1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.26 0.22 0.69 0.15 0.15 0.43 0.06 0.13 0.2 0.12 0.14 0.18 0.01 0.01 0.0 0.01 0.18 0.28 0.07 1.0 0.36 0.0 0.08 0.04 0.14 0.09 0.14 0.27 0.14 0.1 0.12 0.09
1.0 0.67 0.9 0.38 0.51 0.7 0.44 0.41 0.56 0.49 0.51 0.65 0.0 0.03 0.0 0.01 0.21 0.24 0.09 0.39 0.39 0.0 0.09 0.06 0.09 0.3 0.2 0.34 0.27 0.18 0.28 0.22
0.98 0.32 0.89 0.56 1.0 0.88 0.33 0.41 0.35 0.39 0.37 0.5 0.01 0.13 0.11 0.05 0.52 0.54 0.16 0.62 0.0 0.0 0.16 0.07 0.19 0.31 0.17 0.17 0.32 0.3 0.28 0.29
0.31 0.23 0.52 0.17 0.1 0.16 0.05 0.07 0.09 0.17 0.06 0.11 0.0 0.06 0.02 0.0 0.05 1.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.21 0.11 0.09 0.02 0.03 0.08 0.07
0.32 0.25 0.82 0.21 0.26 0.56 0.16 0.26 0.3 0.18 0.34 0.17 0.03 0.07 0.02 0.04 0.1 1.0 0.09 0.02 0.0 0.33 0.03 0.06 0.04 0.08 0.07 0.21 0.24 0.07 0.18 0.11
0.59 0.52 0.5 0.28 0.44 0.48 0.23 0.3 0.31 0.25 0.39 0.39 0.0 0.01 0.01 0.02 0.88 0.14 0.29 0.02 0.04 0.0 0.45 0.28 0.17 0.31 0.25 0.33 1.0 0.6 1.0 0.81
0.7 0.39 0.37 0.26 0.67 0.59 0.25 0.32 0.51 0.47 0.2 0.46 0.08 0.38 0.64 0.07 0.22 1.0 0.18 0.27 0.26 0.0 0.22 0.19 0.15 0.45 0.21 0.65 0.37 0.42 0.37 0.26
0.97 1.0 0.42 0.37 0.55 0.61 0.31 0.33 0.56 0.54 0.41 0.51 0.14 0.4 0.21 0.05 0.86 0.83 0.3 0.0 0.0 0.0 0.31 0.31 0.54 0.42 0.4 0.67 0.79 0.67 0.9 0.84
1.0 0.74 0.75 0.37 0.57 0.74 0.34 0.32 0.53 0.4 0.37 0.45 0.0 0.09 0.01 0.02 0.53 0.47 0.14 0.05 0.05 0.0 0.17 0.11 0.04 0.18 0.16 0.29 0.41 0.33 0.48 0.35
0.46 0.56 1.0 0.13 0.65 0.63 0.2 0.14 0.3 0.21 0.27 0.43 0.0 0.05 0.06 0.0 0.15 0.21 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.04 0.25 0.16 0.25 0.23 0.23 0.11
0.88 0.55 1.0 0.26 0.51 0.82 0.3 0.31 0.43 0.42 0.36 0.42 0.0 0.05 0.02 0.01 0.19 0.36 0.05 0.01 0.01 0.0 0.06 0.05 0.03 0.21 0.21 0.25 0.25 0.16 0.21 0.15
0.46 0.5 0.52 0.23 0.23 0.48 0.31 0.24 0.32 0.41 0.35 0.51 0.18 0.07 0.09 0.2 0.23 0.98 0.23 0.07 0.26 1.0 0.16 0.2 0.25 0.26 0.26 0.58 0.22 0.28 0.27 0.3
0.57 0.48 0.29 0.14 0.17 0.56 0.23 0.31 0.15 0.37 0.4 0.36 0.03 0.04 0.05 0.01 0.36 0.83 0.12 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.88 0.34 0.85 1.0 0.48 0.3 0.3 0.24
1.0 0.46 0.9 0.19 0.44 0.88 0.35 0.41 0.37 0.4 0.26 0.32 0.0 0.04 0.01 0.03 0.17 0.41 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.13 0.09 0.1 0.1 0.29 0.21 0.21 0.25
0.96 1.0 0.58 0.39 0.22 0.78 0.5 0.42 0.27 0.16 0.76 0.83 0.04 0.29 0.13 0.07 0.18 0.65 0.16 0.12 0.0 0.0 0.19 0.1 0.0 0.17 0.19 0.66 0.41 0.26 0.35 0.36
0.24 0.21 0.03 0.2 0.02 0.15 0.17 0.1 0.18 0.23 0.06 0.28 0.01 0.09 0.04 0.02 0.04 1.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.02 0.04 0.0 0.03 0.03 0.06 0.07 0.03 0.07 0.07
