.99 0.97 0.3 0.34 2.26 2.08 2.21 1.93 0.53 0.78 3.11 3.35 2.28 0.62 0.3 0.0 2.88 2.05 4.22 1.69
0.37 0.54 0.5 0.46 0.34 0.68 0.54 0.74 0.58 0.67 0.57 0.59 0.14 0.18 0.48 0.5 0.43 1.05 0.48 0.12 0.18 1.37 0.37 0.37 0.61 0.38 0.58 0.53 0.3 0.34 0.32 0.26
365.34 286.41 168.81 343.95 320.46 300.74 166.63 380.76 332.75 290.67 383.77 239.1 0.34 0.0 0.0 0.61 1.09 442.75 3.11 0.1 0.0 0.0 5.17 7.24 6.15 40.73 4.65 89.62 3.26 2.13 5.73 1.7
0.76 0.46 0.48 0.31 0.83 0.64 0.53 0.47 0.74 0.47 0.58 0.75 0.0 0.2 0.05 0.0 0.32 0.79 0.17 0.33 0.32 0.0 0.09 0.21 0.44 0.04 0.16 0.1 0.54 0.27 0.31 0.37
0.76 0.46 0.48 0.31 0.83 0.64 0.53 0.47 0.74 0.47 0.58 0.75 0.0 0.2 0.05 0.0 0.32 0.79 0.17 0.33 0.32 0.0 0.09 0.21 0.44 0.04 0.16 0.1 0.54 0.27 0.31 0.37
2.38 2.33 0.63 0.42 0.46 1.41 0.96 0.28 0.57 2.12 1.02 2.11 0.06 0.25 0.11 0.0 0.65 1.19 0.43 0.0 0.0 0.0 0.34 0.21 0.23 0.69 0.3 1.04 1.36 0.7 1.6 1.12
19.41 13.35 25.37 7.93 31.17 31.57 1.39 3.76 9.59 7.11 13.36 14.96 0.0 0.0 0.0 1.48 14.96 58.2 6.44 0.0 0.0 0.0 4.48 5.33 0.0 0.0 3.58 0.0 25.57 17.96 20.35 22.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)