1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_103 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.26 0.13 0.14 0.12 0.46 0.51 0.56 0.7 0.64 0.59 0.51 0.37 0.08 0.05 0.2 0.13 0.2 0.17 0.24 0.11 0.03 0.21 0.24 0.23 1.0 0.43 0.64 0.76 0.39 0.48 0.24 0.16
0.04 0.06 0.11 0.18 0.3 0.37 0.4 0.36 0.24 0.14 0.08 0.05 0.06 0.06 0.32 0.07 0.16 0.14 0.12 0.3 0.33 0.22 0.17 0.14 1.0 0.17 0.38 0.35 0.11 0.12 0.09 0.11
0.42 0.4 0.61 0.53 0.7 0.65 0.78 0.84 0.77 0.72 0.58 0.48 0.22 0.23 0.31 0.29 0.44 0.42 0.28 0.29 0.48 0.42 0.38 0.32 0.97 0.42 0.87 1.0 0.46 0.44 0.19 0.17
0.34 0.36 0.4 0.43 0.45 0.47 0.47 0.59 0.5 0.43 0.36 0.37 0.24 0.17 0.32 0.4 0.32 0.28 0.39 0.18 0.21 0.13 0.35 0.34 1.0 0.53 0.63 0.71 0.37 0.35 0.18 0.11
0.01 0.05 0.11 0.28 0.47 0.54 0.37 0.17 0.06 0.03 0.02 0.01 0.05 0.07 0.08 0.09 0.27 0.22 0.14 0.05 0.17 0.03 0.4 0.22 1.0 0.08 0.38 0.42 0.08 0.09 0.04 0.07
0.06 0.13 0.21 0.3 0.42 0.43 0.41 0.34 0.2 0.13 0.09 0.07 0.06 0.06 0.23 0.07 0.22 0.15 0.12 0.37 0.31 0.36 0.2 0.16 1.0 0.17 0.53 0.49 0.1 0.11 0.1 0.14
0.04 0.07 0.15 0.25 0.42 0.51 0.5 0.41 0.2 0.12 0.07 0.05 0.05 0.05 0.06 0.07 0.32 0.26 0.16 0.12 0.45 0.13 0.23 0.18 1.0 0.12 0.42 0.42 0.19 0.18 0.13 0.12
0.34 0.36 0.25 0.33 0.25 0.35 0.35 0.4 0.37 0.46 0.39 0.43 0.17 0.13 0.18 0.19 0.29 0.28 0.24 0.19 0.22 0.23 0.23 0.18 1.0 0.52 0.91 0.9 0.28 0.27 0.22 0.21
0.27 0.4 0.45 0.46 0.47 0.45 0.46 0.34 0.33 0.36 0.33 0.3 0.33 0.1 0.16 0.23 0.33 0.21 0.32 0.14 0.16 0.04 0.36 0.31 1.0 0.24 0.39 0.43 0.31 0.3 0.15 0.14
0.24 0.32 0.39 0.41 0.52 0.66 0.59 0.6 0.4 0.37 0.3 0.27 0.28 0.18 0.19 0.3 0.49 0.3 0.31 0.33 0.77 0.43 0.36 0.3 1.0 0.55 0.67 0.78 0.39 0.37 0.41 0.39
0.37 0.43 0.38 0.55 0.6 0.65 0.7 0.7 0.61 0.49 0.44 0.42 0.13 0.26 0.44 0.21 0.46 0.28 0.34 0.32 0.27 0.5 0.29 0.28 0.77 0.29 0.93 1.0 0.44 0.51 0.28 0.18
0.26 0.35 0.34 0.4 0.45 0.51 0.37 0.45 0.29 0.27 0.24 0.25 0.25 0.25 0.31 0.35 0.27 0.21 0.44 0.32 0.11 0.06 0.28 0.3 1.0 0.47 0.59 0.61 0.25 0.25 0.23 0.21
0.21 0.29 0.28 0.32 0.36 0.32 0.25 0.25 0.2 0.16 0.15 0.15 0.08 0.05 0.03 0.12 0.32 0.21 0.22 0.05 0.22 0.03 0.29 0.26 1.0 0.33 0.57 0.59 0.21 0.21 0.14 0.13
0.08 0.24 0.35 0.41 0.39 0.36 0.33 0.27 0.17 0.13 0.1 0.09 0.04 0.07 0.1 0.06 0.23 0.07 0.27 0.21 0.36 0.05 0.2 0.15 1.0 0.15 0.16 0.14 0.22 0.2 0.11 0.11