0.21 0.26 0.17 0.04 0.09 0.3 0.09 0.1 0.16 0.13 0.22 0.28 0.04 0.07 0.13 0.06 0.13 1.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.06 0.04 0.0 0.3 0.17 0.33 0.19
0.86 0.55 0.76 0.25 0.42 1.0 0.56 0.42 0.56 0.25 0.5 0.59 0.01 0.15 0.06 0.01 0.33 0.57 0.13 0.15 0.1 0.0 0.09 0.14 0.21 0.22 0.34 0.39 0.36 0.21 0.23 0.09
0.32 0.42 0.24 0.09 0.09 0.49 0.23 0.23 0.29 0.11 0.19 0.24 0.01 0.17 0.05 0.03 0.19 1.0 0.08 0.16 0.09 0.16 0.04 0.03 0.34 0.03 0.09 0.24 0.17 0.19 0.19 0.13
1.0 0.75 0.81 0.24 0.35 0.81 0.53 0.44 0.41 0.67 0.73 0.6 0.0 0.0 0.12 0.11 0.23 0.68 0.2 0.07 0.17 0.0 0.04 0.0 0.0 0.29 0.42 0.32 0.37 0.07 0.46 0.28
0.26 0.22 0.69 0.15 0.15 0.43 0.06 0.13 0.2 0.12 0.14 0.18 0.01 0.01 0.0 0.01 0.18 0.28 0.07 1.0 0.36 0.0 0.08 0.04 0.14 0.09 0.14 0.27 0.14 0.1 0.12 0.09
0.31 0.23 0.34 0.1 0.12 0.29 0.12 0.17 0.18 0.08 0.09 0.23 0.01 0.01 0.04 0.02 0.18 1.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.09 0.06 0.03 0.02 0.07 0.06 0.26 0.14 0.23 0.18
1.0 0.67 0.85 0.28 0.5 0.57 0.31 0.27 0.39 0.29 0.66 0.5 0.01 0.12 0.02 0.03 0.38 0.89 0.16 0.81 0.0 0.0 0.15 0.11 0.0 0.35 0.27 0.24 0.7 0.31 0.73 0.57
1.0 0.54 0.91 0.49 0.19 0.71 0.57 0.27 0.52 0.52 0.66 0.53 0.07 0.13 0.06 0.01 0.22 0.7 0.11 0.0 0.1 0.0 0.06 0.14 0.45 0.42 0.27 0.55 0.29 0.2 0.22 0.14
1.0 0.65 0.93 0.29 0.41 0.75 0.4 0.3 0.6 0.37 0.41 0.41 0.01 0.14 0.1 0.02 0.25 0.4 0.06 0.24 0.0 0.0 0.07 0.07 0.03 0.23 0.17 0.32 0.31 0.16 0.36 0.24
0.8 0.67 0.78 0.33 0.56 1.0 0.42 0.27 0.35 0.45 0.28 0.43 0.0 0.26 0.14 0.03 0.4 0.54 0.08 0.06 0.0 0.0 0.13 0.09 0.17 0.25 0.25 0.26 0.37 0.24 0.33 0.37
0.66 0.31 0.49 0.27 0.25 0.48 0.12 0.12 0.38 0.16 0.22 0.23 0.07 0.26 0.09 0.13 0.24 0.59 0.17 0.32 0.2 1.0 0.13 0.14 0.1 0.1 0.22 0.24 0.41 0.28 0.24 0.22
0.64 0.51 1.0 0.2 0.5 0.57 0.22 0.22 0.47 0.35 0.39 0.32 0.02 0.05 0.05 0.02 0.26 0.68 0.06 0.0 0.89 0.0 0.07 0.06 0.25 0.23 0.21 0.32 0.29 0.18 0.29 0.21
0.26 0.08 0.26 0.06 0.05 0.26 0.2 0.02 0.25 0.22 0.12 0.27 0.09 0.17 0.03 0.03 0.23 0.89 0.11 0.0 0.0 1.0 0.09 0.13 0.2 0.13 0.2 0.07 0.35 0.28 0.33 0.32
0.92 0.45 0.45 0.55 0.39 0.29 0.32 0.32 0.35 0.22 0.29 0.41 0.03 0.18 0.05 0.12 1.0 0.58 0.92 0.03 0.22 0.0 0.73 0.42 0.68 0.59 0.3 0.36 0.61 0.88 0.72 0.42
0.32 0.55 0.58 0.14 1.0 0.31 0.14 0.37 0.06 0.14 0.17 0.27 0.06 0.08 0.03 0.04 0.3 0.19 0.12 0.34 0.0 0.0 0.28 0.16 0.0 0.12 0.14 0.33 0.58 0.45 0.56 0.42
0.89 0.73 1.0 0.74 0.79 0.93 0.54 0.69 0.62 0.69 0.69 0.65 0.07 0.6 0.15 0.13 0.31 0.35 0.4 0.03 0.02 0.0 0.34 0.27 0.06 0.76 0.55 0.9 0.24 0.32 0.31 0.28
0.93 0.6 1.0 0.29 0.55 0.91 0.34 0.26 0.53 0.36 0.37 0.48 0.0 0.05 0.01 0.01 0.33 0.34 0.07 0.57 0.34 0.04 0.08 0.07 0.21 0.15 0.14 0.2 0.39 0.23 0.36 0.3
