Heatmap: Cluster_150 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.51 0.58 0.56 0.63 0.62 0.64 0.53 0.51 0.51 0.45 0.47 0.49 0.12 0.24 0.26 0.16 0.64 0.37 0.31 0.16 0.63 0.17 0.3 0.24 0.92 0.35 0.82 1.0 0.46 0.46 0.29 0.27
0.44 0.43 0.47 0.52 0.58 0.62 0.5 0.51 0.52 0.5 0.5 0.52 0.42 0.17 0.09 0.37 0.62 0.48 0.4 0.02 0.22 0.01 0.53 0.44 1.0 0.6 0.79 0.84 0.63 0.61 0.37 0.34
0.2 0.24 0.34 0.39 0.46 0.29 0.28 0.27 0.3 0.21 0.21 0.2 0.4 0.26 0.3 0.6 0.48 0.41 0.64 0.01 0.45 0.11 0.52 0.51 1.0 0.57 0.5 0.52 0.51 0.51 0.16 0.21
0.57 0.49 0.46 0.55 0.64 0.89 0.86 0.87 0.64 0.68 0.49 0.54 0.52 0.44 0.41 0.72 0.66 0.79 0.95 0.68 1.0 0.31 0.68 0.56 0.66 0.54 0.78 0.82 0.9 0.87 0.73 0.6
0.66 0.71 0.68 0.72 0.7 0.81 0.72 0.69 0.68 0.57 0.65 0.59 0.44 0.28 0.36 0.46 0.7 0.62 0.6 0.39 0.65 0.62 0.65 0.58 0.99 0.48 0.97 1.0 0.62 0.65 0.5 0.49
0.14 0.21 0.42 0.68 0.79 0.78 0.71 0.51 0.56 0.39 0.3 0.18 0.67 0.32 0.03 0.9 0.95 0.37 0.84 0.28 0.63 0.0 1.0 0.82 0.77 0.38 0.74 0.82 0.83 1.0 0.37 0.45
0.22 0.21 0.28 0.19 0.48 0.54 0.77 0.69 0.63 0.58 0.53 0.26 0.07 0.08 0.25 0.21 0.63 0.63 0.45 0.35 1.0 0.01 0.5 0.43 0.34 0.27 0.57 0.53 0.62 0.62 0.74 0.59
0.51 0.5 0.54 0.5 0.71 0.51 0.46 0.47 0.43 0.36 0.39 0.42 0.1 0.12 0.24 0.15 0.53 0.52 0.26 0.29 0.48 0.34 0.44 0.42 1.0 0.22 0.63 0.74 0.41 0.47 0.26 0.22
0.22 0.24 0.24 0.37 0.46 0.51 0.55 0.42 0.38 0.28 0.23 0.23 0.0 0.07 0.02 0.02 0.62 0.68 0.24 0.1 0.35 0.02 0.33 0.17 0.87 0.19 1.0 0.97 0.46 0.46 0.34 0.29
0.35 0.36 0.36 0.39 0.38 0.43 0.39 0.42 0.39 0.33 0.34 0.33 0.17 0.24 0.2 0.22 0.47 0.39 0.4 0.07 0.47 0.05 0.26 0.23 1.0 0.36 0.57 0.57 0.39 0.38 0.32 0.32
0.4 0.43 0.55 0.63 0.63 0.63 0.8 0.81 0.77 0.71 0.69 0.55 0.07 0.11 0.09 0.19 0.8 0.56 0.55 0.09 0.31 0.16 0.54 0.42 0.22 1.0 0.86 0.98 0.75 0.71 0.59 0.54
0.46 0.49 0.45 0.55 0.62 0.64 0.73 0.69 0.74 0.58 0.53 0.51 0.09 0.11 0.13 0.18 0.71 0.65 0.29 0.27 0.68 0.34 0.41 0.3 1.0 0.33 0.63 0.6 0.62 0.59 0.57 0.43
0.5 0.61 0.61 0.62 0.64 0.6 0.59 0.52 0.46 0.37 0.38 0.45 0.16 0.3 0.08 0.24 0.47 0.43 0.44 0.18 0.3 0.07 0.22 0.16 0.66 0.32 0.95 1.0 0.53 0.5 0.75 0.58