0.14 0.16 0.2 0.32 0.38 0.46 0.44 0.44 0.33 0.25 0.18 0.16 0.04 0.06 0.07 0.05 0.16 0.15 0.08 0.06 0.43 0.16 0.12 0.09 1.0 0.15 0.45 0.38 0.14 0.14 0.15 0.21
0.13 0.27 0.32 0.3 0.31 0.21 0.21 0.25 0.21 0.24 0.16 0.14 0.1 0.07 0.0 0.1 0.1 0.04 0.12 0.04 0.11 0.0 0.09 0.07 1.0 0.46 0.51 0.38 0.13 0.12 0.08 0.04
0.19 0.31 0.36 0.42 0.55 0.57 0.43 0.42 0.31 0.28 0.22 0.2 0.21 0.14 0.26 0.21 0.29 0.17 0.28 0.22 0.36 0.54 0.27 0.29 1.0 0.29 0.7 0.79 0.28 0.29 0.15 0.16
0.16 0.18 0.29 0.38 0.49 0.46 0.31 0.35 0.23 0.2 0.18 0.14 0.19 0.1 0.05 0.2 0.24 0.25 0.22 0.1 0.34 0.06 0.21 0.16 1.0 0.43 0.53 0.58 0.2 0.18 0.21 0.2
0.12 0.14 0.19 0.33 0.57 0.69 0.57 0.37 0.26 0.16 0.14 0.11 0.08 0.11 0.33 0.1 0.29 0.17 0.15 0.47 0.53 0.6 0.18 0.13 1.0 0.2 0.57 0.47 0.13 0.12 0.1 0.09
0.38 0.37 0.39 0.35 0.38 0.43 0.37 0.36 0.32 0.31 0.28 0.28 0.2 0.24 0.32 0.22 0.43 0.44 0.33 0.04 0.13 0.08 0.25 0.24 1.0 0.3 0.7 0.68 0.31 0.3 0.36 0.44
0.15 0.22 0.36 0.52 0.68 0.82 0.72 0.63 0.41 0.27 0.21 0.16 0.11 0.1 0.12 0.14 0.62 0.41 0.3 0.14 0.38 0.27 0.42 0.33 1.0 0.14 0.52 0.49 0.34 0.32 0.33 0.34
0.26 0.32 0.38 0.54 0.6 0.7 0.63 0.59 0.46 0.31 0.28 0.25 0.06 0.13 0.11 0.09 0.33 0.2 0.24 0.17 0.57 0.11 0.26 0.2 1.0 0.16 0.52 0.6 0.3 0.3 0.22 0.21
0.16 0.23 0.34 0.25 0.3 0.23 0.34 0.31 0.36 0.24 0.15 0.19 0.05 0.03 0.26 0.06 0.3 0.08 0.3 0.2 0.04 0.21 0.23 0.12 1.0 0.22 0.29 0.38 0.32 0.4 0.17 0.09
0.01 0.01 0.0 0.04 0.25 0.55 0.29 0.1 0.06 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.13 0.07 0.1 0.16 0.45 0.05 0.14 0.08 0.97 0.04 0.96 1.0 0.02 0.03 0.01 0.01
0.11 0.13 0.1 0.15 0.18 0.22 0.26 0.28 0.23 0.22 0.15 0.13 0.01 0.01 0.02 0.04 0.19 0.03 0.26 0.06 0.05 0.04 0.29 0.25 1.0 0.14 0.37 0.33 0.22 0.22 0.21 0.24
0.28 0.19 0.18 0.19 0.49 0.29 0.52 0.65 0.61 0.47 0.63 0.4 0.02 0.04 0.13 0.04 0.19 0.27 0.16 0.02 0.14 0.19 0.14 0.11 0.96 0.56 1.0 0.81 0.25 0.28 0.34 0.27
0.11 0.15 0.21 0.37 0.53 0.52 0.25 0.17 0.1 0.08 0.08 0.07 0.0 0.03 0.01 0.02 0.24 0.12 0.3 0.03 0.25 0.0 0.37 0.23 0.93 0.37 1.0 0.85 0.16 0.16 0.12 0.1
0.07 0.12 0.2 0.33 0.52 0.83 0.65 0.41 0.16 0.14 0.12 0.08 0.14 0.15 0.48 0.25 0.24 0.05 0.22 0.51 0.71 0.99 0.19 0.13 1.0 0.29 0.67 0.67 0.12 0.11 0.15 0.1