1.0 0.68 0.72 0.4 0.55 0.79 0.37 0.26 0.61 0.54 0.49 0.61 0.0 0.06 0.02 0.03 0.35 0.5 0.19 0.04 0.02 0.01 0.15 0.13 0.09 0.17 0.15 0.27 0.48 0.3 0.47 0.43
0.65 0.53 0.3 0.19 0.28 0.31 0.42 0.18 0.22 0.22 0.21 0.28 0.03 0.14 0.11 0.06 0.61 0.72 0.22 1.0 0.06 0.0 0.24 0.16 0.34 0.11 0.16 0.48 0.67 0.51 0.69 0.35
0.52 0.4 0.36 0.27 0.17 0.6 0.23 0.37 0.42 0.27 0.59 0.57 0.06 0.2 0.08 0.09 0.29 1.0 0.26 0.0 0.0 0.04 0.23 0.25 0.6 0.08 0.09 0.11 0.39 0.44 0.51 0.3
0.45 0.49 0.55 0.2 0.28 0.3 0.24 0.27 0.27 0.2 0.26 0.4 0.02 0.12 0.02 0.04 0.38 0.35 0.2 0.02 0.02 0.0 0.15 0.16 0.12 0.74 0.41 1.0 0.27 0.25 0.21 0.07
0.94 0.46 0.59 0.45 1.0 0.66 0.45 0.36 0.69 0.84 0.56 0.6 0.03 0.21 0.16 0.14 0.21 0.77 0.22 0.16 0.0 0.0 0.17 0.5 0.87 0.13 0.29 0.2 0.33 0.27 0.37 0.28
0.92 0.42 0.61 0.82 1.0 0.5 0.52 0.36 0.54 0.62 0.61 0.56 0.13 0.2 0.24 0.33 0.1 0.55 0.26 0.04 0.03 0.0 0.2 0.45 0.27 0.13 0.08 0.1 0.32 0.24 0.27 0.27
0.8 0.59 0.59 0.39 0.85 0.74 0.39 0.63 0.9 0.95 0.68 0.34 0.12 0.19 0.23 0.48 0.17 1.0 0.37 0.22 0.17 0.0 0.47 0.76 0.45 0.09 0.18 0.12 0.36 0.52 0.36 0.34
0.26 0.22 0.69 0.15 0.15 0.43 0.06 0.13 0.2 0.12 0.14 0.18 0.01 0.01 0.0 0.01 0.18 0.28 0.07 1.0 0.36 0.0 0.08 0.04 0.14 0.09 0.14 0.27 0.14 0.1 0.12 0.09
1.0 0.65 0.97 0.38 0.51 0.72 0.39 0.4 0.68 0.49 0.4 0.49 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.6 0.03 0.03 0.13 0.01 0.08 0.06 0.06 0.01 0.0 0.01 0.26 0.16 0.28 0.24
0.37 0.25 0.28 0.24 0.23 0.24 0.25 0.23 0.35 0.25 0.19 0.28 0.04 0.09 0.13 0.46 0.1 1.0 0.23 0.0 0.03 0.0 0.26 0.35 0.18 0.09 0.14 0.18 0.2 0.23 0.21 0.12
0.92 0.6 1.0 0.32 0.47 0.78 0.33 0.29 0.48 0.36 0.31 0.41 0.01 0.05 0.01 0.02 0.24 0.46 0.09 0.03 0.04 0.0 0.08 0.08 0.03 0.17 0.22 0.24 0.29 0.21 0.29 0.24
0.3 0.08 0.08 0.09 0.05 0.18 0.0 0.09 0.08 0.14 0.0 0.14 0.01 0.2 0.08 0.0 0.04 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.51 0.24 1.0 0.1 0.07 0.11 0.03
0.89 0.6 1.0 0.35 0.54 0.69 0.41 0.42 0.59 0.44 0.47 0.52 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.32 0.02 0.01 0.03 0.0 0.04 0.04 0.03 0.14 0.1 0.11 0.15 0.11 0.15 0.13
0.7 0.43 0.7 0.25 0.31 0.64 0.21 0.17 0.35 0.24 0.23 0.31 0.01 0.07 0.03 0.03 0.24 0.37 0.07 1.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.05 0.2 0.1 0.16 0.25 0.16 0.24 0.21
0.76 0.91 0.91 0.21 0.65 0.88 0.56 0.44 0.54 0.44 0.43 0.63 0.0 0.09 0.03 0.05 0.68 1.0 0.12 0.09 0.0 0.0 0.3 0.22 0.0 0.15 0.18 0.22 0.4 0.29 0.6 0.49
0.3 0.08 0.08 0.09 0.05 0.18 0.0 0.09 0.08 0.14 0.0 0.14 0.01 0.2 0.08 0.0 0.04 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.51 0.24 1.0 0.1 0.07 0.11 0.03