0.46 0.46 0.54 0.52 0.57 0.58 0.67 0.68 0.65 0.57 0.55 0.51 0.32 0.38 0.21 0.41 0.56 0.56 0.52 0.3 0.87 0.23 0.34 0.29 1.0 0.57 0.91 0.83 0.58 0.61 0.58 0.6
0.22 0.31 0.32 0.45 0.48 0.56 0.38 0.3 0.26 0.22 0.2 0.19 0.15 0.21 0.21 0.42 0.36 0.23 0.75 0.04 0.29 0.02 0.39 0.46 1.0 0.21 0.52 0.63 0.36 0.39 0.38 0.25
0.11 0.18 0.28 0.38 0.41 0.85 0.61 0.55 0.48 0.31 0.3 0.15 0.43 0.29 0.12 0.52 1.0 0.41 0.64 0.03 0.1 0.01 0.78 0.66 0.3 0.59 0.43 0.59 0.8 0.7 0.44 0.38
0.18 0.23 0.29 0.34 0.4 0.4 0.45 0.55 0.42 0.36 0.31 0.21 0.07 0.05 0.1 0.14 0.59 0.79 0.29 0.0 0.33 0.07 0.33 0.21 0.23 0.37 0.9 1.0 0.59 0.55 0.25 0.2
0.16 0.18 0.26 0.32 0.34 0.38 0.43 0.39 0.33 0.27 0.26 0.19 0.16 0.16 0.21 0.18 0.49 0.3 0.29 0.05 0.2 0.06 0.3 0.25 1.0 0.25 0.58 0.72 0.56 0.63 0.21 0.19
0.18 0.2 0.16 0.28 0.29 0.32 0.33 0.29 0.3 0.24 0.22 0.23 0.05 0.06 0.03 0.08 0.44 0.4 0.19 0.19 0.3 0.01 0.33 0.22 1.0 0.52 0.54 0.65 0.39 0.37 0.31 0.22
0.68 0.81 0.79 0.66 0.79 0.74 0.69 0.69 0.65 0.62 0.63 0.57 0.41 0.55 0.63 0.46 0.72 0.59 0.76 0.3 0.48 0.35 0.5 0.53 0.72 0.63 1.0 0.97 0.64 0.69 0.6 0.66
0.48 0.43 0.49 0.54 0.65 0.75 0.92 1.0 0.96 0.75 0.7 0.55 0.17 0.14 0.32 0.21 0.7 0.73 0.61 0.06 0.25 0.55 0.5 0.46 0.19 0.59 0.89 0.96 0.91 0.97 0.44 0.44
0.51 0.58 0.59 0.64 0.63 0.59 0.71 0.66 0.76 0.63 0.67 0.69 0.63 0.3 0.19 1.0 0.74 0.6 0.59 0.24 0.08 0.03 0.58 0.73 0.51 0.45 0.59 0.79 0.75 0.75 0.49 0.28
0.38 0.45 0.57 0.68 0.83 0.8 0.67 0.66 0.53 0.47 0.49 0.42 0.21 0.2 0.19 0.37 1.0 0.57 0.84 0.15 0.44 0.22 0.74 0.59 0.96 0.45 0.82 0.78 0.91 0.94 0.56 0.54
0.35 0.49 0.48 0.46 0.6 0.63 0.63 0.42 0.41 0.3 0.26 0.26 0.58 0.55 0.15 0.46 0.75 0.8 0.59 0.17 0.79 0.19 0.55 0.63 1.0 0.28 0.83 0.89 0.55 0.56 0.64 0.69
0.12 0.12 0.12 0.07 0.01 0.34 0.26 0.27 0.14 0.14 0.2 0.17 0.04 0.05 0.34 0.0 0.3 0.24 0.39 0.06 0.0 0.0 0.2 0.16 1.0 0.08 0.29 0.36 0.29 0.29 0.27 0.22
0.45 0.41 0.53 0.53 0.6 0.66 0.75 0.78 0.61 0.61 0.58 0.52 0.27 0.21 0.16 0.28 0.62 0.53 0.54 0.11 0.39 0.1 0.43 0.37 0.59 0.72 0.98 1.0 0.69 0.69 0.59 0.55