0.04 0.13 0.19 0.35 0.54 0.55 0.38 0.24 0.18 0.1 0.08 0.04 0.15 0.32 0.03 0.19 0.22 0.17 0.2 0.04 0.31 0.0 0.54 0.44 1.0 0.12 0.77 0.82 0.14 0.18 0.09 0.13
0.24 0.27 0.22 0.31 0.36 0.33 0.36 0.51 0.38 0.32 0.31 0.33 0.03 0.09 0.1 0.05 0.26 0.21 0.17 0.04 0.17 0.13 0.17 0.12 1.0 0.16 0.51 0.47 0.24 0.27 0.22 0.19
0.19 0.26 0.24 0.25 0.45 0.37 0.29 0.25 0.21 0.15 0.18 0.12 0.05 0.04 0.03 0.05 0.1 0.12 0.08 0.07 0.18 0.03 0.12 0.11 1.0 0.2 0.37 0.63 0.1 0.1 0.07 0.06
0.21 0.09 0.12 0.12 0.22 0.29 0.18 0.16 0.18 0.32 0.26 0.22 0.15 0.06 0.11 0.16 0.2 0.21 0.28 0.0 0.13 0.1 0.21 0.24 1.0 0.49 0.42 0.47 0.27 0.26 0.14 0.1
0.34 0.27 0.23 0.23 0.31 0.36 0.34 0.43 0.37 0.39 0.3 0.33 0.14 0.12 0.22 0.19 0.18 0.14 0.31 0.03 0.21 0.23 0.21 0.18 1.0 0.32 0.49 0.37 0.25 0.25 0.21 0.22
0.48 0.6 0.61 0.64 0.68 0.75 0.62 0.62 0.55 0.5 0.46 0.42 0.14 0.07 0.49 0.13 0.57 0.37 0.43 0.33 0.31 0.34 0.36 0.25 0.62 0.56 0.89 1.0 0.44 0.45 0.29 0.3
0.24 0.34 0.41 0.44 0.58 0.63 0.48 0.45 0.36 0.27 0.22 0.26 0.03 0.03 0.02 0.08 0.18 0.09 0.12 0.39 0.45 0.16 0.18 0.18 1.0 0.29 0.52 0.54 0.15 0.17 0.13 0.14
0.06 0.13 0.11 0.12 0.06 0.07 0.17 0.17 0.18 0.19 0.14 0.15 0.05 0.01 0.0 0.03 0.11 0.05 0.12 0.06 0.13 0.0 0.12 0.12 1.0 0.11 0.16 0.2 0.23 0.14 0.12 0.06
0.39 0.45 0.55 0.51 0.68 0.65 0.66 0.67 0.61 0.47 0.49 0.42 0.17 0.21 0.26 0.29 0.48 0.29 0.35 0.21 0.3 0.2 0.34 0.28 1.0 0.47 0.76 0.81 0.43 0.43 0.29 0.18
0.17 0.25 0.32 0.27 0.28 0.28 0.33 0.29 0.34 0.31 0.24 0.24 0.07 0.15 0.14 0.17 0.37 0.03 0.22 0.1 0.2 0.3 0.25 0.17 1.0 0.38 0.34 0.5 0.22 0.22 0.1 0.07
0.01 0.01 0.01 0.04 0.24 0.54 0.44 0.21 0.07 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.18 0.11 0.17 0.38 0.01 0.16 0.08 1.0 0.01 0.31 0.26 0.09 0.11 0.06 0.04
0.14 0.21 0.25 0.38 0.46 0.47 0.39 0.33 0.26 0.19 0.15 0.12 0.14 0.12 0.08 0.14 0.2 0.12 0.2 0.21 0.35 0.09 0.19 0.15 1.0 0.37 0.45 0.46 0.16 0.16 0.15 0.16
0.37 0.44 0.43 0.45 0.48 0.47 0.31 0.3 0.29 0.27 0.25 0.27 0.22 0.26 0.11 0.21 0.24 0.24 0.3 0.14 0.28 0.17 0.25 0.21 1.0 0.45 0.7 0.59 0.17 0.18 0.19 0.24
0.1 0.16 0.25 0.34 0.4 0.4 0.36 0.32 0.25 0.21 0.18 0.17 0.0 0.01 0.0 0.02 0.21 0.08 0.1 0.12 0.58 0.02 0.15 0.09 1.0 0.2 0.19 0.23 0.16 0.15 0.12 0.11
0.55 0.47 0.59 0.59 0.7 0.76 0.63 0.64 0.57 0.5 0.45 0.39 0.18 0.31 0.6 0.24 0.62 0.51 0.47 0.32 0.38 0.52 0.42 0.42 0.97 0.5 1.0 1.0 0.47 0.52 0.52 0.44