0.3 0.08 0.08 0.09 0.05 0.18 0.0 0.09 0.08 0.14 0.0 0.14 0.01 0.2 0.08 0.0 0.04 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.51 0.24 1.0 0.1 0.07 0.11 0.03
0.73 0.59 0.64 0.42 0.15 0.33 0.25 0.31 0.46 0.42 0.49 0.4 0.02 0.05 0.04 0.06 0.18 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.08 0.2 0.21 0.0 0.38 0.41 0.29 0.11
0.83 0.6 1.0 0.45 0.45 0.55 0.29 0.35 0.39 0.3 0.26 0.27 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.08 0.03 0.09 0.14
0.76 0.13 1.0 0.67 0.3 0.15 0.0 0.0 0.28 0.34 0.41 0.26 0.14 0.0 0.0 0.0 0.55 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.56 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.13 0.53 0.13
0.01 0.03 0.0 0.02 0.12 0.03 0.03 0.0 0.09 0.0 0.08 0.05 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.72 0.23 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.26 0.0 0.02 0.0 0.0
0.88 0.77 0.49 0.48 0.54 0.29 0.32 0.31 0.57 0.4 0.65 0.42 0.0 0.33 0.02 0.09 0.64 0.46 0.58 0.65 0.17 0.0 0.06 0.07 0.28 0.53 0.14 0.29 0.69 1.0 0.66 0.77
0.91 0.57 0.72 0.56 0.82 0.74 0.47 0.91 1.0 0.6 0.56 0.65 0.03 0.02 0.03 0.11 0.01 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.2 0.13 0.25 0.35 0.07 0.26 0.07 0.03 0.04 0.0
1.0 0.47 0.73 0.59 0.59 0.43 0.37 0.68 0.37 0.79 0.57 0.79 0.33 0.19 0.12 0.15 0.15 0.56 0.25 0.0 0.1 0.0 0.23 0.28 0.4 0.06 0.09 0.15 0.24 0.25 0.19 0.11
0.28 0.21 0.29 0.35 0.25 0.06 0.15 0.16 0.29 0.33 0.4 0.43 0.04 0.04 0.06 0.08 0.08 0.02 0.05 1.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.13 0.03 0.03 0.02 0.04
0.47 0.33 0.58 0.69 0.91 0.56 0.8 0.37 0.99 0.55 0.89 0.49 0.23 0.23 0.07 0.08 0.53 0.49 0.52 0.46 0.13 0.19 0.74 0.8 0.54 0.15 0.07 0.0 0.68 0.49 1.0 0.4
0.27 0.39 0.36 0.33 0.25 0.5 0.39 0.54 0.43 0.49 0.42 0.43 0.1 0.13 0.35 0.37 0.31 0.77 0.35 0.09 0.13 1.0 0.27 0.27 0.44 0.28 0.42 0.39 0.22 0.25 0.24 0.19
0.83 0.65 0.38 0.78 0.72 0.68 0.38 0.86 0.75 0.66 0.87 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.09 0.01 0.2 0.01 0.0 0.01 0.0
0.91 0.55 0.58 0.38 1.0 0.78 0.64 0.57 0.89 0.57 0.7 0.9 0.0 0.24 0.06 0.0 0.39 0.96 0.2 0.39 0.39 0.0 0.11 0.25 0.53 0.05 0.19 0.12 0.65 0.33 0.37 0.45
0.91 0.55 0.58 0.38 1.0 0.78 0.64 0.57 0.89 0.57 0.7 0.9 0.0 0.24 0.06 0.0 0.39 0.96 0.2 0.39 0.39 0.0 0.11 0.25 0.53 0.05 0.19 0.12 0.65 0.33 0.37 0.45
1.0 0.98 0.26 0.18 0.19 0.59 0.4 0.12 0.24 0.89 0.43 0.89 0.02 0.11 0.05 0.0 0.27 0.5 0.18 0.0 0.0 0.0 0.14 0.09 0.1 0.29 0.12 0.44 0.57 0.3 0.67 0.47
0.33 0.23 0.44 0.14 0.54 0.54 0.02 0.06 0.16 0.12 0.23 0.26 0.0 0.0 0.0 0.03 0.26 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 0.44 0.31 0.35 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)