0.22 0.3 0.22 0.32 0.33 0.42 0.42 0.29 0.25 0.27 0.22 0.23 0.2 0.16 0.27 0.26 0.43 0.22 0.77 0.05 0.28 0.06 0.5 0.48 1.0 0.31 0.28 0.41 0.5 0.49 0.14 0.07
0.12 0.15 0.03 0.13 0.17 0.14 0.14 0.23 0.14 0.21 0.2 0.24 0.2 0.07 0.17 0.2 0.24 0.02 0.43 0.18 0.1 0.13 0.28 0.31 1.0 0.29 0.2 0.27 0.19 0.3 0.2 0.17
0.13 0.29 0.18 0.29 0.22 0.28 0.29 0.3 0.11 0.15 0.2 0.16 0.07 0.05 0.11 0.14 0.33 0.15 0.46 0.0 0.16 0.08 0.4 0.37 1.0 0.4 0.42 0.38 0.27 0.3 0.04 0.04
0.37 0.25 0.14 0.19 0.2 0.23 0.34 0.35 0.34 0.45 0.28 0.31 0.11 0.14 0.1 0.13 0.3 0.61 0.46 0.05 0.11 0.04 0.43 0.49 0.16 0.73 1.0 0.83 0.52 0.47 0.36 0.42
0.35 0.36 0.37 0.48 0.54 0.61 0.61 0.59 0.58 0.46 0.42 0.37 0.09 0.24 0.34 0.16 0.51 0.38 0.36 0.13 0.4 0.09 0.27 0.23 1.0 0.41 0.83 0.97 0.46 0.46 0.36 0.26
0.12 0.11 0.1 0.1 0.08 0.13 0.12 0.16 0.09 0.09 0.12 0.11 0.01 0.02 0.01 0.02 0.6 0.59 0.29 0.13 0.34 0.02 0.35 0.19 0.33 0.54 0.97 1.0 0.57 0.51 0.32 0.24
0.07 0.16 0.04 0.06 0.0 0.18 0.27 0.51 0.54 0.25 0.49 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.11 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 1.0 0.47 0.41 0.34 0.79 0.64 0.05 0.02
0.15 0.11 0.15 0.31 0.22 0.33 0.36 0.29 0.3 0.21 0.17 0.14 0.34 0.26 0.18 0.37 0.72 0.43 0.58 0.0 0.02 0.01 0.55 0.54 0.12 0.39 0.81 1.0 0.69 0.78 0.63 0.35
0.43 0.46 0.47 0.53 0.43 0.53 0.52 0.68 0.63 0.65 0.55 0.54 0.26 0.17 0.18 0.23 0.65 0.45 0.41 0.1 0.33 0.21 0.61 0.46 0.47 1.0 0.57 0.7 0.61 0.6 0.46 0.39
0.15 0.07 0.05 0.12 0.11 0.22 0.22 0.45 0.12 0.18 0.27 0.12 0.03 0.02 0.13 0.04 0.2 0.24 0.12 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 0.07 0.16 0.82 1.0 0.18 0.19 0.17 0.07
0.23 0.27 0.25 0.36 0.37 0.43 0.48 0.36 0.33 0.27 0.27 0.24 0.02 0.06 0.06 0.06 0.32 0.34 0.12 0.04 0.34 0.03 0.15 0.11 1.0 0.2 0.58 0.7 0.29 0.28 0.22 0.15
0.22 0.21 0.22 0.23 0.27 0.33 0.32 0.38 0.27 0.19 0.17 0.16 0.12 0.06 0.14 0.18 0.49 0.45 0.39 0.14 0.13 0.04 0.36 0.49 0.65 0.3 0.93 1.0 0.4 0.54 0.25 0.25
0.07 0.08 0.1 0.06 0.05 0.09 0.12 0.09 0.15 0.1 0.07 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.31 0.29 0.0 0.0 0.0 0.18 0.06 1.0 0.08 0.04 0.07 0.21 0.27 0.33 0.26