0.49 0.18 0.18 0.33 0.12 0.28 0.36 0.52 0.3 0.5 0.35 0.35 0.01 0.0 0.01 0.03 0.11 0.29 0.06 0.06 0.04 0.04 0.05 0.04 1.0 0.22 0.44 0.36 0.11 0.16 0.13 0.1
0.01 0.01 0.02 0.09 0.55 0.74 0.59 0.35 0.1 0.04 0.02 0.01 0.03 0.1 0.08 0.09 0.32 0.16 0.26 0.14 0.24 0.11 0.34 0.13 1.0 0.24 0.48 0.53 0.09 0.09 0.09 0.15
0.42 0.38 0.37 0.35 0.43 0.48 0.48 0.43 0.48 0.43 0.41 0.4 0.13 0.15 0.21 0.17 0.37 0.34 0.35 0.02 0.15 0.16 0.22 0.18 1.0 0.29 0.47 0.56 0.37 0.37 0.24 0.28
0.11 0.14 0.2 0.38 0.56 0.67 0.56 0.43 0.36 0.33 0.17 0.17 0.09 0.07 0.03 0.1 0.25 0.13 0.16 0.19 0.74 0.14 0.18 0.16 1.0 0.17 0.14 0.14 0.2 0.19 0.11 0.09
0.42 0.59 0.51 0.58 0.53 0.61 0.53 0.59 0.6 0.64 0.5 0.52 0.29 0.48 0.21 0.42 0.38 0.34 0.46 0.15 0.08 0.15 0.52 0.5 1.0 0.47 0.73 0.72 0.46 0.45 0.12 0.15
0.14 0.04 0.11 0.06 0.18 0.18 0.28 0.28 0.23 0.19 0.2 0.11 0.04 0.01 0.08 0.04 0.15 0.24 0.11 0.13 0.12 0.07 0.13 0.1 1.0 0.1 0.36 0.34 0.23 0.3 0.2 0.13
0.28 0.36 0.35 0.39 0.41 0.39 0.42 0.45 0.38 0.35 0.33 0.3 0.22 0.18 0.31 0.34 0.31 0.19 0.36 0.25 0.18 0.24 0.42 0.43 1.0 0.49 0.59 0.67 0.35 0.39 0.21 0.17
0.23 0.29 0.3 0.34 0.38 0.47 0.44 0.46 0.35 0.29 0.23 0.23 0.15 0.14 0.14 0.13 0.23 0.34 0.31 0.25 0.3 0.33 0.21 0.21 0.72 0.36 0.97 1.0 0.23 0.23 0.19 0.24
0.03 0.1 0.2 0.44 0.55 0.58 0.42 0.31 0.14 0.12 0.05 0.04 0.07 0.03 0.13 0.09 0.21 0.06 0.14 0.09 0.3 0.11 0.19 0.11 1.0 0.23 0.27 0.3 0.05 0.06 0.02 0.02
0.09 0.12 0.18 0.32 0.41 0.37 0.3 0.31 0.2 0.17 0.14 0.13 0.06 0.09 0.07 0.06 0.11 0.06 0.12 0.03 0.1 0.03 0.12 0.11 1.0 0.23 0.61 0.53 0.13 0.13 0.13 0.19
0.32 0.24 0.23 0.33 0.29 0.38 0.34 0.32 0.33 0.24 0.19 0.23 0.08 0.16 0.38 0.09 0.42 0.38 0.28 0.0 0.08 0.11 0.15 0.12 1.0 0.39 0.74 0.52 0.32 0.28 0.22 0.18
0.2 0.28 0.35 0.43 0.52 0.52 0.44 0.41 0.25 0.21 0.2 0.17 0.11 0.14 0.08 0.14 0.29 0.18 0.27 0.14 0.5 0.07 0.21 0.18 1.0 0.21 0.38 0.38 0.22 0.24 0.24 0.26
0.19 0.22 0.23 0.23 0.18 0.29 0.25 0.24 0.25 0.23 0.18 0.2 0.04 0.09 0.2 0.07 0.35 0.07 0.23 0.08 0.03 0.12 0.1 0.08 1.0 0.13 0.48 0.61 0.22 0.24 0.13 0.12
0.35 0.39 0.46 0.53 0.6 0.72 0.64 0.7 0.51 0.44 0.42 0.32 0.14 0.21 0.36 0.28 0.48 0.41 0.47 0.1 0.54 0.35 0.33 0.28 0.73 0.41 1.0 0.88 0.39 0.39 0.26 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)