0.17 0.02 0.04 0.06 0.11 0.29 0.42 0.46 0.56 0.23 0.2 0.13 0.22 0.16 0.43 0.29 0.3 0.67 0.54 0.07 0.11 0.03 0.39 0.29 0.34 0.48 0.9 1.0 0.62 0.69 0.26 0.22
0.66 0.64 0.57 0.53 0.57 0.6 0.71 0.62 0.51 0.41 0.44 0.46 0.21 0.26 0.25 0.3 0.61 0.47 0.47 0.15 0.28 0.09 0.36 0.3 1.0 0.33 0.9 0.99 0.52 0.54 0.51 0.34
0.24 0.25 0.27 0.26 0.26 0.31 0.34 0.29 0.36 0.31 0.27 0.25 0.23 0.11 0.11 0.28 0.49 0.43 0.44 0.04 0.24 0.01 0.43 0.34 1.0 0.4 0.31 0.4 0.48 0.5 0.42 0.29
0.24 0.12 0.22 0.5 0.71 0.82 0.81 0.96 0.75 0.77 0.73 0.44 0.75 0.26 0.11 0.62 0.23 0.67 0.31 0.13 0.62 0.1 0.76 1.0 0.29 0.32 0.31 0.31 0.71 0.7 0.35 0.46
0.32 0.3 0.28 0.3 0.35 0.45 0.5 0.54 0.57 0.42 0.38 0.33 0.03 0.08 0.11 0.11 0.52 0.37 0.32 0.17 0.11 0.07 0.28 0.2 0.42 0.46 0.87 1.0 0.52 0.52 0.35 0.25
0.04 0.02 0.03 0.04 0.11 0.27 0.18 0.5 0.26 0.26 0.17 0.17 0.02 0.04 0.06 0.02 0.13 0.32 0.13 0.01 0.0 0.0 0.15 0.11 0.31 0.11 0.86 1.0 0.25 0.39 0.13 0.06
0.41 0.32 0.32 0.34 0.45 0.37 0.33 0.37 0.4 0.3 0.39 0.31 0.11 0.05 0.06 0.19 0.48 0.5 0.39 0.02 0.17 0.34 0.61 0.43 0.5 0.66 1.0 0.93 0.39 0.44 0.31 0.4
0.49 0.52 0.57 0.67 0.65 0.68 0.72 0.72 0.71 0.6 0.57 0.54 0.6 0.31 0.29 0.65 0.83 0.67 0.53 0.3 0.55 0.23 0.49 0.41 1.0 0.52 0.56 0.63 0.85 0.84 0.47 0.3
0.55 0.75 0.64 0.61 0.65 0.81 0.82 0.72 0.49 0.58 0.47 0.45 0.25 0.21 0.16 0.32 0.48 0.57 0.59 0.36 0.42 0.53 0.46 0.38 0.86 0.46 1.0 0.99 0.51 0.5 0.48 0.47
0.36 0.4 0.44 0.42 0.49 0.65 0.6 0.58 0.61 0.46 0.37 0.34 0.29 0.25 0.37 0.48 0.58 0.49 0.46 0.43 0.39 0.24 0.37 0.36 1.0 0.26 0.79 0.84 0.54 0.6 0.31 0.24
0.4 0.3 0.39 0.47 0.43 0.44 0.59 0.68 0.77 0.84 0.76 0.68 0.04 0.06 0.03 0.07 0.84 0.48 0.37 0.02 0.44 0.0 0.63 0.48 0.35 0.79 0.87 1.0 0.99 0.98 0.5 0.35
0.11 0.14 0.24 0.31 0.4 0.56 0.37 0.29 0.17 0.13 0.08 0.09 0.09 0.16 0.02 0.17 0.56 0.62 0.33 0.05 0.58 0.05 0.36 0.24 1.0 0.17 0.85 0.96 0.38 0.36 0.44 0.41
0.34 0.31 0.37 0.41 0.46 0.54 0.53 0.51 0.49 0.47 0.43 0.38 0.03 0.05 0.03 0.05 0.51 0.45 0.22 0.1 0.61 0.1 0.24 0.17 1.0 0.33 0.81 0.77 0.4 0.38 0.38 0.43
0.73 0.63 0.66 0.74 0.83 0.83 0.84 1.0 0.94 0.85 0.85 0.85 0.37 0.45 0.25 0.43 0.93 0.62 0.56 0.24 0.52 0.14 0.81 0.87 0.85 0.96 0.99 0.98 0.9 0.92 0.92 0.86
0.44 0.39 0.42 0.4 0.5 0.55 0.46 0.47 0.44 0.38 0.44 0.38 0.32 0.35 0.47 0.37 0.82 1.0 0.56 0.28 0.61 0.21 0.5 0.46 0.9 0.56 0.86 0.79 0.65 0.66 0.68 0.67
0.31 0.27 0.29 0.39 0.39 0.38 0.38 0.36 0.39 0.33 0.33 0.38 0.02 0.06 0.01 0.05 0.58 0.36 0.13 0.02 0.42 0.0 0.21 0.14 1.0 0.19 0.53 0.54 0.52 0.48 0.31 0.23
0.34 0.32 0.41 0.54 0.64 0.67 0.66 0.61 0.66 0.52 0.48 0.46 0.06 0.2 0.17 0.12 0.54 0.31 0.23 0.18 0.29 0.15 0.33 0.25 1.0 0.19 0.94 0.85 0.48 0.48 0.41 0.56
0.34 0.32 0.29 0.38 0.38 0.36 0.43 0.49 0.59 0.46 0.45 0.45 0.03 0.17 0.08 0.11 0.65 0.53 0.37 0.08 0.64 0.01 0.36 0.29 1.0 0.44 0.73 0.82 0.57 0.58 0.51 0.39
0.67 0.69 0.75 0.76 0.8 0.71 0.74 0.53 0.63 0.54 0.63 0.6 0.14 0.15 0.1 0.21 0.78 0.62 0.35 0.19 0.52 0.13 0.44 0.29 1.0 0.41 0.83 0.79 0.63 0.58 0.39 0.37
0.04 0.03 0.07 0.33 0.59 0.69 0.81 0.65 0.43 0.35 0.2 0.11 0.08 0.07 0.02 0.07 0.4 0.34 0.25 0.13 1.0 0.05 0.88 0.53 0.32 0.31 0.47 0.36 0.48 0.41 0.32 0.5
0.07 0.06 0.05 0.06 0.12 0.12 0.13 0.07 0.06 0.06 0.04 0.07 0.12 0.01 0.01 0.2 0.17 0.11 0.69 0.0 0.2 0.0 0.23 0.26 1.0 0.15 0.21 0.28 0.28 0.35 0.05 0.05
0.55 0.59 0.69 0.7 0.68 0.69 0.68 0.63 0.67 0.63 0.62 0.61 0.45 0.34 0.46 0.45 0.79 0.69 0.54 0.43 0.59 0.29 0.56 0.53 1.0 0.69 0.92 0.99 0.7 0.7 0.54 0.48
0.36 0.32 0.41 0.45 0.57 0.71 0.93 1.0 0.92 0.72 0.66 0.51 0.14 0.1 0.01 0.14 0.9 0.65 0.39 0.09 0.83 0.1 0.71 0.4 0.68 0.79 0.9 0.86 0.92 0.83 0.7 0.64
0.28 0.24 0.32 0.41 0.42 0.45 0.41 0.48 0.46 0.36 0.32 0.26 0.44 0.37 0.22 0.41 0.58 0.48 0.54 0.17 0.45 0.02 0.59 0.5 0.5 0.67 1.0 0.93 0.67 0.71 0.47 0.41
0.57 0.61 0.7 0.72 0.76 0.76 0.71 0.66 0.61 0.55 0.56 0.54 0.1 0.2 0.23 0.18 0.68 0.51 0.49 0.21 0.71 0.24 0.36 0.3 1.0 0.49 0.88 0.96 0.58 0.63 0.45 0.39
0.43 0.38 0.37 0.41 0.45 0.46 0.52 0.49 0.54 0.46 0.51 0.45 0.08 0.13 0.2 0.12 0.52 0.37 0.32 0.11 0.72 0.07 0.4 0.33 1.0 0.31 0.6 0.71 0.53 0.57 0.37 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)